More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1328 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1328  ABC transporter related  100 
 
 		 256 aa  510  1e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0917234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1578  ABC transporter related  76.59 
 
 		 260 aa  390  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.292703 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3484  ABC transporter related  58 
 
 		 257 aa  305  4.0000000000000004e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0407  ABC transporter component  60.48 
 
 		 257 aa  303  1.0000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1851  ABC transporter related  58.53 
 
 		 263 aa  294  1e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1781  ABC transporter related  57.66 
 
 		 252 aa  285  5.999999999999999e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.122728 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1066  ABC transporter related  58.68 
 
 		 248 aa  285  7e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2458  ABC transporter, ATPase subunit  59.09 
 
 		 248 aa  282  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1121  ABC transporter related  59.09 
 
 		 248 aa  282  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.418609  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2380  ABC transporter  55.24 
 
 		 257 aa  280  2e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83089  normal  0.615068 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1737  ABC transporter related  54.44 
 
 		 245 aa  278  5e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0169856  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2869  ABC transporter related  55.78 
 
 		 261 aa  265  5e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0015  ABC transporter related  54.88 
 
 		 252 aa  261  6e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0891779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3691  ABC transporter related  51.87 
 
 		 245 aa  240  2e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.896312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0787  ABC transporter-related protein  46.89 
 
 		 248 aa  228  6e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0561  ABC transporter related  48.16 
 
 		 248 aa  228  6e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000384868  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0816  ABC transporter, ATP-binding protein  47.08 
 
 		 248 aa  228  9e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0677  ABC transporter related  45.16 
 
 		 255 aa  216  2e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3182  ABC transporter related  44.08 
 
 		 250 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1040  ABC transporter related  46.69 
 
 		 248 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0990  ABC transporter, ATP-binding protein  43.15 
 
 		 233 aa  215  4e-55  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.491255  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0379  ABC transporter related  43.2 
 
 		 262 aa  215  5.9999999999999996e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5159  ABC transporter related protein  46.15 
 
 		 248 aa  208  5e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.364497 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1977  ABC transporter related  44.64 
 
 		 248 aa  208  7e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.28613  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2596  ABC transporter related protein  44.96 
 
 		 260 aa  206  3e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.256414  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4315  ABC transporter related  44.44 
 
 		 259 aa  203  2e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.696843  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0328  ABC transporter related  43.62 
 
 		 249 aa  203  2e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.673492  normal  0.624259 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3808  ABC transporter related  42.75 
 
 		 262 aa  202  5e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.140241  normal  0.926814 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2343  ABC transporter related protein  43.09 
 
 		 252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2343  ABC transporter related  46.61 
 
 		 275 aa  199  3e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464868 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3036  ABC transporter related  40.53 
 
 		 261 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.845975 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2806  ABC transporter related  44.54 
 
 		 257 aa  195  7e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0051  ABC transporter  44.74 
 
 		 238 aa  194  1e-48  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07670  ABC transporter, ATP-binding protein  43.16 
 
 		 254 aa  193  2e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0821592  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1811  ABC transporter related protein  44.54 
 
 		 251 aa  194  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1887  ABC transporter related protein  43.32 
 
 		 296 aa  194  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0085  ABC transporter, ATP-binding protein  43.86 
 
 		 238 aa  194  2e-48  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0450  ABC transporter related  43.16 
 
 		 254 aa  193  2e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1998  ABC transporter-related protein  42.92 
 
 		 248 aa  192  4e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2083  ABC transporter related  42.92 
 
 		 248 aa  192  4e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1862  ABC transporter, ATPase subunit  43.22 
 
 		 248 aa  192  5e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634035  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5086  ABC transporter related  47.03 
 
 		 263 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0940761 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0706  ABC transporter related protein  43.09 
 
 		 258 aa  192  6e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613257  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0892  ABC transporter related  45.02 
 
 		 278 aa  191  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.752922  normal  0.504506 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5282  ABC transporter related  40.95 
 
 		 248 aa  191  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17632 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3462  ABC transporter related  41.45 
 
 		 250 aa  190  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0534254 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0852  ABC transporter related  45.02 
 
 		 278 aa  190  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.705089  normal  0.0418942 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0627  ABC transporter ATP-binding protein  43.27 
 
 		 276 aa  189  2.9999999999999997e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00990626  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0448  ABC-type transport system, ATPase component  40.74 
 
 		 266 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392883  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0698  ABC transporter, ATP-binding protein  38.24 
 
 		 242 aa  189  2.9999999999999997e-47  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0818  ABC transporter related  44.12 
 
 		 278 aa  189  4e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0232927  normal  0.356957 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0853  ABC transporter related  44.35 
 
 		 273 aa  189  4e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0785068 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1349  ABC transporter related  40.17 
 
 		 248 aa  189  4e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3315  ABC transporter related  42.74 
 
 		 258 aa  189  4e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000690504 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0578  ABC transporter related  42.86 
 
 		 276 aa  189  5e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.206439  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22670  putative ATP-binding component of ABC transporter  45.64 
 
 		 264 aa  189  5e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420242 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0141  ABC transporter ATP-binding protein  46.61 
 
 		 263 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0633689  normal  0.467714 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0159  ABC transporter related  46.61 
 
 		 263 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0157  ABC transporter related  46.61 
 
 		 263 aa  188  7e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.961661 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2449  ABC transporter related  38.37 
 
 		 268 aa  187  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4114  ABC transporter related  45.22 
 
 		 268 aa  187  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0512527  normal  0.918883 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2513  ABC transporter related  42.57 
 
 		 259 aa  187  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0824022  normal  0.0374707 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0248  ABC transporter, ATP-binding protein  43.39 
 
 		 255 aa  186  3e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2673  ABC transporter-like  41.02 
 
 		 260 aa  186  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5556  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.21 
 
 		 264 aa  186  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.50977 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0514  ABC transporter related  40.38 
 
 		 261 aa  186  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0531  ABC transporter related  40.38 
 
 		 261 aa  186  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  hitchhiker  0.00910021 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0997  ABC transporter-like protein protein  40.23 
 
 		 260 aa  185  5e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0883738  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1074  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents ATPase component-like protein  40.82 
 
 		 333 aa  185  7e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2585  ABC transporter related  38.4 
 
 		 259 aa  184  9e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1611  ABC transporter related  44.07 
 
 		 295 aa  184  9e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2049  ABC transporter ATP-binding protein  44.07 
 
 		 259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.558071 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1628  ABC transporter related  42.62 
 
 		 256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.387649 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1029  hypothetical protein  42.36 
 
 		 250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0796  ABC transporter related  40.68 
 
 		 255 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1453  ABC transporter related  43.46 
 
 		 257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.329666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10668  ribonucleotide transport ATP-binding protein ABC transporter mkl  40.82 
 
 		 359 aa  183  3e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.139977  normal  0.579373 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2164  ABC transporter related  40.38 
 
 		 261 aa  182  4.0000000000000006e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5099  ABC transporter related  39.59 
 
 		 362 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0528619 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2985  ABC-type organic solvent transporter, ATP-binding protein  39.82 
 
 		 257 aa  181  8.000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.444132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0996  ABC transporter related  39.59 
 
 		 361 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0700  ABC transporter related  39.51 
 
 		 333 aa  180  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2542  ABC transporter-related protein  39.66 
 
 		 262 aa  180  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120611  hitchhiker  0.000000000000186562 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0189  ABC transporter related  39.42 
 
 		 254 aa  180  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0746681  normal  0.958869 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0986  ABC transporter related  39.59 
 
 		 361 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.401008 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4484  ABC transporter related  41.8 
 
 		 257 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1127  ABC transporter related protein  41.25 
 
 		 421 aa  180  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03690  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, ATPase component  38.55 
 
 		 378 aa  180  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.839011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1212  ABC transporter related  39.06 
 
 		 267 aa  180  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00512006  hitchhiker  0.000000000503976 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0968  ABC transporter related  39.59 
 
 		 361 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51873  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1254  ABC transporter-related protein  39.59 
 
 		 357 aa  180  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0999833 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2003  ABC transporter related  44.53 
 
 		 257 aa  180  2e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2743  ABC transporter related  42.86 
 
 		 272 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.132977 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0888  ABC transporter related  39.52 
 
 		 273 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00820574  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0038  ABC transporter-like  43.64 
 
 		 267 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.328477  normal  0.303335 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1953  ABC transporter related  43.72 
 
 		 269 aa  179  4e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0810571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1155  ABC transporter related  44.49 
 
 		 278 aa  179  4e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1621  ABC transporter related protein  41.67 
 
 		 363 aa  179  4.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.966929  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1637  ABC transporter related  41.74 
 
 		 256 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.967279 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2194  ABC transporter related  42.08 
 
 		 281 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0566123  normal  0.102467 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>