More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1983 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1983  ABC transporter related  100 
 
 
282 aa  567  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0366377  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2194  ABC transporter related  94.01 
 
 
281 aa  523  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0566123  normal  0.102467 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1553  ABC transporter related  83 
 
 
268 aa  397  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.116954 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1894  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  74.35 
 
 
286 aa  380  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214916  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1541  ABC transporter related  69.17 
 
 
278 aa  362  5.0000000000000005e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.033832  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2108  ABC transporter related  66.07 
 
 
287 aa  358  4e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1020  ABC transporter, ATP-binding protein  68.66 
 
 
285 aa  354  1e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0987  ABC transporter, ATP-binding protein  68.28 
 
 
287 aa  352  4e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4114  ABC transporter related  64.54 
 
 
268 aa  347  1e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0512527  normal  0.918883 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0818  ABC transporter related  62.45 
 
 
278 aa  346  2e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0232927  normal  0.356957 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0852  ABC transporter related  65.6 
 
 
278 aa  344  7e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.705089  normal  0.0418942 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0892  ABC transporter related  63.46 
 
 
278 aa  344  7e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.752922  normal  0.504506 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2806  ABC transporter related  66.94 
 
 
257 aa  335  3.9999999999999995e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4962  ABC transporter related  67.84 
 
 
271 aa  334  1e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.520706  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1953  ABC transporter related  65.04 
 
 
269 aa  332  3e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0810571  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1628  ABC transporter related  63.45 
 
 
256 aa  325  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.387649 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4484  ABC transporter related  63.05 
 
 
257 aa  323  2e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4934  ABC transporter related  67.34 
 
 
256 aa  323  2e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0622579  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1453  ABC transporter related  61.85 
 
 
257 aa  321  8e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.329666  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5556  putative ABC transporter ATP-binding protein  62.25 
 
 
264 aa  320  9.999999999999999e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.50977 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1637  ABC transporter related  62.25 
 
 
256 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.967279 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1316  ABC transporter related  61.45 
 
 
256 aa  318  7.999999999999999e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3669  ABC transporter related  64.14 
 
 
266 aa  314  9.999999999999999e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0691593 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2513  ABC transporter related  59.59 
 
 
259 aa  301  8.000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0824022  normal  0.0374707 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3499  ABC transporter related  56.97 
 
 
266 aa  300  2e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.756482  normal  0.324318 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22670  putative ATP-binding component of ABC transporter  56.73 
 
 
264 aa  293  3e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420242 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2049  ABC transporter ATP-binding protein  60.82 
 
 
259 aa  290  2e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.558071 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4716  ABC transporter related  56.5 
 
 
259 aa  289  4e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.592299  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2343  ABC transporter related  57.96 
 
 
275 aa  288  7e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00464868 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1611  ABC transporter related  56.73 
 
 
295 aa  287  1e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4042  ABC transporter related  54.26 
 
 
258 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1354  ABC transporter related  55.69 
 
 
258 aa  284  9e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1488  ABC transporter related  54.3 
 
 
257 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2810  ABC transporter, ATPase subunit  54.3 
 
 
257 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.66283  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1719  ABC transporter related  54.9 
 
 
257 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0483086  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2316  ABC transporter related  57.55 
 
 
258 aa  281  6.000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184477  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1374  ABC transporter related  55.28 
 
 
258 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0480  ABC transporter related  55.04 
 
 
292 aa  280  2e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.104959  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1922  ABC transporter related  52.73 
 
 
259 aa  279  3e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5749  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.61 
 
 
259 aa  277  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2743  ABC transporter related  54.55 
 
 
272 aa  278  1e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.132977 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0578  ABC transporter related  50.75 
 
 
276 aa  277  2e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.206439  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0627  ABC transporter ATP-binding protein  50.37 
 
 
276 aa  275  7e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00990626  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0523  ABC transporter related  53.26 
 
 
275 aa  272  4.0000000000000004e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.310884 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0372  ABC transporter related  55.65 
 
 
261 aa  271  7e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1914  ABC transporter ATP-binding protein  56.73 
 
 
264 aa  271  9e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2844  ABC transporter related  55.1 
 
 
300 aa  271  1e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0159  ABC transporter related  56.85 
 
 
263 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0141  ABC transporter ATP-binding protein  56.45 
 
 
263 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0633689  normal  0.467714 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04770  ABC transporter, ATP binding component  56.85 
 
 
266 aa  268  7e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326188  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1504  ABC transporter related  59.02 
 
 
283 aa  268  8e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0157  ABC transporter related  55.6 
 
 
263 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.961661 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5086  ABC transporter related  55.87 
 
 
263 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0940761 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1155  ABC transporter related  55.2 
 
 
278 aa  264  1e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2003  ABC transporter related  57.09 
 
 
257 aa  264  1e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03182  ABC transporter ATP-binding protein  53.63 
 
 
280 aa  263  3e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.501645  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1196  ABC transporter related  54.25 
 
 
264 aa  261  1e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0038  ABC transporter-like  52.76 
 
 
267 aa  258  7e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.328477  normal  0.303335 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0248  ABC transporter, ATP-binding protein  53.53 
 
 
255 aa  256  2e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1680  ABC transporter ATP-binding protein  51.64 
 
 
254 aa  248  6e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0071  ABC transporter-related protein  47.76 
 
 
279 aa  241  7.999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0100  ABC transporter related  49.18 
 
 
278 aa  240  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.106893  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0169  ABC transporter related  48.99 
 
 
292 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0176  ABC transporter related  48.58 
 
 
292 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0314  ABC transporter ATP-binding protein  48.99 
 
 
298 aa  239  4e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1840  ABC transporter related  53.94 
 
 
263 aa  238  1e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2909  ABC transporter related  46.75 
 
 
304 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2285  ABC transporter related  46.75 
 
 
304 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2900  ABC transporter related  46.75 
 
 
304 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.34746  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3200  ABC transporter system ATP-binding protein  46.25 
 
 
280 aa  235  7e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0231  ABC transporter system ATP-binding protein  46.25 
 
 
280 aa  235  7e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0613  ABC transporter system ATP-binding protein  46.25 
 
 
280 aa  235  7e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.686513  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0432  ABC transporter, ATP-binding protein  46.25 
 
 
280 aa  235  7e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.440743  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1362  ABC transporter, ATP-binding protein  46.25 
 
 
280 aa  235  7e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.820814  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0451  ABC transporter, ATP-binding protein  46.25 
 
 
280 aa  235  7e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2811  ABC transporter related  46.34 
 
 
303 aa  234  9e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.688853  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1359  ABC transporter related protein  51.81 
 
 
286 aa  234  1.0000000000000001e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6242  ABC transporter, ATPase subunit  46.34 
 
 
304 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2949  ABC transporter related  46.34 
 
 
303 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.85186  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0374  ABC transporter, ATP-binding protein  45.85 
 
 
280 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.453677  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0797  ABC transporter related  50.21 
 
 
283 aa  232  4.0000000000000004e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.126555  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0404  ABC transporter related  44.91 
 
 
292 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.027511 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0646  ABC transporter, ATP-binding protein  50.21 
 
 
283 aa  232  4.0000000000000004e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0065  ABC transporter, ATP-binding protein  45.9 
 
 
272 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.768033  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3565  ABC transporter related  53.62 
 
 
291 aa  229  3e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.830372  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0492  ABC transporter related  47.95 
 
 
292 aa  229  4e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.242272  normal  0.0865243 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1527  ABC transporter-related protein  45.45 
 
 
246 aa  228  8e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.330803  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0173  ABC transporter, ATP-binding protein  47.41 
 
 
256 aa  224  1e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0206  ABC transporter related  44.83 
 
 
296 aa  224  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4224  ABC transporter, ATPase subunit  46.69 
 
 
292 aa  223  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0307  ABC transporter-related protein  46.77 
 
 
291 aa  223  3e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.993537  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0183  ABC transporter related  50.43 
 
 
265 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.734577  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0251  ABC transporter related  45.14 
 
 
280 aa  217  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0635504 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0245  ABC transporter related  44.75 
 
 
280 aa  215  5.9999999999999996e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.415257  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1982  ABC transporter related  43.55 
 
 
259 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0231  ABC transporter related  50.43 
 
 
262 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2029  hypothetical protein  47.48 
 
 
245 aa  213  2.9999999999999995e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0366  ABC transporter related  47.16 
 
 
267 aa  212  3.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1321  ABC transporter related protein  44.67 
 
 
259 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.627863  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0298  ABC transporter related  47.04 
 
 
272 aa  212  4.9999999999999996e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.510066  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>