More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0853 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0853  ABC transporter related  100 
 
 		 273 aa  543  1e-153  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0785068 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1817  ABC transporter related  71.59 
 
 		 274 aa  397  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2298  ATPase  68.38 
 
 		 273 aa  378  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102276  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0535  ABC transporter related  62.78 
 
 		 271 aa  335  3.9999999999999995e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0022  ATPase  56.61 
 
 		 256 aa  263  3e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0472  ABC transporter related  49.39 
 
 		 293 aa  239  4e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0139008  hitchhiker  0.0000833455 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2750  ABC-type transport system, ATPase component  48.02 
 
 		 265 aa  224  8e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1321  ABC transporter related protein  45.63 
 
 		 259 aa  221  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.627863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6635  ABC transporter related  42.97 
 
 		 363 aa  218  8.999999999999998e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4349  ABC transporter related protein  44.86 
 
 		 359 aa  218  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10668  ribonucleotide transport ATP-binding protein ABC transporter mkl  42.75 
 
 		 359 aa  217  1e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.139977  normal  0.579373 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1057  ABC transporter related  46.04 
 
 		 298 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.184914  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5099  ABC transporter related  42.01 
 
 		 362 aa  215  5e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0528619 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0996  ABC transporter related  41.64 
 
 		 361 aa  214  9e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0677  ABC transporter related  44.4 
 
 		 255 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0986  ABC transporter related  41.64 
 
 		 361 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.401008 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1254  ABC transporter-related protein  44.03 
 
 		 357 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0999833 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0968  ABC transporter related  41.64 
 
 		 361 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51873  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3704  ABC transporter related  45.87 
 
 		 265 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.307132  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1127  ABC transporter related protein  43.75 
 
 		 421 aa  211  7e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2636  ABC transporter related  45.04 
 
 		 261 aa  211  9e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1887  ABC transporter related protein  45.61 
 
 		 296 aa  211  1e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2415  ABC transporter related  47.11 
 
 		 264 aa  211  1e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.805602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03690  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, ATPase component  41.6 
 
 		 378 aa  210  2e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.839011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0700  ABC transporter related  42.04 
 
 		 333 aa  210  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2449  ABC transporter related  45.99 
 
 		 268 aa  209  4e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0039  ABC transporter related  47.52 
 
 		 302 aa  208  6e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1074  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents ATPase component-like protein  44.44 
 
 		 333 aa  208  8e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1984  ATPase  46.22 
 
 		 257 aa  204  9e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.101107  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0752  ABC transporter related protein  42.5 
 
 		 397 aa  204  1e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3137  ABC transporter, ATPase subunit  49.58 
 
 		 253 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.297163  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0379  ABC transporter related  41.15 
 
 		 262 aa  202  4e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4624  ABC transporter related  44.63 
 
 		 258 aa  202  4e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1073  ABC transporter related  40.87 
 
 		 258 aa  201  9.999999999999999e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1495  ABC transporter related  43.9 
 
 		 267 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00076856  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1527  ABC transporter-related protein  43.1 
 
 		 246 aa  198  7.999999999999999e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.330803  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0855  ABC transporter related protein  42.98 
 
 		 273 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.795905 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0888  ABC transporter related  43.8 
 
 		 273 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00820574  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0328  ABC transporter related  41.67 
 
 		 249 aa  197  2.0000000000000003e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.673492  normal  0.624259 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1229  ABC transporter related  45.53 
 
 		 264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.380088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3259  ABC transporter-related protein  43.88 
 
 		 283 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1621  ABC transporter related protein  46.05 
 
 		 363 aa  196  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.966929  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0748  ABC transporter related  44.3 
 
 		 286 aa  196  3e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1712  ABC transporter-related protein  45.2 
 
 		 252 aa  196  3e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000576973 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3122  ABC transporter related  46.05 
 
 		 273 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.701707  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0716  ABC transporter related  44.3 
 
 		 286 aa  195  5.000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2343  ABC transporter related  45.12 
 
 		 275 aa  195  7e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464868 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3016  ABC transporter related  46.12 
 
 		 249 aa  194  1e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.524884  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0401  ABC transporter related  44.73 
 
 		 262 aa  194  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186175  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0685  ABC transporter related  42.45 
 
 		 293 aa  193  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0467  ABC transporter related  41.53 
 
 		 253 aa  192  7e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2909  ABC transporter component  45.45 
 
 		 277 aa  191  8e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.321315  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2446  ABC transporter component  44.63 
 
 		 264 aa  191  9e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.404334  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3101  putative ABC transporter ATP-binding subunit  43.8 
 
 		 279 aa  190  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0248  ABC transporter, ATP-binding protein  46.15 
 
 		 255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2513  ABC transporter related  41.6 
 
 		 259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0824022  normal  0.0374707 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1488  ABC transporter related  42.86 
 
 		 257 aa  189  4e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2810  ABC transporter, ATPase subunit  42.86 
 
 		 257 aa  189  4e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.66283  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1611  ABC transporter related  44.81 
 
 		 295 aa  189  4e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2413  ABC transporter related  41.8 
 
 		 266 aa  189  4e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.104352 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0448  ABC-type transport system, ATPase component  41.22 
 
 		 266 aa  189  5e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392883  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1328  ABC transporter related  44.35 
 
 		 256 aa  189  5e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0917234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1862  ABC transporter, ATPase subunit  41.91 
 
 		 248 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634035  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2935  ABC transporter related  40.23 
 
 		 271 aa  187  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0237  ABC transporter related  40.5 
 
 		 268 aa  187  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0523  ABC transporter related  43.37 
 
 		 275 aa  187  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.310884 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0627  ABC transporter ATP-binding protein  41.84 
 
 		 276 aa  187  2e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00990626  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5028  ABC transporter ATP-binding protein  41.63 
 
 		 269 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57880  ABC transporter ATP-binding protein  41.63 
 
 		 269 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0561  ABC transporter related  42.62 
 
 		 248 aa  187  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000384868  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2806  ABC transporter related  42.31 
 
 		 257 aa  186  3e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3394  ABC transporter-related protein  41.16 
 
 		 278 aa  186  3e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1040  ABC transporter related  42.86 
 
 		 248 aa  186  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0669  ABC transporter related  40.16 
 
 		 254 aa  186  3e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0578  ABC transporter related  41.84 
 
 		 276 aa  185  6e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.206439  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0863  ABC transporter-like  42 
 
 		 270 aa  185  6e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.535463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22670  putative ATP-binding component of ABC transporter  44.54 
 
 		 264 aa  185  6e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420242 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1998  ABC transporter-related protein  40.66 
 
 		 248 aa  185  7e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2749  ABC transporter related  41.32 
 
 		 270 aa  185  7e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2083  ABC transporter related  40.66 
 
 		 248 aa  185  7e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1969  ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 		 275 aa  185  8e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.309748  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03182  ABC transporter ATP-binding protein  43.57 
 
 		 280 aa  185  8e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.501645  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1977  ABC transporter related  40.25 
 
 		 248 aa  185  8e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.28613  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2893  ABC transporter related  43.44 
 
 		 277 aa  185  9e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.267676 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3240  ABC transporter related  43.44 
 
 		 277 aa  185  9e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.738413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1013  ABC transporter-related protein  42.19 
 
 		 306 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0096  ABC transporter related  42.24 
 
 		 282 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.568034  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1953  ABC transporter related  42.86 
 
 		 269 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0810571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1719  ABC transporter related  42.44 
 
 		 257 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0483086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3735  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein  44.16 
 
 		 272 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.527515  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0759  ABC transporter related protein  40.48 
 
 		 289 aa  183  3e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4447  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40.8 
 
 		 269 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2726  ABC transporter, ATP-binding protein  44.16 
 
 		 272 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3704  putative ABC transporter ATP-binding subunit  44.16 
 
 		 272 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2776  ABC transporter, ATP-binding protein  44.16 
 
 		 272 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.849481  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3228  ABC transporter, ATP-binding protein  44.16 
 
 		 272 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0095  ABC transporter related  41.81 
 
 		 283 aa  182  4.0000000000000006e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000937702  normal  0.953414 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3677  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein  44.16 
 
 		 272 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0124064  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1777  ABC transporter, ATP-binding protein  44.16 
 
 		 272 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0793  ABC transporter related  43.53 
 
 		 282 aa  182  5.0000000000000004e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.215167  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>