More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3691 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3691  ABC transporter related  100 
 
 		 245 aa  484  1e-136  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.896312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2458  ABC transporter, ATPase subunit  64.17 
 
 		 248 aa  305  6e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1121  ABC transporter related  64.17 
 
 		 248 aa  305  6e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.418609  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1066  ABC transporter related  63.33 
 
 		 248 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1737  ABC transporter related  62.45 
 
 		 245 aa  297  1e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0169856  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2380  ABC transporter  62.5 
 
 		 257 aa  295  4e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83089  normal  0.615068 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1781  ABC transporter related  61.83 
 
 		 252 aa  295  5e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.122728 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3484  ABC transporter related  55.79 
 
 		 257 aa  275  4e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0407  ABC transporter component  59.5 
 
 		 257 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0015  ABC transporter related  55.6 
 
 		 252 aa  247  1e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0891779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2869  ABC transporter related  55.88 
 
 		 261 aa  244  8e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1578  ABC transporter related  52.85 
 
 		 260 aa  241  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.292703 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1328  ABC transporter related  51.87 
 
 		 256 aa  240  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0917234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1851  ABC transporter related  53.09 
 
 		 263 aa  238  5.999999999999999e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0990  ABC transporter, ATP-binding protein  41.45 
 
 		 233 aa  206  4e-52  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.491255  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0328  ABC transporter related  42.62 
 
 		 249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.673492  normal  0.624259 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3808  ABC transporter related  44.94 
 
 		 262 aa  198  6e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.140241  normal  0.926814 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0997  ABC transporter-like protein protein  42.51 
 
 		 260 aa  198  7.999999999999999e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0883738  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0051  ABC transporter  43.59 
 
 		 238 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0085  ABC transporter, ATP-binding protein  43.59 
 
 		 238 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3036  ABC transporter related  43.09 
 
 		 261 aa  193  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.845975 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0379  ABC transporter related  40.93 
 
 		 262 aa  192  5e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1977  ABC transporter related  42.15 
 
 		 248 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.28613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1611  ABC transporter related  45.42 
 
 		 295 aa  191  1e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5159  ABC transporter related protein  41.6 
 
 		 248 aa  188  5.999999999999999e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.364497 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0480  ABC transporter related  44.27 
 
 		 292 aa  188  5.999999999999999e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.104959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2164  ABC transporter related  42.23 
 
 		 261 aa  188  5.999999999999999e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0816  ABC transporter, ATP-binding protein  43.62 
 
 		 248 aa  188  7e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2673  ABC transporter-like  42 
 
 		 260 aa  187  9e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2083  ABC transporter related  41.74 
 
 		 248 aa  187  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1998  ABC transporter-related protein  41.74 
 
 		 248 aa  187  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2343  ABC transporter related  44.62 
 
 		 275 aa  187  2e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464868 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1862  ABC transporter, ATPase subunit  43.85 
 
 		 248 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634035  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2596  ABC transporter related protein  40.76 
 
 		 260 aa  186  2e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.256414  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2743  ABC transporter related  45.23 
 
 		 272 aa  186  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.132977 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0787  ABC transporter-related protein  42.92 
 
 		 248 aa  186  4e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0677  ABC transporter related  44.21 
 
 		 255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2343  ABC transporter related protein  44.54 
 
 		 252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0248  ABC transporter, ATP-binding protein  44.21 
 
 		 255 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07670  ABC transporter, ATP-binding protein  40.59 
 
 		 254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0821592  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3462  ABC transporter related  38.74 
 
 		 250 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0534254 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0698  ABC transporter, ATP-binding protein  38.98 
 
 		 242 aa  182  4.0000000000000006e-45  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22670  putative ATP-binding component of ABC transporter  44.17 
 
 		 264 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420242 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1887  ABC transporter related protein  43.28 
 
 		 296 aa  182  6e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2810  ABC transporter, ATPase subunit  42.5 
 
 		 257 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.66283  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3963  ABC transporter related  40.59 
 
 		 248 aa  180  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1488  ABC transporter related  42.5 
 
 		 257 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1719  ABC transporter related  42.92 
 
 		 257 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0483086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1628  ABC transporter related  43.15 
 
 		 256 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.387649 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0706  ABC transporter related protein  44.3 
 
 		 258 aa  177  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613257  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1008  ABC transporter related  38.17 
 
 		 397 aa  176  3e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00677316  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0531  ABC transporter related  40 
 
 		 261 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  hitchhiker  0.00910021 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0514  ABC transporter related  40 
 
 		 261 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5086  ABC transporter related  44.17 
 
 		 263 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0940761 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1349  ABC transporter related  37.66 
 
 		 248 aa  176  4e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0578  ABC transporter related  41.6 
 
 		 276 aa  176  4e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.206439  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5556  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.32 
 
 		 264 aa  175  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.50977 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4484  ABC transporter related  41.2 
 
 		 257 aa  175  6e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4315  ABC transporter related  38.91 
 
 		 259 aa  175  6e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.696843  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0176  ABC transporter related  39.53 
 
 		 292 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0350  ATPase  42.23 
 
 		 292 aa  174  9.999999999999999e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1637  ABC transporter related  42.32 
 
 		 256 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.967279 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0627  ABC transporter ATP-binding protein  41.18 
 
 		 276 aa  174  9.999999999999999e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00990626  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0796  ABC transporter related  38.66 
 
 		 255 aa  174  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1453  ABC transporter related  41.08 
 
 		 257 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.329666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0561  ABC transporter related  40.83 
 
 		 248 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000384868  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1040  ABC transporter related  41.15 
 
 		 248 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2513  ABC transporter related  40.57 
 
 		 259 aa  172  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0824022  normal  0.0374707 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0523  ABC transporter related  41.53 
 
 		 275 aa  172  2.9999999999999996e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.310884 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0314  ABC transporter ATP-binding protein  39.92 
 
 		 298 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0157  ABC transporter related  44.17 
 
 		 263 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.961661 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1316  ABC transporter related  42.39 
 
 		 256 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0141  ABC transporter ATP-binding protein  43.75 
 
 		 263 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0633689  normal  0.467714 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3182  ABC transporter related  40.66 
 
 		 250 aa  172  5e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0159  ABC transporter related  43.75 
 
 		 263 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0169  ABC transporter related  43.87 
 
 		 292 aa  172  5e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0372  ABC transporter related  44.17 
 
 		 261 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2806  ABC transporter related  43.03 
 
 		 257 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16468  ABC(ATP-binding) family transporter: toluene tolerance  40.73 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.222539  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2065  ABC transporter related protein  40.73 
 
 		 273 aa  169  3e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1984  ATPase  44.19 
 
 		 257 aa  169  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.101107  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2049  ABC transporter ATP-binding protein  42.62 
 
 		 259 aa  169  3e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.558071 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1621  ABC transporter related protein  39.51 
 
 		 363 aa  169  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.966929  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2844  ABC transporter related  42.44 
 
 		 300 aa  169  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1914  ABC transporter ATP-binding protein  44.58 
 
 		 264 aa  169  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1196  ABC transporter related  43.33 
 
 		 264 aa  169  4e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03182  ABC transporter ATP-binding protein  41.32 
 
 		 280 aa  169  5e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.501645  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1811  ABC transporter related protein  38.24 
 
 		 251 aa  169  5e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04770  ABC transporter, ATP binding component  44.17 
 
 		 266 aa  168  6e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326188  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4624  ABC transporter related  45.02 
 
 		 258 aa  168  7e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0100  ABC transporter related  40.83 
 
 		 278 aa  168  7e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.106893  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1498  ABC transporter related  38.24 
 
 		 256 aa  168  7e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2985  ABC-type organic solvent transporter, ATP-binding protein  37.13 
 
 		 257 aa  168  8e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.444132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4114  ABC transporter related  40.16 
 
 		 268 aa  167  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0512527  normal  0.918883 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2585  ABC transporter related  38.15 
 
 		 259 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2981  ABC transporter related  42.39 
 
 		 245 aa  167  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0189  ABC transporter related  39.17 
 
 		 254 aa  167  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0746681  normal  0.958869 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1658  ABC transporter related  40 
 
 		 254 aa  167  2e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1074  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents ATPase component-like protein  42.08 
 
 		 333 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0029  ABC transporter related  40 
 
 		 250 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957294  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>