More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1057 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1057  ABC transporter related  100 
 
 		 298 aa  609  1e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.184914  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0039  ABC transporter related  64.2 
 
 		 302 aa  330  2e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2415  ABC transporter related  62.65 
 
 		 264 aa  315  8e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.805602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1984  ATPase  61.66 
 
 		 257 aa  307  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.101107  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2636  ABC transporter related  56.49 
 
 		 261 aa  302  5.000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2446  ABC transporter component  52.53 
 
 		 264 aa  261  1e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.404334  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4624  ABC transporter related  53.69 
 
 		 258 aa  259  4e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1961  ABC transporter related  51.42 
 
 		 254 aa  258  1e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.334641  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1321  ABC transporter related protein  51.55 
 
 		 259 aa  256  3e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.627863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1229  ABC transporter related  51.36 
 
 		 264 aa  256  3e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.380088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2750  ABC-type transport system, ATPase component  54.42 
 
 		 265 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3137  ABC transporter, ATPase subunit  56.19 
 
 		 253 aa  252  7e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.297163  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1712  ABC transporter-related protein  51.98 
 
 		 252 aa  243  3e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000576973 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0669  ABC transporter related  52.21 
 
 		 254 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1073  ABC transporter related  50.4 
 
 		 258 aa  239  2.9999999999999997e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3497  ABC transporter related  53.06 
 
 		 256 aa  238  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.214692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0467  ABC transporter related  52.65 
 
 		 253 aa  231  9e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1495  ABC transporter related  50.88 
 
 		 267 aa  223  3e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00076856  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0853  ABC transporter related  46.04 
 
 		 273 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0785068 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3016  ABC transporter related  53.1 
 
 		 249 aa  209  3e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.524884  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0022  ATPase  48.11 
 
 		 256 aa  206  3e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1817  ABC transporter related  49.76 
 
 		 274 aa  204  1e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0472  ABC transporter related  46.55 
 
 		 293 aa  204  1e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0139008  hitchhiker  0.0000833455 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3704  ABC transporter related  44.35 
 
 		 265 aa  203  2e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.307132  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2298  ATPase  47.66 
 
 		 273 aa  202  6e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102276  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0535  ABC transporter related  47.39 
 
 		 271 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2513  ABC transporter related  45.04 
 
 		 259 aa  197  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0824022  normal  0.0374707 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2909  ABC transporter component  49.29 
 
 		 277 aa  194  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.321315  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0379  ABC transporter related  38.63 
 
 		 262 aa  192  8e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2343  ABC transporter related  43.1 
 
 		 275 aa  191  1e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464868 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0523  ABC transporter related  45 
 
 		 275 aa  190  2.9999999999999997e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.310884 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0091  PP-loop family protein  41.13 
 
 		 246 aa  189  5e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0135509  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1611  ABC transporter related  46.44 
 
 		 295 aa  189  5.999999999999999e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0700  ABC transporter related  42.79 
 
 		 333 aa  186  3e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22670  putative ATP-binding component of ABC transporter  44.54 
 
 		 264 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420242 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1016  ABC transporter-related protein  43.7 
 
 		 253 aa  186  4e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2743  ABC transporter related  46.12 
 
 		 272 aa  186  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.132977 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1719  ABC transporter related  43.97 
 
 		 257 aa  186  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0483086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03182  ABC transporter ATP-binding protein  44.44 
 
 		 280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.501645  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1527  ABC transporter-related protein  43.95 
 
 		 246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.330803  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2049  ABC transporter ATP-binding protein  45.26 
 
 		 259 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.558071 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0248  ABC transporter, ATP-binding protein  46.92 
 
 		 255 aa  183  3e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2316  ABC transporter related  44.1 
 
 		 258 aa  183  3e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184477  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1434  methionine import ATP-binding protein MetN  40.33 
 
 		 246 aa  182  4.0000000000000006e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00844706  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1488  ABC transporter related  43.53 
 
 		 257 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2810  ABC transporter, ATPase subunit  43.53 
 
 		 257 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.66283  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2844  ABC transporter related  41.88 
 
 		 300 aa  182  8.000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0578  ABC transporter related  43.84 
 
 		 276 aa  181  1e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.206439  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0401  ABC transporter related  38.52 
 
 		 262 aa  181  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186175  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0474  ABC transporter, ATP-binding protein  44.39 
 
 		 246 aa  180  2.9999999999999997e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.381498  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0480  ABC transporter related  43.75 
 
 		 292 aa  179  4e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.104959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1155  ABC transporter related  48.2 
 
 		 278 aa  179  4.999999999999999e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0627  ABC transporter ATP-binding protein  43.84 
 
 		 276 aa  179  7e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00990626  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2194  ABC transporter related  39.08 
 
 		 281 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0566123  normal  0.102467 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1953  ABC transporter related  41.67 
 
 		 269 aa  177  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0810571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0685  ABC transporter related  41.81 
 
 		 293 aa  176  5e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6635  ABC transporter related  42.92 
 
 		 363 aa  175  9e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1504  ABC transporter related  41.9 
 
 		 283 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10668  ribonucleotide transport ATP-binding protein ABC transporter mkl  42.86 
 
 		 359 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.139977  normal  0.579373 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1127  ABC transporter related protein  41.04 
 
 		 421 aa  174  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0818  ABC transporter related  39.26 
 
 		 278 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0232927  normal  0.356957 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2770  ABC transporter related  40.09 
 
 		 273 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.719655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5099  ABC transporter related  41.43 
 
 		 362 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0528619 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2003  ABC transporter related  43.7 
 
 		 257 aa  173  1.9999999999999998e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2449  ABC transporter related  39.82 
 
 		 268 aa  172  3.9999999999999995e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3462  ABC transporter related  38.57 
 
 		 250 aa  172  5e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0534254 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3963  ABC transporter related  39.05 
 
 		 248 aa  172  5.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0748  ABC transporter related  40.68 
 
 		 286 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0716  ABC transporter related  40.68 
 
 		 286 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0118  putative ABC transporter, ATP-binding protein  41.03 
 
 		 240 aa  172  7.999999999999999e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.568497  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0892  ABC transporter related  41.83 
 
 		 278 aa  171  9e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.752922  normal  0.504506 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03690  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, ATPase component  41.9 
 
 		 378 aa  171  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.839011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0852  ABC transporter related  41.83 
 
 		 278 aa  171  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.705089  normal  0.0418942 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0576  methionine import ATP-binding protein MetN  42.92 
 
 		 243 aa  171  1e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1254  ABC transporter-related protein  40.95 
 
 		 357 aa  171  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0999833 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0179  ABC transporter related  38.1 
 
 		 244 aa  171  2e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1074  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents ATPase component-like protein  41.51 
 
 		 333 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1922  ABC transporter related  41.2 
 
 		 259 aa  171  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3499  ABC transporter related  40.87 
 
 		 266 aa  171  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.756482  normal  0.324318 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4349  ABC transporter related protein  40.57 
 
 		 359 aa  170  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0752  ABC transporter related protein  40.09 
 
 		 397 aa  170  3e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3571  ABC transporter related  39.22 
 
 		 273 aa  170  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626203  hitchhiker  0.0000199293 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2935  ABC transporter related  39.15 
 
 		 271 aa  169  4e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2806  ABC transporter related  43.35 
 
 		 257 aa  169  5e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0372  ABC transporter related  47.27 
 
 		 261 aa  169  6e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1914  ABC transporter ATP-binding protein  47.25 
 
 		 264 aa  169  7e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0096  ABC transporter related  37.45 
 
 		 282 aa  169  7e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.568034  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3101  putative ABC transporter ATP-binding subunit  37.55 
 
 		 279 aa  168  8e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0328  ABC transporter related  37.89 
 
 		 249 aa  168  9e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.673492  normal  0.624259 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0986  ABC transporter related  40 
 
 		 361 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.401008 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0157  ABC transporter related  48.1 
 
 		 263 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.961661 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0393  ABC transporter related  39.3 
 
 		 273 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.261527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3512  ABC transporter, ATPase subunit  39.3 
 
 		 273 aa  168  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.317493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0387  ABC transporter, ATPase subunit, toluene tolerance Ttg2A-like  38.79 
 
 		 273 aa  168  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2693  ABC transporter related  39.3 
 
 		 273 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.663262  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0968  ABC transporter related  40 
 
 		 361 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51873  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1638  ABC transporter, ATP-binding protein  38.86 
 
 		 240 aa  168  1e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0996  ABC transporter related  40 
 
 		 361 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2343  ABC transporter related protein  40.95 
 
 		 252 aa  168  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0414  ABC transporter related  39.3 
 
 		 273 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192398  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>