More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0350 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0350  ATPase  100 
 
 		 292 aa  598  1e-170  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0997  ABC transporter-like protein protein  62.11 
 
 		 260 aa  318  5e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0883738  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3808  ABC transporter related  59.22 
 
 		 262 aa  317  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.140241  normal  0.926814 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3036  ABC transporter related  58.98 
 
 		 261 aa  314  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.845975 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2673  ABC transporter-like  60.7 
 
 		 260 aa  311  5.999999999999999e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0531  ABC transporter related  58.75 
 
 		 261 aa  298  5e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  hitchhiker  0.00910021 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0514  ABC transporter related  58.75 
 
 		 261 aa  298  5e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2164  ABC transporter related  56.37 
 
 		 261 aa  296  2e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2585  ABC transporter related  50.39 
 
 		 259 aa  272  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16468  ABC(ATP-binding) family transporter: toluene tolerance  51.38 
 
 		 256 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.222539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03231  ABC transporter ATP-binding protein  44.36 
 
 		 261 aa  227  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.91104  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03161  ABC transporter ATP-binding protein  43.56 
 
 		 270 aa  227  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03141  ABC transporter ATP-binding protein  45.15 
 
 		 240 aa  215  5.9999999999999996e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0292  ABC transporter ATP-binding protein  45.57 
 
 		 240 aa  215  7e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.155159  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03131  ABC transporter ATP-binding protein  45.15 
 
 		 240 aa  215  7e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25221  ABC transporter ATP-binding protein  47.11 
 
 		 247 aa  214  9e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.862645 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0207  ATPase  47.13 
 
 		 248 aa  211  1e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0989114  normal  0.489158 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0234  ATPase  47.62 
 
 		 232 aa  203  3e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3484  ABC transporter related  40.78 
 
 		 257 aa  199  3e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03701  ABC transporter ATP-binding protein  45.38 
 
 		 261 aa  199  7e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.569464 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0407  ABC transporter component  42.19 
 
 		 257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1656  ABC transporter ATP-binding protein  44.58 
 
 		 261 aa  197  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0677  ABC transporter related  43.02 
 
 		 255 aa  191  8e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1851  ABC transporter related  40.75 
 
 		 263 aa  191  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0816  ABC transporter, ATP-binding protein  41.34 
 
 		 248 aa  191  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2596  ABC transporter related protein  41.96 
 
 		 260 aa  190  2e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.256414  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0328  ABC transporter related  39.46 
 
 		 249 aa  190  2.9999999999999997e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.673492  normal  0.624259 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3182  ABC transporter related  42.58 
 
 		 250 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2869  ABC transporter related  40.54 
 
 		 261 aa  185  8e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1781  ABC transporter related  41 
 
 		 252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.122728 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2449  ABC transporter related  38.13 
 
 		 268 aa  184  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1066  ABC transporter related  41.41 
 
 		 248 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0787  ABC transporter-related protein  40.16 
 
 		 248 aa  182  7e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2380  ABC transporter  41.57 
 
 		 257 aa  181  9.000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83089  normal  0.615068 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0015  ABC transporter related  42.06 
 
 		 252 aa  180  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0891779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0561  ABC transporter related  40.39 
 
 		 248 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000384868  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1621  ABC transporter related protein  37.41 
 
 		 363 aa  179  4e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.966929  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4315  ABC transporter related  39.3 
 
 		 259 aa  179  4.999999999999999e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.696843  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2458  ABC transporter, ATPase subunit  40.62 
 
 		 248 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1121  ABC transporter related  40.62 
 
 		 248 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.418609  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1040  ABC transporter related  40.23 
 
 		 248 aa  175  9e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3691  ABC transporter related  42.23 
 
 		 245 aa  174  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.896312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1737  ABC transporter related  38.98 
 
 		 245 aa  173  2.9999999999999996e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0169856  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1738  ABC transporter related  38.25 
 
 		 244 aa  172  6.999999999999999e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0158  toluene ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40.23 
 
 		 276 aa  170  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1578  ABC transporter related  39.22 
 
 		 260 aa  170  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.292703 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0337  ABC transporter related  40.23 
 
 		 274 aa  170  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.425163 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1328  ABC transporter related  37.93 
 
 		 256 aa  170  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0917234  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0958  toluene tolerance ABC efflux transporter, ATP-binding protein  41.38 
 
 		 269 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5282  ABC transporter related  35.63 
 
 		 248 aa  169  4e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17632 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1695  ABC transporter related  37.35 
 
 		 244 aa  169  6e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0662  ABC transporter related  38.25 
 
 		 244 aa  168  8e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1887  ABC transporter related protein  36.5 
 
 		 296 aa  168  9e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0965  ABC transporter related  41 
 
 		 269 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0997  ABC transporter related  41 
 
 		 269 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0706  ABC transporter related protein  40.32 
 
 		 258 aa  168  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613257  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2886  ABC transporter, ATPase subunit  40.46 
 
 		 275 aa  167  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.21978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2253  ABC transporter related  37.85 
 
 		 244 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.491715  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4536  ABC transporter, ATP-binding protein  37.65 
 
 		 267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4141  ABC transporter  40.68 
 
 		 269 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5028  ABC transporter ATP-binding protein  39.85 
 
 		 269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4257  ABC transporter related  40.61 
 
 		 269 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0441  ATPase  37.05 
 
 		 244 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0479  ATPase  37.85 
 
 		 244 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.119209  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3442  ABC transporter related protein  36.36 
 
 		 246 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.0228809 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57880  ABC transporter ATP-binding protein  39.85 
 
 		 269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0160  ABC transporter related  39.6 
 
 		 272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.609677 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2786  ABC transporter, ATPase subunit  38.31 
 
 		 294 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000312244  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2935  ABC transporter related  39.23 
 
 		 271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0903  hypothetical protein  36.86 
 
 		 265 aa  163  4.0000000000000004e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0872  hypothetical protein  36.86 
 
 		 265 aa  163  4.0000000000000004e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2413  ABC transporter related  38.7 
 
 		 266 aa  162  4.0000000000000004e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.104352 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0387  ABC transporter, ATPase subunit, toluene tolerance Ttg2A-like  38.85 
 
 		 273 aa  162  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0379  ABC transporter related  36.11 
 
 		 262 aa  162  6e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0189  ABC transporter related  37.05 
 
 		 254 aa  162  7e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0746681  normal  0.958869 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1227  ABC transporter, ATP-binding protein  37.65 
 
 		 272 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2292  ABC transporter related  37.86 
 
 		 279 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0863  ABC transporter-like  39.46 
 
 		 270 aa  162  9e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.535463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0341  ABC transporter related  37.79 
 
 		 273 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.444988 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0332  ABC transporter related  37.79 
 
 		 273 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4447  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40.3 
 
 		 269 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1743  ABC transporter-related protein  37.86 
 
 		 271 aa  160  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0876  ABC transporter related  40.61 
 
 		 269 aa  160  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.930987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3394  ABC transporter-related protein  39.84 
 
 		 278 aa  160  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2223  ABC transporter related  38.61 
 
 		 276 aa  161  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.435588  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1969  ABC transporter, ATP-binding protein  38.37 
 
 		 275 aa  160  3e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.309748  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0796  ABC transporter related  38.49 
 
 		 255 aa  160  3e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1977  ABC transporter related  39.68 
 
 		 248 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.28613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1811  ABC transporter related protein  38.33 
 
 		 251 aa  160  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0888  ABC transporter related  38.19 
 
 		 273 aa  159  4e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00820574  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3512  ABC transporter, ATPase subunit  38.17 
 
 		 273 aa  159  6e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.317493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0393  ABC transporter related  38.17 
 
 		 273 aa  159  6e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.261527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2693  ABC transporter related  38.17 
 
 		 273 aa  159  6e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.663262  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0414  ABC transporter related  38.17 
 
 		 273 aa  159  6e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192398  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3735  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein  37.35 
 
 		 272 aa  159  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.527515  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1872  ABC transporter-related protein  35.34 
 
 		 244 aa  159  7e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00971328 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3081  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.02 
 
 		 270 aa  159  8e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.216025 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0022  ATPase  38.74 
 
 		 256 aa  157  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2749  ABC transporter related  36.43 
 
 		 270 aa  158  1e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1074  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents ATPase component-like protein  36.69 
 
 		 333 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>