More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10668 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10668  ribonucleotide transport ATP-binding protein ABC transporter mkl  100 
 
 
359 aa  732    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.139977  normal  0.579373 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1254  ABC transporter-related protein  87.13 
 
 
357 aa  603  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0999833 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0968  ABC transporter related  89.57 
 
 
361 aa  601  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51873  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0986  ABC transporter related  89.57 
 
 
361 aa  601  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.401008 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0996  ABC transporter related  88.65 
 
 
361 aa  596  1e-169  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5099  ABC transporter related  87.5 
 
 
362 aa  592  1e-168  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0528619 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0752  ABC transporter related protein  78.95 
 
 
397 aa  514  1.0000000000000001e-145  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03690  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, ATPase component  71.22 
 
 
378 aa  501  1e-141  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.839011  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1127  ABC transporter related protein  75.08 
 
 
421 aa  499  1e-140  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6635  ABC transporter related  71.47 
 
 
363 aa  469  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1074  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents ATPase component-like protein  70.43 
 
 
333 aa  418  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0700  ABC transporter related  75.67 
 
 
333 aa  416  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4349  ABC transporter related protein  68.38 
 
 
359 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0855  ABC transporter related protein  67.58 
 
 
273 aa  352  5e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.795905 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1621  ABC transporter related protein  50.76 
 
 
363 aa  267  2e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.966929  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0677  ABC transporter related  47.54 
 
 
255 aa  241  2e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0561  ABC transporter related  47.15 
 
 
248 aa  230  3e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000384868  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3182  ABC transporter related  46.31 
 
 
250 aa  224  2e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1040  ABC transporter related  47.15 
 
 
248 aa  223  4e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0853  ABC transporter related  42.75 
 
 
273 aa  217  2e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0785068 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0787  ABC transporter-related protein  45.08 
 
 
248 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2298  ATPase  43.85 
 
 
273 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102276  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1887  ABC transporter related protein  40.74 
 
 
296 aa  215  9.999999999999999e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1862  ABC transporter, ATPase subunit  43.98 
 
 
248 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634035  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1998  ABC transporter-related protein  44.4 
 
 
248 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0816  ABC transporter, ATP-binding protein  44.3 
 
 
248 aa  210  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2083  ABC transporter related  44.4 
 
 
248 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2449  ABC transporter related  43.36 
 
 
268 aa  207  3e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1817  ABC transporter related  42.86 
 
 
274 aa  205  1e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1977  ABC transporter related  43.98 
 
 
248 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.28613  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0979  ABC transporter related  42.21 
 
 
265 aa  202  7e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0379  ABC transporter related  41.53 
 
 
262 aa  202  7e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2343  ABC transporter related protein  45.38 
 
 
252 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2413  ABC transporter related  39.75 
 
 
266 aa  199  9e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.104352 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1173  ABC transporter, ATP-binding protein  40.98 
 
 
264 aa  198  1.0000000000000001e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0015  ABC transporter related  42.04 
 
 
252 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0891779  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3081  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40.24 
 
 
270 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.216025 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1121  ABC transporter related  41.87 
 
 
248 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.418609  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2458  ABC transporter, ATPase subunit  41.87 
 
 
248 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0022  ATPase  42.5 
 
 
256 aa  195  8.000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3484  ABC transporter related  40.08 
 
 
257 aa  196  8.000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1969  ABC transporter, ATP-binding protein  39.75 
 
 
275 aa  194  2e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.309748  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0328  ABC transporter related  40.73 
 
 
249 aa  194  2e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.673492  normal  0.624259 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0407  ABC transporter component  42.04 
 
 
257 aa  194  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5028  ABC transporter ATP-binding protein  40 
 
 
269 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57880  ABC transporter ATP-binding protein  40 
 
 
269 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0401  ABC transporter related  42.21 
 
 
262 aa  194  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186175  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4447  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.18 
 
 
269 aa  192  9e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0448  ABC-type transport system, ATPase component  38.8 
 
 
266 aa  191  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392883  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2380  ABC transporter  42.68 
 
 
257 aa  192  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83089  normal  0.615068 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1066  ABC transporter related  41.87 
 
 
248 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1737  ABC transporter related  42.91 
 
 
245 aa  190  4e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0169856  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2636  ABC transporter related  42.92 
 
 
261 aa  190  4e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2223  ABC transporter related  40.65 
 
 
276 aa  190  4e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.435588  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4141  ABC transporter  38.78 
 
 
269 aa  189  5e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0686  ABC transporter related  40.42 
 
 
270 aa  189  5.999999999999999e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3259  ABC transporter-related protein  40.17 
 
 
283 aa  189  5.999999999999999e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0876  ABC transporter related  39.59 
 
 
269 aa  187  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.930987  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0472  ABC transporter related  39.54 
 
 
293 aa  187  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0139008  hitchhiker  0.0000833455 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4536  ABC transporter, ATP-binding protein  38.52 
 
 
267 aa  187  3e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1013  ABC transporter-related protein  39.75 
 
 
306 aa  187  3e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3304  ABC transporter-related protein  41.39 
 
 
292 aa  186  4e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0863  ABC transporter-like  37.96 
 
 
270 aa  186  5e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.535463  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2596  ABC transporter related protein  41 
 
 
260 aa  186  5e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.256414  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2513  ABC transporter related  40.25 
 
 
259 aa  186  6e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0824022  normal  0.0374707 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2343  ABC transporter related  39.83 
 
 
275 aa  186  6e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00464868 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0281  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  42.62 
 
 
270 aa  186  7e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0958  toluene tolerance ABC efflux transporter, ATP-binding protein  38.78 
 
 
269 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567321  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1719  ABC transporter related  40.74 
 
 
257 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0483086  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3402  ABC transporter related  38.62 
 
 
270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2810  ABC transporter, ATPase subunit  40.74 
 
 
257 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.66283  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1488  ABC transporter related  40.74 
 
 
257 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0288  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  42.62 
 
 
270 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.154418  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3609  ABC transporter related  41.8 
 
 
270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12850  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, ATP binding component  39.18 
 
 
269 aa  185  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3394  ABC transporter-related protein  38.93 
 
 
278 aa  184  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0685  ABC transporter related  38.11 
 
 
293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0793  ABC transporter related  39.38 
 
 
282 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.215167  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03186  putative transport protein (ABC superfamily, atp-binding)  41.8 
 
 
266 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0965  ABC transporter related  38.78 
 
 
269 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1073  ABC transporter related  40.91 
 
 
258 aa  183  3e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1961  ABC transporter related  40.42 
 
 
254 aa  183  3e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.334641  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0716  ABC transporter related  38.93 
 
 
286 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1154  ABC transporter related  38.52 
 
 
286 aa  183  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3370  ABC transporter related  41.39 
 
 
274 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.839994  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0748  ABC transporter related  38.93 
 
 
286 aa  183  5.0000000000000004e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1328  ABC transporter related  40.82 
 
 
256 aa  183  5.0000000000000004e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0917234  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3101  putative ABC transporter ATP-binding subunit  38.52 
 
 
279 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4257  ABC transporter related  38.78 
 
 
269 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2750  ABC-type transport system, ATPase component  40.48 
 
 
265 aa  182  6e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0997  ABC transporter related  38.37 
 
 
269 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2709  ABC transporter related  40.26 
 
 
270 aa  182  6e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1984  ATPase  41.18 
 
 
257 aa  182  7e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.101107  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2844  ABC transporter related  38.4 
 
 
300 aa  182  8.000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5536  ABC transporter related  37.84 
 
 
309 aa  181  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2220  ABC transporter related  40.57 
 
 
283 aa  182  1e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3122  ABC transporter related  38.21 
 
 
273 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.701707  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1611  ABC transporter related  38.93 
 
 
295 aa  181  2e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2726  ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 
272 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3228  ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 
272 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>