More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1040 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1040  ABC transporter related  100 
 
 		 248 aa  496  1e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0787  ABC transporter-related protein  80.24 
 
 		 248 aa  409  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0816  ABC transporter, ATP-binding protein  79.03 
 
 		 248 aa  404  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3182  ABC transporter related  75.2 
 
 		 250 aa  380  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0561  ABC transporter related  73.79 
 
 		 248 aa  372  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000384868  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0677  ABC transporter related  57.49 
 
 		 255 aa  281  6.000000000000001e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0448  ABC-type transport system, ATPase component  49.39 
 
 		 266 aa  258  7e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392883  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2343  ABC transporter related protein  52.08 
 
 		 252 aa  244  8e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1621  ABC transporter related protein  47.97 
 
 		 363 aa  240  1e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.966929  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2596  ABC transporter related protein  47.52 
 
 		 260 aa  235  4e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.256414  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0401  ABC transporter related  47.35 
 
 		 262 aa  233  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186175  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1862  ABC transporter, ATPase subunit  48.78 
 
 		 248 aa  232  5e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634035  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2083  ABC transporter related  48.78 
 
 		 248 aa  231  7.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1998  ABC transporter-related protein  48.78 
 
 		 248 aa  231  7.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2449  ABC transporter related  46.15 
 
 		 268 aa  231  9e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1127  ABC transporter related protein  45.53 
 
 		 421 aa  229  4e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0752  ABC transporter related protein  46.28 
 
 		 397 aa  226  3e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1977  ABC transporter related  48.78 
 
 		 248 aa  226  4e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.28613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03690  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, ATPase component  46.89 
 
 		 378 aa  225  6e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.839011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10668  ribonucleotide transport ATP-binding protein ABC transporter mkl  47.15 
 
 		 359 aa  223  2e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.139977  normal  0.579373 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1887  ABC transporter related protein  46.44 
 
 		 296 aa  223  3e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2413  ABC transporter related  44.67 
 
 		 266 aa  221  7e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.104352 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0700  ABC transporter related  44.31 
 
 		 333 aa  221  7e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6635  ABC transporter related  46.86 
 
 		 363 aa  220  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3484  ABC transporter related  46.56 
 
 		 257 aa  220  1.9999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0379  ABC transporter related  43.85 
 
 		 262 aa  219  1.9999999999999999e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1969  ABC transporter, ATP-binding protein  44.13 
 
 		 275 aa  219  3e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.309748  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0855  ABC transporter related protein  44.13 
 
 		 273 aa  219  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.795905 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3512  ABC transporter, ATPase subunit  44.94 
 
 		 273 aa  219  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.317493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1074  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents ATPase component-like protein  45.61 
 
 		 333 aa  219  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0393  ABC transporter related  44.94 
 
 		 273 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.261527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2693  ABC transporter related  44.94 
 
 		 273 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.663262  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0968  ABC transporter related  45.93 
 
 		 361 aa  219  3e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51873  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0341  ABC transporter related  44.53 
 
 		 273 aa  219  3e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.444988 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0332  ABC transporter related  44.53 
 
 		 273 aa  219  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0414  ABC transporter related  44.94 
 
 		 273 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192398  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0986  ABC transporter related  45.93 
 
 		 361 aa  219  3e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.401008 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0328  ABC transporter related  43.55 
 
 		 249 aa  219  3.9999999999999997e-56  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.673492  normal  0.624259 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0996  ABC transporter related  45.12 
 
 		 361 aa  218  5e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0407  ABC transporter component  46.15 
 
 		 257 aa  218  7e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1851  ABC transporter related  46.03 
 
 		 263 aa  218  7e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0317  ABC transporter related  44.13 
 
 		 273 aa  217  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0527891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4349  ABC transporter related protein  44.31 
 
 		 359 aa  216  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1328  ABC transporter related  46.69 
 
 		 256 aa  216  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0917234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1254  ABC transporter-related protein  44.31 
 
 		 357 aa  216  2e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0999833 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2935  ABC transporter related  42.91 
 
 		 271 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5099  ABC transporter related  44.31 
 
 		 362 aa  215  4e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0528619 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2770  ABC transporter related  44.53 
 
 		 273 aa  214  8e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.719655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0479  ATPase  44.12 
 
 		 244 aa  214  9.999999999999999e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.119209  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2253  ABC transporter related  43.7 
 
 		 244 aa  214  9.999999999999999e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.491715  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1777  ABC transporter, ATP-binding protein  43.8 
 
 		 272 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2726  ABC transporter, ATP-binding protein  43.8 
 
 		 272 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3228  ABC transporter, ATP-binding protein  43.8 
 
 		 272 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3704  putative ABC transporter ATP-binding subunit  43.8 
 
 		 272 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2776  ABC transporter, ATP-binding protein  43.8 
 
 		 272 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.849481  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3677  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein  43.8 
 
 		 272 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0124064  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3571  ABC transporter related  44.13 
 
 		 273 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626203  hitchhiker  0.0000199293 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3004  ABC transporter, ATP-binding protein  43.8 
 
 		 272 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3735  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein  42.91 
 
 		 272 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.527515  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0387  ABC transporter, ATPase subunit, toluene tolerance Ttg2A-like  44.13 
 
 		 273 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1578  ABC transporter related  45.56 
 
 		 260 aa  212  4.9999999999999996e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.292703 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1008  ABC transporter related  42.68 
 
 		 397 aa  211  9e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00677316  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1695  ABC transporter related  44.12 
 
 		 244 aa  210  2e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0737  ABC transporter related  44.67 
 
 		 261 aa  209  3e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0706  ABC transporter related protein  45.34 
 
 		 258 aa  209  4e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613257  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4447  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein, putative  42.62 
 
 		 269 aa  207  8e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1066  ABC transporter related  47.01 
 
 		 248 aa  207  9e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2458  ABC transporter, ATPase subunit  46.61 
 
 		 248 aa  207  1e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1121  ABC transporter related  46.61 
 
 		 248 aa  207  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.418609  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2709  ABC transporter related  43.44 
 
 		 270 aa  207  1e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2786  ABC transporter, ATPase subunit  42.86 
 
 		 294 aa  206  2e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000312244  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1013  ABC transporter-related protein  43.67 
 
 		 306 aa  206  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0979  ABC transporter related  42.45 
 
 		 265 aa  206  2e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002409  ABC transporter ATP-binding protein  42.86 
 
 		 267 aa  206  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1781  ABC transporter related  47.41 
 
 		 252 aa  206  2e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.122728 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2380  ABC transporter  46.61 
 
 		 257 aa  207  2e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83089  normal  0.615068 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0958  toluene tolerance ABC efflux transporter, ATP-binding protein  42.62 
 
 		 269 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4141  ABC transporter  42.21 
 
 		 269 aa  206  3e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1154  ABC transporter related  41.3 
 
 		 286 aa  206  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0662  ABC transporter related  42.86 
 
 		 244 aa  206  3e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1738  ABC transporter related  42.44 
 
 		 244 aa  206  3e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0965  ABC transporter related  42.62 
 
 		 269 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4536  ABC transporter, ATP-binding protein  41.13 
 
 		 267 aa  206  4e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0863  ABC transporter-like  42.21 
 
 		 270 aa  205  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.535463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0716  ABC transporter related  43.67 
 
 		 286 aa  206  4e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0015  ABC transporter related  45.53 
 
 		 252 aa  205  5e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0891779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0793  ABC transporter related  43.28 
 
 		 282 aa  205  5e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.215167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0997  ABC transporter related  42.62 
 
 		 269 aa  205  5e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0685  ABC transporter related  40.08 
 
 		 293 aa  205  6e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4257  ABC transporter related  42.62 
 
 		 269 aa  205  6e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0876  ABC transporter related  43.03 
 
 		 269 aa  204  8e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.930987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0748  ABC transporter related  43.67 
 
 		 286 aa  204  8e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1173  ABC transporter, ATP-binding protein  40.49 
 
 		 264 aa  204  8e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2673  ABC transporter-like  43.19 
 
 		 260 aa  204  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5028  ABC transporter ATP-binding protein  42.74 
 
 		 269 aa  203  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3394  ABC transporter-related protein  40.89 
 
 		 278 aa  203  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0096  ABC transporter related  42.21 
 
 		 282 aa  204  2e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.568034  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3101  putative ABC transporter ATP-binding subunit  40.89 
 
 		 279 aa  203  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3259  ABC transporter-related protein  40.89 
 
 		 283 aa  203  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57880  ABC transporter ATP-binding protein  42.74 
 
 		 269 aa  203  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>