More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0176 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0176  ABC transporter related  100 
 
 		 292 aa  590  1e-167  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0169  ABC transporter related  96.58 
 
 		 292 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0314  ABC transporter ATP-binding protein  90.67 
 
 		 298 aa  545  1e-154  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0100  ABC transporter related  75.79 
 
 		 278 aa  397  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.106893  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0071  ABC transporter-related protein  73.44 
 
 		 279 aa  385  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0404  ABC transporter related  61.23 
 
 		 292 aa  338  9e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.027511 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6242  ABC transporter, ATPase subunit  60.81 
 
 		 304 aa  332  5e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2909  ABC transporter related  61.17 
 
 		 304 aa  332  5e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2285  ABC transporter related  61.17 
 
 		 304 aa  332  5e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2900  ABC transporter related  61.17 
 
 		 304 aa  332  5e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.34746  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0492  ABC transporter related  62.64 
 
 		 292 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.242272  normal  0.0865243 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2811  ABC transporter related  61.6 
 
 		 303 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.688853  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2949  ABC transporter related  61.6 
 
 		 303 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.85186  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0432  ABC transporter, ATP-binding protein  61.22 
 
 		 280 aa  326  3e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.440743  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0451  ABC transporter, ATP-binding protein  61.22 
 
 		 280 aa  326  3e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0613  ABC transporter system ATP-binding protein  61.22 
 
 		 280 aa  326  3e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.686513  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1362  ABC transporter, ATP-binding protein  61.22 
 
 		 280 aa  326  3e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.820814  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0374  ABC transporter, ATP-binding protein  60.84 
 
 		 280 aa  326  3e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.453677  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0231  ABC transporter system ATP-binding protein  61.22 
 
 		 280 aa  326  3e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3200  ABC transporter system ATP-binding protein  61.22 
 
 		 280 aa  326  3e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0065  ABC transporter, ATP-binding protein  60.84 
 
 		 272 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.768033  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0206  ABC transporter related  61.51 
 
 		 296 aa  317  1e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4224  ABC transporter, ATPase subunit  61.51 
 
 		 292 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1982  ABC transporter related  56.35 
 
 		 259 aa  294  1e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0245  ABC transporter related  53.38 
 
 		 280 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.415257  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0251  ABC transporter related  53.01 
 
 		 280 aa  280  1e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0635504 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0298  ABC transporter related  56.81 
 
 		 272 aa  277  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.510066  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0366  ABC transporter related  55.43 
 
 		 267 aa  277  2e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0307  ABC transporter-related protein  55.02 
 
 		 291 aa  272  5.000000000000001e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.993537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0921  ABC transporter related  54.58 
 
 		 291 aa  270  2.9999999999999997e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0183  ABC transporter related  52.09 
 
 		 265 aa  266  2.9999999999999995e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.734577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0231  ABC transporter related  54.98 
 
 		 262 aa  265  5e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2343  ABC transporter related  50 
 
 		 275 aa  265  8e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464868 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3916  ABC transporter related  56.28 
 
 		 271 aa  263  2e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2810  ABC transporter, ATPase subunit  51.19 
 
 		 257 aa  260  2e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.66283  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1719  ABC transporter related  51.78 
 
 		 257 aa  260  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0483086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1488  ABC transporter related  51.19 
 
 		 257 aa  260  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22670  putative ATP-binding component of ABC transporter  51.98 
 
 		 264 aa  258  7e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420242 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2316  ABC transporter related  50.61 
 
 		 258 aa  255  7e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184477  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2743  ABC transporter related  50.81 
 
 		 272 aa  255  7e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.132977 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0646  ABC transporter, ATP-binding protein  50.59 
 
 		 283 aa  252  5.000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0797  ABC transporter related  50.59 
 
 		 283 aa  252  5.000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.126555  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0173  ABC transporter, ATP-binding protein  50.61 
 
 		 256 aa  252  6e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03182  ABC transporter ATP-binding protein  49.61 
 
 		 280 aa  250  2e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.501645  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1611  ABC transporter related  50 
 
 		 295 aa  250  2e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0480  ABC transporter related  48.64 
 
 		 292 aa  250  2e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.104959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1628  ABC transporter related  51.23 
 
 		 256 aa  248  7e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.387649 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0852  ABC transporter related  46.95 
 
 		 278 aa  248  1e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.705089  normal  0.0418942 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0627  ABC transporter ATP-binding protein  49 
 
 		 276 aa  247  1e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00990626  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0892  ABC transporter related  46.56 
 
 		 278 aa  247  2e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.752922  normal  0.504506 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4114  ABC transporter related  47.98 
 
 		 268 aa  246  3e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0512527  normal  0.918883 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1453  ABC transporter related  50 
 
 		 257 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.329666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0818  ABC transporter related  46.18 
 
 		 278 aa  246  4e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0232927  normal  0.356957 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2049  ABC transporter ATP-binding protein  50.2 
 
 		 259 aa  245  6e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.558071 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1637  ABC transporter related  50 
 
 		 256 aa  244  9e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.967279 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1894  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  51.92 
 
 		 286 aa  244  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214916  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5556  putative ABC transporter ATP-binding protein  48.84 
 
 		 264 aa  243  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.50977 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0578  ABC transporter related  48.19 
 
 		 276 aa  243  3e-63  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.206439  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2513  ABC transporter related  49 
 
 		 259 aa  241  7e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0824022  normal  0.0374707 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2194  ABC transporter related  48.99 
 
 		 281 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0566123  normal  0.102467 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1922  ABC transporter related  46.85 
 
 		 259 aa  241  1e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1914  ABC transporter ATP-binding protein  52.21 
 
 		 264 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0523  ABC transporter related  46.18 
 
 		 275 aa  240  2.9999999999999997e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.310884 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4484  ABC transporter related  49.59 
 
 		 257 aa  239  4e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0372  ABC transporter related  50 
 
 		 261 aa  239  4e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1504  ABC transporter related  50.19 
 
 		 283 aa  239  4e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1316  ABC transporter related  47.58 
 
 		 256 aa  239  5.999999999999999e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0038  ABC transporter-like  50.98 
 
 		 267 aa  238  8e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.328477  normal  0.303335 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2806  ABC transporter related  49.59 
 
 		 257 aa  238  9e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0157  ABC transporter related  50.4 
 
 		 263 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.961661 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5086  ABC transporter related  50.99 
 
 		 263 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0940761 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3499  ABC transporter related  47.81 
 
 		 266 aa  236  2e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.756482  normal  0.324318 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2844  ABC transporter related  47.15 
 
 		 300 aa  236  3e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1953  ABC transporter related  46.31 
 
 		 269 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0810571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1155  ABC transporter related  50 
 
 		 278 aa  235  6e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1541  ABC transporter related  50.41 
 
 		 278 aa  235  8e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.033832  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0248  ABC transporter, ATP-binding protein  50.42 
 
 		 255 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4716  ABC transporter related  46.75 
 
 		 259 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.592299  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4962  ABC transporter related  48.09 
 
 		 271 aa  232  5e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.520706  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1020  ABC transporter, ATP-binding protein  51.22 
 
 		 285 aa  231  8.000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0141  ABC transporter ATP-binding protein  49.8 
 
 		 263 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0633689  normal  0.467714 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0159  ABC transporter related  49.01 
 
 		 263 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4042  ABC transporter related  47.74 
 
 		 258 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2003  ABC transporter related  50.2 
 
 		 257 aa  231  1e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0987  ABC transporter, ATP-binding protein  50.81 
 
 		 287 aa  230  2e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2366  ABC transporter related  52.07 
 
 		 256 aa  230  3e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0154742  normal  0.784047 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2108  ABC transporter related  50.41 
 
 		 287 aa  229  6e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04770  ABC transporter, ATP binding component  50.19 
 
 		 266 aa  228  9e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326188  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4934  ABC transporter related  49.18 
 
 		 256 aa  225  6e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0622579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1374  ABC transporter related  47.3 
 
 		 258 aa  225  6e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5749  putative ABC transporter ATP-binding protein  48.15 
 
 		 259 aa  225  8e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2029  hypothetical protein  47.92 
 
 		 245 aa  224  9e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3669  ABC transporter related  50.4 
 
 		 266 aa  224  1e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0691593 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2024  hypothetical protein  47.92 
 
 		 245 aa  224  2e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1553  ABC transporter related  51.22 
 
 		 268 aa  224  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.116954 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1354  ABC transporter related  46.06 
 
 		 258 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1983  ABC transporter related  48.58 
 
 		 282 aa  222  7e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0366377  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1196  ABC transporter related  49.4 
 
 		 264 aa  221  1.9999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3565  ABC transporter related  45.91 
 
 		 291 aa  216  4e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.830372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1680  ABC transporter ATP-binding protein  45.08 
 
 		 254 aa  216  5e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>