More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0706 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0706  ABC transporter related protein  100 
 
 		 258 aa  514  1.0000000000000001e-145  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613257  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0189  ABC transporter related  48.78 
 
 		 254 aa  230  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0746681  normal  0.958869 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2985  ABC-type organic solvent transporter, ATP-binding protein  47.11 
 
 		 257 aa  229  3e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.444132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3315  ABC transporter related  46.25 
 
 		 258 aa  226  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000690504 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4315  ABC transporter related  46.86 
 
 		 259 aa  226  2e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.696843  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0787  ABC transporter-related protein  46.61 
 
 		 248 aa  222  4e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0816  ABC transporter, ATP-binding protein  44.92 
 
 		 248 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0379  ABC transporter related  44.68 
 
 		 262 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1811  ABC transporter related protein  47.3 
 
 		 251 aa  220  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5282  ABC transporter related  46.67 
 
 		 248 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17632 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1862  ABC transporter, ATPase subunit  46.5 
 
 		 248 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634035  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0796  ABC transporter related  46.47 
 
 		 255 aa  219  5e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2083  ABC transporter related  46.5 
 
 		 248 aa  218  6e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1998  ABC transporter-related protein  46.5 
 
 		 248 aa  218  6e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2596  ABC transporter related protein  44.4 
 
 		 260 aa  218  1e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.256414  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0677  ABC transporter related  46.61 
 
 		 255 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3182  ABC transporter related  47.03 
 
 		 250 aa  216  4e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0561  ABC transporter related  44.92 
 
 		 248 aa  214  8e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000384868  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1887  ABC transporter related protein  45.34 
 
 		 296 aa  214  9e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2343  ABC transporter related protein  47.03 
 
 		 252 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0328  ABC transporter related  43.88 
 
 		 249 aa  210  2e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.673492  normal  0.624259 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1977  ABC transporter related  45.23 
 
 		 248 aa  209  3e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.28613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1040  ABC transporter related  45.34 
 
 		 248 aa  209  4e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0888  ABC transporter related  46.53 
 
 		 273 aa  204  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00820574  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2380  ABC transporter  44.31 
 
 		 257 aa  198  6e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83089  normal  0.615068 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3484  ABC transporter related  41.08 
 
 		 257 aa  198  7e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0158  toluene ABC transporter, ATP-binding protein, putative  45.08 
 
 		 276 aa  195  5.000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1737  ABC transporter related  46.03 
 
 		 245 aa  194  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0169856  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0337  ABC transporter related  45.23 
 
 		 274 aa  194  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.425163 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3963  ABC transporter related  40.08 
 
 		 248 aa  192  4e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0448  ABC-type transport system, ATPase component  38.08 
 
 		 266 aa  192  5e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392883  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1328  ABC transporter related  43.09 
 
 		 256 aa  192  6e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0917234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0248  ABC transporter, ATP-binding protein  45 
 
 		 255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1621  ABC transporter related protein  41.34 
 
 		 363 aa  189  2.9999999999999997e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.966929  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0393  ABC transporter related  44.86 
 
 		 273 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.261527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3259  ABC transporter-related protein  42.44 
 
 		 283 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2693  ABC transporter related  44.86 
 
 		 273 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.663262  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0414  ABC transporter related  44.86 
 
 		 273 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192398  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3512  ABC transporter, ATPase subunit  44.86 
 
 		 273 aa  189  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.317493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0341  ABC transporter related  44.86 
 
 		 273 aa  189  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.444988 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0332  ABC transporter related  44.86 
 
 		 273 aa  189  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3402  ABC transporter related  41.6 
 
 		 270 aa  189  5e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1066  ABC transporter related  43.93 
 
 		 248 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2749  ABC transporter related  41.84 
 
 		 270 aa  189  5.999999999999999e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2770  ABC transporter related  44.63 
 
 		 273 aa  187  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.719655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2786  ABC transporter, ATPase subunit  42.62 
 
 		 294 aa  187  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000312244  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0317  ABC transporter related  44.03 
 
 		 273 aa  187  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0527891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1851  ABC transporter related  44.35 
 
 		 263 aa  188  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3462  ABC transporter related  40.68 
 
 		 250 aa  187  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0534254 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2413  ABC transporter related  41.95 
 
 		 266 aa  187  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.104352 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0015  ABC transporter related  43.22 
 
 		 252 aa  186  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0891779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1349  ABC transporter related  39.17 
 
 		 248 aa  186  4e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0096  ABC transporter related  41.56 
 
 		 282 aa  185  6e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.568034  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1743  ABC transporter-related protein  40.91 
 
 		 271 aa  185  6e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2458  ABC transporter, ATPase subunit  43.93 
 
 		 248 aa  185  7e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1121  ABC transporter related  43.93 
 
 		 248 aa  185  7e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.418609  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2223  ABC transporter related  42.86 
 
 		 276 aa  184  9e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.435588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1900  ABC transporter ATPase  43.1 
 
 		 270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.81319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0407  ABC transporter component  41.95 
 
 		 257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5159  ABC transporter related protein  40.51 
 
 		 248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.364497 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1781  ABC transporter related  43.1 
 
 		 252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.122728 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0958  toluene tolerance ABC efflux transporter, ATP-binding protein  42.92 
 
 		 269 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0479  ATPase  37.55 
 
 		 244 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.119209  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5028  ABC transporter ATP-binding protein  42.68 
 
 		 269 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1695  ABC transporter related  37.55 
 
 		 244 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57880  ABC transporter ATP-binding protein  42.68 
 
 		 269 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3394  ABC transporter-related protein  42.63 
 
 		 278 aa  184  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1154  ABC transporter related  43.55 
 
 		 286 aa  182  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0965  ABC transporter related  42.92 
 
 		 269 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2869  ABC transporter related  44.07 
 
 		 261 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4257  ABC transporter related  42.92 
 
 		 269 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3004  ABC transporter, ATP-binding protein  45.69 
 
 		 272 aa  181  7e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0387  ABC transporter, ATPase subunit, toluene tolerance Ttg2A-like  43.7 
 
 		 273 aa  181  7e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0990  ABC transporter, ATP-binding protein  38.82 
 
 		 233 aa  181  8.000000000000001e-45  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.491255  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0686  ABC transporter related  41.42 
 
 		 270 aa  181  8.000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1738  ABC transporter related  38.2 
 
 		 244 aa  181  8.000000000000001e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0997  ABC transporter related  42.5 
 
 		 269 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3571  ABC transporter related  43.28 
 
 		 273 aa  181  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626203  hitchhiker  0.0000199293 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1008  ABC transporter related  36.86 
 
 		 397 aa  181  1e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00677316  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0925  ABC transporter, ATP-binding protein  41.1 
 
 		 254 aa  180  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1227  ABC transporter, ATP-binding protein  41.74 
 
 		 272 aa  180  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0441  ATPase  37.13 
 
 		 244 aa  181  2e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3735  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein  44.35 
 
 		 272 aa  180  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.527515  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0095  ABC transporter related  40.83 
 
 		 283 aa  180  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000937702  normal  0.953414 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0160  ABC transporter related  41.1 
 
 		 272 aa  180  2e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.609677 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07670  ABC transporter, ATP-binding protein  36.86 
 
 		 254 aa  180  2.9999999999999997e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0821592  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1127  ABC transporter related protein  37.82 
 
 		 421 aa  179  2.9999999999999997e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0903  hypothetical protein  41.1 
 
 		 265 aa  179  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4141  ABC transporter  41.74 
 
 		 269 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0863  ABC transporter-like  42.8 
 
 		 270 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.535463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1578  ABC transporter related  41.63 
 
 		 260 aa  179  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.292703 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2726  ABC transporter, ATP-binding protein  44.83 
 
 		 272 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2065  ABC transporter related protein  41.83 
 
 		 273 aa  179  4e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3704  putative ABC transporter ATP-binding subunit  44.83 
 
 		 272 aa  179  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0698  ABC transporter, ATP-binding protein  40.76 
 
 		 242 aa  179  4e-44  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12850  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, ATP binding component  40.83 
 
 		 269 aa  179  4e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1777  ABC transporter, ATP-binding protein  44.83 
 
 		 272 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2776  ABC transporter, ATP-binding protein  44.83 
 
 		 272 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.849481  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3228  ABC transporter, ATP-binding protein  44.83 
 
 		 272 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3036  ABC transporter related  38.71 
 
 		 261 aa  179  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.845975 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>