More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3808 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3808  ABC transporter related  100 
 
 
262 aa  529  1e-149  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.140241  normal  0.926814 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2673  ABC transporter-like  71.15 
 
 
260 aa  382  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3036  ABC transporter related  68.22 
 
 
261 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.845975 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0997  ABC transporter-like protein protein  71.54 
 
 
260 aa  375  1e-103  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0883738  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0531  ABC transporter related  68.09 
 
 
261 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  hitchhiker  0.00910021 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0514  ABC transporter related  68.09 
 
 
261 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2164  ABC transporter related  68.34 
 
 
261 aa  367  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2585  ABC transporter related  58.69 
 
 
259 aa  321  9.000000000000001e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0350  ATPase  59.22 
 
 
292 aa  317  1e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16468  ABC(ATP-binding) family transporter: toluene tolerance  54.94 
 
 
256 aa  292  4e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.222539  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03231  ABC transporter ATP-binding protein  46.67 
 
 
261 aa  240  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.91104  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03161  ABC transporter ATP-binding protein  45.88 
 
 
270 aa  233  3e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0207  ATPase  47.74 
 
 
248 aa  230  2e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0989114  normal  0.489158 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0234  ATPase  49.57 
 
 
232 aa  229  4e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25221  ABC transporter ATP-binding protein  47.74 
 
 
247 aa  229  5e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.862645 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0292  ABC transporter ATP-binding protein  48.1 
 
 
240 aa  228  7e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.155159  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03131  ABC transporter ATP-binding protein  47.68 
 
 
240 aa  226  2e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03141  ABC transporter ATP-binding protein  47.68 
 
 
240 aa  226  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1066  ABC transporter related  48.44 
 
 
248 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3484  ABC transporter related  43.46 
 
 
257 aa  221  8e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2458  ABC transporter, ATPase subunit  47.27 
 
 
248 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1121  ABC transporter related  47.27 
 
 
248 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.418609  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2380  ABC transporter  46.69 
 
 
257 aa  217  1e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83089  normal  0.615068 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0407  ABC transporter component  45.91 
 
 
257 aa  217  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1781  ABC transporter related  45.77 
 
 
252 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.122728 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1737  ABC transporter related  46.48 
 
 
245 aa  211  7.999999999999999e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0169856  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03701  ABC transporter ATP-binding protein  46.4 
 
 
261 aa  209  4e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.569464 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1656  ABC transporter ATP-binding protein  46 
 
 
261 aa  209  5e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1851  ABC transporter related  43.7 
 
 
263 aa  207  9e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1328  ABC transporter related  42.75 
 
 
256 aa  202  6e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0917234  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0677  ABC transporter related  43.36 
 
 
255 aa  201  7e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1578  ABC transporter related  43.14 
 
 
260 aa  201  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.292703 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0015  ABC transporter related  44.09 
 
 
252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0891779  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3691  ABC transporter related  44.94 
 
 
245 aa  198  6e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.896312  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0816  ABC transporter, ATP-binding protein  42.19 
 
 
248 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0787  ABC transporter-related protein  42.58 
 
 
248 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2596  ABC transporter related protein  43.78 
 
 
260 aa  195  5.000000000000001e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.256414  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0328  ABC transporter related  40.23 
 
 
249 aa  194  1e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.673492  normal  0.624259 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3182  ABC transporter related  43.08 
 
 
250 aa  192  5e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0561  ABC transporter related  43.36 
 
 
248 aa  192  6e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000384868  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0379  ABC transporter related  40.87 
 
 
262 aa  191  1e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2869  ABC transporter related  40.7 
 
 
261 aa  186  5e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1040  ABC transporter related  41.41 
 
 
248 aa  185  8e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5282  ABC transporter related  40.56 
 
 
248 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.17632 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1738  ABC transporter related  40.16 
 
 
244 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2449  ABC transporter related  39.69 
 
 
268 aa  182  5.0000000000000004e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0706  ABC transporter related protein  38.87 
 
 
258 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613257  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2749  ABC transporter related  40.08 
 
 
270 aa  178  7e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0888  ABC transporter related  39.61 
 
 
273 aa  178  9e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00820574  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1887  ABC transporter related protein  40 
 
 
296 aa  177  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5159  ABC transporter related protein  42.68 
 
 
248 aa  177  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.364497 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2343  ABC transporter related protein  40.98 
 
 
252 aa  177  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3394  ABC transporter-related protein  39.15 
 
 
278 aa  176  3e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0662  ABC transporter related  39.76 
 
 
244 aa  176  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0248  ABC transporter, ATP-binding protein  40.71 
 
 
255 aa  176  4e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0863  ABC transporter-like  41.57 
 
 
270 aa  175  5e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.535463  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2413  ABC transporter related  38.49 
 
 
266 aa  175  6e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.104352 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0441  ATPase  38.55 
 
 
244 aa  175  7e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5028  ABC transporter ATP-binding protein  42.75 
 
 
269 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2253  ABC transporter related  38.15 
 
 
244 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.491715  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57880  ABC transporter ATP-binding protein  42.75 
 
 
269 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0237  ABC transporter related  38.85 
 
 
268 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1743  ABC transporter-related protein  40.98 
 
 
271 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3259  ABC transporter-related protein  40.08 
 
 
283 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0479  ATPase  38.55 
 
 
244 aa  172  5.999999999999999e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.119209  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3442  ABC transporter related protein  37.94 
 
 
246 aa  171  7.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.0228809 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0796  ABC transporter related  40 
 
 
255 aa  171  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4447  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40.78 
 
 
269 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4141  ABC transporter  40.78 
 
 
269 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2513  ABC transporter related  40.8 
 
 
259 aa  171  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0824022  normal  0.0374707 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0855  ABC transporter related protein  38.89 
 
 
273 aa  171  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.795905 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0393  ABC transporter related  40.08 
 
 
273 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.261527  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1872  ABC transporter-related protein  38.96 
 
 
244 aa  170  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00971328 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3512  ABC transporter, ATPase subunit  40.08 
 
 
273 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.317493  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2542  ABC transporter-related protein  40 
 
 
262 aa  170  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120611  hitchhiker  0.000000000000186562 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2693  ABC transporter related  40.08 
 
 
273 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.663262  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0450  ABC transporter related  40.57 
 
 
254 aa  170  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0414  ABC transporter related  40.08 
 
 
273 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192398  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2292  ABC transporter related  40.08 
 
 
279 aa  169  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0317  ABC transporter related  39.3 
 
 
273 aa  169  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0527891  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0990  ABC transporter, ATP-binding protein  37.25 
 
 
233 aa  169  5e-41  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.491255  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0189  ABC transporter related  40.49 
 
 
254 aa  169  5e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0746681  normal  0.958869 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1227  ABC transporter, ATP-binding protein  40.16 
 
 
272 aa  168  7e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0876  ABC transporter related  41.57 
 
 
269 aa  168  7e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.930987  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0958  toluene tolerance ABC efflux transporter, ATP-binding protein  40.78 
 
 
269 aa  168  9e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567321  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1969  ABC transporter, ATP-binding protein  39.69 
 
 
275 aa  167  1e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.309748  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3101  putative ABC transporter ATP-binding subunit  40.55 
 
 
279 aa  167  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1977  ABC transporter related  39.11 
 
 
248 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.28613  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12850  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, ATP binding component  40.08 
 
 
269 aa  167  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3081  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.77 
 
 
270 aa  168  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.216025 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1621  ABC transporter related protein  35.41 
 
 
363 aa  167  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.966929  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1811  ABC transporter related protein  40.73 
 
 
251 aa  167  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3119  ABC transporter related protein  40 
 
 
276 aa  167  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0685  ABC transporter related  40 
 
 
293 aa  166  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1695  ABC transporter related  36.55 
 
 
244 aa  166  2e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1862  ABC transporter, ATPase subunit  38.31 
 
 
248 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634035  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0387  ABC transporter, ATPase subunit, toluene tolerance Ttg2A-like  39.45 
 
 
273 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2985  ABC-type organic solvent transporter, ATP-binding protein  39.52 
 
 
257 aa  167  2e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.444132  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1173  ABC transporter, ATP-binding protein  36.4 
 
 
264 aa  167  2e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22670  putative ATP-binding component of ABC transporter  39.6 
 
 
264 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420242 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>