More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0669 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0669  ABC transporter related  100 
 
 		 254 aa  520  1e-146  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1961  ABC transporter related  80.56 
 
 		 254 aa  428  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.334641  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2415  ABC transporter related  55.06 
 
 		 264 aa  291  8e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.805602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2636  ABC transporter related  55.69 
 
 		 261 aa  282  3.0000000000000004e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1984  ATPase  51.63 
 
 		 257 aa  278  5e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.101107  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0039  ABC transporter related  52.63 
 
 		 302 aa  271  8.000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2446  ABC transporter component  49.6 
 
 		 264 aa  251  1e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.404334  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4624  ABC transporter related  47.56 
 
 		 258 aa  246  4e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2750  ABC-type transport system, ATPase component  47.37 
 
 		 265 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1321  ABC transporter related protein  46 
 
 		 259 aa  243  9.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.627863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1057  ABC transporter related  52.21 
 
 		 298 aa  243  3e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.184914  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1229  ABC transporter related  46.18 
 
 		 264 aa  241  6e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.380088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1073  ABC transporter related  48.36 
 
 		 258 aa  239  2e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3137  ABC transporter, ATPase subunit  48.16 
 
 		 253 aa  235  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.297163  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1712  ABC transporter-related protein  45.93 
 
 		 252 aa  234  1.0000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000576973 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1495  ABC transporter related  47.13 
 
 		 267 aa  233  3e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00076856  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0467  ABC transporter related  49.21 
 
 		 253 aa  228  5e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3497  ABC transporter related  48.36 
 
 		 256 aa  228  7e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.214692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3016  ABC transporter related  44.72 
 
 		 249 aa  203  3e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.524884  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2298  ATPase  44.21 
 
 		 273 aa  203  3e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102276  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3704  ABC transporter related  43.21 
 
 		 265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.307132  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0022  ATPase  44.98 
 
 		 256 aa  196  3e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0472  ABC transporter related  42.11 
 
 		 293 aa  194  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0139008  hitchhiker  0.0000833455 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2449  ABC transporter related  41.08 
 
 		 268 aa  190  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0853  ABC transporter related  40.16 
 
 		 273 aa  186  3e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0785068 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0328  ABC transporter related  40.66 
 
 		 249 aa  186  4e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.673492  normal  0.624259 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0379  ABC transporter related  39 
 
 		 262 aa  185  7e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3963  ABC transporter related  41.71 
 
 		 248 aa  185  8e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0700  ABC transporter related  39.58 
 
 		 333 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1527  ABC transporter-related protein  43.66 
 
 		 246 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.330803  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1817  ABC transporter related  40.73 
 
 		 274 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2844  ABC transporter related  39.67 
 
 		 300 aa  182  5.0000000000000004e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1016  ABC transporter-related protein  40.49 
 
 		 253 aa  181  1e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0091  PP-loop family protein  39.26 
 
 		 246 aa  181  1e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0135509  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10668  ribonucleotide transport ATP-binding protein ABC transporter mkl  38.75 
 
 		 359 aa  180  2e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.139977  normal  0.579373 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1680  ABC transporter ATP-binding protein  42.21 
 
 		 254 aa  180  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1434  methionine import ATP-binding protein MetN  40.34 
 
 		 246 aa  177  1e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00844706  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0387  ABC transporter, ATPase subunit, toluene tolerance Ttg2A-like  40.91 
 
 		 273 aa  177  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2743  ABC transporter related  41.15 
 
 		 272 aa  176  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.132977 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3571  ABC transporter related  40.24 
 
 		 273 aa  176  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626203  hitchhiker  0.0000199293 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2909  ABC transporter component  41.46 
 
 		 277 aa  175  6e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.321315  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0480  ABC transporter related  39.18 
 
 		 292 aa  175  6e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.104959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2513  ABC transporter related  38.11 
 
 		 259 aa  174  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0824022  normal  0.0374707 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0677  ABC transporter related  37.14 
 
 		 255 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0646  ABC transporter, ATP-binding protein  41.1 
 
 		 283 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0986  ABC transporter related  37.08 
 
 		 361 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.401008 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0968  ABC transporter related  37.08 
 
 		 361 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51873  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0797  ABC transporter related  41.1 
 
 		 283 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.126555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3462  ABC transporter related  38.94 
 
 		 250 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0534254 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1154  ABC transporter related  39.67 
 
 		 286 aa  172  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2194  ABC transporter related  39.39 
 
 		 281 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0566123  normal  0.102467 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0341  ABC transporter related  40.16 
 
 		 273 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.444988 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0332  ABC transporter related  40.16 
 
 		 273 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1254  ABC transporter-related protein  36.25 
 
 		 357 aa  172  5.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0999833 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3512  ABC transporter, ATPase subunit  40.56 
 
 		 273 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.317493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0393  ABC transporter related  40.56 
 
 		 273 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.261527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2693  ABC transporter related  40.56 
 
 		 273 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.663262  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0414  ABC transporter related  40.56 
 
 		 273 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192398  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2770  ABC transporter related  40.66 
 
 		 273 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.719655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5099  ABC transporter related  36.67 
 
 		 362 aa  171  7.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0528619 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03690  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, ATPase component  37.08 
 
 		 378 aa  171  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.839011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0535  ABC transporter related  38.55 
 
 		 271 aa  171  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2413  ABC transporter related  39 
 
 		 266 aa  171  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.104352 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0401  ABC transporter related  37.92 
 
 		 262 aa  171  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186175  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0996  ABC transporter related  36.67 
 
 		 361 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1074  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents ATPase component-like protein  37.08 
 
 		 333 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2049  ABC transporter ATP-binding protein  40.25 
 
 		 259 aa  171  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.558071 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4349  ABC transporter related protein  38.75 
 
 		 359 aa  170  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0787  ABC transporter-related protein  39.58 
 
 		 248 aa  170  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0317  ABC transporter related  40.25 
 
 		 273 aa  169  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0527891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6635  ABC transporter related  37.08 
 
 		 363 aa  169  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3182  ABC transporter related  41.56 
 
 		 250 aa  169  4e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0118  putative ABC transporter, ATP-binding protein  39.44 
 
 		 240 aa  169  4e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.568497  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1638  ABC transporter, ATP-binding protein  39.57 
 
 		 240 aa  168  6e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3004  ABC transporter, ATP-binding protein  40.51 
 
 		 272 aa  169  6e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1819  ABC transporter, ATP-binding protein  39.57 
 
 		 240 aa  168  7e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3402  ABC transporter related  38.78 
 
 		 270 aa  168  7e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2007  ABC transporter, ATP-binding protein  39.57 
 
 		 240 aa  168  8e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5159  ABC transporter related protein  37.76 
 
 		 248 aa  168  8e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.364497 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0404  ABC transporter related  39.51 
 
 		 292 aa  167  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.027511 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1040  ABC transporter related  39.58 
 
 		 248 aa  168  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1127  ABC transporter related protein  35.54 
 
 		 421 aa  167  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6242  ABC transporter, ATPase subunit  38.68 
 
 		 304 aa  166  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2811  ABC transporter related  38.91 
 
 		 303 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.688853  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1628  ABC transporter related  37.04 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.387649 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5556  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.21 
 
 		 264 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.50977 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2285  ABC transporter related  39.33 
 
 		 304 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2909  ABC transporter related  39.33 
 
 		 304 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2949  ABC transporter related  38.91 
 
 		 303 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.85186  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2900  ABC transporter related  39.33 
 
 		 304 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.34746  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0816  ABC transporter, ATP-binding protein  38.33 
 
 		 248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3081  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.92 
 
 		 270 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.216025 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1719  ABC transporter related  38.06 
 
 		 257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0483086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2343  ABC transporter related  38.36 
 
 		 275 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464868 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1488  ABC transporter related  38.06 
 
 		 257 aa  166  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2810  ABC transporter, ATPase subunit  38.06 
 
 		 257 aa  166  4e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.66283  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1611  ABC transporter related  44.81 
 
 		 295 aa  166  4e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1173  ABC transporter, ATP-binding protein  38.43 
 
 		 264 aa  166  4e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07670  ABC transporter, ATP-binding protein  39.52 
 
 		 254 aa  166  5e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0821592  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3704  putative ABC transporter ATP-binding subunit  40.08 
 
 		 272 aa  166  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>