More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1712 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1712  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 252 aa  501  1e-141  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000576973 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2636  ABC transporter related  50 
 
 		 261 aa  262  3e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2415  ABC transporter related  50.83 
 
 		 264 aa  262  4.999999999999999e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.805602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4624  ABC transporter related  52 
 
 		 258 aa  257  1e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1229  ABC transporter related  49.8 
 
 		 264 aa  252  4.0000000000000004e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.380088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1984  ATPase  49 
 
 		 257 aa  250  1e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.101107  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0039  ABC transporter related  50.2 
 
 		 302 aa  248  8e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2446  ABC transporter component  51.82 
 
 		 264 aa  244  8e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.404334  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1057  ABC transporter related  51.98 
 
 		 298 aa  243  3e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.184914  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1321  ABC transporter related protein  49.39 
 
 		 259 aa  241  1e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.627863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0669  ABC transporter related  45.93 
 
 		 254 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1495  ABC transporter related  51.65 
 
 		 267 aa  231  7.000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00076856  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1961  ABC transporter related  45.45 
 
 		 254 aa  231  8.000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.334641  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3137  ABC transporter, ATPase subunit  49 
 
 		 253 aa  228  8e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.297163  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3497  ABC transporter related  50.2 
 
 		 256 aa  223  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.214692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2750  ABC-type transport system, ATPase component  46.43 
 
 		 265 aa  221  7e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0472  ABC transporter related  45.08 
 
 		 293 aa  216  4e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0139008  hitchhiker  0.0000833455 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0467  ABC transporter related  47.97 
 
 		 253 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1073  ABC transporter related  43.72 
 
 		 258 aa  212  5.999999999999999e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0379  ABC transporter related  41.25 
 
 		 262 aa  210  2e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3016  ABC transporter related  50.61 
 
 		 249 aa  209  4e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.524884  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3704  ABC transporter related  45.75 
 
 		 265 aa  207  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.307132  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2909  ABC transporter component  47.93 
 
 		 277 aa  206  3e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.321315  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1488  ABC transporter related  45.93 
 
 		 257 aa  203  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2810  ABC transporter, ATPase subunit  45.93 
 
 		 257 aa  203  2e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.66283  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22670  putative ATP-binding component of ABC transporter  46.15 
 
 		 264 aa  203  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420242 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0022  ATPase  43.15 
 
 		 256 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1719  ABC transporter related  46.06 
 
 		 257 aa  199  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0483086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2513  ABC transporter related  44.67 
 
 		 259 aa  199  3.9999999999999996e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0824022  normal  0.0374707 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1611  ABC transporter related  50.7 
 
 		 295 aa  198  7e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0853  ABC transporter related  45.2 
 
 		 273 aa  196  3e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0785068 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2743  ABC transporter related  44.44 
 
 		 272 aa  193  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.132977 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2049  ABC transporter ATP-binding protein  46.06 
 
 		 259 aa  190  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.558071 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2343  ABC transporter related  44.53 
 
 		 275 aa  190  2e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464868 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2316  ABC transporter related  43.57 
 
 		 258 aa  190  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184477  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0677  ABC transporter related  39.68 
 
 		 255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0248  ABC transporter, ATP-binding protein  48.36 
 
 		 255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2806  ABC transporter related  46.22 
 
 		 257 aa  189  4e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0627  ABC transporter ATP-binding protein  43.57 
 
 		 276 aa  189  5e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00990626  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2449  ABC transporter related  41.67 
 
 		 268 aa  188  5.999999999999999e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0523  ABC transporter related  43.15 
 
 		 275 aa  187  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.310884 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1914  ABC transporter ATP-binding protein  46.56 
 
 		 264 aa  186  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1504  ABC transporter related  47.54 
 
 		 283 aa  186  2e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2298  ATPase  41.77 
 
 		 273 aa  186  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102276  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2844  ABC transporter related  42.15 
 
 		 300 aa  186  4e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0480  ABC transporter related  42.98 
 
 		 292 aa  185  5e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.104959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03182  ABC transporter ATP-binding protein  43.57 
 
 		 280 aa  185  6e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.501645  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0314  ABC transporter ATP-binding protein  43.32 
 
 		 298 aa  185  7e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0372  ABC transporter related  48.42 
 
 		 261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0328  ABC transporter related  37.08 
 
 		 249 aa  183  2.0000000000000003e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.673492  normal  0.624259 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0578  ABC transporter related  43.62 
 
 		 276 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.206439  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5086  ABC transporter related  46.9 
 
 		 263 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0940761 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0176  ABC transporter related  42.68 
 
 		 292 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0038  ABC transporter-like  47.14 
 
 		 267 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.328477  normal  0.303335 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1817  ABC transporter related  41.49 
 
 		 274 aa  182  6e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1155  ABC transporter related  46.89 
 
 		 278 aa  181  7e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0169  ABC transporter related  42.28 
 
 		 292 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3499  ABC transporter related  42.51 
 
 		 266 aa  181  1e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.756482  normal  0.324318 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0892  ABC transporter related  45.33 
 
 		 278 aa  180  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.752922  normal  0.504506 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0852  ABC transporter related  45.33 
 
 		 278 aa  180  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.705089  normal  0.0418942 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1016  ABC transporter-related protein  43.39 
 
 		 253 aa  180  2e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0157  ABC transporter related  47.51 
 
 		 263 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.961661 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0818  ABC transporter related  46.23 
 
 		 278 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0232927  normal  0.356957 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0141  ABC transporter ATP-binding protein  46.46 
 
 		 263 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0633689  normal  0.467714 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1628  ABC transporter related  46.05 
 
 		 256 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.387649 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2285  ABC transporter related  42.74 
 
 		 304 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2909  ABC transporter related  42.74 
 
 		 304 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2900  ABC transporter related  42.74 
 
 		 304 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.34746  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0159  ABC transporter related  47.06 
 
 		 263 aa  178  8e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2194  ABC transporter related  47.06 
 
 		 281 aa  178  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0566123  normal  0.102467 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2811  ABC transporter related  42.32 
 
 		 303 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.688853  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6242  ABC transporter, ATPase subunit  42.32 
 
 		 304 aa  177  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5556  putative ABC transporter ATP-binding protein  46.48 
 
 		 264 aa  177  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.50977 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2949  ABC transporter related  42.32 
 
 		 303 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.85186  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0179  ABC transporter related  37.55 
 
 		 244 aa  176  2e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1223  ABC transporter, ATP-binding protein  43.85 
 
 		 268 aa  176  2e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0100  ABC transporter related  41.91 
 
 		 278 aa  176  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.106893  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0742  ABC transporter ATP-binding protein  43.85 
 
 		 269 aa  176  3e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1637  ABC transporter related  45.12 
 
 		 256 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.967279 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3565  ABC transporter related  44.81 
 
 		 291 aa  175  5e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.830372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0206  ABC transporter related  41.11 
 
 		 296 aa  175  6e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1680  ABC transporter ATP-binding protein  40.8 
 
 		 254 aa  175  6e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4484  ABC transporter related  43.89 
 
 		 257 aa  175  6e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04770  ABC transporter, ATP binding component  45.64 
 
 		 266 aa  174  9e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326188  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0404  ABC transporter related  42.32 
 
 		 292 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.027511 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1953  ABC transporter related  42.92 
 
 		 269 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0810571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4114  ABC transporter related  45.33 
 
 		 268 aa  174  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0512527  normal  0.918883 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1013  ABC transporter-related protein  40.08 
 
 		 306 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0888  ABC transporter related  40.33 
 
 		 273 aa  174  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00820574  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0535  ABC transporter related  41.08 
 
 		 271 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2343  ABC transporter related protein  44.55 
 
 		 252 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2003  ABC transporter related  44.81 
 
 		 257 aa  173  1.9999999999999998e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3101  putative ABC transporter ATP-binding subunit  40.74 
 
 		 279 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0576  methionine import ATP-binding protein MetN  40.25 
 
 		 243 aa  172  2.9999999999999996e-42  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3963  ABC transporter related  37.67 
 
 		 248 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1196  ABC transporter related  46.3 
 
 		 264 aa  172  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2935  ABC transporter related  38.87 
 
 		 271 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0492  ABC transporter related  41.06 
 
 		 292 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.242272  normal  0.0865243 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1349  ABC transporter related  36.73 
 
 		 248 aa  171  1e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1453  ABC transporter related  42.61 
 
 		 257 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.329666  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>