More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0698 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0698  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
242 aa  493  9.999999999999999e-139  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1578  ABC transporter related  40.36 
 
 
260 aa  191  7e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.292703 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0015  ABC transporter related  40.59 
 
 
252 aa  191  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0891779  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1328  ABC transporter related  38.24 
 
 
256 aa  189  2.9999999999999997e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0917234  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1737  ABC transporter related  40.42 
 
 
245 aa  186  3e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0169856  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2343  ABC transporter related protein  42.19 
 
 
252 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3484  ABC transporter related  38.33 
 
 
257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2380  ABC transporter  39.5 
 
 
257 aa  182  3e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83089  normal  0.615068 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3691  ABC transporter related  38.98 
 
 
245 aa  182  4.0000000000000006e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.896312  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0407  ABC transporter component  38.33 
 
 
257 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1977  ABC transporter related  37.76 
 
 
248 aa  181  7e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.28613  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1781  ABC transporter related  37.97 
 
 
252 aa  181  8.000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.122728 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0189  ABC transporter related  42.5 
 
 
254 aa  181  8.000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0746681  normal  0.958869 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2869  ABC transporter related  39.24 
 
 
261 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0706  ABC transporter related protein  40.76 
 
 
258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613257  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1862  ABC transporter, ATPase subunit  36.51 
 
 
248 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634035  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3315  ABC transporter related  41.18 
 
 
258 aa  179  4e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000690504 
 
 
-
 
NC_002978  WD0990  ABC transporter, ATP-binding protein  40.08 
 
 
233 aa  179  4.999999999999999e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.491255  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1851  ABC transporter related  38.87 
 
 
263 aa  179  4.999999999999999e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1066  ABC transporter related  38.98 
 
 
248 aa  178  9e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2083  ABC transporter related  36.51 
 
 
248 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3182  ABC transporter related  39.91 
 
 
250 aa  177  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1998  ABC transporter-related protein  36.51 
 
 
248 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2458  ABC transporter, ATPase subunit  38.56 
 
 
248 aa  176  4e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2596  ABC transporter related protein  41.18 
 
 
260 aa  176  4e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.256414  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1121  ABC transporter related  38.56 
 
 
248 aa  176  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.418609  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0085  ABC transporter, ATP-binding protein  38.82 
 
 
238 aa  174  9.999999999999999e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0787  ABC transporter-related protein  39.92 
 
 
248 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0816  ABC transporter, ATP-binding protein  39.5 
 
 
248 aa  171  6.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0796  ABC transporter related  38.93 
 
 
255 aa  171  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1008  ABC transporter related  37.82 
 
 
397 aa  170  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00677316  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0051  ABC transporter  38.3 
 
 
238 aa  169  5e-41  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1040  ABC transporter related  38.36 
 
 
248 aa  168  7e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2985  ABC-type organic solvent transporter, ATP-binding protein  40.42 
 
 
257 aa  167  1e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.444132  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1637  ABC transporter related  36.71 
 
 
256 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.967279 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5282  ABC transporter related  39.09 
 
 
248 aa  166  4e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.17632 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22670  putative ATP-binding component of ABC transporter  37.55 
 
 
264 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420242 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1811  ABC transporter related protein  38.59 
 
 
251 aa  164  8e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5159  ABC transporter related protein  36.13 
 
 
248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.364497 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1628  ABC transporter related  35.86 
 
 
256 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.387649 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3499  ABC transporter related  36.4 
 
 
266 aa  162  6e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.756482  normal  0.324318 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4114  ABC transporter related  36.29 
 
 
268 aa  161  8.000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0512527  normal  0.918883 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1453  ABC transporter related  36.71 
 
 
257 aa  161  9e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.329666  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4484  ABC transporter related  35.86 
 
 
257 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0561  ABC transporter related  35.95 
 
 
248 aa  160  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000384868  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0379  ABC transporter related  36.1 
 
 
262 aa  159  3e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1743  ABC transporter-related protein  37.29 
 
 
271 aa  159  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1495  ABC transporter related  36.07 
 
 
267 aa  158  7e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00076856  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0448  ABC-type transport system, ATPase component  35.51 
 
 
266 aa  157  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392883  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3442  ABC transporter related protein  34.84 
 
 
246 aa  157  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.0228809 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0328  ABC transporter related  35.71 
 
 
249 aa  157  2e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.673492  normal  0.624259 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0248  ABC transporter, ATP-binding protein  34.03 
 
 
255 aa  157  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2810  ABC transporter, ATPase subunit  35.02 
 
 
257 aa  156  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.66283  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1488  ABC transporter related  35.02 
 
 
257 aa  156  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3036  ABC transporter related  33.06 
 
 
261 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.845975 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4042  ABC transporter related  38.82 
 
 
258 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3963  ABC transporter related  35.95 
 
 
248 aa  156  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764757  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5556  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.6 
 
 
264 aa  156  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.50977 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4716  ABC transporter related  36.71 
 
 
259 aa  155  4e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.592299  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0160  ABC transporter related  36.51 
 
 
272 aa  155  5.0000000000000005e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.609677 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2585  ABC transporter related  34.41 
 
 
259 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1316  ABC transporter related  34.6 
 
 
256 aa  155  6e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1719  ABC transporter related  35.02 
 
 
257 aa  155  7e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0483086  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0892  ABC transporter related  33.88 
 
 
278 aa  154  8e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.752922  normal  0.504506 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0852  ABC transporter related  33.88 
 
 
278 aa  154  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.705089  normal  0.0418942 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1611  ABC transporter related  36.55 
 
 
295 aa  154  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0818  ABC transporter related  33.47 
 
 
278 aa  153  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0232927  normal  0.356957 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2542  ABC transporter-related protein  35.25 
 
 
262 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120611  hitchhiker  0.000000000000186562 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1374  ABC transporter related  36.02 
 
 
258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0997  ABC transporter-like protein protein  34.29 
 
 
260 aa  152  2.9999999999999998e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0883738  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4315  ABC transporter related  38.22 
 
 
259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.696843  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1349  ABC transporter related  35.77 
 
 
248 aa  152  4e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07670  ABC transporter, ATP-binding protein  35.02 
 
 
254 aa  152  4e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0821592  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5086  ABC transporter related  36.71 
 
 
263 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0940761 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2164  ABC transporter related  34.69 
 
 
261 aa  152  4e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0372  ABC transporter related  37.97 
 
 
261 aa  152  5e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1695  ABC transporter related  36.55 
 
 
244 aa  152  7e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03231  ABC transporter ATP-binding protein  35.08 
 
 
261 aa  152  7e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.91104  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0925  ABC transporter, ATP-binding protein  35.39 
 
 
254 aa  151  8e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0493  ABC transporter related  35 
 
 
251 aa  151  8.999999999999999e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.759588  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0677  ABC transporter related  35.15 
 
 
255 aa  150  1e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0038  ABC transporter-like  37.55 
 
 
267 aa  151  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.328477  normal  0.303335 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1922  ABC transporter related  37.66 
 
 
259 aa  151  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1914  ABC transporter ATP-binding protein  37.13 
 
 
264 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2673  ABC transporter-like  35.51 
 
 
260 aa  150  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1872  ABC transporter-related protein  37.39 
 
 
244 aa  150  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00971328 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1887  ABC transporter related protein  33.89 
 
 
296 aa  150  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1498  ABC transporter related  35.02 
 
 
256 aa  150  2e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21470  amino acid ABC transporter, ATP binding component  34.71 
 
 
269 aa  149  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3462  ABC transporter related  36.71 
 
 
250 aa  149  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0534254 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0350  ATPase  34.02 
 
 
292 aa  149  3e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2886  ABC transporter, ATPase subunit  32.37 
 
 
275 aa  149  4e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.21978  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2743  ABC transporter related  35.81 
 
 
272 aa  149  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.132977 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1321  ABC transporter related protein  34.54 
 
 
259 aa  149  4e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.627863  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0662  ABC transporter related  36.48 
 
 
244 aa  149  5e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2194  ABC transporter related  32.49 
 
 
281 aa  148  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0566123  normal  0.102467 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0157  ABC transporter related  37 
 
 
263 aa  148  8e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.961661 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1953  ABC transporter related  33.76 
 
 
269 aa  148  9e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0810571  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2630  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  35.43 
 
 
278 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00585721  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0531  ABC transporter related  32.24 
 
 
261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  hitchhiker  0.00910021 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>