More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0921 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0921  ABC transporter related  100 
 
 
291 aa  573  1.0000000000000001e-162  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0366  ABC transporter related  80 
 
 
267 aa  418  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0307  ABC transporter-related protein  80.08 
 
 
291 aa  410  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.993537  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0251  ABC transporter related  78.82 
 
 
280 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0635504 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0245  ABC transporter related  79.22 
 
 
280 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.415257  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0231  ABC transporter related  70.97 
 
 
262 aa  364  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0183  ABC transporter related  67.58 
 
 
265 aa  362  4e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.734577  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3916  ABC transporter related  69.41 
 
 
271 aa  350  2e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0298  ABC transporter related  67.86 
 
 
272 aa  343  1e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.510066  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0404  ABC transporter related  53.47 
 
 
292 aa  285  8e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.027511 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2811  ABC transporter related  54.28 
 
 
303 aa  278  8e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.688853  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2949  ABC transporter related  54.28 
 
 
303 aa  278  9e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.85186  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6242  ABC transporter, ATPase subunit  53.41 
 
 
304 aa  277  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2900  ABC transporter related  54.35 
 
 
304 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.34746  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2909  ABC transporter related  54.35 
 
 
304 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2285  ABC transporter related  54.35 
 
 
304 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0100  ABC transporter related  54.92 
 
 
278 aa  276  3e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.106893  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0176  ABC transporter related  52.3 
 
 
292 aa  276  4e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0492  ABC transporter related  52.35 
 
 
292 aa  275  6e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.242272  normal  0.0865243 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0374  ABC transporter, ATP-binding protein  53.43 
 
 
280 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.453677  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0071  ABC transporter-related protein  55.06 
 
 
279 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0169  ABC transporter related  52.85 
 
 
292 aa  273  3e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0432  ABC transporter, ATP-binding protein  52.71 
 
 
280 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.440743  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0451  ABC transporter, ATP-binding protein  52.71 
 
 
280 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3200  ABC transporter system ATP-binding protein  52.71 
 
 
280 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0613  ABC transporter system ATP-binding protein  52.71 
 
 
280 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.686513  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0231  ABC transporter system ATP-binding protein  52.71 
 
 
280 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1982  ABC transporter related  51.95 
 
 
259 aa  271  8.000000000000001e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1362  ABC transporter, ATP-binding protein  52.71 
 
 
280 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.820814  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0314  ABC transporter ATP-binding protein  53.87 
 
 
298 aa  269  4e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4224  ABC transporter, ATPase subunit  52.35 
 
 
292 aa  269  4e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0065  ABC transporter, ATP-binding protein  52.77 
 
 
272 aa  269  5e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.768033  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0206  ABC transporter related  52.67 
 
 
296 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2343  ABC transporter related  50.18 
 
 
275 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00464868 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0173  ABC transporter, ATP-binding protein  50.59 
 
 
256 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2366  ABC transporter related  50.2 
 
 
256 aa  227  2e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0154742  normal  0.784047 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0797  ABC transporter related  51.61 
 
 
283 aa  227  2e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.126555  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0646  ABC transporter, ATP-binding protein  51.61 
 
 
283 aa  227  2e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2513  ABC transporter related  48.22 
 
 
259 aa  224  2e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0824022  normal  0.0374707 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1719  ABC transporter related  48.05 
 
 
257 aa  223  4e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0483086  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22670  putative ATP-binding component of ABC transporter  48.86 
 
 
264 aa  223  4e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420242 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1488  ABC transporter related  46.85 
 
 
257 aa  218  6e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2810  ABC transporter, ATPase subunit  46.85 
 
 
257 aa  218  6e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.66283  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0578  ABC transporter related  46.56 
 
 
276 aa  217  2e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.206439  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03182  ABC transporter ATP-binding protein  46.82 
 
 
280 aa  216  2.9999999999999998e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.501645  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0480  ABC transporter related  48.46 
 
 
292 aa  215  5.9999999999999996e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.104959  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2049  ABC transporter ATP-binding protein  47.89 
 
 
259 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.558071 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0248  ABC transporter, ATP-binding protein  49.8 
 
 
255 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0627  ABC transporter ATP-binding protein  46.18 
 
 
276 aa  213  2.9999999999999995e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00990626  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0523  ABC transporter related  45.82 
 
 
275 aa  212  5.999999999999999e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.310884 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1637  ABC transporter related  46.69 
 
 
256 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.967279 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2743  ABC transporter related  48.63 
 
 
272 aa  210  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.132977 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1611  ABC transporter related  43.97 
 
 
295 aa  209  4e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5556  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.79 
 
 
264 aa  209  4e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.50977 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1628  ABC transporter related  46.22 
 
 
256 aa  209  5e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.387649 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2316  ABC transporter related  47.41 
 
 
258 aa  208  7e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184477  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4484  ABC transporter related  45.8 
 
 
257 aa  208  8e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1680  ABC transporter ATP-binding protein  51.08 
 
 
254 aa  208  9e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1453  ABC transporter related  46.61 
 
 
257 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.329666  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2108  ABC transporter related  44.92 
 
 
287 aa  206  4e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2003  ABC transporter related  49.21 
 
 
257 aa  206  4e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1504  ABC transporter related  49.8 
 
 
283 aa  204  1e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1914  ABC transporter ATP-binding protein  48.86 
 
 
264 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2276  ABC transporter related  51 
 
 
263 aa  204  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.793802  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1316  ABC transporter related  46.48 
 
 
256 aa  204  2e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3499  ABC transporter related  45.16 
 
 
266 aa  203  3e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.756482  normal  0.324318 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4716  ABC transporter related  47.81 
 
 
259 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.592299  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0892  ABC transporter related  41.76 
 
 
278 aa  202  6e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.752922  normal  0.504506 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2806  ABC transporter related  44.98 
 
 
257 aa  201  9e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0852  ABC transporter related  41.39 
 
 
278 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.705089  normal  0.0418942 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2844  ABC transporter related  46.33 
 
 
300 aa  201  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1020  ABC transporter, ATP-binding protein  44.53 
 
 
285 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0038  ABC transporter-like  48.82 
 
 
267 aa  200  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.328477  normal  0.303335 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2194  ABC transporter related  44.26 
 
 
281 aa  200  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0566123  normal  0.102467 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4114  ABC transporter related  43.12 
 
 
268 aa  200  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0512527  normal  0.918883 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0987  ABC transporter, ATP-binding protein  44.14 
 
 
287 aa  199  3.9999999999999996e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1840  ABC transporter related  50.79 
 
 
263 aa  198  7.999999999999999e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0157  ABC transporter related  46.72 
 
 
263 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.961661 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1354  ABC transporter related  48.21 
 
 
258 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0141  ABC transporter ATP-binding protein  47.24 
 
 
263 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0633689  normal  0.467714 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0818  ABC transporter related  41.94 
 
 
278 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0232927  normal  0.356957 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0159  ABC transporter related  47.24 
 
 
263 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4042  ABC transporter related  48.66 
 
 
258 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1553  ABC transporter related  44.88 
 
 
268 aa  196  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.116954 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1922  ABC transporter related  47.14 
 
 
259 aa  196  3e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1207  ABC transporter related  53.41 
 
 
251 aa  196  5.000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.882488 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5749  putative ABC transporter ATP-binding protein  49.34 
 
 
259 aa  195  6e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5086  ABC transporter related  47.6 
 
 
263 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0940761 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3565  ABC transporter related  46.93 
 
 
291 aa  194  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.830372  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1374  ABC transporter related  47.16 
 
 
258 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1953  ABC transporter related  42.31 
 
 
269 aa  191  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0810571  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04770  ABC transporter, ATP binding component  45.86 
 
 
266 aa  190  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326188  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1541  ABC transporter related  46.35 
 
 
278 aa  190  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.033832  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2024  hypothetical protein  44.49 
 
 
245 aa  190  2.9999999999999997e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2029  hypothetical protein  44.08 
 
 
245 aa  189  4e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3101  putative ABC transporter ATP-binding subunit  40.69 
 
 
279 aa  189  5e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1196  ABC transporter related  46.03 
 
 
264 aa  188  9e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1155  ABC transporter related  47.6 
 
 
278 aa  188  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0372  ABC transporter related  45.88 
 
 
261 aa  187  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1204  ABC transporter related  51.43 
 
 
257 aa  186  3e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0967348 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>