More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0450 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0450  ABC transporter related  100 
 
 		 254 aa  516  1.0000000000000001e-145  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07670  ABC transporter, ATP-binding protein  73.23 
 
 		 254 aa  379  1e-104  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0821592  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1498  ABC transporter related  71.31 
 
 		 256 aa  372  1e-102  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2195  ABC transporter, ATP-binding protein  61.54 
 
 		 248 aa  312  2.9999999999999996e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00836348 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3462  ABC transporter related  58.8 
 
 		 250 aa  310  1e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0534254 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1212  ABC transporter related  59.68 
 
 		 267 aa  305  5.0000000000000004e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00512006  hitchhiker  0.000000000503976 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3963  ABC transporter related  57.66 
 
 		 248 aa  296  2e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5159  ABC transporter related protein  54.07 
 
 		 248 aa  271  8.000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.364497 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1029  hypothetical protein  52.19 
 
 		 250 aa  268  4e-71  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1034  ABC transporter, ATP-binding protein  55.37 
 
 		 244 aa  268  8e-71  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000170601 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2343  ABC transporter related protein  45 
 
 		 252 aa  221  6e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0160  ABC transporter related  44.21 
 
 		 272 aa  206  3e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.609677 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2596  ABC transporter related protein  43.09 
 
 		 260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.256414  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1887  ABC transporter related protein  41.49 
 
 		 296 aa  194  8.000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0401  ABC transporter related  41.35 
 
 		 262 aa  193  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186175  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1328  ABC transporter related  43.16 
 
 		 256 aa  193  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0917234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3182  ABC transporter related  40.42 
 
 		 250 aa  192  4e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3315  ABC transporter related  41.35 
 
 		 258 aa  192  5e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000690504 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2985  ABC-type organic solvent transporter, ATP-binding protein  41.39 
 
 		 257 aa  192  5e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.444132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0328  ABC transporter related  44.77 
 
 		 249 aa  191  1e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.673492  normal  0.624259 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5282  ABC transporter related  39.59 
 
 		 248 aa  191  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17632 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1977  ABC transporter related  40.66 
 
 		 248 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.28613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0561  ABC transporter related  41.32 
 
 		 248 aa  190  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000384868  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0787  ABC transporter-related protein  40.83 
 
 		 248 aa  190  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0015  ABC transporter related  41.35 
 
 		 252 aa  189  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0891779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1862  ABC transporter, ATPase subunit  39.36 
 
 		 248 aa  188  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634035  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1066  ABC transporter related  42.5 
 
 		 248 aa  188  7e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0816  ABC transporter, ATP-binding protein  39.58 
 
 		 248 aa  188  8e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2380  ABC transporter  40.91 
 
 		 257 aa  187  1e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83089  normal  0.615068 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1998  ABC transporter-related protein  38.96 
 
 		 248 aa  186  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2083  ABC transporter related  38.96 
 
 		 248 aa  186  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2449  ABC transporter related  42.08 
 
 		 268 aa  186  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0189  ABC transporter related  39.92 
 
 		 254 aa  185  7e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0746681  normal  0.958869 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2458  ABC transporter, ATPase subunit  41.91 
 
 		 248 aa  183  3e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1121  ABC transporter related  41.91 
 
 		 248 aa  183  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.418609  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1040  ABC transporter related  39.17 
 
 		 248 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0407  ABC transporter component  40.17 
 
 		 257 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1781  ABC transporter related  41.74 
 
 		 252 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.122728 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3484  ABC transporter related  39.75 
 
 		 257 aa  181  8.000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1851  ABC transporter related  39.09 
 
 		 263 aa  180  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1737  ABC transporter related  41.2 
 
 		 245 aa  181  1e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0169856  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1578  ABC transporter related  40.42 
 
 		 260 aa  179  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.292703 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0677  ABC transporter related  38.66 
 
 		 255 aa  177  2e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0796  ABC transporter related  36.73 
 
 		 255 aa  176  3e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0644  ABC transporter, ATP-binding protein  40.51 
 
 		 318 aa  175  5e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0448  ABC-type transport system, ATPase component  38.56 
 
 		 266 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392883  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4315  ABC transporter related  41 
 
 		 259 aa  174  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.696843  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1621  ABC transporter related protein  37.29 
 
 		 363 aa  173  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.966929  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1984  ATPase  36.29 
 
 		 257 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.101107  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0967  ABC transporter ATP-binding protein  39.66 
 
 		 322 aa  171  6.999999999999999e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2636  ABC transporter related  39.46 
 
 		 261 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1008  ABC transporter related  35.39 
 
 		 397 aa  171  7.999999999999999e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00677316  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1127  ABC transporter related protein  36.69 
 
 		 421 aa  171  9e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3808  ABC transporter related  40.57 
 
 		 262 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.140241  normal  0.926814 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2869  ABC transporter related  40.17 
 
 		 261 aa  170  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10668  ribonucleotide transport ATP-binding protein ABC transporter mkl  36.82 
 
 		 359 aa  170  3e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.139977  normal  0.579373 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1769  ABC transporter related  39.13 
 
 		 344 aa  169  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000333241  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1075  methionine import ATP-binding protein MetN  39.66 
 
 		 318 aa  169  3e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2749  ABC transporter related  36.13 
 
 		 270 aa  169  3e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2673  ABC transporter-like  40.16 
 
 		 260 aa  169  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1233  methionine import ATP-binding protein MetN  40.51 
 
 		 340 aa  169  5e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0855  ABC transporter related protein  37.24 
 
 		 273 aa  168  9e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.795905 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1811  ABC transporter related protein  37.13 
 
 		 251 aa  168  9e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3704  ABC transporter related  38.04 
 
 		 265 aa  168  9e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.307132  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1349  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  37.4 
 
 		 343 aa  167  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0700  ABC transporter related  36.44 
 
 		 333 aa  168  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6999  ABC transporter related  38.02 
 
 		 249 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0192486 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2164  ABC transporter related  40.4 
 
 		 261 aa  167  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4349  ABC transporter related protein  38.14 
 
 		 359 aa  167  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6334  ABC transporter related  38.02 
 
 		 249 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.443551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0706  ABC transporter related protein  36.86 
 
 		 258 aa  166  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613257  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2886  ABC transporter, ATPase subunit  37.29 
 
 		 275 aa  167  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.21978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1495  ABC transporter related  38.02 
 
 		 249 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1013  ABC transporter-related protein  34.31 
 
 		 306 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0853  ABC transporter related  35.44 
 
 		 273 aa  166  4e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0785068 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0752  ABC transporter related protein  37.34 
 
 		 397 aa  166  4e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0997  ABC transporter-like protein protein  39.76 
 
 		 260 aa  165  5.9999999999999996e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0883738  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5462  ABC transporter-like  40.65 
 
 		 245 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1349  ABC transporter related  40.08 
 
 		 248 aa  164  9e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1919  ABC transporter related  37.08 
 
 		 244 aa  164  9e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.831773  normal  0.256849 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2413  ABC transporter related  36.44 
 
 		 266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.104352 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0961  ABC transporter, ATP-binding protein  33.84 
 
 		 352 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0379  ABC transporter related  38.43 
 
 		 262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2786  ABC transporter, ATPase subunit  36.29 
 
 		 294 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000312244  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0039  ABC transporter related  38.57 
 
 		 302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0281  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  36.96 
 
 		 335 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3986  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  37.8 
 
 		 343 aa  163  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0902  ABC transporter, ATP-binding protein  33.84 
 
 		 352 aa  163  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.693076  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2446  ABC transporter component  40 
 
 		 264 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.404334  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0986  ABC transporter related  35.27 
 
 		 361 aa  162  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.401008 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2437  ABC transporter related  40.27 
 
 		 243 aa  163  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2485  ABC transporter related  40.27 
 
 		 243 aa  163  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0968  ABC transporter related  35.27 
 
 		 361 aa  162  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51873  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1395  ABC transporter related  38.57 
 
 		 337 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3036  ABC transporter related  37.35 
 
 		 261 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.845975 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3137  ABC transporter, ATPase subunit  34.45 
 
 		 253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.297163  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5262  D-methionine ABC transporter, ATP-binding protein  36.96 
 
 		 335 aa  162  6e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0472  ABC transporter related  36.29 
 
 		 293 aa  162  6e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0139008  hitchhiker  0.0000833455 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3691  ABC transporter related  36.97 
 
 		 245 aa  162  6e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.896312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3394  ABC transporter-related protein  35 
 
 		 278 aa  162  6e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>