More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1578 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1578  ABC transporter related  100 
 
 		 260 aa  519  1e-146  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.292703 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1328  ABC transporter related  76.59 
 
 		 256 aa  390  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0917234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3484  ABC transporter related  58.94 
 
 		 257 aa  305  7e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0407  ABC transporter component  57.03 
 
 		 257 aa  293  1e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1781  ABC transporter related  57.09 
 
 		 252 aa  277  1e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.122728 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1121  ABC transporter related  56.22 
 
 		 248 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.418609  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2458  ABC transporter, ATPase subunit  56.22 
 
 		 248 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1066  ABC transporter related  55.82 
 
 		 248 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2380  ABC transporter  55 
 
 		 257 aa  273  3e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83089  normal  0.615068 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1737  ABC transporter related  50.6 
 
 		 245 aa  261  1e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0169856  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0015  ABC transporter related  54.84 
 
 		 252 aa  259  4e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0891779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1851  ABC transporter related  51.91 
 
 		 263 aa  258  7e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2869  ABC transporter related  53.04 
 
 		 261 aa  244  6.999999999999999e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3691  ABC transporter related  52.85 
 
 		 245 aa  241  1e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.896312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0328  ABC transporter related  46.34 
 
 		 249 aa  220  1.9999999999999999e-56  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.673492  normal  0.624259 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0787  ABC transporter-related protein  46.09 
 
 		 248 aa  219  3e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0990  ABC transporter, ATP-binding protein  46.93 
 
 		 233 aa  212  3.9999999999999995e-54  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.491255  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0816  ABC transporter, ATP-binding protein  45.27 
 
 		 248 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3182  ABC transporter related  43.32 
 
 		 250 aa  211  5.999999999999999e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1040  ABC transporter related  45.56 
 
 		 248 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0561  ABC transporter related  45.56 
 
 		 248 aa  210  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000384868  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0677  ABC transporter related  44.58 
 
 		 255 aa  208  6e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0379  ABC transporter related  41.94 
 
 		 262 aa  207  2e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1977  ABC transporter related  42.92 
 
 		 248 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.28613  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2596  ABC transporter related protein  43.7 
 
 		 260 aa  204  8e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.256414  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3808  ABC transporter related  43.14 
 
 		 262 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.140241  normal  0.926814 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0085  ABC transporter, ATP-binding protein  45.61 
 
 		 238 aa  198  7e-50  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4315  ABC transporter related  44.31 
 
 		 259 aa  198  7.999999999999999e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.696843  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0051  ABC transporter  45.18 
 
 		 238 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1862  ABC transporter, ATPase subunit  42.92 
 
 		 248 aa  196  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634035  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1998  ABC transporter-related protein  42.5 
 
 		 248 aa  195  6e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2083  ABC transporter related  42.5 
 
 		 248 aa  195  6e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2343  ABC transporter related protein  44.02 
 
 		 252 aa  194  2e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0531  ABC transporter related  42.41 
 
 		 261 aa  192  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  hitchhiker  0.00910021 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0514  ABC transporter related  42.41 
 
 		 261 aa  192  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0698  ABC transporter, ATP-binding protein  40.36 
 
 		 242 aa  191  8e-48  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07670  ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 		 254 aa  189  2.9999999999999997e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0821592  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5159  ABC transporter related protein  43.28 
 
 		 248 aa  189  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.364497 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0997  ABC transporter-like protein protein  40.23 
 
 		 260 aa  189  4e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0883738  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2164  ABC transporter related  41.54 
 
 		 261 aa  188  5.999999999999999e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3036  ABC transporter related  40.23 
 
 		 261 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.845975 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3963  ABC transporter related  41.35 
 
 		 248 aa  186  4e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0448  ABC-type transport system, ATPase component  41.7 
 
 		 266 aa  185  5e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392883  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2673  ABC transporter-like  39.69 
 
 		 260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2449  ABC transporter related  39.27 
 
 		 268 aa  184  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3462  ABC transporter related  41.77 
 
 		 250 aa  183  3e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0534254 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0189  ABC transporter related  40.4 
 
 		 254 aa  182  7e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0746681  normal  0.958869 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0853  ABC transporter related  43.67 
 
 		 273 aa  181  1e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0785068 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2343  ABC transporter related  43.1 
 
 		 275 aa  181  2e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464868 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5282  ABC transporter related  39.67 
 
 		 248 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17632 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0450  ABC transporter related  40.42 
 
 		 254 aa  179  2.9999999999999997e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0706  ABC transporter related protein  41.63 
 
 		 258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613257  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1817  ABC transporter related  41 
 
 		 274 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0401  ABC transporter related  38.75 
 
 		 262 aa  179  2.9999999999999997e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186175  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1887  ABC transporter related protein  41 
 
 		 296 aa  179  4.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1611  ABC transporter related  42.68 
 
 		 295 aa  179  4.999999999999999e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1811  ABC transporter related protein  40.66 
 
 		 251 aa  179  5.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1495  ABC transporter related  43.04 
 
 		 267 aa  179  5.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00076856  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1321  ABC transporter related protein  42.51 
 
 		 259 aa  178  5.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.627863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1349  ABC transporter related  39.41 
 
 		 248 aa  177  1e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1969  ABC transporter, ATP-binding protein  40.95 
 
 		 275 aa  178  1e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.309748  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22670  putative ATP-binding component of ABC transporter  42.68 
 
 		 264 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420242 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1628  ABC transporter related  42.15 
 
 		 256 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.387649 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3315  ABC transporter related  41.03 
 
 		 258 aa  176  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000690504 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1621  ABC transporter related protein  41.63 
 
 		 363 aa  176  4e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.966929  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1212  ABC transporter related  39.66 
 
 		 267 aa  176  4e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00512006  hitchhiker  0.000000000503976 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5556  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.98 
 
 		 264 aa  176  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.50977 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1498  ABC transporter related  40.51 
 
 		 256 aa  175  8e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2316  ABC transporter related  40.73 
 
 		 258 aa  174  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184477  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1453  ABC transporter related  41.35 
 
 		 257 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.329666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0888  ABC transporter related  39.3 
 
 		 273 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00820574  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2298  ATPase  41.2 
 
 		 273 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102276  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1155  ABC transporter related  43.1 
 
 		 278 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1316  ABC transporter related  41.74 
 
 		 256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2585  ABC transporter related  37.98 
 
 		 259 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2542  ABC transporter-related protein  39.46 
 
 		 262 aa  171  6.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120611  hitchhiker  0.000000000000186562 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0100  ABC transporter related  38.61 
 
 		 278 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.106893  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1034  ABC transporter, ATP-binding protein  41.35 
 
 		 244 aa  170  2e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000170601 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0986  ABC transporter related  37.14 
 
 		 361 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.401008 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1029  hypothetical protein  39.66 
 
 		 250 aa  171  2e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0535  ABC transporter related  38.91 
 
 		 271 aa  170  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0350  ATPase  39.22 
 
 		 292 aa  170  2e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0968  ABC transporter related  37.14 
 
 		 361 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51873  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0855  ABC transporter related protein  39.2 
 
 		 273 aa  169  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.795905 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10668  ribonucleotide transport ATP-binding protein ABC transporter mkl  37.96 
 
 		 359 aa  170  3e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.139977  normal  0.579373 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1637  ABC transporter related  40.5 
 
 		 256 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.967279 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0141  ABC transporter ATP-binding protein  41.84 
 
 		 263 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0633689  normal  0.467714 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0159  ABC transporter related  41.84 
 
 		 263 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0996  ABC transporter related  37.14 
 
 		 361 aa  169  4e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0157  ABC transporter related  41.84 
 
 		 263 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.961661 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5099  ABC transporter related  36.73 
 
 		 362 aa  169  6e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0528619 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3442  ABC transporter related protein  39.68 
 
 		 246 aa  168  7e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.0228809 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1074  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents ATPase component-like protein  39.09 
 
 		 333 aa  168  7e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0341  ABC transporter related  38.55 
 
 		 273 aa  168  8e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.444988 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0332  ABC transporter related  38.55 
 
 		 273 aa  168  8e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4484  ABC transporter related  39.11 
 
 		 257 aa  168  9e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1254  ABC transporter-related protein  36.73 
 
 		 357 aa  168  9e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0999833 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0737  ABC transporter related  41.2 
 
 		 261 aa  167  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0096  ABC transporter related  39.42 
 
 		 282 aa  167  1e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.568034  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0160  ABC transporter related  39.83 
 
 		 272 aa  167  2e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.609677 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>