More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0015 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0015  ABC transporter related  100 
 
 		 252 aa  507  1e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0891779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0407  ABC transporter component  65.87 
 
 		 257 aa  338  4e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3484  ABC transporter related  63.86 
 
 		 257 aa  328  4e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2458  ABC transporter, ATPase subunit  62.35 
 
 		 248 aa  298  5e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1121  ABC transporter related  62.35 
 
 		 248 aa  298  5e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.418609  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1066  ABC transporter related  62.35 
 
 		 248 aa  296  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1781  ABC transporter related  62.7 
 
 		 252 aa  290  2e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.122728 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2380  ABC transporter  61.94 
 
 		 257 aa  288  7e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83089  normal  0.615068 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1851  ABC transporter related  57.94 
 
 		 263 aa  284  8e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1737  ABC transporter related  59.68 
 
 		 245 aa  279  3e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0169856  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2869  ABC transporter related  56.85 
 
 		 261 aa  265  4e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1328  ABC transporter related  54.88 
 
 		 256 aa  261  6e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0917234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1578  ABC transporter related  54.84 
 
 		 260 aa  259  4e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.292703 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0677  ABC transporter related  50.6 
 
 		 255 aa  249  2e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3691  ABC transporter related  55.6 
 
 		 245 aa  247  1e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.896312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1977  ABC transporter related  47.64 
 
 		 248 aa  228  7e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.28613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0328  ABC transporter related  44.94 
 
 		 249 aa  223  3e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.673492  normal  0.624259 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2596  ABC transporter related protein  48.54 
 
 		 260 aa  223  3e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.256414  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0051  ABC transporter  48.12 
 
 		 238 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2449  ABC transporter related  44.05 
 
 		 268 aa  220  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1862  ABC transporter, ATPase subunit  46.15 
 
 		 248 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634035  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2083  ABC transporter related  45.3 
 
 		 248 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1998  ABC transporter-related protein  45.3 
 
 		 248 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0085  ABC transporter, ATP-binding protein  48.95 
 
 		 238 aa  219  5e-56  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0561  ABC transporter related  47.15 
 
 		 248 aa  217  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000384868  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0379  ABC transporter related  45.12 
 
 		 262 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0990  ABC transporter, ATP-binding protein  43.91 
 
 		 233 aa  212  3.9999999999999995e-54  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.491255  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1887  ABC transporter related protein  46.44 
 
 		 296 aa  211  1e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0816  ABC transporter, ATP-binding protein  45.53 
 
 		 248 aa  210  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0787  ABC transporter-related protein  46.15 
 
 		 248 aa  208  5e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3315  ABC transporter related  43.51 
 
 		 258 aa  207  9e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000690504 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2343  ABC transporter related protein  48.54 
 
 		 252 aa  206  3e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3182  ABC transporter related  42.68 
 
 		 250 aa  206  4e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1040  ABC transporter related  45.53 
 
 		 248 aa  205  5e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0855  ABC transporter related protein  44.03 
 
 		 273 aa  202  5e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.795905 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1621  ABC transporter related protein  45.83 
 
 		 363 aa  202  6e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.966929  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0401  ABC transporter related  44.9 
 
 		 262 aa  201  9e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186175  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6635  ABC transporter related  42.68 
 
 		 363 aa  200  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0700  ABC transporter related  41.3 
 
 		 333 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3808  ABC transporter related  44.09 
 
 		 262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.140241  normal  0.926814 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1811  ABC transporter related protein  43.46 
 
 		 251 aa  200  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0986  ABC transporter related  41.63 
 
 		 361 aa  199  3e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.401008 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2673  ABC transporter-like  46.51 
 
 		 260 aa  199  3e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0968  ABC transporter related  41.63 
 
 		 361 aa  199  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51873  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1498  ABC transporter related  44.3 
 
 		 256 aa  199  5e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5099  ABC transporter related  41.22 
 
 		 362 aa  198  7e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0528619 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1074  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents ATPase component-like protein  42.28 
 
 		 333 aa  198  7e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03690  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, ATPase component  41.46 
 
 		 378 aa  198  7.999999999999999e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.839011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10668  ribonucleotide transport ATP-binding protein ABC transporter mkl  42.04 
 
 		 359 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.139977  normal  0.579373 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0996  ABC transporter related  41.22 
 
 		 361 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07670  ABC transporter, ATP-binding protein  44.21 
 
 		 254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0821592  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5159  ABC transporter related protein  42.44 
 
 		 248 aa  197  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.364497 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4349  ABC transporter related protein  42.28 
 
 		 359 aa  196  3e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1254  ABC transporter-related protein  40.41 
 
 		 357 aa  196  3e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0999833 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1349  ABC transporter related  40.5 
 
 		 248 aa  194  1e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0997  ABC transporter-like protein protein  42.02 
 
 		 260 aa  192  4e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0883738  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4315  ABC transporter related  43.15 
 
 		 259 aa  192  6e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.696843  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3963  ABC transporter related  40.51 
 
 		 248 aa  191  7e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764757  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2065  ABC transporter related protein  43.72 
 
 		 273 aa  191  9e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2164  ABC transporter related  41.83 
 
 		 261 aa  191  9e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0698  ABC transporter, ATP-binding protein  40.59 
 
 		 242 aa  191  1e-47  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0752  ABC transporter related protein  39.68 
 
 		 397 aa  189  2.9999999999999997e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0450  ABC transporter related  41.35 
 
 		 254 aa  189  4e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0796  ABC transporter related  40.32 
 
 		 255 aa  187  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1127  ABC transporter related protein  38.62 
 
 		 421 aa  186  3e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0706  ABC transporter related protein  43.22 
 
 		 258 aa  186  3e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613257  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2985  ABC-type organic solvent transporter, ATP-binding protein  37.97 
 
 		 257 aa  185  6e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.444132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1008  ABC transporter related  41.25 
 
 		 397 aa  185  7e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00677316  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3442  ABC transporter related protein  43.32 
 
 		 246 aa  185  8e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.0228809 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2542  ABC transporter-related protein  40.98 
 
 		 262 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120611  hitchhiker  0.000000000000186562 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3462  ABC transporter related  40.59 
 
 		 250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0534254 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2292  ABC transporter related  41.98 
 
 		 279 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1743  ABC transporter-related protein  41.39 
 
 		 271 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0531  ABC transporter related  41.76 
 
 		 261 aa  183  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  hitchhiker  0.00910021 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0514  ABC transporter related  41.76 
 
 		 261 aa  183  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2886  ABC transporter, ATPase subunit  40.08 
 
 		 275 aa  182  4.0000000000000006e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.21978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0169  ABC transporter related  40.17 
 
 		 292 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2513  ABC transporter related  40.59 
 
 		 259 aa  181  8.000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0824022  normal  0.0374707 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0248  ABC transporter, ATP-binding protein  42.45 
 
 		 255 aa  181  1e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1227  ABC transporter, ATP-binding protein  40.74 
 
 		 272 aa  180  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0448  ABC-type transport system, ATPase component  40.24 
 
 		 266 aa  180  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392883  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2413  ABC transporter related  39.18 
 
 		 266 aa  180  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.104352 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0350  ATPase  42.06 
 
 		 292 aa  180  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0759  ABC transporter related protein  41.3 
 
 		 289 aa  180  2e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3036  ABC transporter related  42.02 
 
 		 261 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.845975 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0888  ABC transporter related  40.41 
 
 		 273 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00820574  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5282  ABC transporter related  36.51 
 
 		 248 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17632 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0176  ABC transporter related  39.75 
 
 		 292 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1212  ABC transporter related  40.83 
 
 		 267 aa  178  5.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00512006  hitchhiker  0.000000000503976 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0022  ATPase  39.92 
 
 		 256 aa  178  8e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2343  ABC transporter related  42.68 
 
 		 275 aa  178  8e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464868 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2749  ABC transporter related  39.29 
 
 		 270 aa  178  9e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0493  ABC transporter related  41.32 
 
 		 251 aa  177  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.759588  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3402  ABC transporter related  38.74 
 
 		 270 aa  177  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0314  ABC transporter ATP-binding protein  39.33 
 
 		 298 aa  176  3e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2195  ABC transporter, ATP-binding protein  38.49 
 
 		 248 aa  176  3e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00836348 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2806  ABC transporter related  41.56 
 
 		 257 aa  175  5e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0337  ABC transporter related  41.83 
 
 		 274 aa  175  5e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.425163 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0100  ABC transporter related  40 
 
 		 278 aa  175  6e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.106893  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3119  ABC transporter related protein  42.21 
 
 		 276 aa  175  6e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>