More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3650 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_3650  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  100 
 
 		 268 aa  544  1e-154  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3808  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  91.04 
 
 		 269 aa  471  1e-132  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0159276  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0288  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  86.25 
 
 		 270 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.154418  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0281  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  86.25 
 
 		 270 aa  448  1e-125  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4360  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  82.26 
 
 		 271 aa  423  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.132306  normal  0.0534611 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0448  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  82.13 
 
 		 272 aa  420  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.885469  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1146  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  82.13 
 
 		 272 aa  420  1e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0512  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  82.13 
 
 		 272 aa  420  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3672  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  79.55 
 
 		 270 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0355723 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3631  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  78.79 
 
 		 270 aa  403  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.135716 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3505  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  79.55 
 
 		 270 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3574  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  79.55 
 
 		 270 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3503  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  79.55 
 
 		 270 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.260785  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3610  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  79.55 
 
 		 270 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.308589 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03060  predicted toluene transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  80.38 
 
 		 269 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0889868  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0512  ABC transporter related protein  80.38 
 
 		 269 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.648269  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3683  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  80.38 
 
 		 269 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00651992  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0505  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  80.38 
 
 		 269 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.179528 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4517  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  80.38 
 
 		 269 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.257918  normal  0.710569 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3491  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  80.38 
 
 		 269 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03011  hypothetical protein  80.38 
 
 		 269 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.086936  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3388  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  80.38 
 
 		 269 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0514753  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3575  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  80.38 
 
 		 269 aa  399  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.637891  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3081  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  66.67 
 
 		 270 aa  372  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.216025 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03658  hypothetical protein  75.78 
 
 		 267 aa  374  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002409  ABC transporter ATP-binding protein  74.61 
 
 		 267 aa  370  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2102  ABC transporter, ATP-binding protein  75 
 
 		 267 aa  370  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1173  ABC transporter, ATP-binding protein  66.92 
 
 		 264 aa  361  6e-99  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4536  ABC transporter, ATP-binding protein  63.88 
 
 		 267 aa  358  5e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0505  toluene tolerance protein Ttg2A  73.71 
 
 		 268 aa  354  6.999999999999999e-97  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.171907  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0678  ABC transporter related  67.3 
 
 		 272 aa  354  7.999999999999999e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0646516 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3954  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  67.18 
 
 		 272 aa  354  8.999999999999999e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0958  toluene tolerance ABC efflux transporter, ATP-binding protein  64.23 
 
 		 269 aa  353  1e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4257  ABC transporter related  64.23 
 
 		 269 aa  352  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0863  ABC transporter-like  63.32 
 
 		 270 aa  352  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.535463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0965  ABC transporter related  64.23 
 
 		 269 aa  352  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3343  ABC transporter related  67.18 
 
 		 272 aa  352  2.9999999999999997e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.279252 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0679  ABC transporter related  66.79 
 
 		 272 aa  351  5.9999999999999994e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.962432 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4141  ABC transporter  62.55 
 
 		 269 aa  351  7e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0997  ABC transporter related  63.85 
 
 		 269 aa  350  8.999999999999999e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1969  ABC transporter, ATP-binding protein  65.77 
 
 		 275 aa  350  1e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.309748  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5028  ABC transporter ATP-binding protein  63.71 
 
 		 269 aa  349  2e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57880  ABC transporter ATP-binding protein  63.71 
 
 		 269 aa  349  2e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3662  ABC transporter related  66.03 
 
 		 279 aa  348  5e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0392823  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0721  ABC transporter related  66.41 
 
 		 272 aa  348  5e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0713  ABC transporter related  66.41 
 
 		 272 aa  348  6e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00516004 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0722  ABC transporter related  66.03 
 
 		 277 aa  347  9e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.165434 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0692  ABC transporter related  66.03 
 
 		 277 aa  347  9e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03186  putative transport protein (ABC superfamily, atp-binding)  67.55 
 
 		 266 aa  346  2e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2223  ABC transporter related  66.8 
 
 		 276 aa  346  2e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.435588  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4447  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein, putative  61.78 
 
 		 269 aa  345  3e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12850  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, ATP binding component  61.74 
 
 		 269 aa  345  3e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0876  ABC transporter related  60.9 
 
 		 269 aa  346  3e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.930987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2709  ABC transporter related  63.18 
 
 		 270 aa  340  2e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0496  ABC transporter related  65 
 
 		 273 aa  340  2e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00107814  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3609  ABC transporter related  63.74 
 
 		 270 aa  336  1.9999999999999998e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0561  ABC transporter related  64.89 
 
 		 265 aa  335  3.9999999999999995e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3304  ABC transporter-related protein  64.66 
 
 		 292 aa  335  5e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0979  ABC transporter related  60.46 
 
 		 265 aa  335  7e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0733  ABC transporter-related protein  64.23 
 
 		 267 aa  333  2e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.329181 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2220  ABC transporter related  62.74 
 
 		 283 aa  332  4e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0903  hypothetical protein  61.3 
 
 		 265 aa  330  1e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3370  ABC transporter related  64.09 
 
 		 274 aa  330  2e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.839994  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0872  hypothetical protein  60.92 
 
 		 265 aa  328  5.0000000000000004e-89  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4233  ABC transporter related  63.85 
 
 		 271 aa  325  3e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.36582  hitchhiker  0.000301963 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2413  ABC transporter related  61.04 
 
 		 266 aa  324  1e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.104352 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2786  ABC transporter, ATPase subunit  59.85 
 
 		 294 aa  322  4e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000312244  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0737  ABC transporter related  61.48 
 
 		 261 aa  315  5e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2887  ABC transporter ATP-binding protein  59.3 
 
 		 269 aa  312  3.9999999999999997e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.220334  normal  0.384798 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3735  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein  58.17 
 
 		 272 aa  310  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.527515  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0386  ABC transporter related protein  58.69 
 
 		 277 aa  310  1e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3101  putative ABC transporter ATP-binding subunit  61.35 
 
 		 279 aa  310  2e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3259  ABC transporter-related protein  57.36 
 
 		 283 aa  308  8e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2770  ABC transporter related  55.64 
 
 		 273 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.719655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3122  ABC transporter related  55.43 
 
 		 273 aa  305  5.0000000000000004e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.701707  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3004  ABC transporter, ATP-binding protein  58.78 
 
 		 272 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0387  ABC transporter, ATPase subunit, toluene tolerance Ttg2A-like  56.06 
 
 		 273 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0317  ABC transporter related  57.31 
 
 		 273 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0527891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0096  ABC transporter related  59.06 
 
 		 282 aa  303  2.0000000000000002e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.568034  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2726  ABC transporter, ATP-binding protein  58.37 
 
 		 272 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3704  putative ABC transporter ATP-binding subunit  58.37 
 
 		 272 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3512  ABC transporter, ATPase subunit  57.77 
 
 		 273 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.317493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2776  ABC transporter, ATP-binding protein  58.37 
 
 		 272 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.849481  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3228  ABC transporter, ATP-binding protein  58.37 
 
 		 272 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1777  ABC transporter, ATP-binding protein  58.37 
 
 		 272 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0341  ABC transporter related  57.31 
 
 		 273 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.444988 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0393  ABC transporter related  57.31 
 
 		 273 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.261527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3677  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein  58.37 
 
 		 272 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0124064  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2693  ABC transporter related  57.31 
 
 		 273 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.663262  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0332  ABC transporter related  57.31 
 
 		 273 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0414  ABC transporter related  57.31 
 
 		 273 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192398  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3394  ABC transporter-related protein  59.76 
 
 		 278 aa  302  4.0000000000000003e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3571  ABC transporter related  55.68 
 
 		 273 aa  301  5.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626203  hitchhiker  0.0000199293 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2120  ABC transporter related  59.47 
 
 		 274 aa  301  8.000000000000001e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0095  ABC transporter related  57.87 
 
 		 283 aa  300  1e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000937702  normal  0.953414 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2893  ABC transporter related  58.73 
 
 		 277 aa  301  1e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.267676 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3240  ABC transporter related  58.73 
 
 		 277 aa  301  1e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.738413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0685  ABC transporter related  57.77 
 
 		 293 aa  300  2e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5536  ABC transporter related  59.76 
 
 		 309 aa  299  3e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2935  ABC transporter related  54.33 
 
 		 271 aa  299  3e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>