More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4624 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4624  ABC transporter related  100 
 
 		 258 aa  518  1e-146  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2415  ABC transporter related  55.47 
 
 		 264 aa  290  1e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.805602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0039  ABC transporter related  53.04 
 
 		 302 aa  276  2e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2750  ABC-type transport system, ATPase component  53.1 
 
 		 265 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3137  ABC transporter, ATPase subunit  55.28 
 
 		 253 aa  270  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.297163  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1984  ATPase  52.48 
 
 		 257 aa  269  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.101107  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2636  ABC transporter related  49.21 
 
 		 261 aa  268  5.9999999999999995e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1073  ABC transporter related  50 
 
 		 258 aa  265  5e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1057  ABC transporter related  53.69 
 
 		 298 aa  259  3e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.184914  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1495  ABC transporter related  52.19 
 
 		 267 aa  258  7e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00076856  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1321  ABC transporter related protein  51.81 
 
 		 259 aa  258  9e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.627863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1712  ABC transporter-related protein  52 
 
 		 252 aa  257  1e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000576973 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2446  ABC transporter component  50.79 
 
 		 264 aa  256  2e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.404334  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1961  ABC transporter related  50.21 
 
 		 254 aa  251  6e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.334641  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1229  ABC transporter related  49.01 
 
 		 264 aa  245  4e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.380088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0669  ABC transporter related  47.56 
 
 		 254 aa  246  4e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0467  ABC transporter related  51.24 
 
 		 253 aa  241  7.999999999999999e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3016  ABC transporter related  53.78 
 
 		 249 aa  239  4e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.524884  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3497  ABC transporter related  50.61 
 
 		 256 aa  224  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.214692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1611  ABC transporter related  50.41 
 
 		 295 aa  222  4e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3704  ABC transporter related  44.03 
 
 		 265 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.307132  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22670  putative ATP-binding component of ABC transporter  44.98 
 
 		 264 aa  209  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420242 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1016  ABC transporter-related protein  45.75 
 
 		 253 aa  208  5e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2909  ABC transporter component  47.33 
 
 		 277 aa  208  7e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.321315  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2513  ABC transporter related  42.86 
 
 		 259 aa  204  8e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0824022  normal  0.0374707 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0248  ABC transporter, ATP-binding protein  45.68 
 
 		 255 aa  202  3e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0853  ABC transporter related  44.63 
 
 		 273 aa  202  4e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0785068 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0472  ABC transporter related  43.55 
 
 		 293 aa  202  5e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0139008  hitchhiker  0.0000833455 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1488  ABC transporter related  43.98 
 
 		 257 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2810  ABC transporter, ATPase subunit  43.98 
 
 		 257 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.66283  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2844  ABC transporter related  45.04 
 
 		 300 aa  200  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1953  ABC transporter related  42.06 
 
 		 269 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0810571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1719  ABC transporter related  43.57 
 
 		 257 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0483086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1155  ABC transporter related  46.47 
 
 		 278 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0818  ABC transporter related  43.57 
 
 		 278 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0232927  normal  0.356957 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0852  ABC transporter related  43.15 
 
 		 278 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.705089  normal  0.0418942 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04770  ABC transporter, ATP binding component  46.89 
 
 		 266 aa  195  5.000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326188  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0892  ABC transporter related  43.15 
 
 		 278 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.752922  normal  0.504506 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0379  ABC transporter related  40.5 
 
 		 262 aa  195  6e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3499  ABC transporter related  42.32 
 
 		 266 aa  194  8.000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.756482  normal  0.324318 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1527  ABC transporter-related protein  40.77 
 
 		 246 aa  193  2e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.330803  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2316  ABC transporter related  42.15 
 
 		 258 aa  193  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184477  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0022  ATPase  42.62 
 
 		 256 aa  192  3e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1914  ABC transporter ATP-binding protein  45.38 
 
 		 264 aa  192  4e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2806  ABC transporter related  41.84 
 
 		 257 aa  192  5e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0480  ABC transporter related  42.28 
 
 		 292 aa  191  7e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.104959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0091  PP-loop family protein  38.96 
 
 		 246 aa  191  1e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0135509  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2743  ABC transporter related  43.62 
 
 		 272 aa  190  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.132977 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4716  ABC transporter related  43.39 
 
 		 259 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.592299  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2449  ABC transporter related  41.49 
 
 		 268 aa  190  2.9999999999999997e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3963  ABC transporter related  38.11 
 
 		 248 aa  188  7e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5086  ABC transporter related  42.11 
 
 		 263 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0940761 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0141  ABC transporter ATP-binding protein  43.95 
 
 		 263 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0633689  normal  0.467714 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0159  ABC transporter related  44.63 
 
 		 263 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03182  ABC transporter ATP-binding protein  41.39 
 
 		 280 aa  186  4e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.501645  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0038  ABC transporter-like  43.31 
 
 		 267 aa  185  7e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.328477  normal  0.303335 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0372  ABC transporter related  43.98 
 
 		 261 aa  185  7e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1316  ABC transporter related  40.24 
 
 		 256 aa  185  7e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0523  ABC transporter related  41.8 
 
 		 275 aa  185  8e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.310884 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2343  ABC transporter related  41.27 
 
 		 275 aa  184  9e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464868 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0787  ABC transporter-related protein  42.26 
 
 		 248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1628  ABC transporter related  40.16 
 
 		 256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.387649 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0578  ABC transporter related  40.33 
 
 		 276 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.206439  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1922  ABC transporter related  42.98 
 
 		 259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1374  ABC transporter related  43.39 
 
 		 258 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2194  ABC transporter related  38.63 
 
 		 281 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0566123  normal  0.102467 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5556  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.36 
 
 		 264 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.50977 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2298  ATPase  42.15 
 
 		 273 aa  183  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102276  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2049  ABC transporter ATP-binding protein  42.32 
 
 		 259 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.558071 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0407  ABC transporter component  40.98 
 
 		 257 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1196  ABC transporter related  43.5 
 
 		 264 aa  182  4.0000000000000006e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3462  ABC transporter related  37.99 
 
 		 250 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0534254 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0401  ABC transporter related  39.92 
 
 		 262 aa  182  5.0000000000000004e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186175  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1434  methionine import ATP-binding protein MetN  39.39 
 
 		 246 aa  182  5.0000000000000004e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00844706  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2596  ABC transporter related protein  37.08 
 
 		 260 aa  181  9.000000000000001e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.256414  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1637  ABC transporter related  39.84 
 
 		 256 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.967279 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4484  ABC transporter related  39.92 
 
 		 257 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1154  ABC transporter related  41.83 
 
 		 286 aa  180  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0157  ABC transporter related  42.69 
 
 		 263 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.961661 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1349  ABC transporter related  39.43 
 
 		 248 aa  179  2.9999999999999997e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0627  ABC transporter ATP-binding protein  39.51 
 
 		 276 aa  179  2.9999999999999997e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00990626  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3402  ABC transporter related  38.33 
 
 		 270 aa  179  4.999999999999999e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1354  ABC transporter related  42.56 
 
 		 258 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1453  ABC transporter related  39.83 
 
 		 257 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.329666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03211  ABC transporter ATP-binding protein  40.74 
 
 		 264 aa  177  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0816  ABC transporter, ATP-binding protein  40.6 
 
 		 248 aa  177  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3565  ABC transporter related  45.02 
 
 		 291 aa  176  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.830372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3484  ABC transporter related  38.17 
 
 		 257 aa  176  3e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0793  ABC transporter related  43.86 
 
 		 282 aa  176  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.215167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1817  ABC transporter related  40.32 
 
 		 274 aa  176  4e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1013  ABC transporter-related protein  39.75 
 
 		 306 aa  176  4e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4934  ABC transporter related  43.57 
 
 		 256 aa  176  5e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0622579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5749  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.26 
 
 		 259 aa  175  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3259  ABC transporter-related protein  39.38 
 
 		 283 aa  175  5e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3101  putative ABC transporter ATP-binding subunit  41.39 
 
 		 279 aa  176  5e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0474  ABC transporter, ATP-binding protein  42.73 
 
 		 246 aa  175  6e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.381498  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4114  ABC transporter related  39.83 
 
 		 268 aa  175  7e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0512527  normal  0.918883 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1040  ABC transporter related  41 
 
 		 248 aa  175  8e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3394  ABC transporter-related protein  40.74 
 
 		 278 aa  174  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4016  ABC transporter related  44.64 
 
 		 265 aa  174  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.304399  normal  0.276484 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>