More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0179 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0179  ABC transporter related  100 
 
 
244 aa  493  1e-139  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2810  ABC transporter, ATPase subunit  40.41 
 
 
257 aa  201  7e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.66283  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1488  ABC transporter related  40.41 
 
 
257 aa  201  7e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1922  ABC transporter related  43.15 
 
 
259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1719  ABC transporter related  39.59 
 
 
257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0483086  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2743  ABC transporter related  41.7 
 
 
272 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.132977 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2049  ABC transporter ATP-binding protein  40 
 
 
259 aa  195  5.000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.558071 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2513  ABC transporter related  42.17 
 
 
259 aa  195  5.000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0824022  normal  0.0374707 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2343  ABC transporter related  38.78 
 
 
275 aa  195  6e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00464868 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1321  ABC transporter related protein  40.56 
 
 
259 aa  195  6e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.627863  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1495  ABC transporter related  43.93 
 
 
267 aa  194  8.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00076856  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1611  ABC transporter related  41.63 
 
 
295 aa  194  8.000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2194  ABC transporter related  42.45 
 
 
281 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0566123  normal  0.102467 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22670  putative ATP-binding component of ABC transporter  41.22 
 
 
264 aa  193  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420242 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3499  ABC transporter related  41.94 
 
 
266 aa  192  5e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.756482  normal  0.324318 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0065  ABC transporter, ATP-binding protein  40.98 
 
 
272 aa  192  5e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.768033  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0480  ABC transporter related  41.04 
 
 
292 aa  192  6e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.104959  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0248  ABC transporter, ATP-binding protein  40.93 
 
 
255 aa  191  1e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4716  ABC transporter related  42.45 
 
 
259 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.592299  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2909  ABC transporter related  41.39 
 
 
304 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1362  ABC transporter, ATP-binding protein  40.57 
 
 
280 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.820814  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0613  ABC transporter system ATP-binding protein  40.57 
 
 
280 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.686513  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2806  ABC transporter related  40.25 
 
 
257 aa  189  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0231  ABC transporter system ATP-binding protein  40.57 
 
 
280 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0451  ABC transporter, ATP-binding protein  40.57 
 
 
280 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0404  ABC transporter related  41.56 
 
 
292 aa  190  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.027511 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2811  ABC transporter related  41.39 
 
 
303 aa  189  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.688853  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1628  ABC transporter related  42.04 
 
 
256 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.387649 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2844  ABC transporter related  41.46 
 
 
300 aa  190  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0432  ABC transporter, ATP-binding protein  40.57 
 
 
280 aa  189  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.440743  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1354  ABC transporter related  42 
 
 
258 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2285  ABC transporter related  41.39 
 
 
304 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3200  ABC transporter system ATP-binding protein  40.57 
 
 
280 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2003  ABC transporter related  43.27 
 
 
257 aa  190  2e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2949  ABC transporter related  41.39 
 
 
303 aa  189  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.85186  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2900  ABC transporter related  41.39 
 
 
304 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.34746  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0169  ABC transporter related  40.33 
 
 
292 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0374  ABC transporter, ATP-binding protein  40.16 
 
 
280 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.453677  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0176  ABC transporter related  40.33 
 
 
292 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1453  ABC transporter related  40.41 
 
 
257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.329666  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4114  ABC transporter related  40.41 
 
 
268 aa  189  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0512527  normal  0.918883 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0307  ABC transporter-related protein  39.52 
 
 
291 aa  189  4e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.993537  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6242  ABC transporter, ATPase subunit  40.98 
 
 
304 aa  189  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0091  PP-loop family protein  44.02 
 
 
246 aa  188  7e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0135509  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1434  methionine import ATP-binding protein MetN  42.15 
 
 
246 aa  188  7e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00844706  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0797  ABC transporter related  39.92 
 
 
283 aa  187  9e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.126555  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0523  ABC transporter related  39.59 
 
 
275 aa  188  9e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.310884 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0646  ABC transporter, ATP-binding protein  39.92 
 
 
283 aa  187  9e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0100  ABC transporter related  37.7 
 
 
278 aa  187  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.106893  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1374  ABC transporter related  41.39 
 
 
258 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0314  ABC transporter ATP-binding protein  39.09 
 
 
298 aa  186  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2750  ABC-type transport system, ATPase component  42.74 
 
 
265 aa  186  3e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4042  ABC transporter related  41.8 
 
 
258 aa  185  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0366  ABC transporter related  39.15 
 
 
267 aa  186  4e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0379  ABC transporter related  43.46 
 
 
262 aa  185  5e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0892  ABC transporter related  40.41 
 
 
278 aa  185  6e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.752922  normal  0.504506 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1637  ABC transporter related  41.22 
 
 
256 aa  185  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.967279 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1982  ABC transporter related  38.27 
 
 
259 aa  185  7e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0818  ABC transporter related  40.41 
 
 
278 aa  184  8e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0232927  normal  0.356957 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0852  ABC transporter related  40.41 
 
 
278 aa  184  9e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.705089  normal  0.0418942 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4484  ABC transporter related  40.82 
 
 
257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0118  putative ABC transporter, ATP-binding protein  44.17 
 
 
240 aa  184  1.0000000000000001e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.568497  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1638  ABC transporter, ATP-binding protein  43.1 
 
 
240 aa  183  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3182  ABC transporter related  41 
 
 
250 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0492  ABC transporter related  40.57 
 
 
292 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.242272  normal  0.0865243 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4224  ABC transporter, ATPase subunit  40.57 
 
 
292 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0071  ABC transporter-related protein  37.55 
 
 
279 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1819  ABC transporter, ATP-binding protein  43.1 
 
 
240 aa  182  4.0000000000000006e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0141  ABC transporter ATP-binding protein  42.91 
 
 
263 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0633689  normal  0.467714 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3484  ABC transporter related  40.83 
 
 
257 aa  182  5.0000000000000004e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0159  ABC transporter related  42.91 
 
 
263 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0157  ABC transporter related  42.91 
 
 
263 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.961661 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0921  ABC transporter related  37.65 
 
 
291 aa  182  6e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2415  ABC transporter related  37.96 
 
 
264 aa  181  9.000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.805602  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0816  ABC transporter, ATP-binding protein  40.17 
 
 
248 aa  180  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0038  ABC transporter-like  44.08 
 
 
267 aa  180  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.328477  normal  0.303335 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2007  ABC transporter, ATP-binding protein  42.68 
 
 
240 aa  181  1e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5556  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.78 
 
 
264 aa  180  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.50977 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2316  ABC transporter related  36.84 
 
 
258 aa  180  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184477  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0231  ABC transporter related  38.31 
 
 
262 aa  179  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0677  ABC transporter related  39 
 
 
255 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0341  ABC transporter related  36.4 
 
 
273 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.444988 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0237  ABC transporter related  39.67 
 
 
268 aa  178  4.999999999999999e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0332  ABC transporter related  36.4 
 
 
273 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0173  ABC transporter, ATP-binding protein  36.07 
 
 
256 aa  178  7e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5086  ABC transporter related  42.51 
 
 
263 aa  178  7e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0940761 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5749  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.8 
 
 
259 aa  178  7e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0328  ABC transporter related  41.25 
 
 
249 aa  178  7e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.673492  normal  0.624259 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0206  ABC transporter related  40.08 
 
 
296 aa  178  7e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2693  ABC transporter related  36.4 
 
 
273 aa  178  7e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.663262  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0393  ABC transporter related  36.4 
 
 
273 aa  178  7e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.261527  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0414  ABC transporter related  36.4 
 
 
273 aa  178  7e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192398  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3512  ABC transporter, ATPase subunit  36.4 
 
 
273 aa  178  8e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.317493  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1504  ABC transporter related  41.39 
 
 
283 aa  178  8e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03182  ABC transporter ATP-binding protein  39.09 
 
 
280 aa  178  9e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.501645  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2449  ABC transporter related  38.49 
 
 
268 aa  177  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0183  ABC transporter related  38.31 
 
 
265 aa  177  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.734577  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0627  ABC transporter ATP-binding protein  37.96 
 
 
276 aa  177  2e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00990626  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1712  ABC transporter-related protein  37.55 
 
 
252 aa  176  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000576973 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1155  ABC transporter related  39.75 
 
 
278 aa  177  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>