More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2380 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2380  ABC transporter  100 
 
 		 257 aa  509  1e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83089  normal  0.615068 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1781  ABC transporter related  84.74 
 
 		 252 aa  423  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.122728 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1066  ABC transporter related  79.03 
 
 		 248 aa  404  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1121  ABC transporter related  78.63 
 
 		 248 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.418609  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2458  ABC transporter, ATPase subunit  78.63 
 
 		 248 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1737  ABC transporter related  69.08 
 
 		 245 aa  345  4e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0169856  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3484  ABC transporter related  65.18 
 
 		 257 aa  325  5e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0407  ABC transporter component  64.73 
 
 		 257 aa  322  5e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3691  ABC transporter related  62.5 
 
 		 245 aa  295  5e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.896312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0015  ABC transporter related  61.94 
 
 		 252 aa  288  7e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0891779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1328  ABC transporter related  55.24 
 
 		 256 aa  280  2e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0917234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1578  ABC transporter related  55 
 
 		 260 aa  273  3e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.292703 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1851  ABC transporter related  54.86 
 
 		 263 aa  266  2.9999999999999995e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2869  ABC transporter related  56.57 
 
 		 261 aa  251  9.000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0677  ABC transporter related  49.42 
 
 		 255 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0328  ABC transporter related  45.78 
 
 		 249 aa  229  3e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.673492  normal  0.624259 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2596  ABC transporter related protein  47.93 
 
 		 260 aa  226  3e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.256414  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0997  ABC transporter-like protein protein  47.29 
 
 		 260 aa  223  2e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0883738  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0990  ABC transporter, ATP-binding protein  45.57 
 
 		 233 aa  222  4e-57  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.491255  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3808  ABC transporter related  46.69 
 
 		 262 aa  217  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.140241  normal  0.926814 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0561  ABC transporter related  48.4 
 
 		 248 aa  217  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000384868  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0379  ABC transporter related  44.58 
 
 		 262 aa  216  2e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2673  ABC transporter-like  46.12 
 
 		 260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0816  ABC transporter, ATP-binding protein  46.4 
 
 		 248 aa  212  4.9999999999999996e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0085  ABC transporter, ATP-binding protein  45.34 
 
 		 238 aa  211  1e-53  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0051  ABC transporter  45.34 
 
 		 238 aa  210  2e-53  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0787  ABC transporter-related protein  45.6 
 
 		 248 aa  208  6e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3036  ABC transporter related  44.06 
 
 		 261 aa  208  8e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.845975 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5159  ABC transporter related protein  45.87 
 
 		 248 aa  207  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.364497 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0531  ABC transporter related  44.19 
 
 		 261 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  hitchhiker  0.00910021 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0514  ABC transporter related  44.19 
 
 		 261 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2449  ABC transporter related  45.56 
 
 		 268 aa  207  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1040  ABC transporter related  46.61 
 
 		 248 aa  207  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1977  ABC transporter related  43.8 
 
 		 248 aa  206  4e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.28613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1811  ABC transporter related protein  43.5 
 
 		 251 aa  204  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2164  ABC transporter related  43.8 
 
 		 261 aa  204  1e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3182  ABC transporter related  44.18 
 
 		 250 aa  203  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1862  ABC transporter, ATPase subunit  43.8 
 
 		 248 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634035  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1621  ABC transporter related protein  45.12 
 
 		 363 aa  203  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.966929  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2343  ABC transporter related protein  45.04 
 
 		 252 aa  201  6e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2806  ABC transporter related  46.22 
 
 		 257 aa  201  7e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1998  ABC transporter-related protein  42.98 
 
 		 248 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2083  ABC transporter related  42.98 
 
 		 248 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3963  ABC transporter related  44.58 
 
 		 248 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0706  ABC transporter related protein  44.31 
 
 		 258 aa  198  6e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613257  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5556  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.86 
 
 		 264 aa  198  9e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.50977 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1637  ABC transporter related  44.44 
 
 		 256 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.967279 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1628  ABC transporter related  44.03 
 
 		 256 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.387649 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2985  ABC-type organic solvent transporter, ATP-binding protein  42.68 
 
 		 257 aa  194  2e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.444132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1498  ABC transporter related  43.39 
 
 		 256 aa  193  3e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2065  ABC transporter related protein  49.12 
 
 		 273 aa  193  3e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4484  ABC transporter related  43.21 
 
 		 257 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0700  ABC transporter related  40.65 
 
 		 333 aa  192  5e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1887  ABC transporter related protein  43.27 
 
 		 296 aa  192  5e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10668  ribonucleotide transport ATP-binding protein ABC transporter mkl  42.68 
 
 		 359 aa  192  6e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.139977  normal  0.579373 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1008  ABC transporter related  41.46 
 
 		 397 aa  191  9e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00677316  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2223  ABC transporter related  41.02 
 
 		 276 aa  191  9e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.435588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2585  ABC transporter related  41.09 
 
 		 259 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0796  ABC transporter related  41.18 
 
 		 255 aa  191  1e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4315  ABC transporter related  42.08 
 
 		 259 aa  190  2e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.696843  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0888  ABC transporter related  41.83 
 
 		 273 aa  190  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00820574  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0387  ABC transporter, ATPase subunit, toluene tolerance Ttg2A-like  40.94 
 
 		 273 aa  190  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3571  ABC transporter related  41.34 
 
 		 273 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626203  hitchhiker  0.0000199293 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1453  ABC transporter related  43.98 
 
 		 257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.329666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03690  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, ATPase component  41.8 
 
 		 378 aa  189  5e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.839011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1316  ABC transporter related  43.39 
 
 		 256 aa  189  5e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0189  ABC transporter related  44.58 
 
 		 254 aa  189  5e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0746681  normal  0.958869 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1127  ABC transporter related protein  40.24 
 
 		 421 aa  188  7e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3442  ABC transporter related protein  43.6 
 
 		 246 aa  188  8e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.0228809 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0248  ABC transporter, ATP-binding protein  42.32 
 
 		 255 aa  187  1e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0450  ABC transporter related  40.91 
 
 		 254 aa  187  1e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1349  ABC transporter related  38.84 
 
 		 248 aa  187  1e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1212  ABC transporter related  42.45 
 
 		 267 aa  186  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00512006  hitchhiker  0.000000000503976 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2343  ABC transporter related  42 
 
 		 275 aa  185  5e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464868 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2513  ABC transporter related  40.4 
 
 		 259 aa  185  6e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0824022  normal  0.0374707 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2220  ABC transporter related  42.19 
 
 		 283 aa  185  8e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3101  putative ABC transporter ATP-binding subunit  41.43 
 
 		 279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4114  ABC transporter related  39.61 
 
 		 268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0512527  normal  0.918883 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0996  ABC transporter related  39.43 
 
 		 361 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3462  ABC transporter related  39.75 
 
 		 250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0534254 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0341  ABC transporter related  41.18 
 
 		 273 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.444988 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0448  ABC-type transport system, ATPase component  42.28 
 
 		 266 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392883  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0752  ABC transporter related protein  39.02 
 
 		 397 aa  183  2.0000000000000003e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0332  ABC transporter related  41.18 
 
 		 273 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07670  ABC transporter, ATP-binding protein  38.52 
 
 		 254 aa  182  3e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0821592  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0393  ABC transporter related  41.57 
 
 		 273 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.261527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3512  ABC transporter, ATPase subunit  41.57 
 
 		 273 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.317493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5099  ABC transporter related  39.84 
 
 		 362 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0528619 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0698  ABC transporter, ATP-binding protein  39.5 
 
 		 242 aa  182  4.0000000000000006e-45  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2693  ABC transporter related  41.57 
 
 		 273 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.663262  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0414  ABC transporter related  41.57 
 
 		 273 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192398  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1254  ABC transporter-related protein  39.84 
 
 		 357 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0999833 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3394  ABC transporter-related protein  40.39 
 
 		 278 aa  182  5.0000000000000004e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2770  ABC transporter related  40.32 
 
 		 273 aa  182  6e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.719655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0350  ATPase  41.57 
 
 		 292 aa  181  7e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22670  putative ATP-binding component of ABC transporter  40.41 
 
 		 264 aa  181  7e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420242 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1074  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents ATPase component-like protein  39.75 
 
 		 333 aa  181  8.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0986  ABC transporter related  39.84 
 
 		 361 aa  181  9.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.401008 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0968  ABC transporter related  39.84 
 
 		 361 aa  181  9.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51873  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3735  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein  41.13 
 
 		 272 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.527515  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>