More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0561 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0561  ABC transporter related  100 
 
 
248 aa  496  1e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000384868  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0816  ABC transporter, ATP-binding protein  72.58 
 
 
248 aa  377  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3182  ABC transporter related  73.17 
 
 
250 aa  378  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0787  ABC transporter-related protein  71.77 
 
 
248 aa  375  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1040  ABC transporter related  73.79 
 
 
248 aa  372  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0677  ABC transporter related  56.68 
 
 
255 aa  280  1e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1887  ABC transporter related protein  49.79 
 
 
296 aa  243  1.9999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1621  ABC transporter related protein  48.37 
 
 
363 aa  243  1.9999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.966929  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2596  ABC transporter related protein  48.1 
 
 
260 aa  239  2e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.256414  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0448  ABC-type transport system, ATPase component  47.95 
 
 
266 aa  238  5.999999999999999e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392883  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2343  ABC transporter related protein  50.21 
 
 
252 aa  238  8e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2083  ABC transporter related  49.17 
 
 
248 aa  235  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1998  ABC transporter-related protein  49.17 
 
 
248 aa  235  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1862  ABC transporter, ATPase subunit  49.17 
 
 
248 aa  234  9e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634035  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0407  ABC transporter component  48.37 
 
 
257 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0752  ABC transporter related protein  47.11 
 
 
397 aa  231  7.000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1127  ABC transporter related protein  45.93 
 
 
421 aa  231  9e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10668  ribonucleotide transport ATP-binding protein ABC transporter mkl  47.15 
 
 
359 aa  230  2e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.139977  normal  0.579373 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03690  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, ATPase component  47.15 
 
 
378 aa  229  2e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.839011  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3484  ABC transporter related  48.58 
 
 
257 aa  229  3e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0700  ABC transporter related  46.75 
 
 
333 aa  229  3e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1328  ABC transporter related  48.16 
 
 
256 aa  228  5e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0917234  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2449  ABC transporter related  45.75 
 
 
268 aa  228  7e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0996  ABC transporter related  45.93 
 
 
361 aa  228  8e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0401  ABC transporter related  46.53 
 
 
262 aa  228  9e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186175  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1977  ABC transporter related  47.52 
 
 
248 aa  226  3e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.28613  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6635  ABC transporter related  47.28 
 
 
363 aa  225  4e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1254  ABC transporter-related protein  45.53 
 
 
357 aa  224  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0999833 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4349  ABC transporter related protein  45.93 
 
 
359 aa  224  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0986  ABC transporter related  45.93 
 
 
361 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.401008 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0968  ABC transporter related  45.93 
 
 
361 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51873  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5099  ABC transporter related  45.12 
 
 
362 aa  222  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0528619 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1066  ABC transporter related  48.79 
 
 
248 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0015  ABC transporter related  47.15 
 
 
252 aa  217  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0891779  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2380  ABC transporter  48.4 
 
 
257 aa  217  2e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83089  normal  0.615068 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2413  ABC transporter related  43.44 
 
 
266 aa  216  2.9999999999999998e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.104352 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0855  ABC transporter related protein  42.51 
 
 
273 aa  216  2.9999999999999998e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.795905 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1781  ABC transporter related  49 
 
 
252 aa  216  4e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.122728 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0979  ABC transporter related  45.31 
 
 
265 aa  215  5.9999999999999996e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0706  ABC transporter related protein  44.92 
 
 
258 aa  214  7e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613257  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0328  ABC transporter related  43.15 
 
 
249 aa  214  8e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.673492  normal  0.624259 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1851  ABC transporter related  46.03 
 
 
263 aa  214  9.999999999999999e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002409  ABC transporter ATP-binding protein  45.71 
 
 
267 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1074  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents ATPase component-like protein  43.93 
 
 
333 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2709  ABC transporter related  43.85 
 
 
270 aa  213  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1008  ABC transporter related  44.77 
 
 
397 aa  212  3.9999999999999995e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00677316  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1121  ABC transporter related  47.98 
 
 
248 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.418609  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2458  ABC transporter, ATPase subunit  47.98 
 
 
248 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03658  hypothetical protein  44.9 
 
 
267 aa  211  1e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1578  ABC transporter related  45.56 
 
 
260 aa  210  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.292703 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0379  ABC transporter related  43.44 
 
 
262 aa  208  5e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0479  ATPase  44.54 
 
 
244 aa  208  7e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.119209  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0662  ABC transporter related  44.54 
 
 
244 aa  208  7e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4536  ABC transporter, ATP-binding protein  43.67 
 
 
267 aa  206  3e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0337  ABC transporter related  44.9 
 
 
274 aa  206  3e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.425163 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0158  toluene ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.9 
 
 
276 aa  206  3e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1738  ABC transporter related  44.12 
 
 
244 aa  206  3e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3402  ABC transporter related  41.46 
 
 
270 aa  204  9e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2223  ABC transporter related  42.45 
 
 
276 aa  203  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.435588  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2253  ABC transporter related  42.02 
 
 
244 aa  202  3e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.491715  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2786  ABC transporter, ATPase subunit  42.45 
 
 
294 aa  202  3e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000312244  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0888  ABC transporter related  43.27 
 
 
273 aa  202  4e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00820574  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0160  ABC transporter related  42.26 
 
 
272 aa  201  6e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.609677 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0958  toluene tolerance ABC efflux transporter, ATP-binding protein  42.62 
 
 
269 aa  201  8e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567321  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1969  ABC transporter, ATP-binding protein  44.21 
 
 
275 aa  201  8e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.309748  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0997  ABC transporter related  42.62 
 
 
269 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0441  ATPase  42.44 
 
 
244 aa  200  9.999999999999999e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4315  ABC transporter related  44.96 
 
 
259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.696843  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2102  ABC transporter, ATP-binding protein  44.08 
 
 
267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3081  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  42.04 
 
 
270 aa  199  3e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.216025 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0386  ABC transporter related protein  42.21 
 
 
277 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0965  ABC transporter related  42.21 
 
 
269 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1695  ABC transporter related  42.86 
 
 
244 aa  199  3.9999999999999996e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0793  ABC transporter related  44.3 
 
 
282 aa  199  5e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.215167  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1872  ABC transporter-related protein  42.86 
 
 
244 aa  198  7e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00971328 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4257  ABC transporter related  42.21 
 
 
269 aa  198  9e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0505  toluene tolerance protein Ttg2A  45.31 
 
 
268 aa  197  1.0000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.171907  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0863  ABC transporter-like  41.39 
 
 
270 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.535463  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2935  ABC transporter related  41.06 
 
 
271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1811  ABC transporter related protein  44.35 
 
 
251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4447  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40.98 
 
 
269 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3442  ABC transporter related protein  41.46 
 
 
246 aa  196  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.0228809 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0903  hypothetical protein  41.56 
 
 
265 aa  196  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0872  hypothetical protein  41.56 
 
 
265 aa  196  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4141  ABC transporter  40.98 
 
 
269 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2673  ABC transporter-like  42.41 
 
 
260 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2749  ABC transporter related  41.06 
 
 
270 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5028  ABC transporter ATP-binding protein  40.98 
 
 
269 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3394  ABC transporter-related protein  40.65 
 
 
278 aa  196  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57880  ABC transporter ATP-binding protein  40.98 
 
 
269 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2869  ABC transporter related  44.13 
 
 
261 aa  196  3e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0393  ABC transporter related  42.51 
 
 
273 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.261527  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1900  ABC transporter ATPase  42.45 
 
 
270 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.81319  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3512  ABC transporter, ATPase subunit  42.51 
 
 
273 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.317493  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2693  ABC transporter related  42.51 
 
 
273 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.663262  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0414  ABC transporter related  42.51 
 
 
273 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192398  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0317  ABC transporter related  42.28 
 
 
273 aa  195  7e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0527891  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0022  ATPase  43.22 
 
 
256 aa  194  9e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5159  ABC transporter related protein  41.67 
 
 
248 aa  194  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.364497 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1737  ABC transporter related  42.97 
 
 
245 aa  194  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0169856  normal  0.620791 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>