More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2343 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2343  ABC transporter related protein  100 
 
 		 252 aa  512  1e-144  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0787  ABC transporter-related protein  52.92 
 
 		 248 aa  251  6e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2596  ABC transporter related protein  49.8 
 
 		 260 aa  248  7e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.256414  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1040  ABC transporter related  52.08 
 
 		 248 aa  244  8e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0816  ABC transporter, ATP-binding protein  49.58 
 
 		 248 aa  239  5e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0561  ABC transporter related  50.21 
 
 		 248 aa  238  9e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000384868  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1212  ABC transporter related  46.28 
 
 		 267 aa  232  5e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00512006  hitchhiker  0.000000000503976 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1862  ABC transporter, ATPase subunit  50.21 
 
 		 248 aa  231  6e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634035  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3963  ABC transporter related  47.26 
 
 		 248 aa  231  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1998  ABC transporter-related protein  50.21 
 
 		 248 aa  229  2e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2083  ABC transporter related  50.21 
 
 		 248 aa  229  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3182  ABC transporter related  47.92 
 
 		 250 aa  229  3e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0379  ABC transporter related  47.7 
 
 		 262 aa  229  3e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0328  ABC transporter related  46.47 
 
 		 249 aa  229  4e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.673492  normal  0.624259 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5159  ABC transporter related protein  45.64 
 
 		 248 aa  224  9e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.364497 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3462  ABC transporter related  46.28 
 
 		 250 aa  223  2e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0534254 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1977  ABC transporter related  49.38 
 
 		 248 aa  223  2e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.28613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2449  ABC transporter related  46.59 
 
 		 268 aa  223  3e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0677  ABC transporter related  48.1 
 
 		 255 aa  222  4.9999999999999996e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1498  ABC transporter related  43.98 
 
 		 256 aa  222  4.9999999999999996e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0450  ABC transporter related  45 
 
 		 254 aa  221  6e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0700  ABC transporter related  46.64 
 
 		 333 aa  220  9.999999999999999e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0448  ABC-type transport system, ATPase component  45.83 
 
 		 266 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392883  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1887  ABC transporter related protein  46.44 
 
 		 296 aa  218  6e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0401  ABC transporter related  46.44 
 
 		 262 aa  217  2e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186175  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2195  ABC transporter, ATP-binding protein  43.57 
 
 		 248 aa  216  4e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00836348 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3315  ABC transporter related  46.86 
 
 		 258 aa  214  7e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000690504 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07670  ABC transporter, ATP-binding protein  42.74 
 
 		 254 aa  214  9.999999999999999e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0821592  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4315  ABC transporter related  46.64 
 
 		 259 aa  213  2.9999999999999995e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.696843  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0706  ABC transporter related protein  47.03 
 
 		 258 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613257  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4349  ABC transporter related protein  46.64 
 
 		 359 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1029  hypothetical protein  43.57 
 
 		 250 aa  211  1e-53  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3704  ABC transporter related  44.35 
 
 		 265 aa  207  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.307132  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0015  ABC transporter related  48.54 
 
 		 252 aa  206  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0891779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3402  ABC transporter related  46.44 
 
 		 270 aa  206  4e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03690  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, ATPase component  45.34 
 
 		 378 aa  206  4e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.839011  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0752  ABC transporter related protein  43.1 
 
 		 397 aa  205  6e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1127  ABC transporter related protein  42.74 
 
 		 421 aa  205  6e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2985  ABC-type organic solvent transporter, ATP-binding protein  43.22 
 
 		 257 aa  203  2e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.444132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1349  ABC transporter related  43.85 
 
 		 248 aa  202  3e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0968  ABC transporter related  44.54 
 
 		 361 aa  202  4e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51873  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0986  ABC transporter related  44.54 
 
 		 361 aa  202  4e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.401008 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0160  ABC transporter related  45.57 
 
 		 272 aa  202  5e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.609677 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1074  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents ATPase component-like protein  44.35 
 
 		 333 aa  202  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2380  ABC transporter  45.04 
 
 		 257 aa  201  6e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83089  normal  0.615068 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0996  ABC transporter related  43.7 
 
 		 361 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3081  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  47.26 
 
 		 270 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.216025 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10668  ribonucleotide transport ATP-binding protein ABC transporter mkl  45.38 
 
 		 359 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.139977  normal  0.579373 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0662  ABC transporter related  43.46 
 
 		 244 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0855  ABC transporter related protein  44.12 
 
 		 273 aa  200  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.795905 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1328  ABC transporter related  43.09 
 
 		 256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0917234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1851  ABC transporter related  45.04 
 
 		 263 aa  200  1.9999999999999998e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1695  ABC transporter related  43.72 
 
 		 244 aa  199  3e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1254  ABC transporter-related protein  42.86 
 
 		 357 aa  199  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0999833 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1781  ABC transporter related  44.63 
 
 		 252 aa  199  5e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.122728 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1738  ABC transporter related  42.62 
 
 		 244 aa  198  6e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5099  ABC transporter related  43.28 
 
 		 362 aa  198  6e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0528619 
 
 
-
 
NC_002950  PG1034  ABC transporter, ATP-binding protein  45.08 
 
 		 244 aa  198  9e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000170601 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0479  ATPase  43.72 
 
 		 244 aa  197  9e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.119209  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0407  ABC transporter component  43.39 
 
 		 257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2886  ABC transporter, ATPase subunit  44.49 
 
 		 275 aa  197  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.21978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1811  ABC transporter related protein  43.88 
 
 		 251 aa  196  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0441  ATPase  43.72 
 
 		 244 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3484  ABC transporter related  42.62 
 
 		 257 aa  196  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2413  ABC transporter related  42.44 
 
 		 266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.104352 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1066  ABC transporter related  45.61 
 
 		 248 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2253  ABC transporter related  42.79 
 
 		 244 aa  196  3e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.491715  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0979  ABC transporter related  45.19 
 
 		 265 aa  196  3e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0095  ABC transporter related  44.35 
 
 		 283 aa  196  3e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000937702  normal  0.953414 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2223  ABC transporter related  45 
 
 		 276 aa  195  5.000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.435588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0096  ABC transporter related  45.61 
 
 		 282 aa  194  8.000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.568034  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3442  ABC transporter related protein  42.68 
 
 		 246 aa  194  9e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.0228809 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3259  ABC transporter-related protein  42.68 
 
 		 283 aa  194  9e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0472  ABC transporter related  42.02 
 
 		 293 aa  194  9e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0139008  hitchhiker  0.0000833455 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6635  ABC transporter related  44.49 
 
 		 363 aa  194  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1578  ABC transporter related  44.02 
 
 		 260 aa  194  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.292703 
 
 
-
 
NC_002978  WD0990  ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 		 233 aa  192  3e-48  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.491255  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5282  ABC transporter related  40.51 
 
 		 248 aa  192  3e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17632 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3004  ABC transporter, ATP-binding protein  44.59 
 
 		 272 aa  192  3e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1173  ABC transporter, ATP-binding protein  43.15 
 
 		 264 aa  192  3e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1953  ABC transporter related  43.46 
 
 		 269 aa  192  5e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0810571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1453  ABC transporter related  43.04 
 
 		 257 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.329666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1008  ABC transporter related  38.11 
 
 		 397 aa  190  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00677316  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0189  ABC transporter related  42.19 
 
 		 254 aa  190  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0746681  normal  0.958869 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2458  ABC transporter, ATPase subunit  43.93 
 
 		 248 aa  190  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1121  ABC transporter related  43.93 
 
 		 248 aa  190  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.418609  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3101  putative ABC transporter ATP-binding subunit  42.68 
 
 		 279 aa  190  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5028  ABC transporter ATP-binding protein  45.37 
 
 		 269 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0888  ABC transporter related  43.75 
 
 		 273 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00820574  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1628  ABC transporter related  43.46 
 
 		 256 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.387649 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1737  ABC transporter related  44.12 
 
 		 245 aa  189  2.9999999999999997e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0169856  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0737  ABC transporter related  46.7 
 
 		 261 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57880  ABC transporter ATP-binding protein  45.37 
 
 		 269 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1969  ABC transporter, ATP-binding protein  43.46 
 
 		 275 aa  189  4e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.309748  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1872  ABC transporter-related protein  42.42 
 
 		 244 aa  189  5e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00971328 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0393  ABC transporter related  44.16 
 
 		 273 aa  189  5e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.261527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3512  ABC transporter, ATPase subunit  44.16 
 
 		 273 aa  189  5e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.317493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2693  ABC transporter related  44.16 
 
 		 273 aa  189  5e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.663262  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0414  ABC transporter related  44.16 
 
 		 273 aa  189  5e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192398  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0686  ABC transporter related  43.04 
 
 		 270 aa  188  7e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>