More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0474 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0474  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 246 aa  502  1e-141  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.381498  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1434  methionine import ATP-binding protein MetN  65.15 
 
 		 246 aa  338  5e-92  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00844706  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0091  PP-loop family protein  64.41 
 
 		 246 aa  328  5.0000000000000004e-89  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0135509  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0576  methionine import ATP-binding protein MetN  65.15 
 
 		 243 aa  313  1.9999999999999998e-84  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1527  ABC transporter-related protein  46.44 
 
 		 246 aa  221  6e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.330803  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0118  putative ABC transporter, ATP-binding protein  46.81 
 
 		 240 aa  213  1.9999999999999998e-54  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.568497  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1819  ABC transporter, ATP-binding protein  48.87 
 
 		 240 aa  213  1.9999999999999998e-54  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1638  ABC transporter, ATP-binding protein  48.87 
 
 		 240 aa  213  1.9999999999999998e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2007  ABC transporter, ATP-binding protein  48.87 
 
 		 240 aa  213  1.9999999999999998e-54  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0101  ABC transporter related protein  49.37 
 
 		 244 aa  202  3e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0248  ABC transporter, ATP-binding protein  42.51 
 
 		 255 aa  201  9.999999999999999e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1680  ABC transporter ATP-binding protein  47.88 
 
 		 254 aa  200  9.999999999999999e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1984  ATPase  42.62 
 
 		 257 aa  199  5e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.101107  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22670  putative ATP-binding component of ABC transporter  39.92 
 
 		 264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420242 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2415  ABC transporter related  42.92 
 
 		 264 aa  195  5.000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.805602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1073  ABC transporter related  41.6 
 
 		 258 aa  195  7e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2194  ABC transporter related  40.34 
 
 		 281 aa  194  9e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0566123  normal  0.102467 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1057  ABC transporter related  44.39 
 
 		 298 aa  192  4e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.184914  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1611  ABC transporter related  39.08 
 
 		 295 aa  191  1e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4624  ABC transporter related  42.73 
 
 		 258 aa  190  2e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0039  ABC transporter related  39.26 
 
 		 302 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0379  ABC transporter related  41.22 
 
 		 262 aa  189  5e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2743  ABC transporter related  39.06 
 
 		 272 aa  186  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.132977 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1321  ABC transporter related protein  39.34 
 
 		 259 aa  184  9e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.627863  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0065  ABC transporter, ATP-binding protein  39 
 
 		 272 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.768033  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2513  ABC transporter related  38.84 
 
 		 259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0824022  normal  0.0374707 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2108  ABC transporter related  41.6 
 
 		 287 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2446  ABC transporter component  42.51 
 
 		 264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.404334  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2636  ABC transporter related  41.28 
 
 		 261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2343  ABC transporter related  38.08 
 
 		 275 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464868 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0892  ABC transporter related  40.76 
 
 		 278 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.752922  normal  0.504506 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0100  ABC transporter related  40.25 
 
 		 278 aa  183  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.106893  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0852  ABC transporter related  40.76 
 
 		 278 aa  183  3e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.705089  normal  0.0418942 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1719  ABC transporter related  36.97 
 
 		 257 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0483086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0231  ABC transporter system ATP-binding protein  38.59 
 
 		 280 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0451  ABC transporter, ATP-binding protein  38.59 
 
 		 280 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0613  ABC transporter system ATP-binding protein  38.59 
 
 		 280 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.686513  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3200  ABC transporter system ATP-binding protein  38.59 
 
 		 280 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1362  ABC transporter, ATP-binding protein  38.59 
 
 		 280 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.820814  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0432  ABC transporter, ATP-binding protein  38.59 
 
 		 280 aa  182  6e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.440743  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0492  ABC transporter related  39.08 
 
 		 292 aa  181  7e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.242272  normal  0.0865243 
 
 
-
 
NC_004310  BR1020  ABC transporter, ATP-binding protein  41.18 
 
 		 285 aa  181  8.000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0179  ABC transporter related  44.64 
 
 		 244 aa  181  8.000000000000001e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2003  ABC transporter related  43.78 
 
 		 257 aa  181  8.000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0374  ABC transporter, ATP-binding protein  38.17 
 
 		 280 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.453677  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0818  ABC transporter related  40.76 
 
 		 278 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0232927  normal  0.356957 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2810  ABC transporter, ATPase subunit  36.97 
 
 		 257 aa  180  1e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.66283  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1495  ABC transporter related  41.49 
 
 		 267 aa  181  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00076856  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1488  ABC transporter related  36.97 
 
 		 257 aa  180  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1914  ABC transporter ATP-binding protein  40.34 
 
 		 264 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4224  ABC transporter, ATPase subunit  40.55 
 
 		 292 aa  180  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0987  ABC transporter, ATP-binding protein  40.76 
 
 		 287 aa  180  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2844  ABC transporter related  37.39 
 
 		 300 aa  179  2.9999999999999997e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0173  ABC transporter, ATP-binding protein  38.66 
 
 		 256 aa  179  4e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1983  ABC transporter related  41.18 
 
 		 282 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0366377  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3499  ABC transporter related  42.08 
 
 		 266 aa  178  5.999999999999999e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.756482  normal  0.324318 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2316  ABC transporter related  36.97 
 
 		 258 aa  178  7e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184477  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1504  ABC transporter related  41.48 
 
 		 283 aa  178  7e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2806  ABC transporter related  39.66 
 
 		 257 aa  177  1e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0480  ABC transporter related  39.13 
 
 		 292 aa  177  1e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.104959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0404  ABC transporter related  38.24 
 
 		 292 aa  177  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.027511 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1349  ABC transporter related  39.32 
 
 		 248 aa  177  2e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2750  ABC-type transport system, ATPase component  39.09 
 
 		 265 aa  177  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2909  ABC transporter component  41.81 
 
 		 277 aa  177  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.321315  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1712  ABC transporter-related protein  41.2 
 
 		 252 aa  176  3e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000576973 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4114  ABC transporter related  39.92 
 
 		 268 aa  176  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0512527  normal  0.918883 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1316  ABC transporter related  40.76 
 
 		 256 aa  176  3e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3704  ABC transporter related  40.51 
 
 		 265 aa  176  3e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.307132  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0669  ABC transporter related  41.86 
 
 		 254 aa  176  4e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1453  ABC transporter related  40.17 
 
 		 257 aa  175  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.329666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03182  ABC transporter ATP-binding protein  39.15 
 
 		 280 aa  176  5e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.501645  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0372  ABC transporter related  40.55 
 
 		 261 aa  175  6e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04770  ABC transporter, ATP binding component  39.08 
 
 		 266 aa  175  7e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326188  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0206  ABC transporter related  40.93 
 
 		 296 aa  175  7e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2449  ABC transporter related  39.18 
 
 		 268 aa  175  7e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0071  ABC transporter-related protein  37.82 
 
 		 279 aa  174  9e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1553  ABC transporter related  41.2 
 
 		 268 aa  174  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.116954 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2811  ABC transporter related  37.82 
 
 		 303 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.688853  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2949  ABC transporter related  37.82 
 
 		 303 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.85186  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6242  ABC transporter, ATPase subunit  37.82 
 
 		 304 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3137  ABC transporter, ATPase subunit  39.52 
 
 		 253 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.297163  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1628  ABC transporter related  40.17 
 
 		 256 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.387649 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2285  ABC transporter related  37.82 
 
 		 304 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2909  ABC transporter related  37.82 
 
 		 304 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2900  ABC transporter related  37.82 
 
 		 304 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.34746  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5556  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.33 
 
 		 264 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.50977 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4716  ABC transporter related  39.24 
 
 		 259 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.592299  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4484  ABC transporter related  39.33 
 
 		 257 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0523  ABC transporter related  36.82 
 
 		 275 aa  172  5.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.310884 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1541  ABC transporter related  39.5 
 
 		 278 aa  172  5.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.033832  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3081  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  41.63 
 
 		 270 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.216025 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0157  ABC transporter related  38.66 
 
 		 263 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.961661 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0141  ABC transporter ATP-binding protein  38.66 
 
 		 263 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0633689  normal  0.467714 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0159  ABC transporter related  38.66 
 
 		 263 aa  171  9e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5086  ABC transporter related  40.34 
 
 		 263 aa  171  9e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0940761 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0685  ABC transporter related  39.53 
 
 		 293 aa  171  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1223  ABC transporter, ATP-binding protein  39.92 
 
 		 268 aa  171  1e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0742  ABC transporter ATP-binding protein  39.92 
 
 		 269 aa  171  1e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2935  ABC transporter related  38.91 
 
 		 271 aa  170  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1961  ABC transporter related  40.47 
 
 		 254 aa  170  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.334641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>