More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03182 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03182  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
280 aa  562  1.0000000000000001e-159  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.501645  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0523  ABC transporter related  81.16 
 
 
275 aa  447  1.0000000000000001e-124  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.310884 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0578  ABC transporter related  79.77 
 
 
276 aa  429  1e-119  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.206439  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0627  ABC transporter ATP-binding protein  79.77 
 
 
276 aa  428  1e-119  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00990626  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2844  ABC transporter related  64.71 
 
 
300 aa  327  1.0000000000000001e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2743  ABC transporter related  64.94 
 
 
272 aa  322  3e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.132977 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2810  ABC transporter, ATPase subunit  62.7 
 
 
257 aa  319  3e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.66283  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1488  ABC transporter related  62.7 
 
 
257 aa  319  3e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1719  ABC transporter related  63.45 
 
 
257 aa  317  1e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0483086  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2343  ABC transporter related  62.25 
 
 
275 aa  311  5.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00464868 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22670  putative ATP-binding component of ABC transporter  65.48 
 
 
264 aa  311  9e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420242 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1611  ABC transporter related  64.26 
 
 
295 aa  310  2e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2316  ABC transporter related  64.23 
 
 
258 aa  307  1.0000000000000001e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184477  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2513  ABC transporter related  62.4 
 
 
259 aa  307  2.0000000000000002e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0824022  normal  0.0374707 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0480  ABC transporter related  62.8 
 
 
292 aa  305  4.0000000000000004e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.104959  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2049  ABC transporter ATP-binding protein  65.04 
 
 
259 aa  304  1.0000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.558071 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1155  ABC transporter related  68.03 
 
 
278 aa  300  2e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0141  ABC transporter ATP-binding protein  64.96 
 
 
263 aa  298  8e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0633689  normal  0.467714 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0159  ABC transporter related  65.74 
 
 
263 aa  297  1e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0157  ABC transporter related  64.45 
 
 
263 aa  295  7e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.961661 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0372  ABC transporter related  65.57 
 
 
261 aa  294  9e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1914  ABC transporter ATP-binding protein  66.27 
 
 
264 aa  292  3e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5086  ABC transporter related  65.06 
 
 
263 aa  291  7e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0940761 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2806  ABC transporter related  59.13 
 
 
257 aa  288  5.0000000000000004e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04770  ABC transporter, ATP binding component  65.6 
 
 
266 aa  288  7e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326188  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2003  ABC transporter related  63.39 
 
 
257 aa  286  2.9999999999999996e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0038  ABC transporter-like  61.72 
 
 
267 aa  281  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.328477  normal  0.303335 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0892  ABC transporter related  54.85 
 
 
278 aa  278  6e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.752922  normal  0.504506 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0852  ABC transporter related  54.85 
 
 
278 aa  278  7e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.705089  normal  0.0418942 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0818  ABC transporter related  54.12 
 
 
278 aa  277  2e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0232927  normal  0.356957 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4114  ABC transporter related  54.86 
 
 
268 aa  274  1.0000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0512527  normal  0.918883 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1504  ABC transporter related  60.4 
 
 
283 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5556  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.33 
 
 
264 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.50977 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3669  ABC transporter related  61.26 
 
 
266 aa  273  2.0000000000000002e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0691593 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1628  ABC transporter related  56.5 
 
 
256 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.387649 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0404  ABC transporter related  53.03 
 
 
292 aa  272  3e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.027511 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1953  ABC transporter related  56.97 
 
 
269 aa  272  5.000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0810571  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4484  ABC transporter related  55.69 
 
 
257 aa  271  8.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6242  ABC transporter, ATPase subunit  52.71 
 
 
304 aa  270  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1637  ABC transporter related  55.28 
 
 
256 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.967279 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1196  ABC transporter related  59.07 
 
 
264 aa  269  4e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2909  ABC transporter related  52.29 
 
 
304 aa  268  8e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2285  ABC transporter related  52.29 
 
 
304 aa  268  8e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2900  ABC transporter related  52.29 
 
 
304 aa  268  8e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.34746  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2194  ABC transporter related  52.51 
 
 
281 aa  268  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0566123  normal  0.102467 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1453  ABC transporter related  53.88 
 
 
257 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.329666  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4716  ABC transporter related  54.98 
 
 
259 aa  266  2e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.592299  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2811  ABC transporter related  52.57 
 
 
303 aa  264  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.688853  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2949  ABC transporter related  52.57 
 
 
303 aa  264  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.85186  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4934  ABC transporter related  60.41 
 
 
256 aa  263  3e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0622579  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1894  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  57.72 
 
 
286 aa  261  6.999999999999999e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214916  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1374  ABC transporter related  53.33 
 
 
258 aa  261  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3565  ABC transporter related  57.82 
 
 
291 aa  261  8.999999999999999e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.830372  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0374  ABC transporter, ATP-binding protein  53.54 
 
 
280 aa  260  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.453677  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4042  ABC transporter related  53.88 
 
 
258 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4962  ABC transporter related  57.74 
 
 
271 aa  259  3e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.520706  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1354  ABC transporter related  52.94 
 
 
258 aa  259  4e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0231  ABC transporter system ATP-binding protein  52.53 
 
 
280 aa  257  1e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0248  ABC transporter, ATP-binding protein  55.37 
 
 
255 aa  257  1e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0613  ABC transporter system ATP-binding protein  52.53 
 
 
280 aa  257  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.686513  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0432  ABC transporter, ATP-binding protein  52.53 
 
 
280 aa  257  1e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.440743  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0451  ABC transporter, ATP-binding protein  52.53 
 
 
280 aa  257  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1362  ABC transporter, ATP-binding protein  52.53 
 
 
280 aa  257  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.820814  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3200  ABC transporter system ATP-binding protein  52.53 
 
 
280 aa  257  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3499  ABC transporter related  50.57 
 
 
266 aa  257  2e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.756482  normal  0.324318 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1316  ABC transporter related  53.47 
 
 
256 aa  257  2e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0169  ABC transporter related  49.43 
 
 
292 aa  254  9e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0176  ABC transporter related  49.06 
 
 
292 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0100  ABC transporter related  51.41 
 
 
278 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.106893  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0065  ABC transporter, ATP-binding protein  52.8 
 
 
272 aa  251  6e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.768033  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1922  ABC transporter related  52.59 
 
 
259 aa  251  6e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1983  ABC transporter related  54.15 
 
 
282 aa  251  7e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0366377  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1541  ABC transporter related  52.27 
 
 
278 aa  251  8.000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.033832  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0071  ABC transporter-related protein  53.01 
 
 
279 aa  251  9.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1553  ABC transporter related  54.26 
 
 
268 aa  250  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.116954 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0314  ABC transporter ATP-binding protein  49.04 
 
 
298 aa  249  2e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2108  ABC transporter related  52.51 
 
 
287 aa  249  2e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0492  ABC transporter related  51 
 
 
292 aa  249  4e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.242272  normal  0.0865243 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5749  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.29 
 
 
259 aa  245  6e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1020  ABC transporter, ATP-binding protein  54.1 
 
 
285 aa  244  8e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0987  ABC transporter, ATP-binding protein  53.69 
 
 
287 aa  243  1.9999999999999999e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1840  ABC transporter related  57.31 
 
 
263 aa  241  7e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0206  ABC transporter related  51.41 
 
 
296 aa  241  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4224  ABC transporter, ATPase subunit  50 
 
 
292 aa  238  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1359  ABC transporter related protein  53.85 
 
 
286 aa  237  2e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0251  ABC transporter related  51.19 
 
 
280 aa  236  4e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0635504 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0245  ABC transporter related  51.19 
 
 
280 aa  235  7e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.415257  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1204  ABC transporter related  57.43 
 
 
257 aa  234  1.0000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0967348 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0307  ABC transporter-related protein  50 
 
 
291 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.993537  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0366  ABC transporter related  48.03 
 
 
267 aa  231  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0183  ABC transporter related  50.62 
 
 
265 aa  228  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.734577  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1680  ABC transporter ATP-binding protein  51.64 
 
 
254 aa  224  9e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1982  ABC transporter related  45.56 
 
 
259 aa  223  2e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0231  ABC transporter related  51.06 
 
 
262 aa  223  4e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0797  ABC transporter related  48.36 
 
 
283 aa  218  7.999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.126555  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0646  ABC transporter, ATP-binding protein  48.36 
 
 
283 aa  218  7.999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0921  ABC transporter related  48.4 
 
 
291 aa  216  2.9999999999999998e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0298  ABC transporter related  46.77 
 
 
272 aa  215  5.9999999999999996e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.510066  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3916  ABC transporter related  48.51 
 
 
271 aa  211  1e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1527  ABC transporter-related protein  42.15 
 
 
246 aa  209  3e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.330803  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>