More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0118 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0118  putative ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 240 aa  484  1e-136  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.568497  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2007  ABC transporter, ATP-binding protein  72.92 
 
 		 240 aa  364  1e-100  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1638  ABC transporter, ATP-binding protein  72.92 
 
 		 240 aa  364  1e-100  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1819  ABC transporter, ATP-binding protein  72.5 
 
 		 240 aa  362  2e-99  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1527  ABC transporter-related protein  52.68 
 
 		 246 aa  244  6.999999999999999e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.330803  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1434  methionine import ATP-binding protein MetN  47.66 
 
 		 246 aa  224  8e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00844706  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0091  PP-loop family protein  46.78 
 
 		 246 aa  224  1e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0135509  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0101  ABC transporter related protein  52.72 
 
 		 244 aa  224  1e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2513  ABC transporter related  42.86 
 
 		 259 aa  215  4e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0824022  normal  0.0374707 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1611  ABC transporter related  43.1 
 
 		 295 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2844  ABC transporter related  42.44 
 
 		 300 aa  211  1e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1680  ABC transporter ATP-binding protein  47.06 
 
 		 254 aa  209  3e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2343  ABC transporter related  42.04 
 
 		 275 aa  208  6e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464868 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0480  ABC transporter related  43.64 
 
 		 292 aa  206  3e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.104959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1628  ABC transporter related  44.12 
 
 		 256 aa  205  5e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.387649 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1453  ABC transporter related  42.44 
 
 		 257 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.329666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1488  ABC transporter related  39.75 
 
 		 257 aa  202  5e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0248  ABC transporter, ATP-binding protein  40.76 
 
 		 255 aa  202  5e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2810  ABC transporter, ATPase subunit  39.75 
 
 		 257 aa  202  5e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.66283  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1316  ABC transporter related  42.86 
 
 		 256 aa  202  5e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2743  ABC transporter related  41 
 
 		 272 aa  201  7e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.132977 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4224  ABC transporter, ATPase subunit  43.78 
 
 		 292 aa  201  8e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1719  ABC transporter related  39.74 
 
 		 257 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0483086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4484  ABC transporter related  42.86 
 
 		 257 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2909  ABC transporter related  40.42 
 
 		 304 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2285  ABC transporter related  40.42 
 
 		 304 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22670  putative ATP-binding component of ABC transporter  38.66 
 
 		 264 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420242 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2900  ABC transporter related  40.42 
 
 		 304 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.34746  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6242  ABC transporter, ATPase subunit  40 
 
 		 304 aa  199  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1637  ABC transporter related  42.86 
 
 		 256 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.967279 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4114  ABC transporter related  43.7 
 
 		 268 aa  198  5e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0512527  normal  0.918883 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0523  ABC transporter related  42.92 
 
 		 275 aa  198  6e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.310884 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0404  ABC transporter related  40.17 
 
 		 292 aa  198  6e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.027511 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0374  ABC transporter, ATP-binding protein  40.59 
 
 		 280 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.453677  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2811  ABC transporter related  40.17 
 
 		 303 aa  197  9e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.688853  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2949  ABC transporter related  40.17 
 
 		 303 aa  197  9e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.85186  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5556  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.18 
 
 		 264 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.50977 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0492  ABC transporter related  41.42 
 
 		 292 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.242272  normal  0.0865243 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0797  ABC transporter related  41.52 
 
 		 283 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.126555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0646  ABC transporter, ATP-binding protein  41.52 
 
 		 283 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0576  methionine import ATP-binding protein MetN  47.01 
 
 		 243 aa  196  3e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5086  ABC transporter related  42.92 
 
 		 263 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0940761 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3200  ABC transporter system ATP-binding protein  40.59 
 
 		 280 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0451  ABC transporter, ATP-binding protein  40.59 
 
 		 280 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0613  ABC transporter system ATP-binding protein  40.59 
 
 		 280 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.686513  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0231  ABC transporter system ATP-binding protein  40.59 
 
 		 280 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1362  ABC transporter, ATP-binding protein  40.59 
 
 		 280 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.820814  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0432  ABC transporter, ATP-binding protein  40.59 
 
 		 280 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.440743  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0065  ABC transporter, ATP-binding protein  40.59 
 
 		 272 aa  195  6e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.768033  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2194  ABC transporter related  42.67 
 
 		 281 aa  195  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0566123  normal  0.102467 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2049  ABC transporter ATP-binding protein  39.08 
 
 		 259 aa  194  8.000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.558071 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0159  ABC transporter related  42.17 
 
 		 263 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0141  ABC transporter ATP-binding protein  42.17 
 
 		 263 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0633689  normal  0.467714 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2029  hypothetical protein  40.76 
 
 		 245 aa  193  2e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2024  hypothetical protein  40.76 
 
 		 245 aa  193  2e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0206  ABC transporter related  42.33 
 
 		 296 aa  193  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0157  ABC transporter related  41.74 
 
 		 263 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.961661 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0578  ABC transporter related  41.1 
 
 		 276 aa  191  8e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.206439  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0474  ABC transporter, ATP-binding protein  46.81 
 
 		 246 aa  191  9e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.381498  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2806  ABC transporter related  41.45 
 
 		 257 aa  191  1e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0892  ABC transporter related  40.76 
 
 		 278 aa  190  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.752922  normal  0.504506 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2316  ABC transporter related  38.24 
 
 		 258 aa  191  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184477  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0818  ABC transporter related  40.76 
 
 		 278 aa  190  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0232927  normal  0.356957 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0852  ABC transporter related  40.76 
 
 		 278 aa  190  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.705089  normal  0.0418942 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0627  ABC transporter ATP-binding protein  41.1 
 
 		 276 aa  189  2.9999999999999997e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00990626  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03182  ABC transporter ATP-binding protein  41.1 
 
 		 280 aa  189  4e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.501645  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0038  ABC transporter-like  40 
 
 		 267 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.328477  normal  0.303335 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0169  ABC transporter related  41.01 
 
 		 292 aa  188  5.999999999999999e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1504  ABC transporter related  44.35 
 
 		 283 aa  187  1e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0100  ABC transporter related  38.91 
 
 		 278 aa  187  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.106893  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0307  ABC transporter-related protein  43.89 
 
 		 291 aa  186  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.993537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1922  ABC transporter related  40.08 
 
 		 259 aa  186  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1541  ABC transporter related  43.56 
 
 		 278 aa  186  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.033832  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1321  ABC transporter related protein  39.26 
 
 		 259 aa  186  2e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.627863  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0176  ABC transporter related  40.55 
 
 		 292 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2108  ABC transporter related  43.36 
 
 		 287 aa  186  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0231  ABC transporter related  42.21 
 
 		 262 aa  186  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0071  ABC transporter-related protein  38.49 
 
 		 279 aa  186  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0372  ABC transporter related  42.17 
 
 		 261 aa  185  5e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1196  ABC transporter related  38.91 
 
 		 264 aa  185  6e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0366  ABC transporter related  40.74 
 
 		 267 aa  185  7e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1953  ABC transporter related  38.66 
 
 		 269 aa  184  9e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0810571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0179  ABC transporter related  44.17 
 
 		 244 aa  184  1.0000000000000001e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0298  ABC transporter related  40.16 
 
 		 272 aa  184  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.510066  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0183  ABC transporter related  47.52 
 
 		 265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.734577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3499  ABC transporter related  40.71 
 
 		 266 aa  184  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.756482  normal  0.324318 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0314  ABC transporter ATP-binding protein  39.17 
 
 		 298 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1020  ABC transporter, ATP-binding protein  42.48 
 
 		 285 aa  182  4.0000000000000006e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1914  ABC transporter ATP-binding protein  41.01 
 
 		 264 aa  182  6e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0987  ABC transporter, ATP-binding protein  42.04 
 
 		 287 aa  181  9.000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2750  ABC-type transport system, ATPase component  40.52 
 
 		 265 aa  181  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04770  ABC transporter, ATP binding component  39.08 
 
 		 266 aa  180  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326188  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3916  ABC transporter related  41.15 
 
 		 271 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2003  ABC transporter related  41.84 
 
 		 257 aa  179  2.9999999999999997e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1349  ABC transporter related  40.26 
 
 		 248 aa  179  4e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0921  ABC transporter related  40.27 
 
 		 291 aa  179  4e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0245  ABC transporter related  38.11 
 
 		 280 aa  178  5.999999999999999e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.415257  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1983  ABC transporter related  42.73 
 
 		 282 aa  178  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0366377  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0742  ABC transporter ATP-binding protein  40.76 
 
 		 269 aa  177  1e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4042  ABC transporter related  39.24 
 
 		 258 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>