More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0341 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0341  ABC transporter related  100 
 
 
273 aa  542  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.444988 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0332  ABC transporter related  100 
 
 
273 aa  542  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0393  ABC transporter related  98.17 
 
 
273 aa  533  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.261527  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2693  ABC transporter related  98.17 
 
 
273 aa  533  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.663262  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0414  ABC transporter related  98.17 
 
 
273 aa  533  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192398  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3512  ABC transporter, ATPase subunit  97.8 
 
 
273 aa  531  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.317493  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0317  ABC transporter related  96.7 
 
 
273 aa  529  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0527891  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3735  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein  93.26 
 
 
272 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.527515  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3004  ABC transporter, ATP-binding protein  94.23 
 
 
272 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2726  ABC transporter, ATP-binding protein  94.23 
 
 
272 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3704  putative ABC transporter ATP-binding subunit  94.23 
 
 
272 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1777  ABC transporter, ATP-binding protein  94.23 
 
 
272 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3571  ABC transporter related  89.42 
 
 
273 aa  489  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626203  hitchhiker  0.0000199293 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2776  ABC transporter, ATP-binding protein  94.23 
 
 
272 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.849481  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2770  ABC transporter related  89.71 
 
 
273 aa  489  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.719655  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3228  ABC transporter, ATP-binding protein  94.23 
 
 
272 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3677  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein  94.23 
 
 
272 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0124064  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0387  ABC transporter, ATPase subunit, toluene tolerance Ttg2A-like  87.96 
 
 
273 aa  479  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2962  ABC transporter ATP-binding protein  71.53 
 
 
279 aa  391  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3240  ABC transporter related  71.96 
 
 
277 aa  388  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.738413  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2893  ABC transporter related  71.96 
 
 
277 aa  388  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.267676 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3259  ABC transporter-related protein  70.41 
 
 
283 aa  388  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0096  ABC transporter related  72.35 
 
 
282 aa  381  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.568034  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0095  ABC transporter related  71.97 
 
 
283 aa  380  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000937702  normal  0.953414 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3122  ABC transporter related  68.52 
 
 
273 aa  372  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.701707  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0748  ABC transporter related  68.18 
 
 
286 aa  363  2e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0716  ABC transporter related  68.18 
 
 
286 aa  363  2e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1154  ABC transporter related  67.65 
 
 
286 aa  359  3e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3101  putative ABC transporter ATP-binding subunit  67.68 
 
 
279 aa  358  8e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1900  ABC transporter ATPase  66.42 
 
 
270 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.81319  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3394  ABC transporter-related protein  66.67 
 
 
278 aa  353  2e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5536  ABC transporter related  68.8 
 
 
309 aa  352  4e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0685  ABC transporter related  65.28 
 
 
293 aa  352  5e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2935  ABC transporter related  62.22 
 
 
271 aa  351  8e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0888  ABC transporter related  67.05 
 
 
273 aa  350  1e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00820574  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0793  ABC transporter related  63.84 
 
 
282 aa  348  4e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.215167  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1013  ABC transporter-related protein  66.54 
 
 
306 aa  348  5e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2397  ABC transporter related  65.15 
 
 
277 aa  345  6e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0237  ABC transporter related  63.22 
 
 
268 aa  341  7e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2749  ABC transporter related  61.57 
 
 
270 aa  340  2e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3402  ABC transporter related  59.55 
 
 
270 aa  329  3e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2709  ABC transporter related  60.38 
 
 
270 aa  325  3e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0737  ABC transporter related  61.48 
 
 
261 aa  314  9e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4447  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein, putative  57.59 
 
 
269 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1969  ABC transporter, ATP-binding protein  58.11 
 
 
275 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.309748  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4141  ABC transporter  57.2 
 
 
269 aa  311  5.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1190  ATP-binding ABC transporter protein  58.65 
 
 
281 aa  308  5.9999999999999995e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726252  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0863  ABC transporter-like  56.03 
 
 
270 aa  308  6.999999999999999e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.535463  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2223  ABC transporter related  59.07 
 
 
276 aa  308  9e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.435588  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1173  ABC transporter, ATP-binding protein  57.14 
 
 
264 aa  306  2.0000000000000002e-82  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0965  ABC transporter related  57.2 
 
 
269 aa  306  3e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4257  ABC transporter related  57.2 
 
 
269 aa  306  3e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0876  ABC transporter related  55.85 
 
 
269 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.930987  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3081  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  57.14 
 
 
270 aa  305  5.0000000000000004e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.216025 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0958  toluene tolerance ABC efflux transporter, ATP-binding protein  56.81 
 
 
269 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567321  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0997  ABC transporter related  56.42 
 
 
269 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12850  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, ATP binding component  56.08 
 
 
269 aa  300  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5028  ABC transporter ATP-binding protein  53.99 
 
 
269 aa  300  2e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57880  ABC transporter ATP-binding protein  53.99 
 
 
269 aa  300  2e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4536  ABC transporter, ATP-binding protein  54.76 
 
 
267 aa  298  5e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2220  ABC transporter related  56.77 
 
 
283 aa  298  5e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0721  ABC transporter related  59.84 
 
 
272 aa  297  1e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3662  ABC transporter related  59.44 
 
 
279 aa  296  2e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0392823  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0713  ABC transporter related  59.84 
 
 
272 aa  296  2e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00516004 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0692  ABC transporter related  59.44 
 
 
277 aa  295  4e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0722  ABC transporter related  59.44 
 
 
277 aa  295  4e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.165434 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3954  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  59.84 
 
 
272 aa  295  7e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3343  ABC transporter related  59.84 
 
 
272 aa  295  7e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.279252 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0678  ABC transporter related  59.84 
 
 
272 aa  294  9e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0646516 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0679  ABC transporter related  59.84 
 
 
272 aa  294  9e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.962432 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2120  ABC transporter related  58.36 
 
 
274 aa  294  1e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0979  ABC transporter related  53.99 
 
 
265 aa  293  2e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0386  ABC transporter related protein  58.94 
 
 
277 aa  293  3e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0158  toluene ABC transporter, ATP-binding protein, putative  58.43 
 
 
276 aa  291  9e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0337  ABC transporter related  58.96 
 
 
274 aa  288  5.0000000000000004e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.425163 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2786  ABC transporter, ATPase subunit  54.89 
 
 
294 aa  288  6e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000312244  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3370  ABC transporter related  56.42 
 
 
274 aa  288  6e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.839994  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0903  hypothetical protein  50.77 
 
 
265 aa  288  7e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2413  ABC transporter related  53.49 
 
 
266 aa  288  7e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.104352 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0872  hypothetical protein  50.38 
 
 
265 aa  286  2.9999999999999996e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3609  ABC transporter related  57.71 
 
 
270 aa  285  5e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3304  ABC transporter-related protein  57.94 
 
 
292 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2887  ABC transporter ATP-binding protein  53.49 
 
 
269 aa  285  7e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.220334  normal  0.384798 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0505  toluene tolerance protein Ttg2A  57.36 
 
 
268 aa  285  8e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.171907  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4233  ABC transporter related  56.25 
 
 
271 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.36582  hitchhiker  0.000301963 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0496  ABC transporter related  56.47 
 
 
273 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00107814  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03658  hypothetical protein  56.59 
 
 
267 aa  282  3.0000000000000004e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4360  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  56.82 
 
 
271 aa  281  7.000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.132306  normal  0.0534611 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3610  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  56.4 
 
 
270 aa  280  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3574  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  56.4 
 
 
270 aa  280  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3503  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  56.4 
 
 
270 aa  280  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.260785  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3672  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  56.4 
 
 
270 aa  280  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0355723 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3650  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  57.31 
 
 
268 aa  280  1e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3505  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  56.4 
 
 
270 aa  280  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0512  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  57.2 
 
 
272 aa  280  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0448  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  57.2 
 
 
272 aa  280  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.885469  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1146  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  57.2 
 
 
272 aa  280  2e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03186  putative transport protein (ABC superfamily, atp-binding)  56.92 
 
 
266 aa  279  3e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002409  ABC transporter ATP-binding protein  56.2 
 
 
267 aa  278  6e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0288  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  57.6 
 
 
270 aa  278  7e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.154418  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>