More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2223 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_2223  ABC transporter related  100 
 
 		 276 aa  551  1e-156  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.435588  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1969  ABC transporter, ATP-binding protein  69.92 
 
 		 275 aa  383  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.309748  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0737  ABC transporter related  70.93 
 
 		 261 aa  372  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2786  ABC transporter, ATPase subunit  67.8 
 
 		 294 aa  368  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000312244  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0979  ABC transporter related  68.22 
 
 		 265 aa  369  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2120  ABC transporter related  70.7 
 
 		 274 aa  358  5e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2709  ABC transporter related  67.45 
 
 		 270 aa  355  5e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1173  ABC transporter, ATP-binding protein  62.93 
 
 		 264 aa  350  2e-95  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4447  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein, putative  63.4 
 
 		 269 aa  349  3e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2220  ABC transporter related  68.44 
 
 		 283 aa  348  4e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4141  ABC transporter  63.02 
 
 		 269 aa  347  1e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12850  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, ATP binding component  64.73 
 
 		 269 aa  344  1e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5028  ABC transporter ATP-binding protein  61.13 
 
 		 269 aa  341  7e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57880  ABC transporter ATP-binding protein  61.13 
 
 		 269 aa  341  7e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0903  hypothetical protein  61.39 
 
 		 265 aa  340  2e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0863  ABC transporter-like  60.67 
 
 		 270 aa  340  2e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.535463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0876  ABC transporter related  64.48 
 
 		 269 aa  340  2e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.930987  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0958  toluene tolerance ABC efflux transporter, ATP-binding protein  61.51 
 
 		 269 aa  339  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0679  ABC transporter related  63.67 
 
 		 272 aa  338  4e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.962432 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0997  ABC transporter related  61.51 
 
 		 269 aa  338  5e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0965  ABC transporter related  61.51 
 
 		 269 aa  338  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0872  hypothetical protein  61 
 
 		 265 aa  337  9e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3081  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  62.6 
 
 		 270 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.216025 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3954  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  64.42 
 
 		 272 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4257  ABC transporter related  61.51 
 
 		 269 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3343  ABC transporter related  63.67 
 
 		 272 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.279252 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0678  ABC transporter related  63.3 
 
 		 272 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0646516 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3370  ABC transporter related  63.1 
 
 		 274 aa  335  2.9999999999999997e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.839994  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3662  ABC transporter related  62.27 
 
 		 279 aa  335  3.9999999999999995e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0392823  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0722  ABC transporter related  62.27 
 
 		 277 aa  334  9e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.165434 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0692  ABC transporter related  62.27 
 
 		 277 aa  334  9e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0721  ABC transporter related  62.92 
 
 		 272 aa  333  2e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0158  toluene ABC transporter, ATP-binding protein, putative  63.49 
 
 		 276 aa  333  2e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0337  ABC transporter related  63.49 
 
 		 274 aa  333  2e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.425163 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0713  ABC transporter related  63.3 
 
 		 272 aa  333  3e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00516004 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2413  ABC transporter related  60.87 
 
 		 266 aa  332  4e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.104352 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0496  ABC transporter related  63.64 
 
 		 273 aa  332  5e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00107814  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2749  ABC transporter related  60.47 
 
 		 270 aa  329  2e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3609  ABC transporter related  65.25 
 
 		 270 aa  329  3e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0095  ABC transporter related  59.11 
 
 		 283 aa  329  3e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000937702  normal  0.953414 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0386  ABC transporter related protein  62.08 
 
 		 277 aa  327  1.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0096  ABC transporter related  60.15 
 
 		 282 aa  327  2.0000000000000001e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.568034  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4536  ABC transporter, ATP-binding protein  57.69 
 
 		 267 aa  325  4.0000000000000003e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3402  ABC transporter related  59.47 
 
 		 270 aa  325  5e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3650  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  66.8 
 
 		 268 aa  324  1e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0281  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  64.86 
 
 		 270 aa  324  1e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0505  toluene tolerance protein Ttg2A  63.74 
 
 		 268 aa  324  1e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.171907  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3304  ABC transporter-related protein  64.48 
 
 		 292 aa  323  2e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3122  ABC transporter related  61.2 
 
 		 273 aa  322  4e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.701707  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1900  ABC transporter ATPase  62.4 
 
 		 270 aa  322  4e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.81319  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3808  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  64.86 
 
 		 269 aa  322  5e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0159276  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002409  ABC transporter ATP-binding protein  63.08 
 
 		 267 aa  321  7e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0288  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  63.71 
 
 		 270 aa  319  3e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.154418  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2102  ABC transporter, ATP-binding protein  63.71 
 
 		 267 aa  319  3e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4360  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  64.48 
 
 		 271 aa  318  3.9999999999999996e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.132306  normal  0.0534611 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4233  ABC transporter related  62.6 
 
 		 271 aa  318  7.999999999999999e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.36582  hitchhiker  0.000301963 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0733  ABC transporter-related protein  60.69 
 
 		 267 aa  317  9e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.329181 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2887  ABC transporter ATP-binding protein  57.47 
 
 		 269 aa  317  1e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.220334  normal  0.384798 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03658  hypothetical protein  62.31 
 
 		 267 aa  317  2e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3240  ABC transporter related  60.8 
 
 		 277 aa  316  2e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.738413  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2893  ABC transporter related  60.8 
 
 		 277 aa  316  2e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.267676 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0448  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  62.55 
 
 		 272 aa  316  3e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.885469  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0512  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  62.55 
 
 		 272 aa  316  3e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0888  ABC transporter related  61.6 
 
 		 273 aa  316  3e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00820574  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1146  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  62.55 
 
 		 272 aa  316  3e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3259  ABC transporter-related protein  58.73 
 
 		 283 aa  315  4e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3571  ABC transporter related  59.25 
 
 		 273 aa  315  5e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626203  hitchhiker  0.0000199293 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0237  ABC transporter related  57.92 
 
 		 268 aa  315  5e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3505  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  62.69 
 
 		 270 aa  315  7e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2962  ABC transporter ATP-binding protein  60 
 
 		 279 aa  315  7e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3503  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  62.69 
 
 		 270 aa  315  7e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.260785  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3610  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  62.69 
 
 		 270 aa  315  7e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3574  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  62.69 
 
 		 270 aa  315  7e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3672  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  62.69 
 
 		 270 aa  315  7e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0355723 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1013  ABC transporter-related protein  59.32 
 
 		 306 aa  314  9e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0561  ABC transporter related  59.85 
 
 		 265 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3735  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein  57.58 
 
 		 272 aa  311  9e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.527515  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03060  predicted toluene transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  62.16 
 
 		 269 aa  310  2e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0889868  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0512  ABC transporter related protein  62.16 
 
 		 269 aa  310  2e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.648269  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4517  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  62.16 
 
 		 269 aa  310  2e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.257918  normal  0.710569 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3683  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  62.16 
 
 		 269 aa  310  2e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00651992  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3491  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  62.16 
 
 		 269 aa  310  2e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3575  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  62.16 
 
 		 269 aa  310  2e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.637891  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0716  ABC transporter related  57.25 
 
 		 286 aa  310  2e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03011  hypothetical protein  62.16 
 
 		 269 aa  310  2e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.086936  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0505  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  62.16 
 
 		 269 aa  310  2e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.179528 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3388  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  62.16 
 
 		 269 aa  310  2e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0514753  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1154  ABC transporter related  58.33 
 
 		 286 aa  309  2.9999999999999997e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2770  ABC transporter related  58.33 
 
 		 273 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.719655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3631  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  62.55 
 
 		 270 aa  309  4e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.135716 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0393  ABC transporter related  57.41 
 
 		 273 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.261527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2693  ABC transporter related  57.41 
 
 		 273 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.663262  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0414  ABC transporter related  57.41 
 
 		 273 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192398  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3512  ABC transporter, ATPase subunit  57.41 
 
 		 273 aa  308  8e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.317493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0748  ABC transporter related  57.58 
 
 		 286 aa  308  9e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0332  ABC transporter related  59.07 
 
 		 273 aa  308  9e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0341  ABC transporter related  59.07 
 
 		 273 aa  308  9e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.444988 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3704  putative ABC transporter ATP-binding subunit  59.06 
 
 		 272 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2776  ABC transporter, ATP-binding protein  59.06 
 
 		 272 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.849481  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3677  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein  59.06 
 
 		 272 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0124064  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>