More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2636 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2636  ABC transporter related  100 
 
 		 261 aa  525  1e-148  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2415  ABC transporter related  76.23 
 
 		 264 aa  388  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.805602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0039  ABC transporter related  73.25 
 
 		 302 aa  367  1e-101  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1984  ATPase  68.98 
 
 		 257 aa  354  6.999999999999999e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.101107  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1057  ABC transporter related  56.49 
 
 		 298 aa  302  4.0000000000000003e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.184914  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1961  ABC transporter related  55.78 
 
 		 254 aa  293  3e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.334641  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3137  ABC transporter, ATPase subunit  57.55 
 
 		 253 aa  284  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.297163  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0669  ABC transporter related  55.69 
 
 		 254 aa  282  3.0000000000000004e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2446  ABC transporter component  54.88 
 
 		 264 aa  270  2e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.404334  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4624  ABC transporter related  49.21 
 
 		 258 aa  268  7e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1712  ABC transporter-related protein  50 
 
 		 252 aa  262  3e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000576973 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1229  ABC transporter related  50.6 
 
 		 264 aa  261  8e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.380088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1321  ABC transporter related protein  54.07 
 
 		 259 aa  260  1e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.627863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1073  ABC transporter related  51.03 
 
 		 258 aa  255  6e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2750  ABC-type transport system, ATPase component  50.2 
 
 		 265 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3497  ABC transporter related  53.5 
 
 		 256 aa  247  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.214692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0467  ABC transporter related  53.06 
 
 		 253 aa  238  5e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1495  ABC transporter related  51.64 
 
 		 267 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00076856  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3704  ABC transporter related  45.56 
 
 		 265 aa  219  3e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.307132  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0472  ABC transporter related  46.59 
 
 		 293 aa  214  8e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0139008  hitchhiker  0.0000833455 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0853  ABC transporter related  45.04 
 
 		 273 aa  211  9e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0785068 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3016  ABC transporter related  47.79 
 
 		 249 aa  210  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.524884  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2298  ATPase  45.38 
 
 		 273 aa  207  1e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102276  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1016  ABC transporter-related protein  43.85 
 
 		 253 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0022  ATPase  43.15 
 
 		 256 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0387  ABC transporter, ATPase subunit, toluene tolerance Ttg2A-like  43.67 
 
 		 273 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2449  ABC transporter related  42.92 
 
 		 268 aa  199  5e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3512  ABC transporter, ATPase subunit  42.98 
 
 		 273 aa  198  6e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.317493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0393  ABC transporter related  42.98 
 
 		 273 aa  198  7e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.261527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2693  ABC transporter related  42.98 
 
 		 273 aa  198  7e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.663262  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0414  ABC transporter related  42.98 
 
 		 273 aa  198  7e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192398  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3571  ABC transporter related  43.27 
 
 		 273 aa  198  9e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626203  hitchhiker  0.0000199293 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1817  ABC transporter related  42.17 
 
 		 274 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0317  ABC transporter related  42.51 
 
 		 273 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0527891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0341  ABC transporter related  42.15 
 
 		 273 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.444988 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0332  ABC transporter related  42.15 
 
 		 273 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0716  ABC transporter related  42.04 
 
 		 286 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0748  ABC transporter related  42.04 
 
 		 286 aa  195  5.000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2770  ABC transporter related  42.86 
 
 		 273 aa  195  6e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.719655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0535  ABC transporter related  40.84 
 
 		 271 aa  195  7e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0379  ABC transporter related  39.34 
 
 		 262 aa  194  9e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0091  PP-loop family protein  42.19 
 
 		 246 aa  194  1e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0135509  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3735  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein  41.63 
 
 		 272 aa  193  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.527515  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2343  ABC transporter related  43.24 
 
 		 275 aa  193  3e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464868 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3677  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein  42.8 
 
 		 272 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0124064  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2726  ABC transporter, ATP-binding protein  42.8 
 
 		 272 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3704  putative ABC transporter ATP-binding subunit  42.8 
 
 		 272 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3004  ABC transporter, ATP-binding protein  43.22 
 
 		 272 aa  192  4e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2776  ABC transporter, ATP-binding protein  42.8 
 
 		 272 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.849481  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1777  ABC transporter, ATP-binding protein  42.8 
 
 		 272 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3228  ABC transporter, ATP-binding protein  42.8 
 
 		 272 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0248  ABC transporter, ATP-binding protein  48.78 
 
 		 255 aa  192  5e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1719  ABC transporter related  48.08 
 
 		 257 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0483086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10668  ribonucleotide transport ATP-binding protein ABC transporter mkl  42.92 
 
 		 359 aa  190  2e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.139977  normal  0.579373 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22670  putative ATP-binding component of ABC transporter  41.7 
 
 		 264 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420242 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1611  ABC transporter related  47.57 
 
 		 295 aa  187  1e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2513  ABC transporter related  45.59 
 
 		 259 aa  187  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0824022  normal  0.0374707 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1527  ABC transporter-related protein  46.12 
 
 		 246 aa  187  2e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.330803  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0237  ABC transporter related  39.26 
 
 		 268 aa  187  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1173  ABC transporter, ATP-binding protein  40.98 
 
 		 264 aa  186  2e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5099  ABC transporter related  41.25 
 
 		 362 aa  186  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0528619 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2810  ABC transporter, ATPase subunit  47.34 
 
 		 257 aa  186  3e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.66283  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3394  ABC transporter-related protein  41.08 
 
 		 278 aa  186  3e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1488  ABC transporter related  47.34 
 
 		 257 aa  186  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1013  ABC transporter-related protein  40.83 
 
 		 306 aa  186  4e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0401  ABC transporter related  40.98 
 
 		 262 aa  185  6e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186175  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0685  ABC transporter related  40 
 
 		 293 aa  185  7e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0677  ABC transporter related  38.89 
 
 		 255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0700  ABC transporter related  40.42 
 
 		 333 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1154  ABC transporter related  40.42 
 
 		 286 aa  183  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0986  ABC transporter related  40.83 
 
 		 361 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.401008 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3101  putative ABC transporter ATP-binding subunit  39.53 
 
 		 279 aa  183  3e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0968  ABC transporter related  40.83 
 
 		 361 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51873  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1254  ABC transporter-related protein  40 
 
 		 357 aa  182  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0999833 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2909  ABC transporter component  42.04 
 
 		 277 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.321315  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2935  ABC transporter related  39.09 
 
 		 271 aa  182  6e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2049  ABC transporter ATP-binding protein  47.8 
 
 		 259 aa  182  6e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.558071 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1155  ABC transporter related  45.58 
 
 		 278 aa  181  7e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3963  ABC transporter related  39.34 
 
 		 248 aa  182  7e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764757  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2194  ABC transporter related  41.25 
 
 		 281 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0566123  normal  0.102467 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5028  ABC transporter ATP-binding protein  41 
 
 		 269 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57880  ABC transporter ATP-binding protein  41 
 
 		 269 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2316  ABC transporter related  46.34 
 
 		 258 aa  181  9.000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184477  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0888  ABC transporter related  40 
 
 		 273 aa  181  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00820574  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07670  ABC transporter, ATP-binding protein  43.13 
 
 		 254 aa  181  1e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0821592  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2811  ABC transporter related  43.75 
 
 		 303 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.688853  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0404  ABC transporter related  42.49 
 
 		 292 aa  180  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.027511 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6242  ABC transporter, ATPase subunit  43.23 
 
 		 304 aa  180  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0996  ABC transporter related  40 
 
 		 361 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0071  ABC transporter-related protein  40.61 
 
 		 279 aa  180  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2949  ABC transporter related  43.75 
 
 		 303 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.85186  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1434  methionine import ATP-binding protein MetN  43.41 
 
 		 246 aa  180  2.9999999999999997e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00844706  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2909  ABC transporter related  43.75 
 
 		 304 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3259  ABC transporter-related protein  39.67 
 
 		 283 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2285  ABC transporter related  43.75 
 
 		 304 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2900  ABC transporter related  43.75 
 
 		 304 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.34746  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0372  ABC transporter related  49.04 
 
 		 261 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3081  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40.91 
 
 		 270 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.216025 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3182  ABC transporter related  43.13 
 
 		 250 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5536  ABC transporter related  40.59 
 
 		 309 aa  178  8e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>