More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1817 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1817  ABC transporter related  100 
 
 		 274 aa  548  1e-155  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0853  ABC transporter related  71.59 
 
 		 273 aa  397  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0785068 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2298  ATPase  70.15 
 
 		 273 aa  370  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102276  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0535  ABC transporter related  62.17 
 
 		 271 aa  332  4e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0022  ATPase  56.79 
 
 		 256 aa  270  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0472  ABC transporter related  50.67 
 
 		 293 aa  229  3e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0139008  hitchhiker  0.0000833455 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2449  ABC transporter related  44.4 
 
 		 268 aa  207  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2750  ABC-type transport system, ATPase component  46.61 
 
 		 265 aa  207  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1074  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents ATPase component-like protein  45.19 
 
 		 333 aa  206  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1254  ABC transporter-related protein  42.44 
 
 		 357 aa  206  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0999833 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5099  ABC transporter related  42.44 
 
 		 362 aa  206  5e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0528619 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10668  ribonucleotide transport ATP-binding protein ABC transporter mkl  42.86 
 
 		 359 aa  205  7e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.139977  normal  0.579373 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0996  ABC transporter related  42.02 
 
 		 361 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1057  ABC transporter related  49.76 
 
 		 298 aa  204  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.184914  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4349  ABC transporter related protein  43.1 
 
 		 359 aa  204  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0968  ABC transporter related  42.02 
 
 		 361 aa  203  3e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51873  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0986  ABC transporter related  42.02 
 
 		 361 aa  203  3e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.401008 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0379  ABC transporter related  40.25 
 
 		 262 aa  202  5e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1321  ABC transporter related protein  43.43 
 
 		 259 aa  201  9e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.627863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1887  ABC transporter related protein  42.26 
 
 		 296 aa  201  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1127  ABC transporter related protein  41.6 
 
 		 421 aa  200  1.9999999999999998e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3704  ABC transporter related  43.15 
 
 		 265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.307132  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6635  ABC transporter related  43.1 
 
 		 363 aa  199  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0328  ABC transporter related  42.56 
 
 		 249 aa  199  3.9999999999999996e-50  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.673492  normal  0.624259 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0401  ABC transporter related  43.98 
 
 		 262 aa  199  5e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186175  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0700  ABC transporter related  42.08 
 
 		 333 aa  198  6e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2636  ABC transporter related  42.17 
 
 		 261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0752  ABC transporter related protein  40.76 
 
 		 397 aa  197  2.0000000000000003e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1984  ATPase  43.33 
 
 		 257 aa  196  3e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.101107  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2415  ABC transporter related  43.8 
 
 		 264 aa  195  7e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.805602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0855  ABC transporter related protein  43.86 
 
 		 273 aa  195  8.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.795905 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0716  ABC transporter related  43.03 
 
 		 286 aa  195  9e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0748  ABC transporter related  43.03 
 
 		 286 aa  194  1e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03690  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, ATPase component  41.42 
 
 		 378 aa  194  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.839011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0677  ABC transporter related  42.19 
 
 		 255 aa  192  4e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2413  ABC transporter related  39.83 
 
 		 266 aa  192  4e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.104352 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0685  ABC transporter related  39.6 
 
 		 293 aa  191  8e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1073  ABC transporter related  39.92 
 
 		 258 aa  191  9e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1229  ABC transporter related  47.85 
 
 		 264 aa  189  2.9999999999999997e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.380088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3137  ABC transporter, ATPase subunit  45.61 
 
 		 253 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.297163  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2513  ABC transporter related  42.86 
 
 		 259 aa  187  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0824022  normal  0.0374707 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2935  ABC transporter related  41.18 
 
 		 271 aa  188  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3963  ABC transporter related  38.82 
 
 		 248 aa  187  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0448  ABC-type transport system, ATPase component  38.96 
 
 		 266 aa  187  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392883  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1527  ABC transporter-related protein  41 
 
 		 246 aa  187  2e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.330803  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0039  ABC transporter related  41.38 
 
 		 302 aa  186  3e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0467  ABC transporter related  41.53 
 
 		 253 aa  185  8e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0669  ABC transporter related  40.73 
 
 		 254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2343  ABC transporter related  42.62 
 
 		 275 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464868 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3101  putative ABC transporter ATP-binding subunit  42.44 
 
 		 279 aa  183  3e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3394  ABC transporter-related protein  41.94 
 
 		 278 aa  182  3e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0386  ABC transporter related protein  42.74 
 
 		 277 aa  182  3e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1969  ABC transporter, ATP-binding protein  42.57 
 
 		 275 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.309748  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1621  ABC transporter related protein  43.86 
 
 		 363 aa  182  5.0000000000000004e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.966929  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0888  ABC transporter related  41.77 
 
 		 273 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00820574  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1712  ABC transporter-related protein  41.49 
 
 		 252 aa  182  7e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000576973 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0096  ABC transporter related  41.99 
 
 		 282 aa  182  7e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.568034  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0095  ABC transporter related  41.56 
 
 		 283 aa  182  7e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000937702  normal  0.953414 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1212  ABC transporter related  35.44 
 
 		 267 aa  182  7e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00512006  hitchhiker  0.000000000503976 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12850  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, ATP binding component  40.8 
 
 		 269 aa  181  9.000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0759  ABC transporter related protein  41.5 
 
 		 289 aa  181  1e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2343  ABC transporter related protein  42.19 
 
 		 252 aa  181  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1154  ABC transporter related  39.42 
 
 		 286 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5536  ABC transporter related  41.39 
 
 		 309 aa  180  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5028  ABC transporter ATP-binding protein  40.49 
 
 		 269 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0793  ABC transporter related  40.16 
 
 		 282 aa  180  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.215167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1173  ABC transporter, ATP-binding protein  39.08 
 
 		 264 aa  180  2e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57880  ABC transporter ATP-binding protein  40.49 
 
 		 269 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1578  ABC transporter related  41 
 
 		 260 aa  179  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.292703 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3122  ABC transporter related  43.05 
 
 		 273 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.701707  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2909  ABC transporter component  42.34 
 
 		 277 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.321315  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1013  ABC transporter-related protein  40.98 
 
 		 306 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2806  ABC transporter related  42.8 
 
 		 257 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1977  ABC transporter related  39.83 
 
 		 248 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.28613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2397  ABC transporter related  41.98 
 
 		 277 aa  179  4.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1998  ABC transporter-related protein  38.59 
 
 		 248 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1862  ABC transporter, ATPase subunit  39 
 
 		 248 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634035  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2083  ABC transporter related  38.59 
 
 		 248 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4447  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40.16 
 
 		 269 aa  178  7e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3259  ABC transporter-related protein  40.53 
 
 		 283 aa  178  8e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0997  ABC transporter related  40 
 
 		 269 aa  178  9e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0816  ABC transporter, ATP-binding protein  37.97 
 
 		 248 aa  177  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0958  toluene tolerance ABC efflux transporter, ATP-binding protein  40 
 
 		 269 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2446  ABC transporter component  40.46 
 
 		 264 aa  177  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.404334  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0876  ABC transporter related  41.56 
 
 		 269 aa  177  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.930987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0523  ABC transporter related  43.1 
 
 		 275 aa  176  3e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.310884 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4141  ABC transporter  39.75 
 
 		 269 aa  176  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0248  ABC transporter, ATP-binding protein  46.15 
 
 		 255 aa  176  3e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3016  ABC transporter related  42.98 
 
 		 249 aa  176  3e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.524884  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3402  ABC transporter related  39 
 
 		 270 aa  176  4e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1719  ABC transporter related  41.6 
 
 		 257 aa  176  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0483086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4624  ABC transporter related  40.32 
 
 		 258 aa  176  4e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2770  ABC transporter related  40.25 
 
 		 273 aa  176  5e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.719655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0965  ABC transporter related  40 
 
 		 269 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0863  ABC transporter-like  40 
 
 		 270 aa  175  6e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.535463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2810  ABC transporter, ATPase subunit  40.76 
 
 		 257 aa  175  7e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.66283  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1628  ABC transporter related  41.6 
 
 		 256 aa  175  7e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.387649 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1488  ABC transporter related  40.76 
 
 		 257 aa  175  7e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0317  ABC transporter related  39.6 
 
 		 273 aa  175  8e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0527891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4315  ABC transporter related  37.92 
 
 		 259 aa  175  8e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.696843  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>