More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0207 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0207  ATPase  100 
 
 
248 aa  504  9.999999999999999e-143  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0989114  normal  0.489158 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0234  ATPase  87.07 
 
 
232 aa  415  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25221  ABC transporter ATP-binding protein  80.57 
 
 
247 aa  402  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.862645 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03161  ABC transporter ATP-binding protein  63.67 
 
 
270 aa  351  5e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03231  ABC transporter ATP-binding protein  62.6 
 
 
261 aa  338  7e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.91104  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03701  ABC transporter ATP-binding protein  65.85 
 
 
261 aa  333  1e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.569464 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1656  ABC transporter ATP-binding protein  65.85 
 
 
261 aa  331  6e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03141  ABC transporter ATP-binding protein  61.92 
 
 
240 aa  322  3e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03131  ABC transporter ATP-binding protein  61.92 
 
 
240 aa  322  5e-87  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0292  ABC transporter ATP-binding protein  62.34 
 
 
240 aa  318  3.9999999999999996e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.155159  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2164  ABC transporter related  50.21 
 
 
261 aa  237  1e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2673  ABC transporter-like  49.79 
 
 
260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3036  ABC transporter related  48.15 
 
 
261 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.845975 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3808  ABC transporter related  47.74 
 
 
262 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.140241  normal  0.926814 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0997  ABC transporter-like protein protein  46.91 
 
 
260 aa  227  2e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0883738  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0514  ABC transporter related  49.38 
 
 
261 aa  226  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0531  ABC transporter related  49.38 
 
 
261 aa  226  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  hitchhiker  0.00910021 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0350  ATPase  47.13 
 
 
292 aa  211  1e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2585  ABC transporter related  43.5 
 
 
259 aa  202  6e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16468  ABC(ATP-binding) family transporter: toluene tolerance  44.09 
 
 
256 aa  201  9.999999999999999e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.222539  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0816  ABC transporter, ATP-binding protein  41.98 
 
 
248 aa  177  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0561  ABC transporter related  40.33 
 
 
248 aa  171  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000384868  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0787  ABC transporter-related protein  41.18 
 
 
248 aa  170  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3182  ABC transporter related  41.98 
 
 
250 aa  167  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2596  ABC transporter related protein  39.83 
 
 
260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.256414  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3484  ABC transporter related  37.25 
 
 
257 aa  161  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2449  ABC transporter related  41.08 
 
 
268 aa  159  3e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1040  ABC transporter related  40 
 
 
248 aa  159  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0328  ABC transporter related  36.99 
 
 
249 aa  158  8e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.673492  normal  0.624259 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0407  ABC transporter component  37.7 
 
 
257 aa  156  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1227  ABC transporter, ATP-binding protein  37.08 
 
 
272 aa  154  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0448  ABC-type transport system, ATPase component  37.1 
 
 
266 aa  153  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392883  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1328  ABC transporter related  37.65 
 
 
256 aa  152  4e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0917234  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1887  ABC transporter related protein  38.33 
 
 
296 aa  151  8e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0853  ABC transporter related  41.6 
 
 
273 aa  150  2e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0785068 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0677  ABC transporter related  38.21 
 
 
255 aa  149  3e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0662  ABC transporter related  34.89 
 
 
244 aa  148  6e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1695  ABC transporter related  34.48 
 
 
244 aa  147  1.0000000000000001e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0793  ABC transporter related  38.93 
 
 
282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.215167  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1851  ABC transporter related  36.14 
 
 
263 aa  146  3e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0379  ABC transporter related  35.92 
 
 
262 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1737  ABC transporter related  35.8 
 
 
245 aa  145  8.000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0169856  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1743  ABC transporter-related protein  35.42 
 
 
271 aa  144  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2749  ABC transporter related  36.07 
 
 
270 aa  144  1e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0015  ABC transporter related  37.3 
 
 
252 aa  144  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0891779  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1143  ABC transporter related  36.21 
 
 
276 aa  144  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0401  ABC transporter related  37.13 
 
 
262 aa  143  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186175  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2380  ABC transporter  36.21 
 
 
257 aa  143  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83089  normal  0.615068 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1738  ABC transporter related  34.05 
 
 
244 aa  142  4e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3119  ABC transporter related protein  35.42 
 
 
276 aa  142  5e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1121  ABC transporter related  36.63 
 
 
248 aa  142  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.418609  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2458  ABC transporter, ATPase subunit  36.63 
 
 
248 aa  142  5e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1066  ABC transporter related  36.07 
 
 
248 aa  142  6e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1781  ABC transporter related  37.45 
 
 
252 aa  142  7e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.122728 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4315  ABC transporter related  34.5 
 
 
259 aa  142  7e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.696843  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2343  ABC transporter related protein  36.18 
 
 
252 aa  141  9e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0450  ABC transporter related  33.62 
 
 
254 aa  141  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0479  ATPase  34.62 
 
 
244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.119209  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0796  ABC transporter related  37.34 
 
 
255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1173  ABC transporter, ATP-binding protein  36.48 
 
 
264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1872  ABC transporter-related protein  34.05 
 
 
244 aa  140  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00971328 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1900  ABC transporter ATPase  37.7 
 
 
270 aa  139  3e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.81319  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0189  ABC transporter related  35.17 
 
 
254 aa  139  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0746681  normal  0.958869 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2292  ABC transporter related  35 
 
 
279 aa  139  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3402  ABC transporter related  35.63 
 
 
270 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5282  ABC transporter related  33.47 
 
 
248 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.17632 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1578  ABC transporter related  36.25 
 
 
260 aa  139  4.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.292703 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0441  ATPase  33.19 
 
 
244 aa  139  6e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0706  ABC transporter related protein  36.82 
 
 
258 aa  138  6e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613257  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3259  ABC transporter-related protein  37.04 
 
 
283 aa  138  8.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0237  ABC transporter related  36.17 
 
 
268 aa  137  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5028  ABC transporter ATP-binding protein  36.59 
 
 
269 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3704  ABC transporter related  37.99 
 
 
265 aa  138  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.307132  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57880  ABC transporter ATP-binding protein  36.59 
 
 
269 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2298  ATPase  35.83 
 
 
273 aa  137  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102276  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0958  toluene tolerance ABC efflux transporter, ATP-binding protein  36.63 
 
 
269 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567321  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0535  ABC transporter related  37.29 
 
 
271 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2413  ABC transporter related  36.63 
 
 
266 aa  136  4e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.104352 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2869  ABC transporter related  35.22 
 
 
261 aa  136  4e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0888  ABC transporter related  36.25 
 
 
273 aa  135  7.000000000000001e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00820574  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3691  ABC transporter related  37.6 
 
 
245 aa  135  8e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.896312  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0965  ABC transporter related  36.63 
 
 
269 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3394  ABC transporter-related protein  37.14 
 
 
278 aa  134  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0876  ABC transporter related  36.69 
 
 
269 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.930987  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0022  ATPase  37.34 
 
 
256 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2253  ABC transporter related  32.48 
 
 
244 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.491715  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0337  ABC transporter related  36.1 
 
 
274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.425163 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0863  ABC transporter-like  34.96 
 
 
270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.535463  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0997  ABC transporter related  36.21 
 
 
269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1817  ABC transporter related  36.4 
 
 
274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0085  ABC transporter, ATP-binding protein  33.76 
 
 
238 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0158  toluene ABC transporter, ATP-binding protein, putative  36.1 
 
 
276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2397  ABC transporter related  38.21 
 
 
277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0990  ABC transporter, ATP-binding protein  29.91 
 
 
233 aa  133  3e-30  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.491255  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4447  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.77 
 
 
269 aa  133  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1013  ABC transporter-related protein  37.8 
 
 
306 aa  133  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4257  ABC transporter related  36.21 
 
 
269 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0051  ABC transporter  35.24 
 
 
238 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2542  ABC transporter-related protein  35.9 
 
 
262 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120611  hitchhiker  0.000000000000186562 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0698  ABC transporter, ATP-binding protein  32.75 
 
 
242 aa  132  5e-30  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>