More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2292 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2292  ABC transporter related  100 
 
 
279 aa  571  1.0000000000000001e-162  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3119  ABC transporter related protein  81.45 
 
 
276 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1143  ABC transporter related  80.73 
 
 
276 aa  455  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1227  ABC transporter, ATP-binding protein  80.3 
 
 
272 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1743  ABC transporter-related protein  77.7 
 
 
271 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0379  ABC transporter related  47.11 
 
 
262 aa  209  4e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0686  ABC transporter related  43.57 
 
 
270 aa  209  5e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0328  ABC transporter related  45.68 
 
 
249 aa  202  5e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.673492  normal  0.624259 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0677  ABC transporter related  40 
 
 
255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0787  ABC transporter-related protein  42.98 
 
 
248 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2596  ABC transporter related protein  42.11 
 
 
260 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.256414  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1977  ABC transporter related  44.4 
 
 
248 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.28613  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1887  ABC transporter related protein  40.59 
 
 
296 aa  188  8e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0816  ABC transporter, ATP-binding protein  40.91 
 
 
248 aa  187  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2449  ABC transporter related  41.56 
 
 
268 aa  185  6e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1862  ABC transporter, ATPase subunit  41.15 
 
 
248 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634035  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2886  ABC transporter, ATPase subunit  42.8 
 
 
275 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.21978  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0015  ABC transporter related  41.98 
 
 
252 aa  183  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0891779  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3182  ABC transporter related  40.5 
 
 
250 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1040  ABC transporter related  40.91 
 
 
248 aa  181  9.000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2343  ABC transporter related protein  42.8 
 
 
252 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3484  ABC transporter related  40.74 
 
 
257 aa  181  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3704  ABC transporter related  40.24 
 
 
265 aa  180  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.307132  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1998  ABC transporter-related protein  40.74 
 
 
248 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2083  ABC transporter related  40.74 
 
 
248 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0561  ABC transporter related  41.1 
 
 
248 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000384868  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0407  ABC transporter component  42.04 
 
 
257 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1127  ABC transporter related protein  38.91 
 
 
421 aa  178  9e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3036  ABC transporter related  38.98 
 
 
261 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.845975 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1781  ABC transporter related  40.65 
 
 
252 aa  176  4e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.122728 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0997  ABC transporter-like protein protein  39 
 
 
260 aa  176  5e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0883738  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2673  ABC transporter-like  40 
 
 
260 aa  176  5e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0700  ABC transporter related  38.78 
 
 
333 aa  175  6e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0493  ABC transporter related  41.39 
 
 
251 aa  175  7e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.759588  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0160  ABC transporter related  40.93 
 
 
272 aa  175  7e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.609677 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0996  ABC transporter related  39.33 
 
 
361 aa  175  8e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1254  ABC transporter-related protein  38.91 
 
 
357 aa  175  9e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0999833 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  39.66 
 
 
245 aa  174  9.999999999999999e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5099  ABC transporter related  39.33 
 
 
362 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0528619 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0968  ABC transporter related  39.33 
 
 
361 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51873  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0986  ABC transporter related  39.33 
 
 
361 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.401008 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1074  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents ATPase component-like protein  39.84 
 
 
333 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0448  ABC-type transport system, ATPase component  38.59 
 
 
266 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392883  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  43.18 
 
 
262 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0855  ABC transporter related protein  39.02 
 
 
273 aa  173  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.795905 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3081  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.75 
 
 
270 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.216025 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6293  ABC transporter related protein  41.36 
 
 
242 aa  172  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118906  normal  0.0827304 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3137  ABC transporter, ATPase subunit  37.97 
 
 
253 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.297163  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  41.96 
 
 
247 aa  172  5e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1811  ABC transporter related protein  41.1 
 
 
251 aa  172  5e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  39.33 
 
 
270 aa  172  6.999999999999999e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  41.95 
 
 
241 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2413  ABC transporter related  37.29 
 
 
266 aa  172  7.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.104352 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0752  ABC transporter related protein  37.96 
 
 
397 aa  172  7.999999999999999e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2854  ABC transporter-like  42.74 
 
 
254 aa  171  9e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4349  ABC transporter related protein  39.02 
 
 
359 aa  171  9e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3315  ABC transporter related  39.5 
 
 
258 aa  171  9e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000690504 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0176  ABC transporter related  40.51 
 
 
292 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0169  ABC transporter related  40.51 
 
 
292 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  41.15 
 
 
256 aa  171  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0706  ABC transporter related protein  40 
 
 
258 aa  171  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613257  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11340  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40.09 
 
 
258 aa  170  2e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.571361  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0314  ABC transporter ATP-binding protein  39.59 
 
 
298 aa  170  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0903  hypothetical protein  38.62 
 
 
265 aa  170  2e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0872  hypothetical protein  39.43 
 
 
265 aa  170  2e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2909  ABC transporter component  40.25 
 
 
277 aa  171  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.321315  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2985  ABC-type organic solvent transporter, ATP-binding protein  40.93 
 
 
257 aa  170  2e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.444132  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10668  ribonucleotide transport ATP-binding protein ABC transporter mkl  39.75 
 
 
359 aa  170  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.139977  normal  0.579373 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2698  ABC transporter related  38.91 
 
 
264 aa  171  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3808  ABC transporter related  40.08 
 
 
262 aa  169  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.140241  normal  0.926814 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1656  ABC transporter related  43.42 
 
 
255 aa  170  3e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00836866  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0472  ABC transporter related  40.08 
 
 
293 aa  169  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0139008  hitchhiker  0.0000833455 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3101  putative ABC transporter ATP-binding subunit  35.8 
 
 
279 aa  169  4e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0439  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  40.44 
 
 
250 aa  169  4e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0501472  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0401  ABC transporter related  38.43 
 
 
262 aa  169  4e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186175  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1180  ABC transporter related  45.49 
 
 
360 aa  169  4e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3012  ABC transporter related  42.04 
 
 
244 aa  169  4e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197193  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1436  hypothetical protein  40.69 
 
 
247 aa  169  5e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2021  ABC transporter related  44.58 
 
 
363 aa  169  5e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0979  ABC transporter related  38.84 
 
 
265 aa  169  6e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0598  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.16 
 
 
242 aa  169  7e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00132309  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0358  ABC transporter related  41 
 
 
243 aa  168  8e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.648234  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2443  ABC transporter related  40.91 
 
 
261 aa  168  8e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172731  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0925  ABC transporter, ATP-binding protein  41.1 
 
 
254 aa  168  9e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3332  ABC transporter related  38.82 
 
 
261 aa  168  9e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.269585  normal  0.16412 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0467  ABC transporter related  43.21 
 
 
253 aa  168  9e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1247  ABC transporter related protein  40.91 
 
 
249 aa  168  9e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0795163  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1453  ABC transporter related  39.5 
 
 
257 aa  168  9e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.329666  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0514  ABC transporter related  38.82 
 
 
261 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1680  sulphate transport system permease protein 1  38.98 
 
 
338 aa  168  1e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.070095  normal  0.46795 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3442  ABC transporter related protein  38.84 
 
 
246 aa  168  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.0228809 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2758  ABC transporter related  40.36 
 
 
252 aa  168  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0531  ABC transporter related  38.82 
 
 
261 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  hitchhiker  0.00910021 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  40.09 
 
 
257 aa  168  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  44.84 
 
 
242 aa  167  2e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2786  ABC transporter, ATPase subunit  38.43 
 
 
294 aa  167  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000312244  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2458  ABC transporter, ATPase subunit  39.02 
 
 
248 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1066  ABC transporter related  39.43 
 
 
248 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  42.34 
 
 
242 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0431  ABC transporter related  40.89 
 
 
286 aa  167  2e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0284174  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>