More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3963 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3963  ABC transporter related  100 
 
 		 248 aa  508  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5159  ABC transporter related protein  71.77 
 
 		 248 aa  377  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.364497 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2195  ABC transporter, ATP-binding protein  67.61 
 
 		 248 aa  364  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00836348 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3462  ABC transporter related  62.3 
 
 		 250 aa  321  8e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0534254 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1212  ABC transporter related  56.85 
 
 		 267 aa  299  2e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00512006  hitchhiker  0.000000000503976 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0450  ABC transporter related  57.66 
 
 		 254 aa  296  2e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1029  hypothetical protein  55.24 
 
 		 250 aa  296  2e-79  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07670  ABC transporter, ATP-binding protein  54.84 
 
 		 254 aa  291  8e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0821592  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1498  ABC transporter related  54.44 
 
 		 256 aa  285  7e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1034  ABC transporter, ATP-binding protein  52.89 
 
 		 244 aa  255  5e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000170601 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2343  ABC transporter related protein  47.26 
 
 		 252 aa  231  1e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0328  ABC transporter related  44.96 
 
 		 249 aa  209  3e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.673492  normal  0.624259 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3182  ABC transporter related  42.19 
 
 		 250 aa  207  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0816  ABC transporter, ATP-binding protein  41.35 
 
 		 248 aa  204  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1066  ABC transporter related  43.93 
 
 		 248 aa  202  5e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2380  ABC transporter  44.58 
 
 		 257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83089  normal  0.615068 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2458  ABC transporter, ATPase subunit  43.1 
 
 		 248 aa  199  3e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1121  ABC transporter related  43.1 
 
 		 248 aa  199  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.418609  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0677  ABC transporter related  42.62 
 
 		 255 aa  197  9e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2596  ABC transporter related protein  41.49 
 
 		 260 aa  196  4.0000000000000005e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.256414  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1781  ABC transporter related  43.51 
 
 		 252 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.122728 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0561  ABC transporter related  38.4 
 
 		 248 aa  194  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000384868  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0787  ABC transporter-related protein  40.51 
 
 		 248 aa  194  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1040  ABC transporter related  39.24 
 
 		 248 aa  194  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0706  ABC transporter related protein  40.08 
 
 		 258 aa  192  4e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613257  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0015  ABC transporter related  40.51 
 
 		 252 aa  191  7e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0891779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1887  ABC transporter related protein  37.25 
 
 		 296 aa  190  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0407  ABC transporter component  41.35 
 
 		 257 aa  189  5e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1737  ABC transporter related  42.5 
 
 		 245 aa  189  5e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0169856  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4624  ABC transporter related  38.11 
 
 		 258 aa  188  7e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0401  ABC transporter related  38.82 
 
 		 262 aa  188  8e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186175  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3315  ABC transporter related  39.3 
 
 		 258 aa  188  8e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000690504 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1817  ABC transporter related  38.82 
 
 		 274 aa  187  1e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1851  ABC transporter related  40.08 
 
 		 263 aa  187  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1961  ABC transporter related  41.71 
 
 		 254 aa  187  1e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.334641  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0160  ABC transporter related  40 
 
 		 272 aa  187  2e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.609677 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1578  ABC transporter related  41.35 
 
 		 260 aa  186  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.292703 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3484  ABC transporter related  38.82 
 
 		 257 aa  186  3e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1862  ABC transporter, ATPase subunit  40.25 
 
 		 248 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634035  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1621  ABC transporter related protein  40.68 
 
 		 363 aa  186  4e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.966929  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0022  ATPase  37.29 
 
 		 256 aa  185  6e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0669  ABC transporter related  41.71 
 
 		 254 aa  185  8e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2083  ABC transporter related  39.83 
 
 		 248 aa  184  9e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1998  ABC transporter-related protein  39.83 
 
 		 248 aa  184  9e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2449  ABC transporter related  37.55 
 
 		 268 aa  183  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2415  ABC transporter related  40.95 
 
 		 264 aa  183  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.805602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1321  ABC transporter related protein  39.58 
 
 		 259 aa  183  3e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.627863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1127  ABC transporter related protein  36.93 
 
 		 421 aa  182  4.0000000000000006e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0189  ABC transporter related  38.17 
 
 		 254 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0746681  normal  0.958869 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2869  ABC transporter related  42.73 
 
 		 261 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2636  ABC transporter related  39.34 
 
 		 261 aa  182  6e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1984  ATPase  40.87 
 
 		 257 aa  181  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.101107  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2298  ATPase  37.97 
 
 		 273 aa  181  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102276  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5282  ABC transporter related  39.24 
 
 		 248 aa  180  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17632 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0248  ABC transporter, ATP-binding protein  36.36 
 
 		 255 aa  180  2e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3691  ABC transporter related  40.59 
 
 		 245 aa  180  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.896312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2750  ABC-type transport system, ATPase component  39.81 
 
 		 265 aa  180  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1229  ABC transporter related  40.28 
 
 		 264 aa  179  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.380088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0535  ABC transporter related  36.71 
 
 		 271 aa  179  4e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3704  ABC transporter related  38.18 
 
 		 265 aa  179  4e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.307132  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1977  ABC transporter related  39.83 
 
 		 248 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.28613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0039  ABC transporter related  39.52 
 
 		 302 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03690  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, ATPase component  38.56 
 
 		 378 aa  179  4.999999999999999e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.839011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2446  ABC transporter component  38.82 
 
 		 264 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.404334  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10668  ribonucleotide transport ATP-binding protein ABC transporter mkl  36.1 
 
 		 359 aa  178  7e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.139977  normal  0.579373 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0472  ABC transporter related  37.55 
 
 		 293 aa  178  8e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0139008  hitchhiker  0.0000833455 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0700  ABC transporter related  36.93 
 
 		 333 aa  178  8e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1328  ABC transporter related  39.06 
 
 		 256 aa  177  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0917234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4315  ABC transporter related  39.33 
 
 		 259 aa  176  3e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.696843  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6635  ABC transporter related  35.59 
 
 		 363 aa  176  4e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1811  ABC transporter related protein  40.47 
 
 		 251 aa  175  5e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2253  ABC transporter related  37.04 
 
 		 244 aa  175  6e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.491715  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0855  ABC transporter related protein  38.56 
 
 		 273 aa  175  7e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.795905 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2985  ABC-type organic solvent transporter, ATP-binding protein  40.91 
 
 		 257 aa  174  8e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.444132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0853  ABC transporter related  35.86 
 
 		 273 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0785068 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1495  ABC transporter related  38.39 
 
 		 267 aa  174  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00076856  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1074  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents ATPase component-like protein  34.58 
 
 		 333 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0441  ATPase  37.04 
 
 		 244 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3259  ABC transporter-related protein  36.1 
 
 		 283 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1712  ABC transporter-related protein  37.67 
 
 		 252 aa  172  2.9999999999999996e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000576973 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1057  ABC transporter related  39.05 
 
 		 298 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.184914  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3402  ABC transporter related  36.82 
 
 		 270 aa  172  5e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1349  ABC transporter related  40.57 
 
 		 248 aa  172  5e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4349  ABC transporter related protein  35.68 
 
 		 359 aa  172  5e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0379  ABC transporter related  39.41 
 
 		 262 aa  172  5.999999999999999e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0479  ATPase  36.63 
 
 		 244 aa  172  5.999999999999999e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.119209  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3122  ABC transporter related  35.68 
 
 		 273 aa  171  6.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.701707  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1738  ABC transporter related  37.45 
 
 		 244 aa  172  6.999999999999999e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0662  ABC transporter related  36.63 
 
 		 244 aa  171  6.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0752  ABC transporter related protein  36.02 
 
 		 397 aa  171  9e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3442  ABC transporter related protein  35.44 
 
 		 246 aa  170  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.0228809 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0237  ABC transporter related  36.71 
 
 		 268 aa  170  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1254  ABC transporter-related protein  34.44 
 
 		 357 aa  169  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0999833 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2343  ABC transporter related  36.14 
 
 		 275 aa  169  3e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464868 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2413  ABC transporter related  33.9 
 
 		 266 aa  169  4e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.104352 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0986  ABC transporter related  33.61 
 
 		 361 aa  169  5e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.401008 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0968  ABC transporter related  33.61 
 
 		 361 aa  169  5e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51873  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2513  ABC transporter related  35.95 
 
 		 259 aa  169  6e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0824022  normal  0.0374707 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0448  ABC-type transport system, ATPase component  38.43 
 
 		 266 aa  168  8e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392883  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1872  ABC transporter-related protein  35.51 
 
 		 244 aa  167  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00971328 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>