More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1127 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1127  ABC transporter related protein  100 
 
 		 421 aa  860    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5099  ABC transporter related  75.38 
 
 		 362 aa  501  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0528619 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0986  ABC transporter related  70.57 
 
 		 361 aa  499  1e-140  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.401008 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0752  ABC transporter related protein  68.96 
 
 		 397 aa  498  1e-140  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0968  ABC transporter related  70.57 
 
 		 361 aa  499  1e-140  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51873  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10668  ribonucleotide transport ATP-binding protein ABC transporter mkl  75.08 
 
 		 359 aa  499  1e-140  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.139977  normal  0.579373 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0996  ABC transporter related  70 
 
 		 361 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1254  ABC transporter-related protein  73.85 
 
 		 357 aa  496  1e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0999833 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03690  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, ATPase component  69.3 
 
 		 378 aa  476  1e-133  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.839011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6635  ABC transporter related  69.49 
 
 		 363 aa  473  1e-132  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0700  ABC transporter related  76.47 
 
 		 333 aa  420  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1074  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents ATPase component-like protein  70.59 
 
 		 333 aa  414  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4349  ABC transporter related protein  66.32 
 
 		 359 aa  396  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0855  ABC transporter related protein  64.34 
 
 		 273 aa  360  2e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.795905 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1621  ABC transporter related protein  51 
 
 		 363 aa  272  1e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.966929  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0677  ABC transporter related  45.49 
 
 		 255 aa  236  6e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0561  ABC transporter related  45.93 
 
 		 248 aa  231  2e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000384868  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1040  ABC transporter related  45.53 
 
 		 248 aa  229  8e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3182  ABC transporter related  45.9 
 
 		 250 aa  228  1e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0787  ABC transporter-related protein  44.67 
 
 		 248 aa  219  5e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0816  ABC transporter, ATP-binding protein  42.21 
 
 		 248 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0853  ABC transporter related  43.75 
 
 		 273 aa  211  1e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0785068 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2449  ABC transporter related  41.96 
 
 		 268 aa  210  3e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1173  ABC transporter, ATP-binding protein  40.62 
 
 		 264 aa  206  5e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2298  ATPase  41.47 
 
 		 273 aa  206  7e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102276  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1887  ABC transporter related protein  40.76 
 
 		 296 aa  205  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2343  ABC transporter related protein  42.74 
 
 		 252 aa  205  1e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0379  ABC transporter related  41.13 
 
 		 262 aa  205  1e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2413  ABC transporter related  38.93 
 
 		 266 aa  204  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.104352 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0979  ABC transporter related  41.2 
 
 		 265 aa  202  6e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1013  ABC transporter-related protein  41.8 
 
 		 306 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3394  ABC transporter-related protein  40.98 
 
 		 278 aa  201  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3081  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40.24 
 
 		 270 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.216025 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1969  ABC transporter, ATP-binding protein  39.75 
 
 		 275 aa  201  3e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.309748  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1817  ABC transporter related  41.6 
 
 		 274 aa  200  5e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4536  ABC transporter, ATP-binding protein  40.16 
 
 		 267 aa  199  7e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1862  ABC transporter, ATPase subunit  41.32 
 
 		 248 aa  199  9e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634035  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0716  ABC transporter related  40.57 
 
 		 286 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3259  ABC transporter-related protein  38.62 
 
 		 283 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0748  ABC transporter related  40.57 
 
 		 286 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0401  ABC transporter related  41.39 
 
 		 262 aa  198  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186175  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2083  ABC transporter related  41.32 
 
 		 248 aa  197  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1998  ABC transporter-related protein  41.32 
 
 		 248 aa  197  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0448  ABC-type transport system, ATPase component  37.94 
 
 		 266 aa  196  5.000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392883  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0328  ABC transporter related  39.11 
 
 		 249 aa  196  7e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.673492  normal  0.624259 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5536  ABC transporter related  41.41 
 
 		 309 aa  196  8.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3101  putative ABC transporter ATP-binding subunit  39.75 
 
 		 279 aa  195  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1738  ABC transporter related  41.77 
 
 		 244 aa  194  2e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0793  ABC transporter related  41.95 
 
 		 282 aa  194  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.215167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1977  ABC transporter related  41.74 
 
 		 248 aa  194  3e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.28613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0686  ABC transporter related  40.83 
 
 		 270 aa  193  4e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2596  ABC transporter related protein  40.08 
 
 		 260 aa  193  4e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.256414  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3609  ABC transporter related  42.62 
 
 		 270 aa  193  5e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4447  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.3 
 
 		 269 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12850  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, ATP binding component  39.75 
 
 		 269 aa  192  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3402  ABC transporter related  39.02 
 
 		 270 aa  192  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1154  ABC transporter related  40.16 
 
 		 286 aa  192  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0022  ATPase  39.24 
 
 		 256 aa  192  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2397  ABC transporter related  40.17 
 
 		 277 aa  192  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1121  ABC transporter related  40.65 
 
 		 248 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.418609  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2458  ABC transporter, ATPase subunit  40.65 
 
 		 248 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0888  ABC transporter related  40.16 
 
 		 273 aa  191  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00820574  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3304  ABC transporter-related protein  40.57 
 
 		 292 aa  191  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3484  ABC transporter related  38.71 
 
 		 257 aa  191  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2223  ABC transporter related  39.43 
 
 		 276 aa  191  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.435588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0479  ATPase  39.66 
 
 		 244 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.119209  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2935  ABC transporter related  38.11 
 
 		 271 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0958  toluene tolerance ABC efflux transporter, ATP-binding protein  38.52 
 
 		 269 aa  190  5e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3122  ABC transporter related  38.62 
 
 		 273 aa  189  7e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.701707  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0685  ABC transporter related  37.98 
 
 		 293 aa  189  7e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0662  ABC transporter related  40.51 
 
 		 244 aa  189  8e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03186  putative transport protein (ABC superfamily, atp-binding)  43.44 
 
 		 266 aa  189  8e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0965  ABC transporter related  38.52 
 
 		 269 aa  189  9e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2343  ABC transporter related  39.42 
 
 		 275 aa  189  9e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464868 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4141  ABC transporter  36.89 
 
 		 269 aa  189  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1066  ABC transporter related  40.65 
 
 		 248 aa  189  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2380  ABC transporter  40.24 
 
 		 257 aa  188  1e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83089  normal  0.615068 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2709  ABC transporter related  37.7 
 
 		 270 aa  189  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1695  ABC transporter related  38.82 
 
 		 244 aa  188  1e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002409  ABC transporter ATP-binding protein  42.21 
 
 		 267 aa  189  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4257  ABC transporter related  38.52 
 
 		 269 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0863  ABC transporter-like  38.46 
 
 		 270 aa  188  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.535463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0997  ABC transporter related  38.11 
 
 		 269 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5028  ABC transporter ATP-binding protein  38.52 
 
 		 269 aa  187  4e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03658  hypothetical protein  40.98 
 
 		 267 aa  187  4e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07670  ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 		 254 aa  187  4e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0821592  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57880  ABC transporter ATP-binding protein  38.52 
 
 		 269 aa  187  4e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3662  ABC transporter related  38.58 
 
 		 279 aa  186  5e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0392823  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0876  ABC transporter related  39.32 
 
 		 269 aa  186  5e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.930987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3370  ABC transporter related  40.98 
 
 		 274 aa  186  5e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.839994  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0737  ABC transporter related  36.54 
 
 		 261 aa  186  6e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0015  ABC transporter related  38.62 
 
 		 252 aa  186  7e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0891779  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2893  ABC transporter related  39.02 
 
 		 277 aa  186  8e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.267676 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3240  ABC transporter related  39.02 
 
 		 277 aa  186  8e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.738413  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0281  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  41.39 
 
 		 270 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0441  ATPase  39.24 
 
 		 244 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3004  ABC transporter, ATP-binding protein  39.57 
 
 		 272 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2887  ABC transporter ATP-binding protein  35.69 
 
 		 269 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.220334  normal  0.384798 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0692  ABC transporter related  39.75 
 
 		 277 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2786  ABC transporter, ATPase subunit  39.75 
 
 		 294 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000312244  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>