More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2065 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2065  ABC transporter related protein  100 
 
 		 273 aa  560  1.0000000000000001e-159  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3484  ABC transporter related  44.53 
 
 		 257 aa  221  9.999999999999999e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0407  ABC transporter component  44.98 
 
 		 257 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2596  ABC transporter related protein  48.95 
 
 		 260 aa  217  2e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.256414  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2380  ABC transporter  49.12 
 
 		 257 aa  208  9e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83089  normal  0.615068 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0015  ABC transporter related  43.72 
 
 		 252 aa  206  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0891779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0677  ABC transporter related  43.08 
 
 		 255 aa  206  4e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3315  ABC transporter related  43.5 
 
 		 258 aa  204  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000690504 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2458  ABC transporter, ATPase subunit  45.02 
 
 		 248 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1121  ABC transporter related  45.02 
 
 		 248 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.418609  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1066  ABC transporter related  44.62 
 
 		 248 aa  203  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0379  ABC transporter related  42.45 
 
 		 262 aa  203  3e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4315  ABC transporter related  42.47 
 
 		 259 aa  202  4e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.696843  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1781  ABC transporter related  45.24 
 
 		 252 aa  202  4e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.122728 
 
 
-
 
NC_002978  WD0990  ABC transporter, ATP-binding protein  41.43 
 
 		 233 aa  200  1.9999999999999998e-50  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.491255  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1887  ABC transporter related protein  42.69 
 
 		 296 aa  200  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1737  ABC transporter related  43.41 
 
 		 245 aa  197  2.0000000000000003e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0169856  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0328  ABC transporter related  42.23 
 
 		 249 aa  196  4.0000000000000005e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.673492  normal  0.624259 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1349  ABC transporter related  40.24 
 
 		 248 aa  193  2e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0706  ABC transporter related protein  41.83 
 
 		 258 aa  193  3e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613257  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0796  ABC transporter related  41.43 
 
 		 255 aa  190  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2869  ABC transporter related  41.37 
 
 		 261 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1013  ABC transporter-related protein  41.2 
 
 		 306 aa  189  4e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1851  ABC transporter related  39.69 
 
 		 263 aa  189  5.999999999999999e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5282  ABC transporter related  39.84 
 
 		 248 aa  189  5.999999999999999e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17632 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3691  ABC transporter related  40.73 
 
 		 245 aa  184  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.896312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1811  ABC transporter related protein  39.92 
 
 		 251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1998  ABC transporter-related protein  38.15 
 
 		 248 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2083  ABC transporter related  38.15 
 
 		 248 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1862  ABC transporter, ATPase subunit  38.55 
 
 		 248 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634035  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1977  ABC transporter related  39.36 
 
 		 248 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.28613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0716  ABC transporter related  39.31 
 
 		 286 aa  183  3e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0189  ABC transporter related  38.35 
 
 		 254 aa  182  6e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0746681  normal  0.958869 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2343  ABC transporter related  41.38 
 
 		 275 aa  182  7e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464868 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0748  ABC transporter related  39.92 
 
 		 286 aa  182  7e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1611  ABC transporter related  39.31 
 
 		 295 aa  181  1e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0997  ABC transporter-like protein protein  38.89 
 
 		 260 aa  180  2e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0883738  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2343  ABC transporter related protein  46.95 
 
 		 252 aa  180  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2194  ABC transporter related  39.53 
 
 		 281 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0566123  normal  0.102467 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2985  ABC-type organic solvent transporter, ATP-binding protein  38.46 
 
 		 257 aa  180  2e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.444132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0248  ABC transporter, ATP-binding protein  40.89 
 
 		 255 aa  179  4.999999999999999e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2886  ABC transporter, ATPase subunit  37.7 
 
 		 275 aa  179  5.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.21978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1328  ABC transporter related  38.89 
 
 		 256 aa  177  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0917234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0401  ABC transporter related  41.3 
 
 		 262 aa  177  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186175  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0700  ABC transporter related  41.04 
 
 		 333 aa  176  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0085  ABC transporter, ATP-binding protein  43.69 
 
 		 238 aa  176  3e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1173  ABC transporter, ATP-binding protein  38.55 
 
 		 264 aa  176  3e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1008  ABC transporter related  35.86 
 
 		 397 aa  176  4e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00677316  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2673  ABC transporter-like  39.62 
 
 		 260 aa  176  5e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0160  ABC transporter related  38.37 
 
 		 272 aa  176  5e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.609677 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1621  ABC transporter related protein  38.15 
 
 		 363 aa  175  6e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.966929  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2397  ABC transporter related  38.87 
 
 		 277 aa  175  6e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0051  ABC transporter  45.19 
 
 		 238 aa  175  7e-43  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1154  ABC transporter related  38.4 
 
 		 286 aa  175  8e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5028  ABC transporter ATP-binding protein  37.94 
 
 		 269 aa  175  9e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57880  ABC transporter ATP-binding protein  37.94 
 
 		 269 aa  175  9e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4114  ABC transporter related  40.08 
 
 		 268 aa  174  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0512527  normal  0.918883 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0686  ABC transporter related  39.06 
 
 		 270 aa  174  9.999999999999999e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3036  ABC transporter related  39.51 
 
 		 261 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.845975 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0863  ABC transporter-like  36.51 
 
 		 270 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.535463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0514  ABC transporter related  40.56 
 
 		 261 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2164  ABC transporter related  37.55 
 
 		 261 aa  174  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0531  ABC transporter related  40.56 
 
 		 261 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  hitchhiker  0.00910021 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0685  ABC transporter related  37.21 
 
 		 293 aa  172  3.9999999999999995e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0888  ABC transporter related  36.58 
 
 		 273 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00820574  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0561  ABC transporter related  37.1 
 
 		 248 aa  172  5e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000384868  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0479  ATPase  37.74 
 
 		 244 aa  172  5.999999999999999e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.119209  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3394  ABC transporter-related protein  38.71 
 
 		 278 aa  172  6.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10668  ribonucleotide transport ATP-binding protein ABC transporter mkl  40.57 
 
 		 359 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.139977  normal  0.579373 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1984  ATPase  41.9 
 
 		 257 aa  171  9e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.101107  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2513  ABC transporter related  37.55 
 
 		 259 aa  171  9e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0824022  normal  0.0374707 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2449  ABC transporter related  36.51 
 
 		 268 aa  171  9e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0958  toluene tolerance ABC efflux transporter, ATP-binding protein  36.11 
 
 		 269 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1578  ABC transporter related  38.4 
 
 		 260 aa  171  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.292703 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0366  ABC transporter related  38.01 
 
 		 267 aa  171  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12850  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, ATP binding component  37.1 
 
 		 269 aa  171  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0173  ABC transporter, ATP-binding protein  39.43 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07670  ABC transporter, ATP-binding protein  35.06 
 
 		 254 aa  170  2e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0821592  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1127  ABC transporter related protein  39.62 
 
 		 421 aa  170  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2935  ABC transporter related  36.43 
 
 		 271 aa  170  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5536  ABC transporter related  38.4 
 
 		 309 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3182  ABC transporter related  37.6 
 
 		 250 aa  170  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3101  putative ABC transporter ATP-binding subunit  37.6 
 
 		 279 aa  170  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0965  ABC transporter related  36.11 
 
 		 269 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3808  ABC transporter related  37.84 
 
 		 262 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.140241  normal  0.926814 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0855  ABC transporter related protein  41.98 
 
 		 273 aa  170  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.795905 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0997  ABC transporter related  35.71 
 
 		 269 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0996  ABC transporter related  39.62 
 
 		 361 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22670  putative ATP-binding component of ABC transporter  38.89 
 
 		 264 aa  170  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420242 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4141  ABC transporter  35.71 
 
 		 269 aa  169  4e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1254  ABC transporter-related protein  39.15 
 
 		 357 aa  169  5e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0999833 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1719  ABC transporter related  39.11 
 
 		 257 aa  169  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0483086  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0816  ABC transporter, ATP-binding protein  37.9 
 
 		 248 aa  169  6e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3402  ABC transporter related  36.84 
 
 		 270 aa  169  6e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0979  ABC transporter related  37.35 
 
 		 265 aa  168  7e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2316  ABC transporter related  38.25 
 
 		 258 aa  168  7e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184477  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1453  ABC transporter related  40 
 
 		 257 aa  168  8e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.329666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3081  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.55 
 
 		 270 aa  168  9e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.216025 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4257  ABC transporter related  35.71 
 
 		 269 aa  168  9e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1074  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents ATPase component-like protein  40 
 
 		 333 aa  168  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>