More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0644 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0644  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 318 aa  639    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0865  ABC transporter, ATP-binding protein  71.56 
 
 		 336 aa  477  1e-133  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0795  ABC transporter, ATP-binding protein  71.26 
 
 		 336 aa  474  1e-133  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.771589  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1238  ABC transporter, ATP-binding protein  71.26 
 
 		 336 aa  473  1e-132  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1075  methionine import ATP-binding protein MetN  69.09 
 
 		 318 aa  466  9.999999999999999e-131  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1250  methionine import ATP-binding protein MetN  70.66 
 
 		 318 aa  465  9.999999999999999e-131  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0967  ABC transporter ATP-binding protein  66.67 
 
 		 322 aa  436  1e-121  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1233  methionine import ATP-binding protein MetN  64.78 
 
 		 340 aa  424  1e-117  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0358  ABC transporter related protein  59.87 
 
 		 319 aa  398  9.999999999999999e-111  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.703642  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1540  ABC transporter related  50.78 
 
 		 348 aa  331  1e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00159208  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3791  ABC transporter related  44.24 
 
 		 377 aa  285  8e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.407755  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19590  ABC-type metal ion transport system, ATPase component  44.65 
 
 		 337 aa  283  4.0000000000000003e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.197301  hitchhiker  0.00100295 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3079  ABC transporter related protein  42.9 
 
 		 342 aa  281  9e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2926  ABC transporter related  42.31 
 
 		 342 aa  280  2e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015869  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2652  ABC transporter related  43.32 
 
 		 340 aa  280  2e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1908  ABC transporter-like protein  42.77 
 
 		 318 aa  279  4e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.103908 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1769  ABC transporter related  44.57 
 
 		 344 aa  279  5e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000333241  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2457  ABC transporter related  42.86 
 
 		 368 aa  275  1.0000000000000001e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0857  ABC transporter related protein  41.79 
 
 		 338 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0291  ABC transporter-related protein  44.79 
 
 		 339 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3172  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  40 
 
 		 348 aa  273  3e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.255507  hitchhiker  0.00172815 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0341  ABC transporter, ATP-binding protein  44.48 
 
 		 339 aa  271  9e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1512  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  38.73 
 
 		 348 aa  271  9e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2345  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  38.73 
 
 		 348 aa  271  9e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0385  ABC transporter, ATP-binding protein  44.48 
 
 		 339 aa  271  9e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0284  ABC transporter, ATP-binding protein  44.48 
 
 		 339 aa  271  1e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3248  D-methionine ABC transporter, ATP-binding protein  43.03 
 
 		 320 aa  271  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0544526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1610  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  43.59 
 
 		 368 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4962  ABC transporter, ATP-binding protein  44.16 
 
 		 339 aa  270  2e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0281  ABC transporter, ATP-binding protein  44.16 
 
 		 339 aa  270  2e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0358  ABC transporter, ATP-binding protein  44.16 
 
 		 339 aa  271  2e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0292  ABC transporter related  44.16 
 
 		 339 aa  270  2e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0534  ABC transporter related protein  41.77 
 
 		 328 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0297  ABC transporter ATP-binding protein  43.85 
 
 		 339 aa  269  5e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0343  ABC transporter, ATP-binding protein  43.85 
 
 		 339 aa  269  5e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0312  ABC transporter ATP-binding protein  43.85 
 
 		 339 aa  269  5e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2604  ABC transporter related  41.12 
 
 		 354 aa  269  5e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0563  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  42.77 
 
 		 356 aa  268  8e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0625  ABC transporter related protein  44.2 
 
 		 325 aa  268  1e-70  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3225  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  42.81 
 
 		 382 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.384288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3768  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  41.41 
 
 		 331 aa  267  2e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.227967  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2553  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  42.81 
 
 		 344 aa  267  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1487  ABC transporter related  43.69 
 
 		 340 aa  267  2e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000017469  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0788  ABC transporter component  40.96 
 
 		 351 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0995  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  40.83 
 
 		 344 aa  266  4e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0734  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  42.81 
 
 		 344 aa  265  5e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.260825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0935  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  41.42 
 
 		 344 aa  265  5e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2870  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  41.12 
 
 		 344 aa  265  7e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0414  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  41.12 
 
 		 344 aa  265  7e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2980  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  41.12 
 
 		 344 aa  265  7e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0215  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  41.12 
 
 		 344 aa  265  7e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2931  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  41.12 
 
 		 344 aa  265  7e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2558  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  41.12 
 
 		 344 aa  265  7e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0934  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  41.12 
 
 		 344 aa  265  7e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2245  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  41.12 
 
 		 385 aa  265  8e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1018  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  41.12 
 
 		 344 aa  265  8e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2988  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  40.83 
 
 		 344 aa  265  8e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.550247  hitchhiker  0.00296949 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0580  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  41.12 
 
 		 385 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.300402  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1059  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  41.12 
 
 		 385 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46952  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1503  ABC transporter related protein  41.11 
 
 		 350 aa  264  1e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4172  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  40.83 
 
 		 344 aa  264  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.781042  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0939  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  41.12 
 
 		 344 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.446687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3485  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  40.18 
 
 		 335 aa  264  2e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.762526 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0114  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  40.12 
 
 		 335 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.867435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0131  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  40.12 
 
 		 335 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0281  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  41.51 
 
 		 335 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0759  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  40.53 
 
 		 344 aa  262  6e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1145  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  42.12 
 
 		 377 aa  261  8e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4491  ABC transporter related  42.32 
 
 		 387 aa  261  8.999999999999999e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.565642  normal  0.031599 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0790  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  41.11 
 
 		 349 aa  261  8.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.264335  normal  0.409094 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1797  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  40.84 
 
 		 341 aa  261  1e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1650  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  40.83 
 
 		 344 aa  261  1e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0805  ABC transporter related protein  41.46 
 
 		 322 aa  261  1e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.63859 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23470  ABC-type metal ion transport system, ATPase component  41.38 
 
 		 349 aa  261  1e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00129815  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0920  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  39.83 
 
 		 350 aa  260  2e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.539621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0861  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  40.82 
 
 		 349 aa  260  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.232562  normal  0.527075 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2100  ABC transporter related  39.47 
 
 		 347 aa  260  2e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.182492  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0129  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  39.82 
 
 		 335 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131021 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5114  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  39.22 
 
 		 335 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.182422  normal  0.245583 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2785  ABC transporter related  41.74 
 
 		 359 aa  259  3e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5262  D-methionine ABC transporter, ATP-binding protein  40.88 
 
 		 335 aa  259  4e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3342  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  40.59 
 
 		 343 aa  259  4e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000749199  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5160  ABC transporter related  40.13 
 
 		 388 aa  259  4e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3499  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  39.71 
 
 		 343 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00014071  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1796  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  41.14 
 
 		 341 aa  259  6e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1230  ABC transporter related  40.47 
 
 		 347 aa  258  6e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3753  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  41.18 
 
 		 343 aa  258  8e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000257186  normal  0.0826267 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03093  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  40.19 
 
 		 335 aa  258  1e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2123  ABC transporter related protein  43.6 
 
 		 337 aa  258  1e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72620  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  39.52 
 
 		 335 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2760  ABC transporter related  40.48 
 
 		 359 aa  258  1e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0840965  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0269  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  40.7 
 
 		 343 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0053957  normal  0.255493 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0274  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  40.7 
 
 		 343 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0116933  normal  0.0903375 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0269  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  40.7 
 
 		 343 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000470965  normal  0.859728 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4503  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  39.22 
 
 		 335 aa  257  2e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0288  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  40.7 
 
 		 343 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000549841  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004238  methionine ABC transporter ATP-binding protein  41.47 
 
 		 344 aa  257  2e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01202  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  41.47 
 
 		 344 aa  256  3e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0065  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  41.19 
 
 		 335 aa  256  3e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0210  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  41.57 
 
 		 343 aa  256  5e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000485974  normal  0.606224 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>