More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_1029 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010830  Aasi_1029  hypothetical protein  100 
 
 
250 aa  511  1e-144  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2195  ABC transporter, ATP-binding protein  60.89 
 
 
248 aa  320  9.999999999999999e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00836348 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3462  ABC transporter related  57.89 
 
 
250 aa  304  7e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0534254 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3963  ABC transporter related  55.24 
 
 
248 aa  296  2e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764757  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5159  ABC transporter related protein  55.74 
 
 
248 aa  282  3.0000000000000004e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.364497 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1212  ABC transporter related  53.69 
 
 
267 aa  276  2e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00512006  hitchhiker  0.000000000503976 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0450  ABC transporter related  52.19 
 
 
254 aa  268  4e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1034  ABC transporter, ATP-binding protein  54.55 
 
 
244 aa  263  3e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000170601 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1498  ABC transporter related  49.8 
 
 
256 aa  262  3e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07670  ABC transporter, ATP-binding protein  47.58 
 
 
254 aa  261  8e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0821592  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2343  ABC transporter related protein  43.57 
 
 
252 aa  211  1e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0401  ABC transporter related  43.46 
 
 
262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186175  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1040  ABC transporter related  42.5 
 
 
248 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3182  ABC transporter related  41.25 
 
 
250 aa  194  9e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0816  ABC transporter, ATP-binding protein  41.67 
 
 
248 aa  192  5e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0787  ABC transporter-related protein  42.5 
 
 
248 aa  192  6e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1328  ABC transporter related  42.36 
 
 
256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0917234  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0328  ABC transporter related  42.44 
 
 
249 aa  181  7e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.673492  normal  0.624259 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0561  ABC transporter related  40.51 
 
 
248 aa  181  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000384868  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0535  ABC transporter related  38.4 
 
 
271 aa  179  4e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2380  ABC transporter  41.74 
 
 
257 aa  178  5.999999999999999e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83089  normal  0.615068 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1887  ABC transporter related protein  38.49 
 
 
296 aa  178  8e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1737  ABC transporter related  42.02 
 
 
245 aa  176  3e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0169856  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0160  ABC transporter related  39.92 
 
 
272 aa  176  3e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.609677 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1851  ABC transporter related  41.63 
 
 
263 aa  176  4e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2458  ABC transporter, ATPase subunit  42.73 
 
 
248 aa  176  5e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3315  ABC transporter related  38.82 
 
 
258 aa  175  5e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000690504 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1121  ABC transporter related  42.73 
 
 
248 aa  176  5e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.418609  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0407  ABC transporter component  40.83 
 
 
257 aa  175  6e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0853  ABC transporter related  38.82 
 
 
273 aa  175  8e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0785068 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1066  ABC transporter related  42.73 
 
 
248 aa  174  9e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2869  ABC transporter related  40.25 
 
 
261 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0015  ABC transporter related  40.17 
 
 
252 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0891779  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17000  ABC-type metal ion transport system, ATPase component  40.35 
 
 
323 aa  173  1.9999999999999998e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.115214  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3768  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  39 
 
 
331 aa  173  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.227967  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1781  ABC transporter related  40.08 
 
 
252 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.122728 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2636  ABC transporter related  42.08 
 
 
261 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3484  ABC transporter related  39.66 
 
 
257 aa  171  9e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1578  ABC transporter related  39.66 
 
 
260 aa  171  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.292703 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1817  ABC transporter related  37.97 
 
 
274 aa  169  4e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0281  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  38.02 
 
 
335 aa  168  6e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2596  ABC transporter related protein  37.34 
 
 
260 aa  168  7e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.256414  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0379  ABC transporter related  38.49 
 
 
262 aa  168  8e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2298  ATPase  38.4 
 
 
273 aa  168  8e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102276  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0677  ABC transporter related  40.43 
 
 
255 aa  168  9e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0297  ABC transporter ATP-binding protein  39.13 
 
 
339 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0281  ABC transporter, ATP-binding protein  39.13 
 
 
339 aa  167  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1621  ABC transporter related protein  38.56 
 
 
363 aa  167  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.966929  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0292  ABC transporter related  38.7 
 
 
339 aa  167  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0312  ABC transporter ATP-binding protein  39.13 
 
 
339 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0343  ABC transporter, ATP-binding protein  39.13 
 
 
339 aa  167  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2449  ABC transporter related  37.5 
 
 
268 aa  167  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1043  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  36.22 
 
 
343 aa  166  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163916  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5262  D-methionine ABC transporter, ATP-binding protein  37.6 
 
 
335 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0358  ABC transporter, ATP-binding protein  39.13 
 
 
339 aa  167  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1984  ATPase  41.74 
 
 
257 aa  166  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.101107  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2886  ABC transporter, ATPase subunit  38.56 
 
 
275 aa  166  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.21978  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4962  ABC transporter, ATP-binding protein  38.7 
 
 
339 aa  167  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3405  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  36.22 
 
 
343 aa  166  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0164729  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0341  ABC transporter, ATP-binding protein  38.7 
 
 
339 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0385  ABC transporter, ATP-binding protein  38.7 
 
 
339 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0284  ABC transporter, ATP-binding protein  38.7 
 
 
339 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10668  ribonucleotide transport ATP-binding protein ABC transporter mkl  37.71 
 
 
359 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.139977  normal  0.579373 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3016  ABC transporter related  40.27 
 
 
249 aa  166  5e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.524884  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0878  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  36.61 
 
 
343 aa  165  5e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000103335  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0847  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  38.7 
 
 
343 aa  165  5e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000211162  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5114  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  37.19 
 
 
335 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.182422  normal  0.245583 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0961  ABC transporter, ATP-binding protein  36.28 
 
 
352 aa  165  5.9999999999999996e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0131  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  37.19 
 
 
335 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0091  PP-loop family protein  41.52 
 
 
246 aa  165  5.9999999999999996e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0135509  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1321  ABC transporter related protein  41.82 
 
 
259 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.627863  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4349  ABC transporter related protein  37.76 
 
 
359 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3986  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  37.7 
 
 
343 aa  165  6.9999999999999995e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0129  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  37.19 
 
 
335 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.131021 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3753  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  37.14 
 
 
343 aa  165  6.9999999999999995e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000257186  normal  0.0826267 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0114  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  37.19 
 
 
335 aa  165  8e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.867435  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0855  ABC transporter related protein  39.15 
 
 
273 aa  165  8e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.795905 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3499  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  36.08 
 
 
343 aa  165  8e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00014071  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1533  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  37.89 
 
 
345 aa  164  9e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0757943  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2343  ABC transporter related  39.83 
 
 
275 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00464868 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0902  ABC transporter, ATP-binding protein  36.28 
 
 
352 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.693076  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0039  ABC transporter related  40.28 
 
 
302 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3691  ABC transporter related  38.24 
 
 
245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.896312  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0925  ABC transporter, ATP-binding protein  37.92 
 
 
254 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1127  ABC transporter related protein  35.83 
 
 
421 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0291  ABC transporter-related protein  37.39 
 
 
339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2253  ABC transporter related  35.86 
 
 
244 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.491715  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2604  ABC transporter related  37.95 
 
 
354 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0022  ATPase  36.86 
 
 
256 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3342  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  36.08 
 
 
343 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000749199  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3704  ABC transporter related  37.55 
 
 
265 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.307132  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1395  ABC transporter related  37.27 
 
 
337 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0997  ABC transporter-like protein protein  39.68 
 
 
260 aa  164  2.0000000000000002e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0883738  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1495  ABC transporter related  39.91 
 
 
267 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00076856  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1096  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  35.83 
 
 
343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000220357  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3403  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  35.43 
 
 
343 aa  162  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000150207  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3402  ABC transporter related  36.25 
 
 
270 aa  163  3e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0441  ATPase  36.29 
 
 
244 aa  163  3e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2542  ABC transporter-related protein  36.86 
 
 
262 aa  163  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120611  hitchhiker  0.000000000000186562 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0700  ABC transporter related  36.93 
 
 
333 aa  163  3e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>