More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0534 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_0534  ABC transporter related protein  100 
 
 
328 aa  662    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1233  methionine import ATP-binding protein MetN  45.4 
 
 
340 aa  286  2.9999999999999996e-76  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1250  methionine import ATP-binding protein MetN  43.99 
 
 
318 aa  278  8e-74  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19590  ABC-type metal ion transport system, ATPase component  44.24 
 
 
337 aa  276  4e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.197301  hitchhiker  0.00100295 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1075  methionine import ATP-binding protein MetN  43.99 
 
 
318 aa  272  5.000000000000001e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0644  ABC transporter, ATP-binding protein  41.77 
 
 
318 aa  270  2.9999999999999997e-71  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1540  ABC transporter related  41.01 
 
 
348 aa  269  5e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00159208  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0358  ABC transporter related protein  41.88 
 
 
319 aa  261  1e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.703642  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0967  ABC transporter ATP-binding protein  41.46 
 
 
322 aa  257  2e-67  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0865  ABC transporter, ATP-binding protein  40.84 
 
 
336 aa  252  7e-66  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0795  ABC transporter, ATP-binding protein  40.84 
 
 
336 aa  251  1e-65  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.771589  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1238  ABC transporter, ATP-binding protein  40.54 
 
 
336 aa  248  1e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3531  ABC transporter related protein  44.13 
 
 
341 aa  246  4e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0961  ABC transporter, ATP-binding protein  40.56 
 
 
352 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0902  ABC transporter, ATP-binding protein  40.56 
 
 
352 aa  243  3.9999999999999997e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.693076  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4306  ABC transporter related  39.18 
 
 
377 aa  238  6.999999999999999e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3768  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  37.38 
 
 
331 aa  238  9e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.227967  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1395  ABC transporter related  41.27 
 
 
337 aa  238  1e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72620  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  40.12 
 
 
335 aa  237  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3986  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  40.24 
 
 
343 aa  236  3e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2100  ABC transporter related  39.35 
 
 
347 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.182492  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6304  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  39.81 
 
 
335 aa  235  6e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0129  ABC D-methionine uptake transporter, ATPase subunit  36.63 
 
 
353 aa  235  9e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.539804  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03093  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  38.75 
 
 
335 aa  235  9e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0065  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  41.59 
 
 
335 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2457  ABC transporter related  40.13 
 
 
368 aa  234  1.0000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3248  D-methionine ABC transporter, ATP-binding protein  37.38 
 
 
320 aa  234  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0544526  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1766  ABC transporter related  36.63 
 
 
353 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.129001  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4331  NLPA lipoprotein  36.63 
 
 
353 aa  233  3e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0798419  normal  0.109457 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4503  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  39.87 
 
 
335 aa  233  3e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2652  ABC transporter related  40.19 
 
 
340 aa  233  3e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0129  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  40.38 
 
 
335 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.131021 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0114  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  40.38 
 
 
335 aa  232  5e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.867435  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0131  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  40.38 
 
 
335 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5262  D-methionine ABC transporter, ATP-binding protein  41.01 
 
 
335 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0281  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  40 
 
 
335 aa  231  9e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004238  methionine ABC transporter ATP-binding protein  43.65 
 
 
344 aa  231  9e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2430  hypothetical protein  39.42 
 
 
345 aa  231  2e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0121441  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5114  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  40.19 
 
 
335 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.182422  normal  0.245583 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01202  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  42.76 
 
 
344 aa  229  3e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1230  ABC transporter related  37.79 
 
 
347 aa  230  3e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0429  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  42.72 
 
 
344 aa  230  3e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1533  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  40.29 
 
 
345 aa  230  3e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0757943  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0291  ABC transporter-related protein  38.44 
 
 
339 aa  229  4e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0886  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  44.33 
 
 
344 aa  229  4e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0297  ABC transporter ATP-binding protein  38.44 
 
 
339 aa  229  5e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0343  ABC transporter, ATP-binding protein  38.44 
 
 
339 aa  229  5e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0312  ABC transporter ATP-binding protein  38.44 
 
 
339 aa  229  5e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0385  ABC transporter, ATP-binding protein  38.44 
 
 
339 aa  229  6e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0292  ABC transporter related  38.75 
 
 
339 aa  229  6e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0341  ABC transporter, ATP-binding protein  38.44 
 
 
339 aa  229  6e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0281  ABC transporter, ATP-binding protein  38.44 
 
 
339 aa  229  6e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0358  ABC transporter, ATP-binding protein  38.12 
 
 
339 aa  229  6e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3753  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  39.74 
 
 
343 aa  229  6e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000257186  normal  0.0826267 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1781  ABC transporter related  39.13 
 
 
397 aa  229  7e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.337928  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0284  ABC transporter, ATP-binding protein  38.12 
 
 
339 aa  228  9e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4962  ABC transporter, ATP-binding protein  38.12 
 
 
339 aa  228  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3403  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  39.74 
 
 
343 aa  227  2e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000150207  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0625  ABC transporter related protein  41.35 
 
 
325 aa  228  2e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0236  ABC transporter-like  41.22 
 
 
374 aa  227  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127209  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2336  ABC transporter-like  44.62 
 
 
266 aa  227  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31520  ABC transporter, ATP-binding component  39.67 
 
 
385 aa  227  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.100251  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00198  DL-methionine transporter subunit  39.74 
 
 
343 aa  226  3e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000236  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0211  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  39.74 
 
 
343 aa  226  3e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000167757  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0206  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  39.74 
 
 
343 aa  226  3e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000462586  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0203  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  39.74 
 
 
343 aa  226  3e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000442829  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0193  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  39.74 
 
 
343 aa  226  3e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000317621  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00197  hypothetical protein  39.74 
 
 
343 aa  226  3e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000135351  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1908  ABC transporter-like protein  38.08 
 
 
318 aa  226  3e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.103908 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0210  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  39.74 
 
 
343 aa  226  3e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000485974  normal  0.606224 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3460  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  39.74 
 
 
343 aa  226  3e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000625697  normal  0.693626 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0847  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  39.6 
 
 
343 aa  226  4e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000211162  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3485  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  39.25 
 
 
335 aa  226  4e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.762526 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0878  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  40 
 
 
343 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000103335  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6095  ABC transporter related  41.82 
 
 
362 aa  226  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.733778 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1512  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  34.62 
 
 
348 aa  225  8e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0269  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  39.4 
 
 
343 aa  225  8e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0053957  normal  0.255493 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0274  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  39.4 
 
 
343 aa  225  8e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0116933  normal  0.0903375 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0269  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  39.4 
 
 
343 aa  225  8e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000470965  normal  0.859728 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0288  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  39.4 
 
 
343 aa  225  8e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000549841  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0251  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  40.73 
 
 
310 aa  225  8e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.990396  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2345  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  34.62 
 
 
348 aa  225  8e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0734  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  39.3 
 
 
344 aa  225  9e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.260825  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1487  ABC transporter related  37.5 
 
 
340 aa  225  9e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000017469  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0285  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  39.4 
 
 
343 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00936615  normal  0.383177 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3582  ABC transporter-related protein  39.5 
 
 
341 aa  225  1e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0126168  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2926  ABC transporter related  37.03 
 
 
342 aa  224  1e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015869  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0311  ABC metal ion transporter, ATPase subunit  46.05 
 
 
398 aa  225  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1043  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  39.07 
 
 
343 aa  224  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163916  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3029  ABC transporter related  46.05 
 
 
394 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193089  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3405  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  39.07 
 
 
343 aa  224  1e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0164729  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2365  ABC transporter related  40.13 
 
 
365 aa  224  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0817479  hitchhiker  0.00312127 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5337  ABC transporter related  46.05 
 
 
394 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.874002  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0857  ABC transporter related protein  38.74 
 
 
338 aa  224  1e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2536  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  37.2 
 
 
352 aa  224  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0300192  normal  0.239692 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1447  ABC transporter related  47.7 
 
 
342 aa  224  2e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513841  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0737  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  39.74 
 
 
343 aa  224  2e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00428338  normal  0.945518 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4931  ABC transporter related  46.05 
 
 
392 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247063  normal  0.893842 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0250  ABC transporter related protein  49.3 
 
 
400 aa  224  2e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1096  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  39.07 
 
 
343 aa  224  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000220357  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>