More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0366 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_0366  ABC transporter related  100 
 
 
267 aa  531  1e-150  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0921  ABC transporter related  80.65 
 
 
291 aa  415  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0307  ABC transporter-related protein  81.71 
 
 
291 aa  412  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.993537  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0245  ABC transporter related  74.16 
 
 
280 aa  389  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.415257  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0251  ABC transporter related  73.78 
 
 
280 aa  386  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0635504 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0231  ABC transporter related  70 
 
 
262 aa  358  3e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0183  ABC transporter related  66.14 
 
 
265 aa  350  8.999999999999999e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.734577  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0298  ABC transporter related  68.53 
 
 
272 aa  342  2.9999999999999997e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.510066  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3916  ABC transporter related  66.13 
 
 
271 aa  331  6e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0404  ABC transporter related  55.6 
 
 
292 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.027511 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0100  ABC transporter related  54.81 
 
 
278 aa  280  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.106893  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0314  ABC transporter ATP-binding protein  56.59 
 
 
298 aa  278  6e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0071  ABC transporter-related protein  56.64 
 
 
279 aa  278  7e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0492  ABC transporter related  54.02 
 
 
292 aa  277  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.242272  normal  0.0865243 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6242  ABC transporter, ATPase subunit  53.38 
 
 
304 aa  277  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0176  ABC transporter related  55.43 
 
 
292 aa  277  2e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2949  ABC transporter related  54.47 
 
 
303 aa  275  4e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.85186  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2909  ABC transporter related  55.51 
 
 
304 aa  275  5e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2811  ABC transporter related  54.47 
 
 
303 aa  275  5e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.688853  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2285  ABC transporter related  55.51 
 
 
304 aa  275  5e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2900  ABC transporter related  55.51 
 
 
304 aa  275  5e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.34746  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0169  ABC transporter related  53.44 
 
 
292 aa  275  7e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0231  ABC transporter system ATP-binding protein  54.86 
 
 
280 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1362  ABC transporter, ATP-binding protein  54.86 
 
 
280 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.820814  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0451  ABC transporter, ATP-binding protein  54.86 
 
 
280 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0613  ABC transporter system ATP-binding protein  54.86 
 
 
280 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.686513  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0432  ABC transporter, ATP-binding protein  54.86 
 
 
280 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.440743  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3200  ABC transporter system ATP-binding protein  54.86 
 
 
280 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0065  ABC transporter, ATP-binding protein  58.72 
 
 
272 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.768033  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0374  ABC transporter, ATP-binding protein  54.09 
 
 
280 aa  271  1e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.453677  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0206  ABC transporter related  55.81 
 
 
296 aa  265  5e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1982  ABC transporter related  51.56 
 
 
259 aa  265  5e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4224  ABC transporter, ATPase subunit  53.26 
 
 
292 aa  265  8e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2513  ABC transporter related  49.62 
 
 
259 aa  237  1e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0824022  normal  0.0374707 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0173  ABC transporter, ATP-binding protein  49.61 
 
 
256 aa  236  3e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2366  ABC transporter related  52.61 
 
 
256 aa  236  3e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0154742  normal  0.784047 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2343  ABC transporter related  48.86 
 
 
275 aa  236  4e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00464868 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0578  ABC transporter related  48.8 
 
 
276 aa  232  4.0000000000000004e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.206439  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1719  ABC transporter related  49.42 
 
 
257 aa  232  6e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0483086  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0627  ABC transporter ATP-binding protein  46.64 
 
 
276 aa  231  9e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00990626  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0646  ABC transporter, ATP-binding protein  52.77 
 
 
283 aa  231  9e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0797  ABC transporter related  52.77 
 
 
283 aa  231  9e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.126555  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2049  ABC transporter ATP-binding protein  49.41 
 
 
259 aa  230  1e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.558071 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0480  ABC transporter related  48.85 
 
 
292 aa  229  3e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.104959  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22670  putative ATP-binding component of ABC transporter  50.4 
 
 
264 aa  229  4e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420242 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2810  ABC transporter, ATPase subunit  49.01 
 
 
257 aa  228  5e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.66283  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1488  ABC transporter related  49.01 
 
 
257 aa  228  5e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0523  ABC transporter related  48.62 
 
 
275 aa  228  9e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.310884 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1628  ABC transporter related  49.6 
 
 
256 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.387649 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03182  ABC transporter ATP-binding protein  47.98 
 
 
280 aa  227  2e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.501645  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1637  ABC transporter related  47.64 
 
 
256 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.967279 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1611  ABC transporter related  46.92 
 
 
295 aa  223  2e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5556  putative ABC transporter ATP-binding protein  46.27 
 
 
264 aa  222  4e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.50977 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2743  ABC transporter related  48.63 
 
 
272 aa  221  7e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.132977 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2806  ABC transporter related  47.92 
 
 
257 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4484  ABC transporter related  47.6 
 
 
257 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4114  ABC transporter related  46.47 
 
 
268 aa  220  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0512527  normal  0.918883 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2316  ABC transporter related  48.62 
 
 
258 aa  219  3.9999999999999997e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184477  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2003  ABC transporter related  49.41 
 
 
257 aa  216  2.9999999999999998e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2844  ABC transporter related  46.83 
 
 
300 aa  215  5.9999999999999996e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0038  ABC transporter-like  49.61 
 
 
267 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.328477  normal  0.303335 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1680  ABC transporter ATP-binding protein  50.87 
 
 
254 aa  214  9.999999999999999e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1453  ABC transporter related  46.4 
 
 
257 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.329666  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2194  ABC transporter related  47.16 
 
 
281 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0566123  normal  0.102467 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1316  ABC transporter related  46.03 
 
 
256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1840  ABC transporter related  51.19 
 
 
263 aa  212  3.9999999999999995e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1553  ABC transporter related  50.63 
 
 
268 aa  212  4.9999999999999996e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.116954 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1504  ABC transporter related  49.01 
 
 
283 aa  210  1e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4042  ABC transporter related  47.48 
 
 
258 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4716  ABC transporter related  45.53 
 
 
259 aa  209  5e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.592299  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5086  ABC transporter related  47.06 
 
 
263 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0940761 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1922  ABC transporter related  45.99 
 
 
259 aa  208  6e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0818  ABC transporter related  42.31 
 
 
278 aa  208  6e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0232927  normal  0.356957 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1953  ABC transporter related  42.37 
 
 
269 aa  208  7e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0810571  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1354  ABC transporter related  45.78 
 
 
258 aa  208  8e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0159  ABC transporter related  47.06 
 
 
263 aa  208  9e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0141  ABC transporter ATP-binding protein  48 
 
 
263 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0633689  normal  0.467714 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1914  ABC transporter ATP-binding protein  49.6 
 
 
264 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0852  ABC transporter related  43.08 
 
 
278 aa  207  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.705089  normal  0.0418942 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0892  ABC transporter related  42.69 
 
 
278 aa  206  3e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.752922  normal  0.504506 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0157  ABC transporter related  47.6 
 
 
263 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.961661 
 
 
-
 
NC_004310  BR1020  ABC transporter, ATP-binding protein  44.36 
 
 
285 aa  205  5e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3499  ABC transporter related  46.26 
 
 
266 aa  205  6e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.756482  normal  0.324318 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0248  ABC transporter, ATP-binding protein  46.94 
 
 
255 aa  205  6e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0987  ABC transporter, ATP-binding protein  43.98 
 
 
287 aa  204  8e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2108  ABC transporter related  46 
 
 
287 aa  205  8e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1894  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  47.2 
 
 
286 aa  203  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214916  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1196  ABC transporter related  46.09 
 
 
264 aa  202  4e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1374  ABC transporter related  44.58 
 
 
258 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2276  ABC transporter related  48.44 
 
 
263 aa  201  8e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.793802  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1155  ABC transporter related  48.05 
 
 
278 aa  201  9e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5749  putative ABC transporter ATP-binding protein  45.34 
 
 
259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04770  ABC transporter, ATP binding component  47.1 
 
 
266 aa  200  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326188  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3669  ABC transporter related  45.85 
 
 
266 aa  199  3e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0691593 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0372  ABC transporter related  46.4 
 
 
261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1983  ABC transporter related  47.16 
 
 
282 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0366377  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2024  hypothetical protein  45.49 
 
 
245 aa  196  3e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1541  ABC transporter related  47.21 
 
 
278 aa  196  3e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.033832  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2029  hypothetical protein  45.08 
 
 
245 aa  195  5.000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4934  ABC transporter related  44.76 
 
 
256 aa  193  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0622579  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>