More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2415 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2415  ABC transporter related  100 
 
 		 264 aa  535  1e-151  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.805602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2636  ABC transporter related  76.23 
 
 		 261 aa  388  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0039  ABC transporter related  74.1 
 
 		 302 aa  378  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1984  ATPase  67.48 
 
 		 257 aa  351  7e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.101107  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1057  ABC transporter related  62.65 
 
 		 298 aa  315  7e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.184914  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1961  ABC transporter related  56.68 
 
 		 254 aa  298  7e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.334641  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3137  ABC transporter, ATPase subunit  60.33 
 
 		 253 aa  296  3e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.297163  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0669  ABC transporter related  55.06 
 
 		 254 aa  291  8e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4624  ABC transporter related  55.47 
 
 		 258 aa  290  1e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2446  ABC transporter component  60 
 
 		 264 aa  290  2e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.404334  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1229  ABC transporter related  55.47 
 
 		 264 aa  283  3.0000000000000004e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.380088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1321  ABC transporter related protein  54.51 
 
 		 259 aa  281  6.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.627863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3497  ABC transporter related  57.2 
 
 		 256 aa  271  6e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.214692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1712  ABC transporter-related protein  50.83 
 
 		 252 aa  262  4.999999999999999e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000576973 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2750  ABC-type transport system, ATPase component  48.44 
 
 		 265 aa  261  6.999999999999999e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1073  ABC transporter related  49.79 
 
 		 258 aa  258  6e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1495  ABC transporter related  54.44 
 
 		 267 aa  257  1e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00076856  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0467  ABC transporter related  53.04 
 
 		 253 aa  252  4.0000000000000004e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0472  ABC transporter related  48.24 
 
 		 293 aa  227  1e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0139008  hitchhiker  0.0000833455 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1016  ABC transporter-related protein  46.67 
 
 		 253 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3016  ABC transporter related  50.81 
 
 		 249 aa  219  3e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.524884  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3704  ABC transporter related  50.48 
 
 		 265 aa  217  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.307132  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0853  ABC transporter related  47.11 
 
 		 273 aa  211  1e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0785068 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2298  ATPase  46.28 
 
 		 273 aa  210  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102276  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0022  ATPase  43.72 
 
 		 256 aa  208  9e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22670  putative ATP-binding component of ABC transporter  45.67 
 
 		 264 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420242 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1611  ABC transporter related  46.25 
 
 		 295 aa  199  3e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0379  ABC transporter related  39.51 
 
 		 262 aa  199  5e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0535  ABC transporter related  42.56 
 
 		 271 aa  196  3e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1817  ABC transporter related  43.8 
 
 		 274 aa  195  6e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0393  ABC transporter related  44.35 
 
 		 273 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.261527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3512  ABC transporter, ATPase subunit  44.35 
 
 		 273 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.317493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0091  PP-loop family protein  41.63 
 
 		 246 aa  193  2e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0135509  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2693  ABC transporter related  44.35 
 
 		 273 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.663262  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0414  ABC transporter related  44.35 
 
 		 273 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192398  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2449  ABC transporter related  40.91 
 
 		 268 aa  194  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0341  ABC transporter related  43.51 
 
 		 273 aa  192  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.444988 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0332  ABC transporter related  43.51 
 
 		 273 aa  192  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0248  ABC transporter, ATP-binding protein  46.45 
 
 		 255 aa  192  4e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2513  ABC transporter related  42.92 
 
 		 259 aa  192  4e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0824022  normal  0.0374707 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1719  ABC transporter related  42.86 
 
 		 257 aa  191  9e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0483086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2343  ABC transporter related  41.41 
 
 		 275 aa  191  9e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464868 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2770  ABC transporter related  42.62 
 
 		 273 aa  191  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.719655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2810  ABC transporter, ATPase subunit  43.09 
 
 		 257 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.66283  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1488  ABC transporter related  43.09 
 
 		 257 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3571  ABC transporter related  43.51 
 
 		 273 aa  191  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626203  hitchhiker  0.0000199293 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0317  ABC transporter related  43.51 
 
 		 273 aa  190  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0527891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2909  ABC transporter component  45.23 
 
 		 277 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.321315  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2194  ABC transporter related  43.35 
 
 		 281 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0566123  normal  0.102467 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1155  ABC transporter related  45.82 
 
 		 278 aa  188  5.999999999999999e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1527  ABC transporter-related protein  48.28 
 
 		 246 aa  188  7e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.330803  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3004  ABC transporter, ATP-binding protein  43.64 
 
 		 272 aa  188  9e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0387  ABC transporter, ATPase subunit, toluene tolerance Ttg2A-like  42.68 
 
 		 273 aa  186  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0716  ABC transporter related  42.74 
 
 		 286 aa  187  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0748  ABC transporter related  42.74 
 
 		 286 aa  187  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3735  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein  41.98 
 
 		 272 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.527515  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3228  ABC transporter, ATP-binding protein  43.22 
 
 		 272 aa  186  4e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2726  ABC transporter, ATP-binding protein  43.22 
 
 		 272 aa  186  4e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3704  putative ABC transporter ATP-binding subunit  43.22 
 
 		 272 aa  186  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3677  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein  43.22 
 
 		 272 aa  186  4e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0124064  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1777  ABC transporter, ATP-binding protein  43.22 
 
 		 272 aa  186  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2776  ABC transporter, ATP-binding protein  43.22 
 
 		 272 aa  186  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.849481  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3394  ABC transporter-related protein  43.15 
 
 		 278 aa  185  5e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0677  ABC transporter related  41 
 
 		 255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1914  ABC transporter ATP-binding protein  45.67 
 
 		 264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3963  ABC transporter related  40.95 
 
 		 248 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2844  ABC transporter related  44.16 
 
 		 300 aa  183  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0328  ABC transporter related  39.53 
 
 		 249 aa  184  2.0000000000000003e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.673492  normal  0.624259 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0578  ABC transporter related  42.06 
 
 		 276 aa  182  4.0000000000000006e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.206439  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2049  ABC transporter ATP-binding protein  42.58 
 
 		 259 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.558071 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0071  ABC transporter-related protein  41.84 
 
 		 279 aa  181  7e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0474  ABC transporter, ATP-binding protein  42.92 
 
 		 246 aa  182  7e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.381498  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2316  ABC transporter related  41.6 
 
 		 258 aa  182  7e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184477  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0523  ABC transporter related  44.93 
 
 		 275 aa  181  8.000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.310884 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2811  ABC transporter related  42.99 
 
 		 303 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.688853  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0179  ABC transporter related  37.96 
 
 		 244 aa  181  1e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2949  ABC transporter related  42.99 
 
 		 303 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.85186  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03182  ABC transporter ATP-binding protein  46.05 
 
 		 280 aa  181  1e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.501645  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0372  ABC transporter related  45.14 
 
 		 261 aa  180  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6242  ABC transporter, ATPase subunit  42.99 
 
 		 304 aa  180  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10668  ribonucleotide transport ATP-binding protein ABC transporter mkl  40.42 
 
 		 359 aa  181  2e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.139977  normal  0.579373 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1434  methionine import ATP-binding protein MetN  41.5 
 
 		 246 aa  180  2e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00844706  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0404  ABC transporter related  44.4 
 
 		 292 aa  180  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.027511 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2743  ABC transporter related  44.16 
 
 		 272 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.132977 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2909  ABC transporter related  42.99 
 
 		 304 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0576  methionine import ATP-binding protein MetN  43.87 
 
 		 243 aa  179  2.9999999999999997e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2285  ABC transporter related  42.99 
 
 		 304 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2900  ABC transporter related  42.99 
 
 		 304 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.34746  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0492  ABC transporter related  43.11 
 
 		 292 aa  179  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.242272  normal  0.0865243 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0627  ABC transporter ATP-binding protein  41.67 
 
 		 276 aa  178  5.999999999999999e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00990626  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0038  ABC transporter-like  43.14 
 
 		 267 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.328477  normal  0.303335 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0480  ABC transporter related  40.3 
 
 		 292 aa  179  5.999999999999999e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.104959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1983  ABC transporter related  42.31 
 
 		 282 aa  178  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0366377  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1887  ABC transporter related protein  38.4 
 
 		 296 aa  178  8e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1680  ABC transporter ATP-binding protein  42.19 
 
 		 254 aa  177  1e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0700  ABC transporter related  38.17 
 
 		 333 aa  177  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1154  ABC transporter related  40.83 
 
 		 286 aa  177  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1504  ABC transporter related  41.92 
 
 		 283 aa  177  2e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0401  ABC transporter related  39.02 
 
 		 262 aa  177  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186175  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5086  ABC transporter related  42.19 
 
 		 263 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0940761 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>