More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4349 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4349  ABC transporter related protein  100 
 
 
359 aa  713    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1074  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents ATPase component-like protein  81.4 
 
 
333 aa  547  1e-155  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0700  ABC transporter related  75.4 
 
 
333 aa  461  9.999999999999999e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6635  ABC transporter related  78.63 
 
 
363 aa  419  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03690  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, ATPase component  70 
 
 
378 aa  416  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.839011  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5099  ABC transporter related  61.95 
 
 
362 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0528619 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0752  ABC transporter related protein  68.97 
 
 
397 aa  404  1e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0996  ABC transporter related  67.7 
 
 
361 aa  401  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1254  ABC transporter-related protein  67.7 
 
 
357 aa  402  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0999833 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0986  ABC transporter related  67.7 
 
 
361 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.401008 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0968  ABC transporter related  67.7 
 
 
361 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51873  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10668  ribonucleotide transport ATP-binding protein ABC transporter mkl  68.38 
 
 
359 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.139977  normal  0.579373 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1127  ABC transporter related protein  66.32 
 
 
421 aa  396  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0855  ABC transporter related protein  66.67 
 
 
273 aa  355  8.999999999999999e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.795905 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1621  ABC transporter related protein  54.58 
 
 
363 aa  270  4e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.966929  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0677  ABC transporter related  46.15 
 
 
255 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0561  ABC transporter related  45.93 
 
 
248 aa  223  3e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000384868  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0401  ABC transporter related  48.77 
 
 
262 aa  219  3.9999999999999997e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186175  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0853  ABC transporter related  44.86 
 
 
273 aa  216  4e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0785068 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1040  ABC transporter related  44.31 
 
 
248 aa  216  7e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3182  ABC transporter related  44.26 
 
 
250 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0787  ABC transporter-related protein  44.67 
 
 
248 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0816  ABC transporter, ATP-binding protein  42.62 
 
 
248 aa  212  7.999999999999999e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2343  ABC transporter related protein  46.64 
 
 
252 aa  211  1e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1887  ABC transporter related protein  40.7 
 
 
296 aa  211  1e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4536  ABC transporter, ATP-binding protein  40.98 
 
 
267 aa  210  3e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3081  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  42.68 
 
 
270 aa  208  1e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.216025 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2449  ABC transporter related  43.44 
 
 
268 aa  207  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2298  ATPase  42.86 
 
 
273 aa  205  8e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102276  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1817  ABC transporter related  43.1 
 
 
274 aa  203  3e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2083  ABC transporter related  43.21 
 
 
248 aa  203  4e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1998  ABC transporter-related protein  43.21 
 
 
248 aa  203  4e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2413  ABC transporter related  41.39 
 
 
266 aa  202  6e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.104352 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1862  ABC transporter, ATPase subunit  43.62 
 
 
248 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634035  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0379  ABC transporter related  39.92 
 
 
262 aa  199  6e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0022  ATPase  40.42 
 
 
256 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1173  ABC transporter, ATP-binding protein  39.34 
 
 
264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5028  ABC transporter ATP-binding protein  40.16 
 
 
269 aa  197  3e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57880  ABC transporter ATP-binding protein  40.16 
 
 
269 aa  197  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0979  ABC transporter related  40.8 
 
 
265 aa  195  8.000000000000001e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0328  ABC transporter related  40.32 
 
 
249 aa  195  9e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.673492  normal  0.624259 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0958  toluene tolerance ABC efflux transporter, ATP-binding protein  39.34 
 
 
269 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567321  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0997  ABC transporter related  39.75 
 
 
269 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1977  ABC transporter related  42.98 
 
 
248 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.28613  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0015  ABC transporter related  42.28 
 
 
252 aa  194  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0891779  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4141  ABC transporter  39.34 
 
 
269 aa  193  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0863  ABC transporter-like  39.34 
 
 
270 aa  193  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.535463  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0965  ABC transporter related  39.34 
 
 
269 aa  193  4e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0448  ABC-type transport system, ATPase component  40.94 
 
 
266 aa  192  6e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392883  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4257  ABC transporter related  39.34 
 
 
269 aa  192  8e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3402  ABC transporter related  39.34 
 
 
270 aa  191  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4447  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.34 
 
 
269 aa  190  4e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0281  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  42.68 
 
 
270 aa  189  5e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0686  ABC transporter related  42.08 
 
 
270 aa  189  5e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0288  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  42.28 
 
 
270 aa  189  5.999999999999999e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.154418  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1013  ABC transporter-related protein  40.24 
 
 
306 aa  189  7e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12850  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, ATP binding component  39.34 
 
 
269 aa  189  7e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1969  ABC transporter, ATP-binding protein  39.75 
 
 
275 aa  189  9e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.309748  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0876  ABC transporter related  40.16 
 
 
269 aa  189  9e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.930987  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3315  ABC transporter related  44.17 
 
 
258 aa  189  9e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000690504 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3672  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  40.98 
 
 
270 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0355723 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3503  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  40.98 
 
 
270 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.260785  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3505  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  40.98 
 
 
270 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3484  ABC transporter related  39.52 
 
 
257 aa  188  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3574  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  40.98 
 
 
270 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3610  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  40.98 
 
 
270 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0872  hypothetical protein  37.7 
 
 
265 aa  187  2e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3101  putative ABC transporter ATP-binding subunit  38.93 
 
 
279 aa  187  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002409  ABC transporter ATP-binding protein  40.93 
 
 
267 aa  187  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0793  ABC transporter related  40.25 
 
 
282 aa  187  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.215167  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2513  ABC transporter related  41.91 
 
 
259 aa  187  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0824022  normal  0.0374707 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03186  putative transport protein (ABC superfamily, atp-binding)  40.98 
 
 
266 aa  187  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0472  ABC transporter related  42.79 
 
 
293 aa  187  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0139008  hitchhiker  0.0000833455 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0903  hypothetical protein  37.7 
 
 
265 aa  187  3e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2397  ABC transporter related  39.33 
 
 
277 aa  186  4e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0505  toluene tolerance protein Ttg2A  42.28 
 
 
268 aa  186  6e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.171907  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0716  ABC transporter related  39.02 
 
 
286 aa  186  7e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1073  ABC transporter related  38.43 
 
 
258 aa  186  8e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3304  ABC transporter-related protein  41.8 
 
 
292 aa  186  8e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0748  ABC transporter related  39.02 
 
 
286 aa  186  8e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03060  predicted toluene transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  41.06 
 
 
269 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0889868  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0512  ABC transporter related protein  41.06 
 
 
269 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.648269  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4517  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  41.06 
 
 
269 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.257918  normal  0.710569 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3575  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  41.06 
 
 
269 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.637891  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03658  hypothetical protein  39.77 
 
 
267 aa  185  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2458  ABC transporter, ATPase subunit  40.65 
 
 
248 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03011  hypothetical protein  41.06 
 
 
269 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.086936  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3683  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  41.06 
 
 
269 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00651992  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3388  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  41.06 
 
 
269 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0514753  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3631  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  40.98 
 
 
270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.135716 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1121  ABC transporter related  40.65 
 
 
248 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.418609  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0505  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  41.06 
 
 
269 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.179528 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2102  ABC transporter, ATP-binding protein  41.8 
 
 
267 aa  185  1.0000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0679  ABC transporter related  40.65 
 
 
272 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.962432 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3491  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  41.06 
 
 
269 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2596  ABC transporter related protein  40.08 
 
 
260 aa  185  1.0000000000000001e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.256414  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2935  ABC transporter related  37.31 
 
 
271 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3259  ABC transporter-related protein  36.59 
 
 
283 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3343  ABC transporter related  40.65 
 
 
272 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.279252 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0386  ABC transporter related protein  38.78 
 
 
277 aa  184  3e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.232819 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>