More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0925 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0925  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 254 aa  504  9.999999999999999e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2542  ABC transporter-related protein  83.81 
 
 		 262 aa  418  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120611  hitchhiker  0.000000000000186562 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1244  ABC transporter related  73.77 
 
 		 252 aa  351  5.9999999999999994e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0493  ABC transporter related  70.33 
 
 		 251 aa  351  8e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.759588  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3213  ABC transporter related  72.84 
 
 		 250 aa  345  3e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0379  ABC transporter related  41.42 
 
 		 262 aa  204  1e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1695  ABC transporter related  43.04 
 
 		 244 aa  191  1e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0662  ABC transporter related  42.62 
 
 		 244 aa  188  9e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2343  ABC transporter related protein  41.98 
 
 		 252 aa  187  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0479  ATPase  41.77 
 
 		 244 aa  186  4e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.119209  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1738  ABC transporter related  41.35 
 
 		 244 aa  185  6e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1872  ABC transporter-related protein  41.77 
 
 		 244 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00971328 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2886  ABC transporter, ATPase subunit  41.2 
 
 		 275 aa  182  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.21978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1977  ABC transporter related  39.42 
 
 		 248 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.28613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0706  ABC transporter related protein  41.1 
 
 		 258 aa  180  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613257  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2413  ABC transporter related  38.11 
 
 		 266 aa  180  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.104352 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0853  ABC transporter related  39.66 
 
 		 273 aa  179  4e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0785068 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2253  ABC transporter related  40.51 
 
 		 244 aa  179  4.999999999999999e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.491715  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1349  ABC transporter related  42.86 
 
 		 248 aa  178  5.999999999999999e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0677  ABC transporter related  40.25 
 
 		 255 aa  178  7e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1887  ABC transporter related protein  37.9 
 
 		 296 aa  177  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1328  ABC transporter related  40.09 
 
 		 256 aa  176  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0917234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3182  ABC transporter related  41 
 
 		 250 aa  175  5e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1227  ABC transporter, ATP-binding protein  42.08 
 
 		 272 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0441  ATPase  39.66 
 
 		 244 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3512  ABC transporter, ATPase subunit  37.96 
 
 		 273 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.317493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0414  ABC transporter related  37.96 
 
 		 273 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192398  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0095  ABC transporter related  41.53 
 
 		 283 aa  173  1.9999999999999998e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000937702  normal  0.953414 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1781  ABC transporter related  41.63 
 
 		 252 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.122728 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2693  ABC transporter related  37.96 
 
 		 273 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.663262  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0393  ABC transporter related  37.96 
 
 		 273 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.261527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2749  ABC transporter related  38.27 
 
 		 270 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0015  ABC transporter related  40.34 
 
 		 252 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0891779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1862  ABC transporter, ATPase subunit  38.63 
 
 		 248 aa  172  5e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634035  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0317  ABC transporter related  37.14 
 
 		 273 aa  171  9e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0527891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2083  ABC transporter related  39.06 
 
 		 248 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1998  ABC transporter-related protein  39.06 
 
 		 248 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2449  ABC transporter related  39.02 
 
 		 268 aa  171  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0341  ABC transporter related  37.55 
 
 		 273 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.444988 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0332  ABC transporter related  37.55 
 
 		 273 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3484  ABC transporter related  36.29 
 
 		 257 aa  170  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1743  ABC transporter-related protein  41.95 
 
 		 271 aa  170  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3735  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein  36.69 
 
 		 272 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.527515  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3259  ABC transporter-related protein  38.26 
 
 		 283 aa  170  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3462  ABC transporter related  39.26 
 
 		 250 aa  169  3e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0534254 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1969  ABC transporter, ATP-binding protein  41.13 
 
 		 275 aa  169  3e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.309748  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0328  ABC transporter related  39.39 
 
 		 249 aa  169  3e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.673492  normal  0.624259 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1900  ABC transporter ATPase  38.98 
 
 		 270 aa  169  3e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.81319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0561  ABC transporter related  38.4 
 
 		 248 aa  169  4e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000384868  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0022  ATPase  38.56 
 
 		 256 aa  169  4e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5159  ABC transporter related protein  37.92 
 
 		 248 aa  169  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.364497 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0876  ABC transporter related  40.17 
 
 		 269 aa  169  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.930987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3004  ABC transporter, ATP-binding protein  37.92 
 
 		 272 aa  169  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1143  ABC transporter related  40.51 
 
 		 276 aa  169  6e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3677  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 		 272 aa  168  6e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0124064  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1777  ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 		 272 aa  168  6e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2776  ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 		 272 aa  168  6e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.849481  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2726  ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 		 272 aa  168  6e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3704  putative ABC transporter ATP-binding subunit  37.5 
 
 		 272 aa  168  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0759  ABC transporter related protein  38.66 
 
 		 289 aa  169  6e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3228  ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 		 272 aa  168  6e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2596  ABC transporter related protein  37.19 
 
 		 260 aa  168  7e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.256414  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2786  ABC transporter, ATPase subunit  39.83 
 
 		 294 aa  168  8e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000312244  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2292  ABC transporter related  41.1 
 
 		 279 aa  168  8e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0816  ABC transporter, ATP-binding protein  38.75 
 
 		 248 aa  168  9e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0787  ABC transporter-related protein  39.58 
 
 		 248 aa  167  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1737  ABC transporter related  39.24 
 
 		 245 aa  167  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0169856  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12850  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, ATP binding component  37.5 
 
 		 269 aa  168  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3571  ABC transporter related  38.65 
 
 		 273 aa  167  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626203  hitchhiker  0.0000199293 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0888  ABC transporter related  38.98 
 
 		 273 aa  167  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00820574  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2770  ABC transporter related  38.25 
 
 		 273 aa  167  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.719655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4141  ABC transporter  39.08 
 
 		 269 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3036  ABC transporter related  41.13 
 
 		 261 aa  166  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.845975 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2869  ABC transporter related  42.17 
 
 		 261 aa  166  2e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0958  toluene tolerance ABC efflux transporter, ATP-binding protein  38.82 
 
 		 269 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4257  ABC transporter related  39.24 
 
 		 269 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4447  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.5 
 
 		 269 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0158  toluene ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.33 
 
 		 276 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3402  ABC transporter related  37.71 
 
 		 270 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0965  ABC transporter related  38.82 
 
 		 269 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0337  ABC transporter related  39.33 
 
 		 274 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.425163 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0472  ABC transporter related  40.51 
 
 		 293 aa  166  2.9999999999999998e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0139008  hitchhiker  0.0000833455 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0997  ABC transporter related  38.82 
 
 		 269 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1040  ABC transporter related  38.91 
 
 		 248 aa  166  4e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0646  ABC transporter, ATP-binding protein  42.02 
 
 		 283 aa  166  4e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0096  ABC transporter related  39.67 
 
 		 282 aa  166  4e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.568034  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0797  ABC transporter related  42.02 
 
 		 283 aa  166  4e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.126555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3315  ABC transporter related  38.24 
 
 		 258 aa  165  5.9999999999999996e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000690504 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0700  ABC transporter related  37.97 
 
 		 333 aa  165  6.9999999999999995e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2380  ABC transporter  39.75 
 
 		 257 aa  165  6.9999999999999995e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83089  normal  0.615068 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3119  ABC transporter related protein  39.66 
 
 		 276 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0531  ABC transporter related  41.53 
 
 		 261 aa  164  9e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  hitchhiker  0.00910021 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0514  ABC transporter related  41.53 
 
 		 261 aa  164  9e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07670  ABC transporter, ATP-binding protein  37.9 
 
 		 254 aa  164  9e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0821592  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1680  ABC transporter ATP-binding protein  43.43 
 
 		 254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1066  ABC transporter related  39.5 
 
 		 248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0863  ABC transporter-like  38.66 
 
 		 270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.535463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0685  ABC transporter related  37.29 
 
 		 293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0401  ABC transporter related  40.44 
 
 		 262 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186175  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1851  ABC transporter related  37.9 
 
 		 263 aa  163  2.0000000000000002e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>