More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0071 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0071  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 279 aa  553  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0100  ABC transporter related  80.14 
 
 		 278 aa  440  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.106893  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0314  ABC transporter ATP-binding protein  73.05 
 
 		 298 aa  385  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0176  ABC transporter related  73.44 
 
 		 292 aa  385  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0169  ABC transporter related  72.27 
 
 		 292 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0492  ABC transporter related  63.6 
 
 		 292 aa  339  2e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.242272  normal  0.0865243 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6242  ABC transporter, ATPase subunit  63.6 
 
 		 304 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0404  ABC transporter related  61.54 
 
 		 292 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.027511 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0231  ABC transporter system ATP-binding protein  64.37 
 
 		 280 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0432  ABC transporter, ATP-binding protein  64.37 
 
 		 280 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.440743  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0451  ABC transporter, ATP-binding protein  64.37 
 
 		 280 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2909  ABC transporter related  63.6 
 
 		 304 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0613  ABC transporter system ATP-binding protein  64.37 
 
 		 280 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.686513  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1362  ABC transporter, ATP-binding protein  64.37 
 
 		 280 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.820814  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3200  ABC transporter system ATP-binding protein  64.37 
 
 		 280 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2900  ABC transporter related  63.6 
 
 		 304 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.34746  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2285  ABC transporter related  63.6 
 
 		 304 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0065  ABC transporter, ATP-binding protein  64.37 
 
 		 272 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.768033  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2811  ABC transporter related  62.84 
 
 		 303 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.688853  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2949  ABC transporter related  62.84 
 
 		 303 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.85186  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0374  ABC transporter, ATP-binding protein  63.6 
 
 		 280 aa  333  2e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.453677  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4224  ABC transporter, ATPase subunit  63.6 
 
 		 292 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0206  ABC transporter related  64.29 
 
 		 296 aa  315  4e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0298  ABC transporter related  60 
 
 		 272 aa  296  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.510066  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1982  ABC transporter related  55.6 
 
 		 259 aa  286  2e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0231  ABC transporter related  57.81 
 
 		 262 aa  280  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0366  ABC transporter related  56.64 
 
 		 267 aa  278  8e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0251  ABC transporter related  56.25 
 
 		 280 aa  278  9e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0635504 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0307  ABC transporter-related protein  56.63 
 
 		 291 aa  278  9e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.993537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0245  ABC transporter related  56.25 
 
 		 280 aa  278  1e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.415257  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2810  ABC transporter, ATPase subunit  54.76 
 
 		 257 aa  275  5e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.66283  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1488  ABC transporter related  54.76 
 
 		 257 aa  275  5e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0183  ABC transporter related  53.44 
 
 		 265 aa  272  4.0000000000000004e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.734577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0921  ABC transporter related  56.18 
 
 		 291 aa  271  7e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1719  ABC transporter related  54.76 
 
 		 257 aa  271  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0483086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2343  ABC transporter related  52.73 
 
 		 275 aa  268  5e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464868 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0173  ABC transporter, ATP-binding protein  52.23 
 
 		 256 aa  268  8e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2316  ABC transporter related  54.44 
 
 		 258 aa  266  4e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184477  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3916  ABC transporter related  56.3 
 
 		 271 aa  265  4e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2743  ABC transporter related  55.28 
 
 		 272 aa  264  1e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.132977 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0797  ABC transporter related  52.08 
 
 		 283 aa  263  3e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.126555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0646  ABC transporter, ATP-binding protein  52.08 
 
 		 283 aa  263  3e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2513  ABC transporter related  52.57 
 
 		 259 aa  262  6e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0824022  normal  0.0374707 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22670  putative ATP-binding component of ABC transporter  53.12 
 
 		 264 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420242 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0627  ABC transporter ATP-binding protein  51.37 
 
 		 276 aa  259  4e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00990626  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2049  ABC transporter ATP-binding protein  53.15 
 
 		 259 aa  258  7e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.558071 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4114  ABC transporter related  50.57 
 
 		 268 aa  257  2e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0512527  normal  0.918883 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1611  ABC transporter related  53.01 
 
 		 295 aa  255  4e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0578  ABC transporter related  50.59 
 
 		 276 aa  255  6e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.206439  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0480  ABC transporter related  51.75 
 
 		 292 aa  255  7e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.104959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0523  ABC transporter related  54.47 
 
 		 275 aa  251  8.000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.310884 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2844  ABC transporter related  52.44 
 
 		 300 aa  250  2e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0038  ABC transporter-like  53.94 
 
 		 267 aa  247  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.328477  normal  0.303335 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0852  ABC transporter related  48.64 
 
 		 278 aa  248  1e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.705089  normal  0.0418942 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0892  ABC transporter related  48.25 
 
 		 278 aa  247  1e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.752922  normal  0.504506 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0818  ABC transporter related  49.06 
 
 		 278 aa  247  1e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0232927  normal  0.356957 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03182  ABC transporter ATP-binding protein  53.33 
 
 		 280 aa  247  2e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.501645  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1453  ABC transporter related  50.81 
 
 		 257 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.329666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2194  ABC transporter related  48.62 
 
 		 281 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0566123  normal  0.102467 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0248  ABC transporter, ATP-binding protein  53.36 
 
 		 255 aa  242  5e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1155  ABC transporter related  53.23 
 
 		 278 aa  240  2e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0372  ABC transporter related  53.44 
 
 		 261 aa  240  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3499  ABC transporter related  47.24 
 
 		 266 aa  239  2.9999999999999997e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.756482  normal  0.324318 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3669  ABC transporter related  53.6 
 
 		 266 aa  239  2.9999999999999997e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0691593 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1914  ABC transporter ATP-binding protein  53.6 
 
 		 264 aa  239  4e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2366  ABC transporter related  54.1 
 
 		 256 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0154742  normal  0.784047 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5086  ABC transporter related  52.19 
 
 		 263 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0940761 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2003  ABC transporter related  55.02 
 
 		 257 aa  238  6.999999999999999e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0157  ABC transporter related  51.97 
 
 		 263 aa  238  8e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.961661 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0141  ABC transporter ATP-binding protein  51.57 
 
 		 263 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0633689  normal  0.467714 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0159  ABC transporter related  51.57 
 
 		 263 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2806  ABC transporter related  51.63 
 
 		 257 aa  237  2e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4962  ABC transporter related  51.59 
 
 		 271 aa  237  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.520706  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1953  ABC transporter related  48.77 
 
 		 269 aa  236  3e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0810571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1628  ABC transporter related  50.41 
 
 		 256 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.387649 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1637  ABC transporter related  50 
 
 		 256 aa  235  6e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.967279 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4484  ABC transporter related  50 
 
 		 257 aa  235  7e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1922  ABC transporter related  48.98 
 
 		 259 aa  235  8e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1316  ABC transporter related  48.4 
 
 		 256 aa  234  9e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1504  ABC transporter related  54.47 
 
 		 283 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4042  ABC transporter related  49.4 
 
 		 258 aa  232  5e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4934  ABC transporter related  52.05 
 
 		 256 aa  232  6e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0622579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5556  putative ABC transporter ATP-binding protein  49.18 
 
 		 264 aa  231  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.50977 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4716  ABC transporter related  48.76 
 
 		 259 aa  229  5e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.592299  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1354  ABC transporter related  48.15 
 
 		 258 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1553  ABC transporter related  49.6 
 
 		 268 aa  226  3e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.116954 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1541  ABC transporter related  47.6 
 
 		 278 aa  226  3e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.033832  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1020  ABC transporter, ATP-binding protein  47.08 
 
 		 285 aa  225  6e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2024  hypothetical protein  48.33 
 
 		 245 aa  225  6e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1983  ABC transporter related  47.76 
 
 		 282 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0366377  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2029  hypothetical protein  47.92 
 
 		 245 aa  224  1e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0987  ABC transporter, ATP-binding protein  46.69 
 
 		 287 aa  224  1e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1680  ABC transporter ATP-binding protein  48.57 
 
 		 254 aa  224  1e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1894  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  49.02 
 
 		 286 aa  223  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214916  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04770  ABC transporter, ATP binding component  52.73 
 
 		 266 aa  224  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326188  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5749  putative ABC transporter ATP-binding protein  48.97 
 
 		 259 aa  223  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2108  ABC transporter related  46.51 
 
 		 287 aa  222  4e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1374  ABC transporter related  47.33 
 
 		 258 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1196  ABC transporter related  50.6 
 
 		 264 aa  222  7e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3565  ABC transporter related  51.53 
 
 		 291 aa  221  7e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.830372  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>