More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0189 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0189  ABC transporter related  100 
 
 		 254 aa  515  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0746681  normal  0.958869 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0796  ABC transporter related  70.8 
 
 		 255 aa  364  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2985  ABC-type organic solvent transporter, ATP-binding protein  72.24 
 
 		 257 aa  363  1e-99  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.444132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1811  ABC transporter related protein  71.14 
 
 		 251 aa  362  2e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5282  ABC transporter related  67.89 
 
 		 248 aa  348  5e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17632 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3315  ABC transporter related  56.25 
 
 		 258 aa  274  1.0000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000690504 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4315  ABC transporter related  52.24 
 
 		 259 aa  259  3e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.696843  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0706  ABC transporter related protein  48.78 
 
 		 258 aa  230  1e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613257  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1862  ABC transporter, ATPase subunit  45.71 
 
 		 248 aa  203  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634035  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2596  ABC transporter related protein  43.28 
 
 		 260 aa  204  2e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.256414  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1977  ABC transporter related  44.9 
 
 		 248 aa  202  4e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.28613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3182  ABC transporter related  43.04 
 
 		 250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1998  ABC transporter-related protein  44.9 
 
 		 248 aa  199  5e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2083  ABC transporter related  44.9 
 
 		 248 aa  199  5e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0816  ABC transporter, ATP-binding protein  42.62 
 
 		 248 aa  198  6e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0787  ABC transporter-related protein  43.04 
 
 		 248 aa  196  3e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0677  ABC transporter related  42.44 
 
 		 255 aa  194  8.000000000000001e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2343  ABC transporter related protein  42.19 
 
 		 252 aa  190  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0328  ABC transporter related  44.58 
 
 		 249 aa  190  2e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.673492  normal  0.624259 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2380  ABC transporter  44.58 
 
 		 257 aa  189  5e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83089  normal  0.615068 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1040  ABC transporter related  41.77 
 
 		 248 aa  187  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3484  ABC transporter related  42.62 
 
 		 257 aa  185  5e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0561  ABC transporter related  42.62 
 
 		 248 aa  186  5e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000384868  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0450  ABC transporter related  39.92 
 
 		 254 aa  185  7e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1887  ABC transporter related protein  41.95 
 
 		 296 aa  185  8e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0407  ABC transporter component  41.84 
 
 		 257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07670  ABC transporter, ATP-binding protein  38.82 
 
 		 254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0821592  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3704  ABC transporter related  39 
 
 		 265 aa  182  3e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.307132  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3963  ABC transporter related  38.17 
 
 		 248 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1578  ABC transporter related  40.4 
 
 		 260 aa  182  6e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.292703 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1621  ABC transporter related protein  41.84 
 
 		 363 aa  182  7e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.966929  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0698  ABC transporter, ATP-binding protein  42.5 
 
 		 242 aa  181  8.000000000000001e-45  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1781  ABC transporter related  43.15 
 
 		 252 aa  181  9.000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.122728 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1328  ABC transporter related  39.42 
 
 		 256 aa  180  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0917234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2869  ABC transporter related  44.58 
 
 		 261 aa  180  2e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1066  ABC transporter related  42.68 
 
 		 248 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5159  ABC transporter related protein  36.93 
 
 		 248 aa  179  4e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.364497 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3462  ABC transporter related  39.24 
 
 		 250 aa  178  7e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0534254 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1121  ABC transporter related  42.68 
 
 		 248 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.418609  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2458  ABC transporter, ATPase subunit  42.68 
 
 		 248 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0160  ABC transporter related  40.59 
 
 		 272 aa  177  2e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.609677 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3442  ABC transporter related protein  38.4 
 
 		 246 aa  176  3e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.0228809 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4484  ABC transporter related  39.36 
 
 		 257 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1498  ABC transporter related  37.55 
 
 		 256 aa  175  7e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2343  ABC transporter related  38.96 
 
 		 275 aa  175  7e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464868 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2164  ABC transporter related  40.56 
 
 		 261 aa  174  9e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0448  ABC-type transport system, ATPase component  39.66 
 
 		 266 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392883  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4349  ABC transporter related protein  40.76 
 
 		 359 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1851  ABC transporter related  39.09 
 
 		 263 aa  173  2.9999999999999996e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1737  ABC transporter related  42.26 
 
 		 245 aa  172  3.9999999999999995e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0169856  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0700  ABC transporter related  39.5 
 
 		 333 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2513  ABC transporter related  40.16 
 
 		 259 aa  172  3.9999999999999995e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0824022  normal  0.0374707 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0015  ABC transporter related  39.57 
 
 		 252 aa  172  6.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0891779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0468  ABC transporter related  39.42 
 
 		 240 aa  171  1e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  39.84 
 
 		 244 aa  170  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2065  ABC transporter related protein  38.35 
 
 		 273 aa  170  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2886  ABC transporter, ATPase subunit  37.45 
 
 		 275 aa  169  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.21978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03690  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, ATPase component  40.25 
 
 		 378 aa  169  4e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.839011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3808  ABC transporter related  40.49 
 
 		 262 aa  169  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.140241  normal  0.926814 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0379  ABC transporter related  38.56 
 
 		 262 aa  169  5e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2844  ABC transporter related  38 
 
 		 300 aa  169  5e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1953  ABC transporter related  37.08 
 
 		 269 aa  169  5e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0810571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2195  ABC transporter, ATP-binding protein  34.6 
 
 		 248 aa  166  2e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00836348 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3691  ABC transporter related  39.17 
 
 		 245 aa  167  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.896312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1127  ABC transporter related protein  36.86 
 
 		 421 aa  166  2.9999999999999998e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2316  ABC transporter related  40.17 
 
 		 258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184477  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2511  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  34.3 
 
 		 245 aa  166  4e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000409098  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0797  ABC transporter related  38.91 
 
 		 283 aa  166  4e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.126555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1074  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents ATPase component-like protein  38.56 
 
 		 333 aa  166  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0646  ABC transporter, ATP-binding protein  38.91 
 
 		 283 aa  166  4e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  37.35 
 
 		 258 aa  166  4e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0997  ABC transporter-like protein protein  39.6 
 
 		 260 aa  165  5.9999999999999996e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0883738  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2743  ABC transporter related  37.86 
 
 		 272 aa  165  6.9999999999999995e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.132977 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4114  ABC transporter related  36.44 
 
 		 268 aa  165  6.9999999999999995e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0512527  normal  0.918883 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0855  ABC transporter related protein  38.17 
 
 		 273 aa  165  6.9999999999999995e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.795905 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0752  ABC transporter related protein  36.36 
 
 		 397 aa  165  6.9999999999999995e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2049  ABC transporter ATP-binding protein  39.75 
 
 		 259 aa  165  6.9999999999999995e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.558071 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0006  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein  35.95 
 
 		 245 aa  165  8e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00283619  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4042  ABC transporter related  37.45 
 
 		 258 aa  165  8e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0818  ABC transporter related  36.73 
 
 		 278 aa  165  8e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0232927  normal  0.356957 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0480  ABC transporter related  39.42 
 
 		 292 aa  165  8e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.104959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0892  ABC transporter related  36.51 
 
 		 278 aa  165  8e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.752922  normal  0.504506 
 
 
-
 
NC_002978  WD0990  ABC transporter, ATP-binding protein  38.43 
 
 		 233 aa  164  9e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.491255  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0852  ABC transporter related  36.51 
 
 		 278 aa  164  9e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.705089  normal  0.0418942 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10668  ribonucleotide transport ATP-binding protein ABC transporter mkl  38.24 
 
 		 359 aa  164  9e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.139977  normal  0.579373 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0020  amino acid ABC transporter ATPase  35.74 
 
 		 256 aa  164  9e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.732673  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0176  ABC transporter related  37.76 
 
 		 292 aa  164  9e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0100  ABC transporter related  37.65 
 
 		 278 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.106893  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1075  methionine import ATP-binding protein MetN  36.71 
 
 		 318 aa  164  1.0000000000000001e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1628  ABC transporter related  37.76 
 
 		 256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.387649 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  36.93 
 
 		 242 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1233  methionine import ATP-binding protein MetN  36.21 
 
 		 340 aa  164  1.0000000000000001e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1254  ABC transporter-related protein  37.82 
 
 		 357 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0999833 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3036  ABC transporter related  38.15 
 
 		 261 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.845975 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1212  ABC transporter related  36.25 
 
 		 267 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00512006  hitchhiker  0.000000000503976 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  35.71 
 
 		 270 aa  163  2.0000000000000002e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0169  ABC transporter related  36.93 
 
 		 292 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1637  ABC transporter related  37.34 
 
 		 256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.967279 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2449  ABC transporter related  36.4 
 
 		 268 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1321  ABC transporter related protein  39.07 
 
 		 259 aa  163  3e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.627863  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>