More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0759 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_0759  ABC transporter related protein  100 
 
 		 289 aa  576  1.0000000000000001e-163  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0386  ABC transporter related protein  61.89 
 
 		 277 aa  308  9e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1969  ABC transporter, ATP-binding protein  61.07 
 
 		 275 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.309748  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2709  ABC transporter related  60.24 
 
 		 270 aa  303  2.0000000000000002e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2413  ABC transporter related  59.35 
 
 		 266 aa  302  4.0000000000000003e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.104352 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2223  ABC transporter related  57.97 
 
 		 276 aa  300  1e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.435588  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0903  hypothetical protein  56.5 
 
 		 265 aa  291  9e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0737  ABC transporter related  60.08 
 
 		 261 aa  291  9e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0872  hypothetical protein  56.5 
 
 		 265 aa  291  1e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4536  ABC transporter, ATP-binding protein  54.32 
 
 		 267 aa  286  2e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0979  ABC transporter related  56.22 
 
 		 265 aa  286  4e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3081  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  56.28 
 
 		 270 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.216025 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0876  ABC transporter related  58.02 
 
 		 269 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.930987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2220  ABC transporter related  59.44 
 
 		 283 aa  282  4.0000000000000003e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57880  ABC transporter ATP-binding protein  55.38 
 
 		 269 aa  281  7.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5028  ABC transporter ATP-binding protein  55.38 
 
 		 269 aa  281  7.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2786  ABC transporter, ATPase subunit  58.02 
 
 		 294 aa  281  9e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000312244  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1173  ABC transporter, ATP-binding protein  55.14 
 
 		 264 aa  281  1e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3304  ABC transporter-related protein  59.26 
 
 		 292 aa  280  2e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12850  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, ATP binding component  54.84 
 
 		 269 aa  279  3e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4447  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein, putative  55.87 
 
 		 269 aa  278  1e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4141  ABC transporter  55.87 
 
 		 269 aa  277  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3609  ABC transporter related  59.18 
 
 		 270 aa  277  2e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0863  ABC transporter-like  55.56 
 
 		 270 aa  276  4e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.535463  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0958  toluene tolerance ABC efflux transporter, ATP-binding protein  55.38 
 
 		 269 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0496  ABC transporter related  57.55 
 
 		 273 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00107814  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0888  ABC transporter related  55.56 
 
 		 273 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00820574  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0997  ABC transporter related  55.38 
 
 		 269 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0965  ABC transporter related  55.38 
 
 		 269 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3343  ABC transporter related  57.61 
 
 		 272 aa  272  4.0000000000000004e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.279252 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0678  ABC transporter related  57.61 
 
 		 272 aa  272  4.0000000000000004e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0646516 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3402  ABC transporter related  53.41 
 
 		 270 aa  271  6e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002409  ABC transporter ATP-binding protein  57.03 
 
 		 267 aa  271  7e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0733  ABC transporter-related protein  57.61 
 
 		 267 aa  271  8.000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.329181 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03658  hypothetical protein  56.63 
 
 		 267 aa  271  8.000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3662  ABC transporter related  56.38 
 
 		 279 aa  270  1e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0392823  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3610  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  58.02 
 
 		 270 aa  270  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3505  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  58.02 
 
 		 270 aa  270  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3574  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  58.02 
 
 		 270 aa  270  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0713  ABC transporter related  56.79 
 
 		 272 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00516004 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0679  ABC transporter related  57.2 
 
 		 272 aa  271  1e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.962432 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3503  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  58.02 
 
 		 270 aa  270  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.260785  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3672  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  58.02 
 
 		 270 aa  270  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0355723 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03060  predicted toluene transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  57.61 
 
 		 269 aa  270  2e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0889868  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0512  ABC transporter related protein  57.61 
 
 		 269 aa  270  2e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.648269  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0505  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  57.61 
 
 		 269 aa  270  2e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.179528 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03011  hypothetical protein  57.61 
 
 		 269 aa  270  2e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.086936  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3954  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  57.61 
 
 		 272 aa  270  2e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4517  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  57.61 
 
 		 269 aa  270  2e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.257918  normal  0.710569 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0722  ABC transporter related  56.38 
 
 		 277 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.165434 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3683  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  57.61 
 
 		 269 aa  270  2e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00651992  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3575  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  57.61 
 
 		 269 aa  270  2e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.637891  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0692  ABC transporter related  56.38 
 
 		 277 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4257  ABC transporter related  54.98 
 
 		 269 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3491  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  57.61 
 
 		 269 aa  270  2e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3388  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  57.61 
 
 		 269 aa  270  2e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0514753  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1013  ABC transporter-related protein  55.24 
 
 		 306 aa  268  8.999999999999999e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2102  ABC transporter, ATP-binding protein  56.63 
 
 		 267 aa  267  1e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0337  ABC transporter related  54.22 
 
 		 274 aa  268  1e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.425163 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0158  toluene ABC transporter, ATP-binding protein, putative  54.22 
 
 		 276 aa  267  1e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4233  ABC transporter related  56.79 
 
 		 271 aa  266  2e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.36582  hitchhiker  0.000301963 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2887  ABC transporter ATP-binding protein  50.92 
 
 		 269 aa  266  2e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.220334  normal  0.384798 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0721  ABC transporter related  55.97 
 
 		 272 aa  266  2e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4360  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  56.22 
 
 		 271 aa  266  2.9999999999999995e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.132306  normal  0.0534611 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0505  toluene tolerance protein Ttg2A  57.26 
 
 		 268 aa  265  4e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.171907  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03186  putative transport protein (ABC superfamily, atp-binding)  54.88 
 
 		 266 aa  265  5.999999999999999e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0448  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  57.2 
 
 		 272 aa  265  7e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.885469  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0512  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  57.2 
 
 		 272 aa  265  7e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1146  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  57.2 
 
 		 272 aa  265  7e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0716  ABC transporter related  53.06 
 
 		 286 aa  264  1e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0237  ABC transporter related  53.63 
 
 		 268 aa  264  1e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3370  ABC transporter related  56.38 
 
 		 274 aa  264  1e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.839994  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0096  ABC transporter related  55.65 
 
 		 282 aa  264  2e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.568034  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0685  ABC transporter related  51.21 
 
 		 293 aa  264  2e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0095  ABC transporter related  54.69 
 
 		 283 aa  263  2e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000937702  normal  0.953414 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0748  ABC transporter related  52.65 
 
 		 286 aa  263  3e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0561  ABC transporter related  53.66 
 
 		 265 aa  263  3e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3122  ABC transporter related  57.21 
 
 		 273 aa  262  6e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.701707  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1154  ABC transporter related  52.87 
 
 		 286 aa  261  6.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2749  ABC transporter related  51.67 
 
 		 270 aa  261  8e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3259  ABC transporter-related protein  55.08 
 
 		 283 aa  261  8.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3735  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein  51.82 
 
 		 272 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.527515  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0281  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  55.56 
 
 		 270 aa  261  1e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3394  ABC transporter-related protein  55.14 
 
 		 278 aa  260  2e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3101  putative ABC transporter ATP-binding subunit  55.28 
 
 		 279 aa  259  2e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2935  ABC transporter related  50.81 
 
 		 271 aa  259  3e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3808  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  54.62 
 
 		 269 aa  258  6e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0159276  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0393  ABC transporter related  51.42 
 
 		 273 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.261527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3512  ABC transporter, ATPase subunit  51.42 
 
 		 273 aa  258  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.317493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2693  ABC transporter related  51.42 
 
 		 273 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.663262  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0414  ABC transporter related  51.42 
 
 		 273 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192398  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3650  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  54.62 
 
 		 268 aa  256  2e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2120  ABC transporter related  57.32 
 
 		 274 aa  257  2e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3228  ABC transporter, ATP-binding protein  52.72 
 
 		 272 aa  256  3e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2726  ABC transporter, ATP-binding protein  52.72 
 
 		 272 aa  256  3e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3704  putative ABC transporter ATP-binding subunit  52.72 
 
 		 272 aa  256  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3677  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein  52.72 
 
 		 272 aa  256  3e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0124064  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2776  ABC transporter, ATP-binding protein  52.72 
 
 		 272 aa  256  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.849481  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0317  ABC transporter related  51.01 
 
 		 273 aa  256  3e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0527891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1777  ABC transporter, ATP-binding protein  52.72 
 
 		 272 aa  256  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>