More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0796 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0796  ABC transporter related  100 
 
 		 255 aa  521  1e-147  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2985  ABC-type organic solvent transporter, ATP-binding protein  72.47 
 
 		 257 aa  374  1e-103  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.444132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1811  ABC transporter related protein  71.43 
 
 		 251 aa  365  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0189  ABC transporter related  70.8 
 
 		 254 aa  364  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0746681  normal  0.958869 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5282  ABC transporter related  67.61 
 
 		 248 aa  347  1e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17632 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3315  ABC transporter related  53.53 
 
 		 258 aa  274  1.0000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000690504 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4315  ABC transporter related  53.75 
 
 		 259 aa  256  2e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.696843  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0706  ABC transporter related protein  46.47 
 
 		 258 aa  219  5e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613257  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1887  ABC transporter related protein  43.64 
 
 		 296 aa  201  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2596  ABC transporter related protein  43.28 
 
 		 260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.256414  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1998  ABC transporter-related protein  43.67 
 
 		 248 aa  198  6e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2083  ABC transporter related  43.67 
 
 		 248 aa  198  6e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1862  ABC transporter, ATPase subunit  43.67 
 
 		 248 aa  196  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634035  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1977  ABC transporter related  42.86 
 
 		 248 aa  193  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.28613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0677  ABC transporter related  42.19 
 
 		 255 aa  191  8e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2380  ABC transporter  41.18 
 
 		 257 aa  191  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83089  normal  0.615068 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0379  ABC transporter related  42.37 
 
 		 262 aa  189  4e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1851  ABC transporter related  39.83 
 
 		 263 aa  188  5.999999999999999e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0015  ABC transporter related  40.32 
 
 		 252 aa  187  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0891779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2343  ABC transporter related protein  40.93 
 
 		 252 aa  186  3e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1737  ABC transporter related  43.7 
 
 		 245 aa  185  5e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0169856  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1066  ABC transporter related  42.44 
 
 		 248 aa  185  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2869  ABC transporter related  42.92 
 
 		 261 aa  185  7e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1328  ABC transporter related  40.68 
 
 		 256 aa  183  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0917234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1781  ABC transporter related  40.76 
 
 		 252 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.122728 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2458  ABC transporter, ATPase subunit  42.02 
 
 		 248 aa  182  6e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1121  ABC transporter related  42.02 
 
 		 248 aa  182  6e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.418609  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0787  ABC transporter-related protein  39.66 
 
 		 248 aa  181  8.000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0407  ABC transporter component  40.51 
 
 		 257 aa  180  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0990  ABC transporter, ATP-binding protein  41.08 
 
 		 233 aa  179  4.999999999999999e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.491255  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2065  ABC transporter related protein  41.43 
 
 		 273 aa  179  4.999999999999999e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0328  ABC transporter related  42.8 
 
 		 249 aa  178  8e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.673492  normal  0.624259 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0816  ABC transporter, ATP-binding protein  38.4 
 
 		 248 aa  177  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1040  ABC transporter related  40.93 
 
 		 248 aa  177  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3484  ABC transporter related  40.08 
 
 		 257 aa  177  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0561  ABC transporter related  40.08 
 
 		 248 aa  177  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000384868  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0450  ABC transporter related  36.73 
 
 		 254 aa  176  3e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3182  ABC transporter related  39.24 
 
 		 250 aa  175  6e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2164  ABC transporter related  38.4 
 
 		 261 aa  175  7e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3691  ABC transporter related  38.66 
 
 		 245 aa  174  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.896312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1488  ABC transporter related  39.34 
 
 		 257 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2810  ABC transporter, ATPase subunit  39.34 
 
 		 257 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.66283  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3036  ABC transporter related  39.29 
 
 		 261 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.845975 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1719  ABC transporter related  39.67 
 
 		 257 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0483086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002012  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  39.58 
 
 		 245 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000066278  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1349  ABC transporter related  40.17 
 
 		 248 aa  173  1.9999999999999998e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2316  ABC transporter related  41.84 
 
 		 258 aa  173  2.9999999999999996e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184477  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2511  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 		 245 aa  172  3.9999999999999995e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000409098  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07670  ABC transporter, ATP-binding protein  36.67 
 
 		 254 aa  172  6.999999999999999e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0821592  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1498  ABC transporter related  36.97 
 
 		 256 aa  171  6.999999999999999e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0160  ABC transporter related  37.71 
 
 		 272 aa  171  7.999999999999999e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.609677 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3808  ABC transporter related  40 
 
 		 262 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.140241  normal  0.926814 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0698  ABC transporter, ATP-binding protein  38.93 
 
 		 242 aa  171  1e-41  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0997  ABC transporter-like protein protein  38.96 
 
 		 260 aa  170  2e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0883738  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00439  ABC polar amino acid transporter ATPase component  39.17 
 
 		 245 aa  170  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5159  ABC transporter related protein  39.35 
 
 		 248 aa  170  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.364497 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4349  ABC transporter related protein  38.24 
 
 		 359 aa  170  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3119  ABC transporter related protein  39.17 
 
 		 276 aa  169  3e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1621  ABC transporter related protein  39.75 
 
 		 363 aa  169  4e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.966929  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3704  ABC transporter related  37.97 
 
 		 265 aa  169  4e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.307132  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4114  ABC transporter related  36.84 
 
 		 268 aa  169  5e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0512527  normal  0.918883 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2195  ABC transporter, ATP-binding protein  38.43 
 
 		 248 aa  169  5e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00836348 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3499  ABC transporter related  38.62 
 
 		 266 aa  168  7e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.756482  normal  0.324318 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3442  ABC transporter related protein  36.29 
 
 		 246 aa  168  7e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.0228809 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1143  ABC transporter related  38.75 
 
 		 276 aa  167  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2673  ABC transporter-like  40.32 
 
 		 260 aa  167  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0006  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein  39.58 
 
 		 245 aa  167  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00283619  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1578  ABC transporter related  37.82 
 
 		 260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.292703 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2292  ABC transporter related  39.17 
 
 		 279 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3546  amino acid ABC transporter-like protein  39.58 
 
 		 253 aa  165  5e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0700  ABC transporter related  37.29 
 
 		 333 aa  165  5e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0855  ABC transporter related protein  36.1 
 
 		 273 aa  165  5.9999999999999996e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.795905 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2049  ABC transporter ATP-binding protein  38.59 
 
 		 259 aa  165  5.9999999999999996e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.558071 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2343  ABC transporter related  37.5 
 
 		 275 aa  165  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464868 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3963  ABC transporter related  36.82 
 
 		 248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0448  ABC-type transport system, ATPase component  38.29 
 
 		 266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392883  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5099  ABC transporter related  37.71 
 
 		 362 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0528619 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3548  L-cystine import ATP-binding protein TcyN  39.17 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.159589  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0514  ABC transporter related  36.95 
 
 		 261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2886  ABC transporter, ATPase subunit  35.1 
 
 		 275 aa  164  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.21978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0531  ABC transporter related  36.95 
 
 		 261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  hitchhiker  0.00910021 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1557  ABC transporter related protein  38.06 
 
 		 273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1254  ABC transporter-related protein  38.14 
 
 		 357 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0999833 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2786  ABC transporter, ATPase subunit  37.08 
 
 		 294 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000312244  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0071  ABC transporter-related protein  37.19 
 
 		 279 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3462  ABC transporter related  35.42 
 
 		 250 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0534254 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3891  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  37.3 
 
 		 356 aa  163  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.540067  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1953  ABC transporter related  37.24 
 
 		 269 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0810571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3234  ABC transporter related  39.17 
 
 		 265 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0738918  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1611  ABC transporter related  37.25 
 
 		 295 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0100  ABC transporter related  36.07 
 
 		 278 aa  162  6e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.106893  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2806  ABC transporter related  37.71 
 
 		 257 aa  161  7e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1743  ABC transporter-related protein  38.98 
 
 		 271 aa  161  9e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0523  ABC transporter related  41.86 
 
 		 275 aa  160  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.310884 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0892  ABC transporter related  35.8 
 
 		 278 aa  160  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.752922  normal  0.504506 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1227  ABC transporter, ATP-binding protein  40.25 
 
 		 272 aa  160  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0852  ABC transporter related  35.8 
 
 		 278 aa  160  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.705089  normal  0.0418942 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2743  ABC transporter related  35.86 
 
 		 272 aa  160  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.132977 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2513  ABC transporter related  35.8 
 
 		 259 aa  159  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0824022  normal  0.0374707 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2844  ABC transporter related  35.98 
 
 		 300 aa  159  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>