More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0686 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0686  ABC transporter related  100 
 
 
270 aa  543  1e-153  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1227  ABC transporter, ATP-binding protein  44.54 
 
 
272 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1743  ABC transporter-related protein  44.54 
 
 
271 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1143  ABC transporter related  42.68 
 
 
276 aa  211  9e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2292  ABC transporter related  43.57 
 
 
279 aa  209  4e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3119  ABC transporter related protein  41.77 
 
 
276 aa  208  8e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0379  ABC transporter related  42.37 
 
 
262 aa  206  5e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0700  ABC transporter related  41.32 
 
 
333 aa  195  5.000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1127  ABC transporter related protein  40.83 
 
 
421 aa  193  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1074  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents ATPase component-like protein  42.92 
 
 
333 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03690  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, ATPase component  40.98 
 
 
378 aa  193  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.839011  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1254  ABC transporter-related protein  40.42 
 
 
357 aa  193  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0999833 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2083  ABC transporter related  42.51 
 
 
248 aa  193  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1998  ABC transporter-related protein  42.51 
 
 
248 aa  193  3e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0677  ABC transporter related  41.49 
 
 
255 aa  192  4e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6635  ABC transporter related  41.25 
 
 
363 aa  192  4e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4349  ABC transporter related protein  42.08 
 
 
359 aa  190  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5099  ABC transporter related  40 
 
 
362 aa  190  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0528619 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0968  ABC transporter related  39.58 
 
 
361 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51873  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0986  ABC transporter related  39.58 
 
 
361 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.401008 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0996  ABC transporter related  40 
 
 
361 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10668  ribonucleotide transport ATP-binding protein ABC transporter mkl  40.42 
 
 
359 aa  189  4e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.139977  normal  0.579373 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0752  ABC transporter related protein  40 
 
 
397 aa  188  7e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2343  ABC transporter related protein  43.04 
 
 
252 aa  188  8e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1862  ABC transporter, ATPase subunit  41.22 
 
 
248 aa  187  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634035  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2449  ABC transporter related  40.16 
 
 
268 aa  186  5e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2596  ABC transporter related protein  40.17 
 
 
260 aa  185  7e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.256414  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0855  ABC transporter related protein  42.04 
 
 
273 aa  185  9e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.795905 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3704  ABC transporter related  38.49 
 
 
265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.307132  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3081  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40.74 
 
 
270 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.216025 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1977  ABC transporter related  40.66 
 
 
248 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.28613  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3101  putative ABC transporter ATP-binding subunit  39.08 
 
 
279 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0706  ABC transporter related protein  41.42 
 
 
258 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613257  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0160  ABC transporter related  42.8 
 
 
272 aa  181  1e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.609677 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0401  ABC transporter related  40.59 
 
 
262 aa  180  2.9999999999999997e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186175  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0448  ABC-type transport system, ATPase component  38.52 
 
 
266 aa  179  4e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392883  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1739  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.33 
 
 
355 aa  179  4e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4587  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.33 
 
 
375 aa  179  4.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1887  ABC transporter related protein  41.08 
 
 
296 aa  178  8e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1349  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  39.42 
 
 
343 aa  177  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1680  sulphate transport system permease protein 1  38.91 
 
 
338 aa  177  1e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.070095  normal  0.46795 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3182  ABC transporter related  40.08 
 
 
250 aa  177  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3315  ABC transporter related  38.91 
 
 
258 aa  177  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000690504 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2335  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  38.91 
 
 
375 aa  176  3e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1522  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  38.91 
 
 
375 aa  176  3e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.164669  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1903  sulphate transport system permease protein 1  38.49 
 
 
343 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000843013  hitchhiker  0.000000000000895278 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2909  ABC transporter component  41.32 
 
 
277 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.321315  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0964  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  38.66 
 
 
369 aa  174  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0793  ABC transporter related  41.13 
 
 
282 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.215167  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1347  sulfate transport ATP-binding ABC transporter protein  39.13 
 
 
372 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0328  ABC transporter related  37.5 
 
 
249 aa  173  2.9999999999999996e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.673492  normal  0.624259 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1759  sulphate transport system permease protein 1  38.49 
 
 
367 aa  172  5e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1286  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  38.34 
 
 
369 aa  172  7.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.245798  normal  0.231745 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2073  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  38.13 
 
 
374 aa  172  7.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.603613  hitchhiker  7.48501e-17 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0126  ABC type ATPase  38.15 
 
 
352 aa  171  1e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228603 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5048  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  37.97 
 
 
338 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1546  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  37.8 
 
 
362 aa  171  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1223  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  37.94 
 
 
369 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.243512  normal  0.134553 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0479  ATPase  37.5 
 
 
244 aa  171  2e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.119209  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2886  ABC transporter, ATPase subunit  38.25 
 
 
275 aa  171  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.21978  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1154  ABC transporter related  37.45 
 
 
286 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  37.92 
 
 
244 aa  171  2e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0472  ABC transporter related  36.1 
 
 
293 aa  170  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0139008  hitchhiker  0.0000833455 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1968  sulphate transport system permease protein 1  38.8 
 
 
378 aa  170  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0503  sulphate transport system permease protein 1  35.86 
 
 
360 aa  170  3e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2548  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  37.66 
 
 
374 aa  170  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.469643  normal  0.012535 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2002  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.91 
 
 
341 aa  169  4e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2958  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  37.24 
 
 
365 aa  169  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1013  ABC transporter-related protein  37.01 
 
 
306 aa  169  4e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0622  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  40.17 
 
 
365 aa  169  4e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4315  ABC transporter related  39.13 
 
 
259 aa  169  4e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.696843  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0441  ATPase  37.08 
 
 
244 aa  169  6e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2379  sulphate transport system permease protein 1  37.01 
 
 
362 aa  169  6e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3313  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.37 
 
 
502 aa  169  6e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.571004  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1817  ABC transporter related  38.62 
 
 
274 aa  168  7e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1370  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  37.66 
 
 
373 aa  168  8e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1633  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  38.08 
 
 
353 aa  168  9e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1181  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein CysA  36.82 
 
 
348 aa  167  1e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.36202  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4911  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.84 
 
 
336 aa  167  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.181215 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1759  ABC transporter related  38.08 
 
 
353 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.483638  normal  0.015539 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2413  ABC transporter related  36.93 
 
 
266 aa  167  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.104352 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0561  ABC transporter related  36.1 
 
 
248 aa  168  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000384868  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1626  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  38.08 
 
 
352 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.220073  normal  0.514504 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1349  ABC transporter related  36.21 
 
 
248 aa  167  2e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0787  ABC transporter-related protein  37.5 
 
 
248 aa  167  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5159  ABC transporter related protein  37.08 
 
 
248 aa  167  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.364497 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3891  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  37.24 
 
 
356 aa  167  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.540067  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1738  ABC transporter related  36.67 
 
 
244 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1811  ABC transporter related protein  38.08 
 
 
251 aa  166  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3370  ABC transporter related  39.66 
 
 
274 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.839994  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1581  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  38.08 
 
 
352 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254371  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3963  ABC transporter related  37.39 
 
 
248 aa  166  4e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764757  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2534  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  34.87 
 
 
354 aa  166  4e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0417932  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1124  sulphate transport system permease protein 1  38.08 
 
 
352 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1604  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  38.08 
 
 
352 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.96838  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2397  ABC transporter related  37.87 
 
 
277 aa  166  5e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1008  ABC transporter related  36.52 
 
 
397 aa  166  5e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00677316  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4007  sulphate transport system permease protein 1  37.01 
 
 
349 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.451546 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1378  sulphate transport system permease protein 1  38 
 
 
367 aa  166  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.747382  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3402  ABC transporter related  36.63 
 
 
270 aa  165  5.9999999999999996e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>