More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1498 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1498  ABC transporter related  100 
 
 		 256 aa  525  1e-148  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0450  ABC transporter related  71.31 
 
 		 254 aa  372  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07670  ABC transporter, ATP-binding protein  71.43 
 
 		 254 aa  365  1e-100  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0821592  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2195  ABC transporter, ATP-binding protein  55.87 
 
 		 248 aa  291  7e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00836348 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3462  ABC transporter related  55.6 
 
 		 250 aa  288  4e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0534254 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3963  ABC transporter related  54.44 
 
 		 248 aa  285  7e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1212  ABC transporter related  54.03 
 
 		 267 aa  280  2e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00512006  hitchhiker  0.000000000503976 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5159  ABC transporter related protein  54.44 
 
 		 248 aa  280  2e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.364497 
 
 
-
 
NC_002950  PG1034  ABC transporter, ATP-binding protein  58.26 
 
 		 244 aa  277  1e-73  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000170601 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1029  hypothetical protein  49.8 
 
 		 250 aa  262  4e-69  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2343  ABC transporter related protein  43.98 
 
 		 252 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3182  ABC transporter related  42.08 
 
 		 250 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0015  ABC transporter related  44.3 
 
 		 252 aa  199  5e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0891779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1887  ABC transporter related protein  41.42 
 
 		 296 aa  196  4.0000000000000005e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2596  ABC transporter related protein  42.74 
 
 		 260 aa  194  9e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.256414  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2380  ABC transporter  43.39 
 
 		 257 aa  193  3e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83089  normal  0.615068 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0401  ABC transporter related  41.35 
 
 		 262 aa  192  5e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186175  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1066  ABC transporter related  43.98 
 
 		 248 aa  191  9e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0160  ABC transporter related  42.02 
 
 		 272 aa  190  2e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.609677 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5282  ABC transporter related  39.17 
 
 		 248 aa  186  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17632 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1121  ABC transporter related  43.57 
 
 		 248 aa  186  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.418609  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2458  ABC transporter, ATPase subunit  43.57 
 
 		 248 aa  186  5e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1851  ABC transporter related  40.16 
 
 		 263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0787  ABC transporter-related protein  39.58 
 
 		 248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0816  ABC transporter, ATP-binding protein  38.75 
 
 		 248 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1977  ABC transporter related  40.57 
 
 		 248 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.28613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3484  ABC transporter related  41 
 
 		 257 aa  183  3e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0855  ABC transporter related protein  40.91 
 
 		 273 aa  182  4.0000000000000006e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.795905 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1737  ABC transporter related  41.83 
 
 		 245 aa  182  4.0000000000000006e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0169856  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1781  ABC transporter related  42.98 
 
 		 252 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.122728 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2449  ABC transporter related  39.69 
 
 		 268 aa  181  7e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0561  ABC transporter related  38.82 
 
 		 248 aa  181  9.000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000384868  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1008  ABC transporter related  36.21 
 
 		 397 aa  181  9.000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00677316  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0407  ABC transporter component  40.83 
 
 		 257 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2869  ABC transporter related  41.42 
 
 		 261 aa  178  5.999999999999999e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1328  ABC transporter related  41.45 
 
 		 256 aa  178  8e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0917234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1862  ABC transporter, ATPase subunit  38.96 
 
 		 248 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634035  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0328  ABC transporter related  40.34 
 
 		 249 aa  176  2e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.673492  normal  0.624259 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2636  ABC transporter related  39.91 
 
 		 261 aa  176  3e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3315  ABC transporter related  38.82 
 
 		 258 aa  176  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000690504 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0700  ABC transporter related  38.91 
 
 		 333 aa  176  4e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2985  ABC-type organic solvent transporter, ATP-binding protein  38.14 
 
 		 257 aa  176  4e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.444132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0189  ABC transporter related  37.55 
 
 		 254 aa  175  7e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0746681  normal  0.958869 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1578  ABC transporter related  40.51 
 
 		 260 aa  175  8e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.292703 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1127  ABC transporter related protein  38.49 
 
 		 421 aa  174  9e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0677  ABC transporter related  38.24 
 
 		 255 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0085  ABC transporter, ATP-binding protein  41.25 
 
 		 238 aa  174  9.999999999999999e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1998  ABC transporter-related protein  38.55 
 
 		 248 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2083  ABC transporter related  38.55 
 
 		 248 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1811  ABC transporter related protein  37.97 
 
 		 251 aa  174  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0051  ABC transporter  40.83 
 
 		 238 aa  172  6.999999999999999e-42  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0796  ABC transporter related  36.97 
 
 		 255 aa  171  6.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0379  ABC transporter related  40.83 
 
 		 262 aa  170  2e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1040  ABC transporter related  37.5 
 
 		 248 aa  169  5e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1621  ABC transporter related protein  37.07 
 
 		 363 aa  169  6e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.966929  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10668  ribonucleotide transport ATP-binding protein ABC transporter mkl  37.24 
 
 		 359 aa  169  6e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.139977  normal  0.579373 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3704  ABC transporter related  37.97 
 
 		 265 aa  168  7e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.307132  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3691  ABC transporter related  38.24 
 
 		 245 aa  168  8e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.896312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3402  ABC transporter related  37.24 
 
 		 270 aa  167  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0752  ABC transporter related protein  37.34 
 
 		 397 aa  167  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5099  ABC transporter related  36.4 
 
 		 362 aa  167  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0528619 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1495  ABC transporter related  40.85 
 
 		 267 aa  167  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00076856  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1961  ABC transporter related  38.68 
 
 		 254 aa  167  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.334641  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0472  ABC transporter related  37.55 
 
 		 293 aa  167  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0139008  hitchhiker  0.0000833455 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4315  ABC transporter related  38.24 
 
 		 259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.696843  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  39.57 
 
 		 282 aa  166  4e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1924  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  41.33 
 
 		 247 aa  166  4e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.467603  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0986  ABC transporter related  36.07 
 
 		 361 aa  165  5e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.401008 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0968  ABC transporter related  36.07 
 
 		 361 aa  165  5e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51873  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0669  ABC transporter related  38.14 
 
 		 254 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1254  ABC transporter-related protein  35.66 
 
 		 357 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0999833 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4349  ABC transporter related protein  35.69 
 
 		 359 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  41.85 
 
 		 244 aa  164  1.0000000000000001e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3546  amino acid ABC transporter-like protein  38.75 
 
 		 253 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0996  ABC transporter related  35.66 
 
 		 361 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1349  ABC transporter related  40.91 
 
 		 248 aa  162  3e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3548  L-cystine import ATP-binding protein TcyN  38.75 
 
 		 253 aa  163  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.159589  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2431  polar amino acid ABC transporter ATPase  39.06 
 
 		 256 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.477108 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0448  ABC-type transport system, ATPase component  35.22 
 
 		 266 aa  162  6e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392883  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1504  ABC transporter related  38.05 
 
 		 252 aa  162  7e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2542  ABC transporter-related protein  36.29 
 
 		 262 aa  161  9e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120611  hitchhiker  0.000000000000186562 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0706  ABC transporter related protein  36.02 
 
 		 258 aa  161  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613257  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4624  ABC transporter related  33.2 
 
 		 258 aa  160  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2415  ABC transporter related  36.19 
 
 		 264 aa  160  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.805602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3259  ABC transporter-related protein  36.44 
 
 		 283 aa  161  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3234  ABC transporter related  39.17 
 
 		 265 aa  161  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0738918  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2485  ABC transporter related  37.82 
 
 		 243 aa  160  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3442  ABC transporter related protein  35.86 
 
 		 246 aa  160  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.0228809 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6635  ABC transporter related  40.3 
 
 		 363 aa  160  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2909  ABC transporter component  38.56 
 
 		 277 aa  160  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.321315  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1926  ABC transporter related  40.09 
 
 		 247 aa  160  2e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2437  ABC transporter related  37.82 
 
 		 243 aa  160  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2003  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.5 
 
 		 243 aa  159  3e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0849  ABC transporter related  37.39 
 
 		 247 aa  159  3e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000288361  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2253  ABC transporter related  39.72 
 
 		 244 aa  159  3e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.491715  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1984  ATPase  35.56 
 
 		 257 aa  159  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.101107  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0686  ABC transporter related  38.5 
 
 		 270 aa  159  3e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1133  ABC transporter related  39.75 
 
 		 243 aa  159  4e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.010872 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  37.44 
 
 		 240 aa  159  4e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0096  ABC transporter related  35.87 
 
 		 282 aa  159  5e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.568034  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>