More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1374 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1374  ABC transporter related  100 
 
 		 258 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1354  ABC transporter related  92.25 
 
 		 258 aa  484  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4716  ABC transporter related  90.35 
 
 		 259 aa  472  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.592299  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4042  ABC transporter related  82.17 
 
 		 258 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1922  ABC transporter related  78.21 
 
 		 259 aa  398  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5749  putative ABC transporter ATP-binding protein  77.82 
 
 		 259 aa  379  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3499  ABC transporter related  65.34 
 
 		 266 aa  335  5e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.756482  normal  0.324318 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4114  ABC transporter related  64.88 
 
 		 268 aa  326  2.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0512527  normal  0.918883 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1453  ABC transporter related  65.7 
 
 		 257 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.329666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1628  ABC transporter related  64.88 
 
 		 256 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.387649 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1637  ABC transporter related  64.61 
 
 		 256 aa  319  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.967279 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1316  ABC transporter related  65.02 
 
 		 256 aa  319  1.9999999999999998e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5556  putative ABC transporter ATP-binding protein  65.71 
 
 		 264 aa  318  3.9999999999999996e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.50977 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0818  ABC transporter related  62.15 
 
 		 278 aa  317  1e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0232927  normal  0.356957 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4484  ABC transporter related  64.08 
 
 		 257 aa  316  3e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0892  ABC transporter related  61.38 
 
 		 278 aa  311  4.999999999999999e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.752922  normal  0.504506 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0852  ABC transporter related  60.96 
 
 		 278 aa  311  5.999999999999999e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.705089  normal  0.0418942 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1953  ABC transporter related  60.82 
 
 		 269 aa  304  8.000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0810571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2806  ABC transporter related  61.67 
 
 		 257 aa  300  1e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4934  ABC transporter related  61.85 
 
 		 256 aa  300  1e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0622579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4962  ABC transporter related  61.54 
 
 		 271 aa  296  2e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.520706  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2194  ABC transporter related  55.28 
 
 		 281 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0566123  normal  0.102467 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3669  ABC transporter related  59.29 
 
 		 266 aa  282  4.0000000000000003e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0691593 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1541  ABC transporter related  57.89 
 
 		 278 aa  268  8e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.033832  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2108  ABC transporter related  54.66 
 
 		 287 aa  265  8e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1020  ABC transporter, ATP-binding protein  55.51 
 
 		 285 aa  264  1e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0523  ABC transporter related  54.58 
 
 		 275 aa  264  1e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.310884 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0578  ABC transporter related  53.39 
 
 		 276 aa  262  3e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.206439  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1983  ABC transporter related  55.28 
 
 		 282 aa  262  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0366377  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0987  ABC transporter, ATP-binding protein  55.1 
 
 		 287 aa  262  4e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0627  ABC transporter ATP-binding protein  53.39 
 
 		 276 aa  261  6e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00990626  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2743  ABC transporter related  55.1 
 
 		 272 aa  260  2e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.132977 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1894  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  54 
 
 		 286 aa  259  3e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214916  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1553  ABC transporter related  55.97 
 
 		 268 aa  259  3e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.116954 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03182  ABC transporter ATP-binding protein  54.03 
 
 		 280 aa  258  9e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.501645  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2049  ABC transporter ATP-binding protein  54.13 
 
 		 259 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.558071 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2844  ABC transporter related  52.87 
 
 		 300 aa  253  3e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1719  ABC transporter related  50.81 
 
 		 257 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0483086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2513  ABC transporter related  51.42 
 
 		 259 aa  251  8.000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0824022  normal  0.0374707 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1488  ABC transporter related  51.24 
 
 		 257 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2810  ABC transporter, ATPase subunit  51.24 
 
 		 257 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.66283  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2343  ABC transporter related  54.69 
 
 		 275 aa  248  6e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464868 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22670  putative ATP-binding component of ABC transporter  53.53 
 
 		 264 aa  248  7e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420242 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0480  ABC transporter related  52.46 
 
 		 292 aa  248  8e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.104959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2316  ABC transporter related  50.62 
 
 		 258 aa  238  5e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184477  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0797  ABC transporter related  48.78 
 
 		 283 aa  236  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.126555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0646  ABC transporter, ATP-binding protein  48.78 
 
 		 283 aa  236  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1611  ABC transporter related  50.21 
 
 		 295 aa  235  5.0000000000000005e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2003  ABC transporter related  52.23 
 
 		 257 aa  234  1.0000000000000001e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0100  ABC transporter related  48.97 
 
 		 278 aa  232  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.106893  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1914  ABC transporter ATP-binding protein  53.94 
 
 		 264 aa  229  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0169  ABC transporter related  47.3 
 
 		 292 aa  226  4e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0176  ABC transporter related  47.3 
 
 		 292 aa  225  5.0000000000000005e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0314  ABC transporter ATP-binding protein  48.13 
 
 		 298 aa  225  6e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1504  ABC transporter related  53.62 
 
 		 283 aa  222  4e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0071  ABC transporter-related protein  47.33 
 
 		 279 aa  222  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04770  ABC transporter, ATP binding component  50.6 
 
 		 266 aa  219  5e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326188  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1196  ABC transporter related  50.2 
 
 		 264 aa  216  2.9999999999999998e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0374  ABC transporter, ATP-binding protein  47.6 
 
 		 280 aa  216  4e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.453677  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0157  ABC transporter related  51.48 
 
 		 263 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.961661 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0141  ABC transporter ATP-binding protein  51.05 
 
 		 263 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0633689  normal  0.467714 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0451  ABC transporter, ATP-binding protein  47.2 
 
 		 280 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0432  ABC transporter, ATP-binding protein  47.2 
 
 		 280 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.440743  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0613  ABC transporter system ATP-binding protein  47.2 
 
 		 280 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.686513  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0231  ABC transporter system ATP-binding protein  47.2 
 
 		 280 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5086  ABC transporter related  51.05 
 
 		 263 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0940761 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3200  ABC transporter system ATP-binding protein  47.2 
 
 		 280 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1362  ABC transporter, ATP-binding protein  47.2 
 
 		 280 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.820814  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0159  ABC transporter related  51.05 
 
 		 263 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2811  ABC transporter related  47.35 
 
 		 303 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.688853  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2949  ABC transporter related  47.35 
 
 		 303 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.85186  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1155  ABC transporter related  53.45 
 
 		 278 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0038  ABC transporter-like  50 
 
 		 267 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.328477  normal  0.303335 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0372  ABC transporter related  48.55 
 
 		 261 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0248  ABC transporter, ATP-binding protein  48.55 
 
 		 255 aa  211  1e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0065  ABC transporter, ATP-binding protein  47.72 
 
 		 272 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.768033  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6242  ABC transporter, ATPase subunit  47.56 
 
 		 304 aa  209  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2285  ABC transporter related  47.81 
 
 		 304 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2909  ABC transporter related  47.81 
 
 		 304 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2900  ABC transporter related  47.81 
 
 		 304 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.34746  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1840  ABC transporter related  49.6 
 
 		 263 aa  209  3e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0404  ABC transporter related  47.01 
 
 		 292 aa  209  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.027511 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3565  ABC transporter related  50.41 
 
 		 291 aa  208  6e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.830372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1680  ABC transporter ATP-binding protein  47.95 
 
 		 254 aa  207  1e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0492  ABC transporter related  46.28 
 
 		 292 aa  206  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.242272  normal  0.0865243 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0173  ABC transporter, ATP-binding protein  44.53 
 
 		 256 aa  206  4e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1982  ABC transporter related  43.98 
 
 		 259 aa  204  1e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1527  ABC transporter-related protein  41.53 
 
 		 246 aa  203  2e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.330803  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0366  ABC transporter related  44.58 
 
 		 267 aa  202  4e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0206  ABC transporter related  46.72 
 
 		 296 aa  202  6e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4224  ABC transporter, ATPase subunit  45.45 
 
 		 292 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0307  ABC transporter-related protein  45.45 
 
 		 291 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.993537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0251  ABC transporter related  45.04 
 
 		 280 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0635504 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0183  ABC transporter related  47.32 
 
 		 265 aa  194  9e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.734577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0245  ABC transporter related  44.63 
 
 		 280 aa  194  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.415257  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0921  ABC transporter related  47.16 
 
 		 291 aa  193  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1495  ABC transporter related  43.09 
 
 		 267 aa  194  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00076856  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0231  ABC transporter related  45.98 
 
 		 262 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2750  ABC-type transport system, ATPase component  43.98 
 
 		 265 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0298  ABC transporter related  45.26 
 
 		 272 aa  189  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.510066  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>